Chitinophaga pendula: KTO58_23820
Help
Entry
KTO58_23820 CDS
T08407
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
Organism
chf
Chitinophaga pendula
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHU_C
FG-GAP_3
Cadherin
Big_5
Cadherin_4
CopC
Ig_7
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UCJ06662
LinkDB
All DBs
Position
complement(6357271..6366678)
Genome browser
AA seq
3135 aa
AA seq
DB search
MVLATLLITLPVSLRAQTYTAFSAGNGQAKNFPQPQFPGRVVVADFDGDGDADILSQTGG
NGSALTYSRCDANANFTTVAIGDPISPFRNVAAGFPNLTAFNDYVADFDHDGDIDLWLTT
NLGTGSYFRNDGGVFTGVATAGVFPSIGSQLRVTIADFSGDGFPDILFQDGFPTVGAYHY
LKNNGVQGAPLAFTEIPLASSPFAGLTFPTHQGGNVFAADFDKDGNIDIWFGGDIDDPTV
ANRKGWFFKNNGSSFAAASNSAFPELSDIGDAVLGDFDSDGDVDILYQTGAPGTPYNVAL
NTSTGGNVNYNIVNTSASIFAGFTFYDDNTFVVADFDGDTDMDIWQPRNNIDGRFYQQIA
EPPYITSSTPADDAVNVDPTGNITITFNKAVNKGAGNIHIIRTSDNATIQTIDVSSGSVT
TAGAAPATTWTIDPPSNLAYGVGYSILFDPATFRLPAPSNIAFLGIDDIVTFNFTTRTNT
APTVVNLNGDMVSYQENATATVLDAANNATVTDGDSPDFIGGNVTVTITTNKETGDKLAV
GNIGLITISGSNINYNGNLIGTFTGDGSAAPLVVSFTTVNATPAAATALLRAITFVHTTE
NPTANTRTITFTVNDGDGGTSTVASVSCAVTAVNDAPVNTVPTGYIFNEDTQLTLTGIQF
TDVDQDGAVVSSDFFVPNGSGTFQTTGAGVTVAPYTDGTNTGITIAGTYAALNAFMLAGN
VKFTPAVNFNGNTLSISVRNQDGGHTGTGGVQTDLDLIPLTINAINDAPVNNVPISIPVT
EDAATALAGISFSDIDAGNAPVKVTLSVPSGTLAATTGSGVTVGGTATALTLTGSITDIN
AFIAASNVTFLTTVGSDVILTVLISDEGNTGTGGALTDSDPVTLSVTAVNDAPALAIVTT
ARAAQEDVATAVSDIVISDEDAGSGNVKLTLAASSGTLSATVIAGVAVTGNNTGTLVLTG
TLTAINAGITGGNISYKTAQDDILPVAITVTIDDQGNTGTGGAKTATATLNYTITAVNDA
PVNHLPVNISVTEDQVSALTGISFSDVDAGSAAVKVTLSVPSGALAATAGAGVTVGGTAT
ALTLTGSIAAINAFIAASNVTFLTTVGSDVVLTVLISDEGNTGTGGALTDSDPVTLRVAA
VNDAPSLAIVTTARTAQEDIAKVVNDIVISDEDAGAGAVKLTLSASSGTLSASAIAGVTA
TGNGSGTLVLTGTLTAINAGISGGIVSYTTAQDDVQAVTVTVTVDDQGNTGTGGSKTATA
TLNYTIAAVNDAPVNNVPATINVAEDAVTALTGIGFSDVDAGTAAVTVTLRVPTGTLAAT
SSGGVTVGGTSTALILTGSIANINTFIGGGNVTFTTADPGNVTLTVSINDNGNTGTGGSL
TDTDLVTLVVAAANDAPTLAIVTTARTAQEDIAKVVDDIVISDEDAGTGAVKLTLSASSG
RLSASAIAGVTVTGNGSGTLVLTGTLTAINAGISGGIVSYTTAQDDVQAVTVTVTVDDQG
NTGTGGSKTATATLNYTIAAVNDAPVNNVPATIQVTEEQASVLTGISFSDVDAGTGVVTV
TLRVPTGTLAATSGSGVTVGGTSTALTLSGTIGTINTFISGGKVTFTTANAGNVVLTVSI
NDNGNTGTGGSLTDTDPVTLVVDEVNDAPVLTIAPASLSGNEDNAVQINNISIADEDINA
GTGLLHLQSSGGAFFATPQAGITIVSGNNTNDIQISGTLAGLNSYLLAGKVAFTPAANFN
