Chryseobacterium sp. PMSZPI: ACL0VS_02080
Help
Entry
ACL0VS_02080 CDS
T11402
Name
(GenBank) RHS repeat-associated core domain-containing protein
Organism
chrr Chryseobacterium sp. PMSZPI
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XNN38694
LinkDB
All DBs
Position
461897..472168
Genome browser
AA seq
3423 aa
AA seq
DB search
MKINIKRLPFTKKPILLVCFFACMFVFASFTRRDRDRVREFKKELMSRWKKDRTQKLLTE
DPPHQNQTEENVLAKEDKMLLKSILESDTHPATDLVQNTVIPTSFSEEPLSIETISHEAR
EKQGTIGTFSENEEDRISDNFFTVDLSSGAKENVPAYLEYDLFGLASHESVPRSVNRNIA
VGGEIIVPNTSWTHQREEISSALLHTGVNTVMFSSPSAGIKYKVKNLKITFGKNHKTGNH
FNISTILSGDKLYIKGNNISSGNVIINTEQVATQNGEFEKTITLSEKDKAAGTFTLSSGG
VTEAFKIPAETRSFKISADNYATAKSIDILKDKEYSFTYENLGVAIEKESTEAAAVQFLK
LRTKDFPSTSNGVKNITPEVSAYRFSVVSGKLNKKVKLTIPYDEKRLGLVSPKDIKTFYF
DYNKKQWIVEKSAVVDTKTKTVTIESSGDNDYINGIISVPESPQTNAFAPTSISGLKAGD
PTSAVQFVKPPSASQKGDANVSYPIVIPSGRKGMQPSLSVAYSSSNGNGWLGEGWDVSGL
SSITIDTRWGSPVFSPSDETELYSLNGEMLVYDGSYLPHRHNDIDETSGIYTTNKQKRTD
NFANNKKVFFLRRNHDFTKIERYGSSPANYRWVVTGTDGMKTYYGGDENGVDAQSVITNP
AGNIVHWGIWKVEDPNKNNIKYVYDNVSPGGFSGDNANLNGGRVFHIKSIIYTGYDGANG
LYSVDFERETSVTRQDISINAKQGVKRIEPYKLNKIYVRYNGQLIRSYQMNYTTGQFYKT
LLQSIQELDQNGGIASRHDLEYYDDLKTTGANFTADKDVNASIADAFPYLPASLTPSKIQ
ANSSFEWGINGRIPGVGISILWPTQNPFGHFQVSGLFGFTKAEAKNAQNLIDFDGDGIQD
IVYRKPSDGLYVSSGSLANGNLTFTSPKKIINLQSNFSFTTTKTDNKGIDFGAKIFGIGY
NRSLVWSVSRSTTPVYMTDANSDGLMDVVKDGEVWFNKLSGGTPEMTKYSDQTENMVLVA
DAVVEHHEPEPEEELPPSKINVLKVWVAPKGGYIKITDNVSIENVANAKALYSIEIQDNF
ALGADIVRNGRLYMKTLTAGMPVQNITINRVNDYFNDIQALPPTNPNNHWGMNKSDRVWI
GEGAKLYFRLHKEPEKNFKVFSDPKVVYVDQNTGQELPNNPADEQDGFYLNNSGSYSQNF
LLNNRANFANFDAPGSVTVTVPAITFPKITDVIKFKVVKIDVNTDTESIVYSDTYQPSTI
PVTIPGYTLNYTVNAGEPMRLKFVVESDSHTLFKDSNWNNIDIKYVATANNTTNTVNFKG
VAQYPTFEWTQRYPKPDVNGFQSIFPGVHTFGISINKDGQANADFYYIVKKGDQVLAKRR
VKNQPNSPYISEYDMLNNNQLINGYMPINYHTGDPQQLVPADQRISIIIYTETQEQYLSA
IMFTGRGSGTAGPFRFFVDNSITQYSTNTTFILRRGITTKTPLYHNWGQILYDENNDVVP
GTTANTYVLNPQTPSDNYGRLINIKTVENINVPSLNGVNYPACQNLPTQQEIAQCIANQI
NQPNSPYQTGAFNLDPVIPMTTKKLNNVEKWVGLGPEQYSMADSFKNDQETTDLFDPNGG
NPDMPDTVVQGQVDTKMYAIDKKHYSRAKTTTDSGSFIVVSAGNSSSHLEGQGSIDQQDY
MDLNGDGYPELVYPTATQRTNSTGGLGGLMPAYANGNLTNTDSYQNSVSISFSPNSHKTV
