Cohnella herbarum: HH215_06670
Help
Entry
HH215_06670 CDS
T08421
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
cheb
Cohnella herbarum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJD88021
UniProt:
A0A7Z2VRU9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1542572..1547971)
Genome browser
AA seq
1799 aa
AA seq
DB search
MKCLVCREVRCKCKKKKVKKACCKKGPRGPKGPEGPQGLKGATGEQGLMGVTGATGAIGL
TGPTGPRGPTGATGATGPPGPTGATGRKGATGVTGASGNTGANGVTGVTGATGATGTAGA
TGATGATGGETGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGQTGATGSTGDPGATGATGATGASGVTG
VMGATGVTGVTGQTGATGSTGDPGVTGPTGATGLAGVMGQTGATGSTGEPGVTGATGATG
ATGTTGQTGATGATGVTGATGATGVTSATGATGVTGATGSTGATGATGVTGATSETGATG
ATGATGATGETGATGATGATGDTGATGATGETGATGATGATGETGATGETGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGETGATGSTGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGDTGATGATGETGATGATGETGATGETGVTGATGATGATGATGDTGATGATGATG
ETGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGETGATGATG
ATGDTGATGATGATGATGETGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGTIGATGATGATG
VTGETGATGATGSTGATGATGETGATGETGATGATGATGETGAIGETGATGVTGATGATG
ETGATGATGATGATGETGATGATGATGSTGATGETGATGATGATGATGETGATGATGETG
ATGATGETGATGVTGATGATGETGATGATGATGSTGATGATGETGATGATGETGATGETG
ATGDTGATGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGETGATGETGATGETGATG
ATGATGATGATGATGETGATGETGATGATGATGDTGATGATGATGETGATGETGATGATG
ETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGETGATGATGATGATGATGATGVTG
ATGATGATGATGATGDTGATGETGATGATGATGATGATGATGETGATGETGATGATGATG
ATGATGATGATGETGATGATGATGATGSTGETGATGETGATGATGETGETGATGDTGATG
ATGATGATGATGDTGATGATGSTGATGSTGATGSTGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGETGVTGATGETGATGATGETGATGATGETGATGATGETGATGATGETGATGATG
ETGATGATGETGATGATGETGATGATGATGATGATGATGETGATGATGATGETGATGATG
DTGATGETGATGATGATGETGATGETGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ETGATGATGETGATGATGATGETGATGATGATGATGATGATGDTGATGATGATGETGATG
ATGATGETGATGATGATGATGATGETGATGAAGATGATGDTGATGATGETGETGATGATG
ATGVTGVTGVIGPTGATGATGETGATGATGATGATGATGSSGATGATGATGATGATGATG
ATGATGSTGETGETGATGATGSTGATGATGSTGATGATGATGETGATGATGVTGATGATG
ATGATGATGETGATGVTGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATG
ATGATGATGATGATGATGATGVTGATGATGVTGVIGPTGATGATGTNITNTSAFAENTSG
TFLVVLGGLNVSLPNNQNIGANITINGANDTFTLANAGRYYISYKINTTAALLVQSRILL
NGASVPPSVVSPTISTSLLTSDFIITVPANSTITLQFFGLVATVVLSPPGATINIIQIG
NT seq
5400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ataaagtgtttggtttgtcgcgaagtacgttgtaaatgcaaaaagaaaaaggtcaaaaaa
gcatgttgtaagaaaggtccgagaggtccaaaaggtccagaagggcctcaagggctgaag
ggagcaacaggcgaacagggtttgatgggagttacgggagcaacaggagccataggactg
acaggcccaacaggtccaagaggaccaacgggggctaccggtgcaacaggtccgcctggt