GTITITVTFDDQGNTGTGGAKQDQKTFTININAINDTPSITAGATINVDEDTETAISGIS
FADVDAGTGVVKATFAAAGTLTAADGGGVTVNGSGTNTVVLNGTITAINSFISAGSLKYT
PVVNATGNVNLSVNINDNGYTGADPGGPSPTSEEATTTVVLTLVAMNDAPVIAGTGPIAV
TEDVSKAISGMTLSDEDAGSGSVTMTFTLPAASGNLTATSGGGVTVTGNGTATISLLGTV
ANINTFIAGNNITYMPANHLNGDVILTLTATDNGHTGAGGALQAVPVPVTLQIAAVNDVP
SISSNPIPFNVQEDVPTAIRPLAFSDVDAGTGIVKVSFIVAAGGGTFAANSGSGVTVNNS
GSATLTLEGTLTDINTFIAAGGVTYTTPLNSTVTPRSLTVRIDDNGNTGSGGNLFAQLVF
NANITAVNDAPVITIPAAQTVDMNNALVLNGADKISISDVDLNGGVLKITLTATNGSLTL
GNTSGLSFSTGDGLGDVTMTFTGSLSSVNTALNGLTFIPPANYYGAATIKVTADDQGNTG
AGGAQTDEKILSINVQPTFPIITAVSSTAGNGTYKLGDVIPVTVTFNMPVLVTGTPQVQL
ETGATDRNADYVSGAGSSTLTFSYTVQSGDQSTDLDYTATTALQLNGGSIKSAAGLNAAL
TLAAPGAAGSLGANKALVIDGIVPTIASVAVPANGTYITGQVLQFTVNTSEVVTVNTAGG
SPTLTLQIGSSNVQAVYVPGAPATAMQFRYTVVSGDLDTDGINVSGLQLNGATIQDAAGN
NLHLALQNVAPTTAVLVDAVAPAVTSVDIPANKLWKAGEVLNFVVHYSEAVTIAGGTPFI
SVTMGSSIKNFALSAGAGTNTLTFSYTIAAGDLDRDGIAAATNISLNTATIKDAAGNNAT
LVLTGMGATTGVLVDAVPPVITTNQVFSVNENSAAGTTVGAVDANDPGSSGTLQQWTITT
NVDADGDGVPAFIMDPASNVIKVNDAGDLNYEVNSSLTISVRVSDGVNQSAVQTVKINLN
DMPEPPLDIQLSNLLVAENNLLNITVGTLTATADEPGTTFTYTLVAGTGSNDNSSFSIAG
DKLTGLKVFNFEEQSSYRIRVRATTQHGEYLEKTFVISIRDVNEAPTIDVVTDKSYCASG
NDERIAFTTVTAGPEAGQTVTLTASNDNNGLFSSFTIAGNELRFRFVAGASGVANVTVTA
KDNGGTANGGVDQIQRTFRIAVSSINTPVITSDKGLKVSKGDVVRLTATGGVSYVWDPNE
DIQHNPNQAVLVVRPKANATYRVTATNNAGCTASQTISIEVIDDYKVDATNILTPNGDGI
NDRFVIKNIDSYPNNELKIFDRVGRLIYNKRSYLNEWDGTLSGRPLQEGTYYYILDFGPG
LPKVKGFITIIRDKY
NT seq
9408 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtcctggcaacgctccttattacccttcctgtcagcctgcgcgcccagacctatacg
gctttttcggcaggcaatggtcaagccaagaactttccgcaaccacagtttccggggagg
gtcgtggtagctgattttgacggtgacggtgatgccgacatcctatcacagaccggtgga
aacggctctgcacttacctattccaggtgtgatgctaatgccaattttactactgtggcg
atcggtgatcctatttcgcctttccggaatgttgcagctggttttcctaacctgactgcg
tttaacgactatgtggcggactttgatcatgacggcgatatcgatctttggttaacgacc
aatctggggaccggttcttatttccgtaatgatggtggtgtgtttaccggtgttgctacg
gccggcgtctttccatcgataggatcgcagctgcgggtgaccattgctgacttttcggga
gacggtttccccgatatcctgttccaggacggattccctaccgtgggagcctatcattat
cttaaaaacaatggggtacaaggtgctccgctcgcgtttacggagataccgctggcttct
tcaccatttgcgggacttactttccctacgcaccaggggggcaatgtttttgctgcggac
tttgataaagatggtaatatcgatatctggtttggtggcgatatagacgatcctacggta
