Chondrocystis sp. NIES-4102: NIES4102_30070
Help
Entry
NIES4102_30070 CDS
T05085
Name
(GenBank) glycosyl hydrolase 38 domain protein
KO
K01191
alpha-mannosidase [EC:
3.2.1.24
]
Organism
chon
Chondrocystis sp. NIES-4102
Pathway
chon00511
Other glycan degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
chon00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
NIES4102_30070
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
chon04131
]
NIES4102_30070
Enzymes [BR:
chon01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.24 alpha-mannosidase
NIES4102_30070
Membrane trafficking [BR:
chon04131
]
Autophagy
Cytoplasm to vacuolar targeting (CVT) pathway
Selective cargos
NIES4102_30070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_38N
Glyco_hydro_38C
Alpha-mann_mid
Glyco_hydro38C2
Glyco_hydro_57
DUF2685
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ45979
LinkDB
All DBs
Position
complement(3432091..3435246)
Genome browser
AA seq
1051 aa
AA seq
DB search
MQIIDQFVAKLRHQVKLEIQQCWYDVTGLDIDVKKTRIDLKQYQYAQLNDKNYLVFAQGR
QVKYLAQKIVIPSTLAGYPLSGLNLRLVLTWWAEDAQIFINGELKQQGDLFDSSARVLIT
NNAQPGEEYLVIIRLVSPNHDIGALMRSHLLYEQPFDVDDLDPGLVADEITVLAKYLSQF
EPQHLNVLAGALDKFDWNNLANANRFVYDLGKLRSSLLSLGINIKQRCFNLLGHAHLDMA
WLWTTAETYEIAQRTFKSVLSLQQNFPNLIFGHTSPALYEWMEENNPHLLEEIRQAVDLD
RWELLGGMWIEPETNLISGESLIRQLLYGQAYYQKRFGKISTVAWLGDSFGFTWQLPQIL
KQCGIEYFVTGKLHWNDTTKFPLGCFWWESPDGTRLLTLMSPPNVTGVMDTNPLTMANYA
IDWEIQTGLQEIFWLPGVGDHGGGPTRDMLEVASKWSNSPFFPEIKFSRASDYLEVVKGH
DNSSDFPIWQDELYLEFHRGCYSSHADQKKYNRFSERLLYEGELWATLATLLCRDRFVGQ
PLFPIINRISEKEGLCQVGWQELIDIAWKKILFNQFHDILPGTSIPDVYIEANEQWEAAL
EIGNSVLQAALRAIALNLKLPQPPQADASALVIFNSLNWQRSQIVTVPAKQCSVYNHLGE
IVVSESTADEQIIFLAENIPAVGYSLFWLCPKKSPPEKQSIKLQEYILENQYLRVTINQD
NGNLDSIYDLKNQREILSGQGNELQNYQDQGQYWDAWNIDPNYQQKRLDDWQLKSINWLE
TGKLRQTIRVIKQFGQSQFTQDYILHKDSPLLTIKNQVDWQQTHIMVKTAFPFQINSDLV
TYEIPCATITRTTNPKTAAEAAKWEVSALNWADLTDNQGEYGVSLINDCKYGYDAQAQQL
RLTLLRSPTWPDPQSDNGRHNFSYAIYPHKSNWQTAKTVQKGYEFITPLQIIKLNPDEFN
SGGQLPPMSELLNLTANNLILMALKPLNTQELVMRFYEAEGKTSELEISSDLKIKLIKKV
DCLERNQDLPSNQDKKVEPYKIITWVLKIDE
NT seq
3156 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagataatagatcaatttgttgctaagttacgtcaccaggtaaaattagaaatacag
caatgttggtatgatgtaacagggttagatattgacgttaaaaaaacgagaatagattta
aaacaatatcagtatgcccagttaaatgataaaaattatttagtttttgcccaaggaaga
caagttaaatacttagcacaaaaaattgttattccttctactttagcaggatatccttta
tcgggattaaatttacgtttggttttaacctggtgggcggaagatgctcaaatatttatt
aatggagaattgaaacagcagggagatttatttgattcttcagcacgggtattaattaca
aataacgctcaaccaggggaagaatatcttgttattattcgtttggttagtcctaatcat
gacattggcgcattaatgcgatcgcacttattatatgagcaaccttttgatgttgatgat
ttagatccaggtttggtagctgatgaaattactgttttagctaaatatttaagtcagttt
