Chryseobacterium glaciei: A0O34_20450
Help
Entry
A0O34_20450 CDS
T04575
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
chh
Chryseobacterium glaciei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
chh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
chh02000
]
A0O34_20450
Transporters [BR:
chh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
A0O34_20450
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
EF-hand_5
EF-hand_1
EF-hand_6
Dockerin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ANF52736
UniProt:
A0A172Y0V6
LinkDB
All DBs
Position
complement(4517384..4520293)
Genome browser
AA seq
969 aa
AA seq
DB search
MNVRISRSLGMVAVLYFTANFSAQNKTNDTIPKEQKIEEVVMIGYGTQKKSNVTGAISSI
KASDIDEIPSGRAEQVLQGRAAGVSVISNSGQPGSTATVRVRGITSFGAGSNDPLWVVDG
IVVDNIGWLNQSDIEGMEILKDGASAAIYGVSAAKGVVLITTKKGTKGKLGISYNGFFGV
GSAANKLDLLNGNQYATIRNEANTNDGRAPIFANAGSYGNGTDWQKAIFNSAQRQSHEFS
INGGSEKSTYYASFGYYDQEGIVLRDISNYKRINARLNSNHKVLDFLTVGQTFAYTHTKS
AGINANGEFGGPLSSAINLDPLTPLVVTDGVNNQPFPSDYLNNPNIVRDQNGNPYGISHY
VSKEMSNPLAFQQTQLGKYNWTDDIIANVYADLKINKNISFKSTVNGKLSYWGSQAFTPV
NYLSSATKNDFNTLFRQIEKKFEWSTENTVTYQNKFGQHNLNVLLGQGYYEYNISSGQNT
TYKNLPTNDWQEASFNFDIPQTDRATNAWDGKETHKTSYFARVVYDYANKYLFTGTIRRD
GSSKFARDYHWGNFPAMSLGWNVSNEDFWPENNVVNSFKLRGGYGILGNDAIDNFQYANF
LIPGSNYTFGDDVIHIGYAPSTLENPNLKWERTSQLNIAADLKIFKNFDLSVDVYRKKST
DILRRIDLPGYIGLINNPWRNIGDMNNDGVEVSLGYKKNWGDFGFSANGNFAYLKNEITR
LEDDKPYVNFASFQSMGAVSRLQVGSSYGSFYGFQNLGVFQNQAEIDAYKNANGGLIQGN
AKPGDFKRLDANGDGKIDENDYVNLGNSVPKYTFGLTLNMNYKNFDLMIFAQGQAGNKIF
QGLRRLDIPEANYQTSILDRWTGEGTSNTIARVSQDDPNQNYTRMSDYYLQKGDYLRLKL
VQVGYTLPKEVSQAIGASKVRFYVTGENLVTFTKYTGYDPEIAGGDTFGIDRAYYPQSRT
FLFGANVQF
NT seq
2910 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtaagaatatcaagaagtttgggaatggttgcagtcctttattttactgcaaat
ttcagtgcccaaaacaagacgaatgacaccattcctaaagagcaaaaaatagaggaagtg
gtaatgatcggttacggtactcagaagaagagtaatgtgacgggagcaatatcaagtatt
aaagcttcggatattgatgaaattccttcgggaagagctgagcaggttctacaaggtaga
gctgccggagtttctgtaatttcgaattcagggcaaccaggatctactgctacagtaaga
gttcgtggaattaccagttttggggctggaagtaacgatcctctttgggtagttgacgga
attgttgttgataatatcggctggctaaaccaatctgatattgaaggaatggagattctt
aaagacggtgcatcagctgctatctacggagtttctgctgcaaaaggtgttgttttgatt
actaccaaaaaaggtacaaaaggaaaactgggcatttcttacaacggattttttggggtt
ggtagtgctgccaacaagcttgatcttctgaatggaaatcagtacgcaacaattcgaaat
gaagcaaataccaacgatggccgcgcacctatatttgcaaatgctggatcatatggaaat
ggaacagattggcaaaaagcaatttttaatagtgcacagcgtcagtctcatgaatttagt
atcaacggtggaagtgagaaatcaacgtattatgcgtcttttggttattatgatcaagag
ggtattgtattgagagatatttcaaattacaagagaatcaatgcaagattgaactcaaat
cataaagtattagactttttaactgtagggcagacttttgcttatacacatacaaaatct
gcggggatcaatgcaaatggtgaatttggaggtccattaagttctgctattaatcttgat
ccactaacacctctagttgttacagatggagttaataatcagccttttccaagtgattat
ctaaataatccgaacatcgtaagagatcaaaatggaaacccatatggaatctcgcattat
gtgagtaaagaaatgtctaacccattggcttttcaacaaacacaattaggaaaatacaat
tggacagatgatattattgccaacgtttatgctgatttaaaaattaataaaaatattagc
tttaaatctacagtgaacggaaagctttcttattggggaagtcaagcttttactcctgta
aattatttaagttctgctactaaaaatgattttaatactttattcagacaaattgagaaa
aaatttgaatggagcacagaaaatacagttacttaccaaaacaaattcggtcaacataac
ttaaatgtattattgggacagggatattacgaatataatatttcttcaggtcaaaatact
acctataaaaatcttccgacaaacgattggcaggaggcttcatttaactttgatattcca
cagactgacagagctaccaatgcttgggatggaaaggaaacacataaaacatcatatttt
gcaagagtagtatatgattatgctaataaatatcttttcacaggtactatccgtagagat
ggttcttccaaattcgcaagagattatcactggggaaattttcctgcaatgtctttaggc
tggaatgtatctaatgaagatttttggccagaaaataacgtagtaaatagctttaaatta
agaggtggatatggaatattaggaaatgatgctatcgataatttccagtatgccaatttc
ttgattcctggaagtaattatacatttggagatgatgttattcacataggatatgctcca
agtacattagaaaatcctaatttgaaatgggaaagaacttctcagttgaatattgctgcc
gatcttaaaatctttaaaaatttcgatttatcagtagatgtttacagaaaaaagagtacg
gatattttaagaagaattgatcttcctgggtacattggtttaatcaataacccatggaga
aacattggagacatgaataatgatggggtagaagtaagcttaggatacaaaaagaactgg
ggagattttggattctcagcgaatggtaactttgcttatctgaaaaatgagattacaaga
ttagaggatgataaaccatatgtaaattttgcatcatttcagtcaatgggagccgtttca
agattacaggttggttcttcttatggttctttctatggattccagaatttaggtgttttc
cagaatcaagcggaaatcgatgcttataaaaatgctaatggtggactaattcagggcaat
gctaaaccaggtgattttaaaagactggatgcgaatggagatggtaaaattgatgagaat
gactatgtaaatctgggtaattctgtgccaaaatatacttttggattaacattgaatatg
aattacaaaaactttgatctaatgatatttgctcaggggcaggccggaaacaaaattttc
caaggtctgagaagattggatatcccggaagccaattatcagacttcaattttagatcgt
tggacaggtgaaggaacttctaatactatagcaagggtaagtcaggatgacccaaatcaa
aactatacaagaatgtctgactattacctacaaaaaggagattatttacgtctaaaattg
gtacaggtaggatatacacttccaaaagaagtatctcaggcgattggtgcaagcaaagtg
agattctatgttacaggagagaatttggttactttcacaaaatatacaggatatgaccct
gaaattgcaggtggtgatactttcggtattgacagagcttattatccacaatccagaacc
ttccttttcggagctaatgttcaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