gctaacaggaaaggatggttctttaagaataatggaagcagctttgctgcggcatccaat
agtgcgtttccggaactcagcgatataggggatgctgtactgggagattttgacagcgac
ggcgatgttgacatcctatatcagacaggtgctccaggcactccctataatgtagctctc
aatacgagtaccggaggtaacgttaactataacattgttaatacgagtgcctccatattt
gcaggatttactttttatgatgataatacttttgtcgtagctgattttgatggggacaca
gatatggacatctggcaacccaggaataatatagacgggcgattctatcagcagatagcg
gagcctccctatattacttccagtacaccggcggatgatgcggtgaacgtagatcctacc
gggaatataactatcacgttcaataaagcggttaacaagggagcgggcaatatccatatt
atacgtacctccgataacgcgactattcagactatcgatgtaagcagcggcagcgtaacg
acagctggcgcggcaccagctactacctggacgattgatccgccaagtaacctggcatat
ggcgttggatattctatattatttgatccggcaaccttcaggttgcctgcgccgtcaaat
attgcattcctaggtatcgatgatatcgtaacatttaacttcacgaccagaactaatact
gcgcctactgttgttaatctgaatggcgatatggtaagttaccaggaaaacgctaccgcc
acggtacttgatgctgctaataatgcgacggtgacggatggtgactctcctgatttcatc
ggagggaatgtaacggttactattactaccaataaagaaaccggtgataaactcgcagta
ggtaatataggactgattacgatcagtggcagcaacatcaattataatggcaacctgatc
ggtactttcacgggagacggttccgctgctccactggtagtttcctttaccactgtcaat
gctactccggctgctgccacggcattgcttcgtgcgatcacgttcgtacatactacagaa
aatccaacggcaaatacacgcactattacttttacggtgaatgacggtgatggaggtaca
agcactgtagcgagtgttagctgtgcggtgacggcggtaaatgatgcgccagtaaataca
gtgcctacgggatatatatttaatgaagatactcagctgacactgacaggcatacagttc
accgatgtggaccaggatggcgctgtcgtttcttctgatttctttgtacctaatggtagc
ggtacattccaaacgaccggagcgggtgtaaccgtcgctccgtatacggatggtaccaat
accggcatcactatcgcaggtacttatgctgcgctgaatgcctttatgctggcagggaat
gtgaaatttactccagcggttaactttaacggtaatacgttatcgatcagtgtaaggaat
caggacggtgggcatacaggtaccgggggcgtgcagacagatctggatctgataccattg
acgatcaatgcgataaatgatgcgccggtaaataacgtgcctatcagtatcccggtaacg
gaagatgcagcgacggcgttggcagggatcagtttttcagatatagatgctggtaatgcg
ccggtgaaggtgacgttgagtgtaccttccggtacgctggcggcgaccaccggtagtggt
gtgaccgtaggcggtactgcaacagcgctgacactgactggtagcattacagatatcaat
gcttttatagcagcctccaatgtaaccttccttactacggttggcagcgacgttatcctg
actgtgctgatcagtgatgaaggtaatactggtacgggaggtgcattaaccgactctgat
cccgtgacgctgagtgttactgcagtaaatgatgcgcctgcgttggctattgttaccact
gccagagccgcacaggaagacgtagcgacagccgtgagtgatattgtgatctctgatgaa
gatgcgggcagcggaaatgtaaaactgacgttggctgcatccagcggtaccctgtctgcc
actgtcatcgccggtgtagcagtaacaggtaataataccggaactttagtactgacagga
acgttaaccgctatcaatgctggtatcaccgggggtaatatttcttataaaacagctcag