gaacctcaacacctgaatgtattagcaggggcgttagataaatttgattggaataatttg
gcaaatgccaacaggttcgtttacgatttgggtaaattgcgatcgagcctattatcttta
gggataaatattaaacagcgttgctttaatttactcggtcatgctcacttagatatggcg
tggctctggacaactgccgaaacttacgaaatagcccagcgtacttttaaatctgtactt
agtttacaacaaaattttcctaatttgatttttggtcatactagcccagctttatatgaa
tggatggaggaaaataaccctcatttgctggaggaaattaggcaagctgttgacttggat
cgctgggaattgttggggggaatgtggattgaacctgaaactaatttaattagtggcgag
tctttaattagacaattgctatacggacaagcatattatcaaaagcggtttggtaaaatc
tctacagttgcttggcttggtgatagttttgggtttacttggcaattaccacaaatatta
aagcaatgtggcattgaatattttgttacaggtaagctgcactggaatgatactactaag
tttcctttgggttgtttttggtgggagtctcccgacggcacaaggttattgacgctgatg
tctcccccgaatgtaacaggggtgatggatactaacccgctaactatggcaaattatgct
attgattgggaaatacaaacaggtttacaagaaattttttggctaccaggagttggcgat
catggcggtggcccaactagagatatgctagaagttgctagtaaatggagtaattcgccg
ttttttcctgaaattaaattttctcgggctagtgattatttagaagtagttaaaggtcat
gataattcctcagattttcctatctggcaagatgaactatatttagaatttcaccgtggt
tgttacagtagccatgctgatcaaaaaaaatataaccgttttagtgagaggttgttatat
gagggggagttgtgggcaactttagcaactttactttgtagagacaggttcgttgggcag
ccactatttcccattataaacagaataagcgaaaaagaaggtctttgtcaagtagggtgg
caagaattaatagatattgcctggaaaaaaatcctatttaaccaatttcacgacatctta
cctggtacatcgattcctgacgtatatatagaggcaaacgagcagtgggaagcagcttta
gagattgggaatagtgtattgcaagcagctttaagggcgatcgccttaaatctaaaatta
ccccaaccaccccaagcagatgcttccgcattagttattttcaactctttaaattggcag
cgatcgcaaatagtaacagttccagcaaagcaatgtagcgtttataatcaccttggggaa
atagtagtatctgaatcaacagcagatgaacaaataatatttttagctgaaaatatcccc
gcagtcggatatagtttattttggctgtgtcctaagaaatcgccaccagaaaaacagtca
attaaactacaggaatatatcttagaaaatcagtatttacgagtaactattaatcaagat
aacgggaatctagatagcatttacgatctaaaaaatcagcgagaaatcttatcaggacaa
ggaaacgaactacaaaattaccaagatcaaggacaatattgggatgcttggaatattgat
ccaaactatcaacaaaaaagattagatgactggcagttaaagtcaataaactggctagaa
acaggaaaactaagacaaacaattagggtaataaaacagtttgggcaatcacaatttacc
caagattatattttacacaaagactcacctctactaacaattaaaaatcaagtagactgg
caacaaacccatataatggtaaaaactgcttttccatttcagattaatagtgatttagtt
acctatgaaatcccttgtgcaactattactagaactactaaccccaaaacagcagcagaa
gcagcaaaatgggaagtttccgcgttaaattgggcagatttaaccgataatcagggagaa
tatggtgtaagtttaattaacgattgcaaatatggttatgatgctcaagcgcaacaatta
cgcctaactttattaagatctccaacttggccagatcctcaaagcgataatggtagacac
aattttagttatgctatttatccccataaatctaattggcaaacagcaaaaactgtacaa
aaaggatatgaatttataacccctttgcaaataataaaattaaatccagatgaatttaat
agtggaggacaattaccaccaatgagtgaactattaaatttaacagctaataatttaatt
ttgatggcgttaaaaccacttaatacacaagaactagtcatgcgcttttatgaggcggaa
ggcaaaacaagcgagttagaaattagtagtgatttaaagataaaattaattaaaaaagta
gattgcttagaacgaaatcaagatttaccctccaaccaagataaaaaagttgaaccatat
aaaatcataacctgggtgttaaaaatagatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system
