Chondrocystis sp. NIES-4102: NIES4102_33440
Help
Entry
NIES4102_33440 CDS
T05085
Name
(GenBank) response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase
Organism
chon
Chondrocystis sp. NIES-4102
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Response_reg
Ig_NUP210_4th
DUF1815
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAZ46314
UniProt:
A0A1Z4RV23
LinkDB
All DBs
Position
3799225..3801105
Genome browser
AA seq
626 aa
AA seq
DB search
MNSPAVIPQNILIVDDIVDNLRVLSQTLNEQGYKIRCAKNGVTAIKAASMVIPDLILLDI
NMPDMNGYEVCQRLKAQVETQDVPVIFLSALDDVLDKVKAFEVGGVDYITKPFQVEEVLV
RVKNHLALQSAKAEVFGLNQILEQKVKERTIQLKIANEQLAATNEQLTQEILERQKAEKR
LIQDALYDSLTGLANRTLLMERIDFTLSRAKRNPNYLFALLFIDLDRFKIINDSLGHLVG
DKLLIAIAKLLQEGLRDVDTVARLGGDEFVILLDDIHDLKDATKVGDRLQEKLKIPFNFK
GQTIVTSASIGIVLSSGGYNNSSQILRDADIAMYRAKEKGKARYEVFDRDMYLQTLKVIE
LERDLRLALSKQEFSLHYQPIVSLNKNTLAGFEALLRWHHPRIGLISPKEFIPIAEDTGL
ISSIGDWVLFQACQQLATWQKDYVHIPEIASLKISVNVVSQQLQEPEFIAKLDDILQQTG
LDSSCLRLEITERVLVDSGINTQNTLLEIKKRKIKLSIDDFGTGYSSLSYLRRLPIDNLK
IDGSFVEGINKDVEDLEIVKTIITLAHILGMDAIAEGVETIEQVRQLRDLGCEFAQGYLF
SKPLEPKVINSLLYNSFTKEFFPHYK
NT seq
1881 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcacctgctgttatacctcaaaatattttaatcgttgatgatattgttgataat
ttacgagttttatcccaaacactgaacgaacaagggtataagatacgttgcgctaaaaat
ggtgtaacagctattaaagctgccagtatggtaattccagatctgattttactggatatt
aatatgccagatatgaatgggtatgaggtgtgtcaacgattaaaagcccaggttgaaact
caagatgttcccgtaatctttttgagtgctttggatgatgtgttagataaggttaaagct
tttgaggtgggcggagttgactatattactaagccttttcaagtggaggaagttttagtt
agagttaaaaatcatttagctcttcagtcggctaaagcggaagttttcgggttaaatcag
attttagaacagaaggttaaggaacgaactatccagttaaaaattgctaatgagcaacta
gcagccactaatgagcagttgacacaggaaatcctcgaacgtcagaaagcggaaaagaga
ttaatccaagatgcattgtatgatagtttaactggtttggcaaatcggactttactgatg
gagagaattgattttactctttctcgggctaaacgcaaccctaattatttatttgcctta
ttatttatcgatttagatcgctttaaaattattaatgatagcttggggcatttagtaggg
gataaactattaattgcgatcgctaaattacttcaagaggggttacgtgatgtggatact
gtagctcgtctgggaggggacgaatttgtgattctcttagatgatatccatgatttaaaa
gatgctacaaaagtaggcgatcgcttgcaagagaaactcaagataccttttaattttaaa
ggtcaaactattgttacctctgcgagcattggaattgtacttagttctggcggttataat
aacagttctcaaattctacgggatgctgatatagctatgtatcgggcaaaggaaaaaggt
aaagcccgttatgaagtatttgatcgcgatatgtatcttcaaactcttaaagttattgaa
ttggagcgtgatttacgtttagctttatcgaagcaagaatttagtttgcattatcaaccg
atagtttccctcaataagaataccttagcagggtttgaggctttattgcgttggcatcat
ccccgcataggtttgatttctcccaaggaatttatccccatcgccgaagatacaggcttg
atttcttctattggtgactgggtattattccaggcttgtcagcaattggcaacttggcaa
aaagattatgttcatatccctgaaattgccagcttaaaaattagtgttaatgttgttagt
cagcaacttcaagaaccagaatttattgctaaattagacgatatattacagcaaactggt
ttagattctagttgtctgagattggaaattactgaaagggttttagtagattcgggaatt
aatactcaaaatactttattagagattaaaaaaaggaaaattaaactcagtattgatgat
tttggcacggggtattcttctttgagctatttacgccgtttacctattgataaccttaaa
attgatggttcatttgttgaaggaattaataaagatgttgaagacttggaaattgtcaaa
actatcataaccctggcgcatattctgggaatggatgcgatcgctgagggagttgagacg
atcgaacaagttaggcagttaagagatttgggttgtgaatttgctcaaggttatttgttt
tctaaacctttagagccaaaagtaattaattcactgctttataatagttttactaaagag
ttttttcctcactataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