gatgatatactgccggttgcgatcaccgtaacgatagatgaccagggtaatacaggtacc
ggcggggcgaagacagcaacggctacgctcaactataccattactgcggtgaacgatgcg
ccggtaaatcatctgccggttaatatatccgtgacggaagaccaggtgtctgcgttgacg
ggcattagcttctccgatgtagatgcaggtagtgcggcggtaaaagtgacgctaagcgta
ccatcaggtgcgttggcagccaccgccggtgcaggtgtgactgttggaggtacagcgacc
gcgctgacactgacaggatcgatcgcagctatcaatgcgtttatagcagcttctaatgta
accttccttactactgttggcagtgatgttgtcctgacggtgctgatcagtgatgaaggt
aataccggtacgggaggtgcattaaccgactctgaccctgtgacgctgcgtgttgcggct
gtaaacgatgcgccttcgctggctattgttaccactgcgaggaccgcccaggaagatatt
gccaaggtagtaaatgatattgttatctctgatgaagatgcgggagccggcgctgtgaaa
ctgaccttgtctgcatccagcggtacactgtcagcatctgctatcgccggtgtgacagca
accggtaatggtagtggtacgctggtactgaccggtacgctgacggccattaacgcaggc
attagcggaggtattgtatcttatacaacagcacaagatgatgtacaggccgttactgtt
accgtgacagtagatgaccagggtaatactggtacgggcggttcgaagacagctacggct
accctcaactatactattgcggcggtgaatgatgcacctgtaaataatgttcctgctact
attaatgtagcggaagatgcggtcactgcattgacaggtatcggcttctccgatgtagat
gctggcacagccgctgttacagtaacactgcgtgtaccaacgggtacgctggccgcgact
agcagtggcggtgtgactgtaggcggtaccagcactgcgctgatactgactggttctatt
gcgaatatcaacacgtttatcggtggcggtaacgtgacctttaccactgcagatccaggt
aacgtaaccctgacggtgtccatcaatgataatggtaatacgggtacgggaggtagcttg
acagataccgacctagtgaccctggttgtagcagcagcgaacgatgcgcctacgctggct
attgtcactactgcgaggaccgcccaggaagatattgcgaaggtggtagatgatatcgtg
atctctgatgaagatgcgggcaccggcgctgtgaaactgaccttgtctgcatccagcggc
aggctgtcagcatctgctattgccggtgtgacagtaaccggtaacggtagtggtacactg
gtactgaccggtacgctaacggccattaatgcaggcattagcggaggtattgtatcttat
acaacagcacaagatgatgtgcaggccgttactgttaccgtgacagtagatgaccagggt
aatactggtacgggcggttcgaagacagctacggctaccctcaactatactattgcggcg
gtgaatgatgcacctgtaaataatgttcctgctacgattcaagtgacggaagagcaggcg
tccgtattaacaggtatcagcttctctgatgtagacgccggcacaggagtggttacggta
acgctgcgtgtaccaacgggtacgctggccgcgaccagtggtagtggtgtgacggtaggc
ggtaccagcactgcgctgacgctgagcggtactattggtactatcaacacctttatctcc
ggcggtaaagtgacctttaccacagcgaatgcaggtaatgtggtgttgacggtgtctatc
aatgacaatggtaatacaggtacaggtggtagtctgacagatactgaccctgtgacacta
gtggtagacgaggtgaatgatgcacctgtattaacgatcgcaccagcgagcttgtccggt
aatgaagataatgccgtacagatcaacaatatttctatcgcagatgaggatatcaatgcg
ggtactggcctattgcatctgcagtcttccggcggagcgttcttcgcaacgccccaggca