cctactggagctacggggcgaaagggggctacaggagtaacaggagctagcggcaataca
ggagcaaatggagttactggagttacaggtgctacaggtgctacaggtactgcaggtgca
actggagcaacaggagcaactggtggagaaacaggagttacaggagttactggagttaca
ggggttacgggtgcaacaggcgtaactggtgttaccggtcaaacgggagctacgggttcg
actggtgatccaggggcaacgggagccactggggctacaggtgcatctggagtaacagga
gttatgggtgcaacaggcgtaactggtgttaccggtcaaacgggagctacgggttcgact
ggtgacccaggcgtaacaggaccgacaggagcgactggcctagcaggagttatgggtcaa
actggagcaaccggttcaactggggaaccaggcgtaacaggggcaacaggagctactggg
gcaaccggcacaacaggtcaaactggtgcaacaggagcaactggtgttacaggtgcaaca
ggagcaactggggttacaagtgcaacaggagcaactggggttacaggtgcaacaggatct
acgggagcaacaggagcaacaggagtaacgggagctacgagcgaaacgggagcaactggg
gctacaggtgcaacgggcgctacgggcgaaacaggtgcaacaggagcaacaggggcaact
ggggatacaggtgcaacgggtgcaactggcgaaacaggtgcaacgggagctacgggagca
acaggagaaaccggagcaacgggcgaaacgggagcaacaggagcaacaggtgcaacgggt
gcaacaggggcaactggagcaacaggtgcaactggagcaacaggcgcaactggcgataca
ggagcaacgggagctacgggagctacgggcgaaacgggagcgacaggttctacgggagca
acaggagcaacgggagcaactggggctacaggtgcaacaggtgcaacaggtgcaactgga
gcaacaggtgcaactggcgatacaggagcaacgggagctacgggcgaaacgggagcaaca
ggggctacgggcgaaacaggagctacgggagaaaccggtgtaacaggggcaacaggggca
acaggcgcaacaggcgcaactggcgatacaggagcaacgggagcaacgggagctacgggc
gaaacgggagcaacaggagaaaccggtgcaacaggggcaaccggggcaaccggagcaacg
ggagctacgggagcaacaggagcaacaggagcaacgggagcaacaggagcaacgggagca
acaggcgcaacgggagaaaccggagcaacgggcgaaacgggcgcaacaggagcaacggga
gcaactggggatacaggggcaacaggagcaacaggagcaacgggagctacgggcgaaacg
ggagcaactggggctacaggtgcaacaggtgcaacaggtgcaactggcgatacaggagca
acaggagcaacaggcgcaacgggaacaataggtgcaactggggctacaggtgcaacgggc
gttacgggcgaaacaggggcaactggggctacaggttctacgggagcaaccggagctacg
ggcgaaacgggagcaacaggagaaaccggtgcaacgggtgcaacaggggcaacaggagaa
accggtgcaataggagaaacaggggcaactggggtaactggggcaactggggcaactgga
gaaacaggtgcaactggtgcaacaggagcaaccggagcaacaggagaaaccggagcaaca
ggagcaacaggagctacaggttctacgggagctacgggcgaaacaggggctacaggtgca
actggagcaacaggcgctacgggcgaaacaggagcaacgggagctacgggcgaaacggga
gcaacgggagctactggcgaaacgggagcgacaggggttacaggtgcaacaggagcaaca
ggagaaaccggtgcaacgggtgcaacaggcgcaacaggatccaccggtgcaacaggagct
acgggcgaaacaggagcaacgggagcaacaggagaaaccggtgcaacgggagaaaccgga
gcaactggggatacaggtgcaacaggagcaaccggagaaaccggcgcaaccggtgcaaca
ggagcaacaggagcaacgggagcaactggggctacaggggcaacaggagcaactggcgca
actggcgaaacgggagctacgggcgaaacgggagcaacaggagaaaccggtgcaacaggg
gcaaccggagcaacgggagctacgggagcaacaggcgcaacgggagaaaccggagcaacg
ggcgaaacgggcgcaacaggagcaacgggagcaactggggatacaggcgcaacaggtgca
acaggtgcaacaggagaaactggggctacaggagaaactggggctacaggtgcaacagga
gaaactggggctacaggagaaactggggctacaggagaaactggggctacaggagaaact
ggggctacaggagaaactggggctacaggagaaactggggctacaggagaaactggggct
acaggggctacaggggctacaggtgcaacaggtgcaacaggtgcaacaggagtaacggga
gcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggcgcaactggcgatacaggagcaaca
ggagaaaccggtgcaacaggagcaacaggtgcaactggggctacaggtgcaacgggagct
acgggcgaaacgggagcaacaggagaaaccggtgcaacgggagctacaggtgcaacaggg
gcaactggggctacaggtgcaacgggcgctacgggcgaaacaggtgcaacaggagcaaca
ggagcaacaggggctacaggttctacgggagaaaccggagctacgggcgaaacaggtgca
acgggtgctacgggcgaaacgggagaaaccggagcaactggggatacaggtgcaacgggt
gcaacaggggcaactggagcaacaggcgcaactggcgatacaggagcaacaggtgcaaca
ggatctaccggagcaacaggatctaccggagcaacaggatctaccggagcaacaggagca
acaggcgcaacgggagcaacgggagcaacaggagcaacgggagcaacaggagcaacagga
gcaacgggagcaacaggagaaaccggtgtaacgggtgcaacaggtgaaactggggctaca
ggtgcaacaggagaaactggggctacaggtgcaacaggagaaactggggctacaggtgca
acaggagaaactggggctacaggtgcaacaggagaaactggggctacaggtgcaacagga
gaaactggggctacaggtgcaacaggagaaactggggctacaggtgcaacaggagaaact
ggggctacaggggcaacaggggctacaggtgcaacaggagcaacgggagcaacaggcgaa
acaggagcaactggggctacaggagctacgggcgaaacgggagcaaccggcgcaactggg
gatacaggtgcaacaggagaaactggggctacaggtgcaacgggagctacgggcgaaacg
ggagcaacaggagaaaccggtgcaacaggtgcaacaggtgcaacaggggcaacaggggca
acaggggcaacaggcgcaacaggtgcaactggggctacaggtgcaacaggagcaacggga
gaaaccggtgcaacaggagctacgggagaaaccggtgcaacaggggcaacaggagctacg
ggagaaaccggtgcaacaggagcaacaggcgcaacgggagcaacaggtgcaacaggagca
actggggatacaggtgcaacgggggcaacaggagctacgggagaaaccggtgcaacaggg
gcaacaggggctacgggagaaaccggtgcaacgggtgcaacaggagcaacaggtgcaact
ggggctacgggagaaaccggtgcaacaggggcagctggtgcaacaggcgcaactggcgat
acaggagctacgggagctacgggcgaaacgggagaaactggggctacaggtgcaacggga
gcaaccggagtaaccggagtaactggagtcatcggaccgacgggagctacaggtgcaaca
ggggaaactggggctacaggtgcaacaggtgcaacgggtgcaactggggctacaggttct
tcgggagcaacgggagctacgggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaacagga
gcaactggggctacaggttctacgggcgaaacaggagaaaccggtgcaacgggtgctaca
ggatcaacaggggcaacaggtgcaacaggatctaccggcgcaacgggtgctacgggagca
actggcgaaacaggagcaaccggagcaactggggttacaggcgcaaccggagcaacagga
gcaacaggagcaacaggagcaacgggcgaaacgggagcgacaggggttacaggggttaca
ggtgcaacaggagcaacgggagcaacaggcgcaaccggagcaacgggtgcaacgggagca
acaggggcaaccggagcaacgggtgcaaccggagcaacgggagcaacaggggcaaccgga
gcaacaggagcaacaggagcaacgggagcaaccggagcaaccggagcaaccggggcaaca
ggcgtaacgggagctacgggagcaaccggagtaactggagtcatcggaccgacgggagct
acaggagcaacaggaacaaatatcacgaacacttcggcattcgctgaaaacacatcggga
acatttctagtggtactaggtggccttaatgtttcactgcctaataaccagaatattggt
gcaaatatcacgattaatggtgcaaatgacacatttacgctcgcaaatgcgggaaggtat
tatatttcttataaaattaatacgactgctgctttactagttcaatcaagaatattattg
aatggggcttcggtgccgccttctgttgtttcgccaacgattagtacttctcttttaaca
tctgattttattattaccgttccggctaactcgacgataacactccaattttttggactt
gtggctaccgtcgttttatcgccacctggcgctacgatcaatatcattcaaattggttag
DBGET
integrated database retrieval system
