Cryptosporidium hominis: Chro.80130
Help
Entry
Chro.80130 CDS
T00210
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14544
U3 small nucleolar RNA-associated protein 22
Organism
cho
Cryptosporidium hominis
Pathway
cho03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cho00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
Chro.80130
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
cho03009
]
Chro.80130
Ribosome biogenesis [BR:
cho03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
Chro.80130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Nrap_D4
Nrap_D3
Nrap_D5
Phage_TAC_17
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3412100
NCBI-ProteinID:
XP_665453
LinkDB
All DBs
Position
8
AA seq
742 aa
AA seq
DB search
MLTLLEFDSCIMISYPNSFHNIQLSYLISPDNNIPKEISLGEDSNPKTIKRNFDSIWENC
QSSNLVEITRRILIRSYTDRVKNINLREIVSKEKFGCIIGIQFASKITRSIDKGPFVDTF
EAKLFKEFWGNDKIETRRFRDGTVLETLIWNNEIDSNNEFITNKGINEDILRYTLSRHLP
QVKLNSESITGTKDNNNNNITYSMTPFGSINPYLSREKNVHEEFSNFKSIITGLTSLPLS
IKSIQSSNSILRFMKFYTNLNSDLNEGEEIQCVIEMEQSNKWPKTKESIEKIKIAFLLSI
QKELGELHSISSDIIPEYNYLEGTDNPDLKGFAPFLDVYWKGDITFRISIFHPTELEQIA
KITIEPENMSEKVIEENIKFPQENLSQLRNLWWKTXTGAKLLNLSNYFPSLRQTIKKLKQ
FASVNKIPDSQEFLEHVAAYVYTNNDLMNSIYKVPGTSTTGFLRSLWLISRFDWEKKPLI
VDFDFQINEDSEIKRISTPEFQKLDQIHSIQYNYIKKHKLPKNFFYVSSQYDPQSLLIKL
PSFYNSTRLVHFSKLYINIIVYQNSFNLPIKEIKSSFLTQPKNDIVICLQQDYMSLINPQ
SKKFKSSNVLALKKQYVNLNSTQELLSNCNIKASPYNVAREIFESFILEIKSLWNHQVDI
IYDSYVLPYPEKIYLKVRTSQFFPSKITESQNKKRKNYLPGCIISYSNNSTGNYNIFTIP
NLPLILSTIWSRYSGFITDIQI
NT seq
2229 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttacgttattggaatttgattcttgtataatgatatcttatccaaattcttttcat
aatattcaacttagttatttaatttcaccagataacaatattccaaaagaaattagttta
ggtgaagattcaaatccaaaaactatcaagagaaattttgattcaatttgggaaaattgt
cagagttcaaatttggttgagatcacgagacgaatcttaattagaagctacactgataga
gtcaaaaatataaatttgagagaaatagtctcaaaagaaaagtttggatgtatcattggt
attcaattcgcttcaaaaattacaagatctattgataaaggtccttttgttgatactttt
gaggcaaaattatttaaagaattttggggtaatgataaaattgagacaagaagatttaga
gacggtaccgtattggaaacattaatttggaataatgaaattgattcaaataatgaattt
attacaaataaagggattaatgaagatattttgagatatacattaagtagacatctccca
caagttaaattaaattcagaatcaataactggtactaaagataataataataataatata
acttattctatgacaccttttggatctattaatccttatttaagccgagaaaaaaatgta
catgaagaattttccaattttaaatctattattactggattaacttctcttcctttaagt
attaaatcaattcaatcatccaattcaattttgagatttatgaaattttataccaactta
aattctgatctaaatgaaggagaagaaatacaatgtgtaatagaaatggaacaatccaat
aaatggccaaaaacaaaagaatctattgaaaagattaaaatcgcatttttattatcaata
caaaaagaattaggagaattacattctatttcttctgatattataccagaatataattat
ttagaaggtaccgataaccctgacttaaaaggttttgctccatttttagatgtatattgg
aaaggagatatcacttttagaattagtatatttcatccaacagaattagaacaaattgca
aaaattactattgaacctgaaaatatgtcagaaaaagttattgaagaaaatattaaattt
ccacaggaaaatctttcccaattacgtaatttgtggtggaaaacacanactggagcaaaa
ttactcaatctaagtaattatttcccttctttaagacaaactattaagaaattaaaacaa
tttgcctcagttaataagatcccagattctcaagaattcttagaacatgttgctgcttat
gtatatacaaataatgatctaatgaattctatatataaggtacccggtacttctactact
ggatttttaagatctttatggctaatttcaagatttgattgggaaaagaaaccattaata
gtagattttgattttcaaattaatgaagattctgaaattaaaagaatttctactccagaa
tttcaaaagcttgatcagattcattcaattcagtataattacattaagaagcataaatta
ccaaagaattttttttatgtatcatcacaatatgatccacaatctttgttgattaaacta
ccaagtttctataattctactagattggttcatttttcaaaattatatattaatattatt
gtttatcagaattcattcaatctaccaattaaagagattaaatcatcattcttaactcag
cctaaaaacgacattgttatttgtcttcaacaagattatatgagtcttattaatcctcaa
tcaaaaaagtttaaatcttcaaatgtactagcacttaaaaaacaatatgttaatttgaat
tctactcaagagttattaagtaactgtaatatcaaagcttcaccttataatgttgctaga
gagatttttgagagttttatattggaaattaaatcactttggaatcatcaagttgatata
atttatgattcttatgtacttccttatccagaaaagatttatcttaaagtaagaacaagt
caattctttccttcaaaaattactgaaagccaaaataaaaaaagaaagaattatcttcct
ggttgtattatttcctattctaataattccactggaaattacaatattttcacaatacct
aatttacctcttattttaagtacaatttggagtagatattccggttttatcactgacata
cagatatag
DBGET
integrated database retrieval system