ggtattactattgtatccggcaacaataccaatgacatacagatcagcggaacactggcc
ggtctgaatagttatctgcttgccggtaaagtggcctttacacctgctgccaactttaac
gggacgatcacaattacggttacgtttgatgaccagggtaatactggtacgggaggtgct
aaacaagaccagaaaacatttaccattaatataaatgcgataaatgatacaccctctatt
acggcgggagccacgattaatgtggatgaagatactgagacagcgatcagcggaatcagc
tttgcagatgttgatgccggaacaggtgttgttaaggcgacttttgcagcagcaggtacg
ctgacggccgcagatggtggcggagtaactgtgaacggtagcggcaccaatacggtggta
ctgaatggtactattacggctatcaatagctttatctcagcaggatctctgaaatatacg
ccagtagttaatgcgacaggtaatgtaaacttgtctgtcaatattaacgataacgggtat
accggtgccgatccgggcgggccgtcccccaccagcgaggaggcaactactacggttgta
ttgacattggtagcaatgaatgatgcaccggtgatcgccggtacaggaccgatcgctgta
acggaagatgttagcaaagcgatcagcggcatgaccttatctgatgaggatgccggaagt
ggcagcgttactatgacatttacactgcctgctgccagcggtaatctgactgccaccagt
ggtggtggagtaactgtgaccggtaacggtaccgcgacaatctccctgctgggaaccgtt
gccaatatcaatacgtttattgccggtaataatatcacctatatgccggccaaccacttg
aacggcgatgttatattaaccctgaccgcgacggataatggtcataccggagcgggagga
gcgctgcaggcggtgcctgtgccggtaacgttgcagatagcagcggtaaatgatgtacca
agcatttccagcaatccgataccatttaatgtacaggaagatgtgccgaccgcaataaga
ccgttggcattcagtgatgtagatgcgggtaccggtattgtgaaggttagctttattgtt
gctgccggtggaggaacattcgctgccaacagtggtagtggtgtcaccgtcaataattca
ggcagcgctaccctgacgctggaagggacattgaccgacatcaatacgttcattgctgct
ggaggggtaacgtacaccactccgttgaatagtactgttactccgagatcattgaccgta
aggattgatgacaatggtaataccggcagcggcggcaacctgtttgctcagctggtcttc
aacgccaacatcaccgcggtgaatgatgcgccggtaataaccatacctgctgcgcagaca
gtcgatatgaataatgccctggtattgaatggtgctgacaagatcagcatcagcgatgtt
gatctgaatggaggcgttctgaagataacattgacagcgaccaacggttcactgacatta
ggtaatacttcgggattgagcttcagtacgggggatggacttggtgatgtgaccatgacg
tttaccggtagcttatcaagtgtgaacaccgcgctaaatggactcacctttatacctccg
gcaaactattacggtgcggctactattaaagtgactgctgatgatcagggtaacactggt
gcaggaggagcacaaacagatgaaaagatactcagcatcaatgtacaaccgacgttcccg
atcattacagcggtatcttctacagcaggtaacggtacttataaactcggagatgtaata
cccgtcactgtaacatttaatatgccagtgctggtaacaggtacaccacaggtacaactg
gaaacgggcgcaacagatcgtaacgccgattatgtgagtggtgctggtagtagtacgctt
acatttagttataccgtacaaagcggagatcagtctacagatctcgattacactgctact
acggcccttcaactcaatggtggtagcatcaagagtgcggcaggactaaatgcggcgctg
acgctggcagctccaggagccgccggatcactcggtgcgaacaaggcactggtgatcgac