GRTKINGNSITTTQADTSTAWSGTGLSANYDAKDVGESYWLDVNGDGLPDRITGGGTSNM
RYALNMGNALATPESYANLQTYASRPVGSAGLSFSTGAFSQMADFNSGASSGFGISGSLS
ASASLGTAERVFEDINGDGLVDILNVSSSSTTVNYNLGNKFAAPVQLYKSGGGIDFNNEA
KTYSGGFTLSGYYYYNIPIVFFFFVPVIYLKLGAEASANIGLSIAEVDKSFKDMNGDGFP
DLVISKNDGFKVNYSNIGKTNKLKSVASIYNRMPLNKFVIDYKFTQPNYNDPHGRLVMSE
SRIINPDVNSGNYLITNPAKDMVTQFDYGTSRYDRRERDFFGFDTVTSKEMEGSSVYRSS
RETFYNNSYFLNGILKKTEVFGGTSNLLSVNEKIYKLYKFKNNNTQLNPTPVADTFDTGG
REGRKMATALLDNTKNIVYENGGSIQSTTQLTYNSKGQVVTYVYQSPSSPYHTVIDYHTG
LARNMIDIPSKIDVYYGATGNSLLRHRETTVDNATGNIVKVNVKLNYYQNAVTSMKYDPF
GNISQITYPPNEANEEYTLDYVYDHIQSKYLTSTSDSFGLTSATIYDQMFDTLIGSIDTA
GNTISYQYDQRGRLISILAPNEQANGAPYTVSYEYFMSPFLAASNNEQRHLFGAVTRNYD
PEHPQNPIETISIADGLGRVVQVKKDLEIDAEEKMSVSGMAIYDIHGRVVKQYHPVSEAK
STLAITDSNNPNAKLNLGLSGYYASTAYDALDRPIQQTDEDSHSTDTKFSITGGNLKTSV
TQMQNTSVQLISESLKDAEGKIVQTSNYIGGQPLNTKYYYYPLDQLYMVEDAEGITTSYE
YDLAGRRTRVNHPDHSTTKYEYDLAGNLVRLGTANLDGDPNISDPFIKYKYSYNRLMEIK
FPPLANGYGNPSNVRYVYGAANSGNQTGRLIQKYDNTGDTIFKYGMLGEVIEENRSVYPY
VSQAMNFVTKYTYDSWNRIKELRYPDGEKLMYEYDLGGNLKRISNDGGYEYVRNITYDQY
EQRTFIDFGNDTNSSFEYLPTNRRLAFHSLKNNGGNEILANVYKYDFVGNITSMYNKAPK
SSNEMGGPYQFKYSYDQLNRLRDSGGDFNSGGSPYAINKSNYELALAYNASSGIQQKTQR
HTQDGAWNHDNTYDSSYNYIKGTHKIDTIYDSGGLSDSFEYDYNGNPVAHNDSKTGTEHM
YWDEQDRLKAYYAPEKGTFQYYAYDDNSERIIKYNLKDQANLYQNGALISSGFSFDAYKL
YPNAYISVGSNNQYTKHYYAGTQRIAGRIMEGTKKFVMDATPYRMKQDKKEEVKQVNPET
DFKDYLTKAGLDINDITTELSMKTVSQPDVYYLHGDHLGTATFVTNSNSETIQFFLNLPF
GETMAEQMTGVHDNPYKFNAKELDAETGLYYYGARYYNPKLSAWYGVDPLAEDYPSWSPY
VYTLNNPIKYIDPDGKSVWPPAKGTEGQRLSDGDGDFIYTGGKWYRDNGAFIGAFTNRYD
SVGGGGGSSSYDGKSMLPSSNYDYTYDIMPGKQADDIKYWKNGESGTMASRFLETTARDA
IAKENRTTTIEMAATIFTTPRGGGARSSTGKYTEPQLPNKTIVDERGITVEHYYKSGDHA
PTHFHVKGGGTSTKIGANGKPIKGSAELSKAQQTVIENNKSAIRSAGKKLNNYQKFHNYY
KNK
NT seq
10272 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataaatatcaaaagacttccttttacaaagaagcccatacttttggtgtgcttt
tttgcctgcatgtttgtctttgccagctttacacgcagggacagagatcgcgtgcgcgag
ttcaagaaggagctcatgagcagatggaagaaagatcgaactcagaaacttctgactgaa
gatcctcctcatcaaaatcagaccgaagagaacgttctggcaaaagaagataaaatgctt
ttgaaaagtattttagaatccgatactcatccagctactgatcttgtacagaatactgta