ggtattgttccgaccatcgcctcggtggcagtgccggcgaacggtacttatattaccgga
caagtattgcaattcacggtaaatacttccgaagtggttaccgtaaatactgccggcggt
tcacccacgctgacattacagatcggcagcagtaacgtacaggcagtttatgtacccgga
gctccggcaacggcgatgcagttccgctatactgttgttagtggtgacctggatacagac
ggcattaatgtaagcggattgcaattgaatggcgccactatacaagatgcggcaggaaat
aaccttcacctcgccttacaaaacgtggcaccaacgaccgcagttctcgtagatgcagta
gcaccagcagtgaccagtgttgatattcctgctaataaactttggaaagctggtgaagta
ctcaactttgtagtacattattctgaggccgtaacgatcgcgggaggtacaccattcatt
tcggtaacgatgggcagcagtatcaaaaactttgcactctctgccggtgcgggcactaac
acacttacattcagttatacaatagccgccggtgatctggacagagatggtatcgctgcg
gccactaatatttctcttaacactgctaccattaaagatgcagccggtaataatgccacg
cttgtattaacaggaatgggagccactaccggtgtactggtagatgcagtaccgccagtg
atcaccaccaaccaagtatttagtgtcaatgagaacagtgctgcaggaacgactgtagga
gctgttgatgctaatgatccaggttcttccggtacactgcaacaatggactattacaact
aacgttgatgcggatggagatggagtacctgcgttcatcatggatccggcgagcaatgtg
atcaaggtaaatgatgcgggcgacctgaattatgaagtgaatagcagtctgacaatttca
gtgagggtaagcgatggggtgaatcaaagtgctgtacagacagtgaagatcaacctcaac
gacatgccggaacctccgttggatatccagctcagcaacctgctcgtggcagagaataac
ctgctcaatatcacagtaggtacattgactgctacggctgacgaaccaggaacaacattc
acttacaccctggtagctggtaccggtagtaatgataacagcagcttcagcattgcagga
gataagctgacaggtctgaaggtcttcaactttgaagaacaatccagctaccgtatccgg
gtaagagccactacgcagcatggagagtacctggagaaaacgttcgtgatcagcatcaga
gatgtaaatgaagcgccgaccattgacgtcgtgacagacaagagctattgtgcttccggc
aacgatgagcggatcgcattcacaactgtaacagcaggacctgaagcaggacagacggtg
accctcactgccagcaatgacaacaacggcctcttctcctctttcacgatcgcaggtaat
gaactccggttcagatttgtggccggtgcatcaggtgttgccaacgttactgtgacagct
aaggacaatggtggcacggctaatggcggtgtggaccagatacagcggactttccgtatt
gcagtgagcagcataaatacgcctgtgatcaccagcgataagggattgaaagtatccaaa
ggcgatgtggtacggctgacagcaacaggtggtgtaagttatgtatgggatcccaatgaa
gacatacagcataatcctaaccaggctgtgttggtagtccgtccgaaagcgaatgcgacc
tatcgcgttacggcaaccaacaatgctggctgtacggcatctcagacgatctcaatagaa
gtaatagatgattataaggtagacgccacgaatatactgacgcctaatggagacggtatc
aatgatcgctttgtgataaagaacattgacagctatccgaataatgagctgaagatattt
gatcgcgtcggaagattgatctataacaaacggagttatctgaatgaatgggatggaaca
ttaagcggcagacccctgcaggaaggcacttattattatatcctcgacttcggtcccgga
ttaccaaaagtaaaaggtttcattaccatcatcagagataaatactaa
DBGET
integrated database retrieval system