atacctacttctttttcggaagagccgctttctattgaaaccatttcacatgaagcaaga
gaaaagcaaggaaccataggaacattctctgaaaacgaagaagatcgtatttcggacaat
ttctttacagtagatctatcttccggtgctaaagaaaacgtaccggcttatcttgaatat
gatctttttggacttgcttcacacgaatcggttccaagatctgtcaaccgtaatatcgct
gtgggaggagaaattatcgttccaaacacttcctggacacatcagagagaagaaatcagc
tctgctcttttgcacacaggagtaaacaccgttatgttttcttctccttcagcaggaata
aaatataaagtaaagaaccttaaaattaccttcggcaaaaaccacaaaaccggaaatcat
tttaatatcagtacgattctttctggtgataaactatatatcaaaggaaataatatctcc
tctggaaatgttattatcaatacagaacaggttgctactcagaacggagagtttgaaaaa
accatcaccctttctgaaaaagataaggcggcaggtacctttactttatcttcaggaggc
gtaacagaagcatttaaaattcctgctgaaacacgttcttttaaaatctctgccgataac
tatgctacagcaaaaagcattgacattttaaaagataaagaatatagctttacttacgaa
aatcttggtgtagctattgaaaaagaaagtacagaagcagcagccgttcaatttttaaag
cttagaacaaaagatttcccttctacttctaatggcgttaaaaatattactcctgaagtc
tctgcttacagattttcagtagtatcagggaaattaaataaaaaagtgaagcttactatt
ccttacgatgaaaagcgtttgggattggtttcgcctaaggatatcaagactttttatttt
gattacaataaaaagcaatggatcgtagaaaagtctgcggtagtggataccaagacaaag
acggttactattgaaagtagtggtgataatgattatatcaacggaatcatttcggttcct
gaatcccctcaaacgaatgcatttgctccaacaagcatcagtggacttaaagctggtgac
cctacttctgctgtacaatttgtaaaacctccttctgcaagtcagaaaggagatgcaaat
gtatcctaccctatcgtaatcccatcaggaagaaaaggaatgcaaccttctctatcggta
gcttatagcagtagtaacggaaacggatggcttggtgaaggttgggacgtcagcggattg
tcttcaattaccatcgatacaagatggggaagcccggttttcagtccttcagacgaaaca
gaattatattctctaaatggcgaaatgttggtatatgacggaagctaccttccccacagg
cataacgacattgatgaaaccagcggtatatataccaccaacaaacagaaaagaacagac
aattttgccaacaacaaaaaagtctttttcttacgaagaaaccatgattttacaaaaatc
gaaagatatggttccagccctgcaaactatcgatgggtagtaactggtacagacgggatg
aaaacctattacggaggtgacgaaaatggagttgatgcacaatctgttatcacaaatccg
gcaggaaacatcgttcattggggaatatggaaagtagaggatccaaacaaaaacaatatc
aagtatgtctatgataatgtttctccaggtggtttctcaggagacaatgccaaccttaac
ggaggacgtgtatttcatatcaaaagcattatttatacagggtacgacggtgccaatggt
ctttatagcgtagactttgaaagagaaacgtcagtaacaaggcaggatatcagcatcaat
gctaaacagggagtaaaaagaattgagccttataagcttaataaaatctatgtaagatat
aacggtcagctgatcagaagttatcagatgaattataccaccggtcaattttacaaaaca
cttcttcaaagcattcaagaactcgatcagaacggcggcattgcttcccgacatgatctt
gaatattatgatgacttaaaaactacaggagccaactttacggcagataaggatgtcaat
gcaagtattgcggatgcattcccttatcttccggcatctcttactccttctaaaattcaa
gcgaattcatcatttgaatggggaatcaacggaagaatcccgggcgtaggaatcagtatt
ttatggccaacacaaaatccttttggacattttcaggtatcagggttattcggttttaca
aaagccgaggcaaaaaatgcccaaaatctaatagatttcgatggagatggtattcaggat
attgtatatagaaagcctagcgatggtttatacgtaagttcaggaagcttagctaatggt
aatcttaccttcacctctccaaagaaaatcattaacctacagagtaatttctcattcaca
acaactaaaacagataataaaggaatcgatttcggtgccaaaatttttggtatcggatat
aatagatcccttgtatggtctgtttccagaagtaccactccggtttatatgacggatgcc
aattcagatgggctcatggatgttgtaaaagacggagaagtatggtttaataaacttagc
ggagggactcctgagatgacgaagtacagtgatcagacagaaaacatggttcttgtggct
gatgctgtagtagaacaccatgaacctgaacctgaagaagaacttcctccttcaaagatc
aatgtgctgaaagtatgggttgctccaaaaggaggatacattaaaattacagataatgta
agtattgaaaatgtagctaacgccaaagctctttactctattgagatacaagataatttt
gctcttggtgctgatattgtaagaaatggaaggctatatatgaaaacgcttacagcagga
atgcctgtccaaaatatcactataaacagagtcaacgattatttcaatgacattcaggca
ctaccaccaacaaacccaaacaaccactgggggatgaataaaagtgaccgtgtttggatt
ggagaaggagctaaactctatttccgtcttcataaagaacctgagaaaaacttcaaagtt
ttttcagatcctaaggtcgtatatgttgatcaaaatacaggacaggaacttccaaacaat
cctgcagatgaacaagacggtttttatttgaataattcaggatcatactcacaaaacttt
ttgcttaacaacagagctaattttgccaactttgatgctccgggaagcgttacagtcacc
gtaccggcgataacattcccaaaaatcacagacgtcatcaaatttaaggtggttaaaatt
gatgtcaatacagacacagaaagtattgtctattcggatacgtatcagccaagtacaatt
ccggttaccattccgggttacacattgaattatacagtgaatgcgggtgaacctatgaga
ttaaagtttgtggtagaatcagactcccatactttattcaaagacagtaactggaacaat
attgatattaaatatgttgctactgccaataacactaccaatactgttaacttcaaagga
gtggctcaataccctactttcgagtggactcaaagatatcctaaaccggatgttaatgga
ttccaatcaatttttccaggagtccacacttttggtatttccattaataaagatggacaa
gctaatgctgatttctattatattgttaaaaaaggagatcaggtattagcgaagagaagg
gtaaaaaatcaaccgaattcaccgtatatatcggaatatgatatgctgaataataaccaa
ctcattaatggttatatgcccatcaattatcatacaggagatcctcaacagttggtaccg
gcagatcaaagaattagtatcattatatatacagaaacgcaagaacaatatttatcggct
attatgttcaccggacgaggttccggaactgcagggccgttcaggttcttcgtagataat
tctattacacaatattcgactaacactacctttatacttaggagaggtatcactacaaaa
acgccattatatcacaactggggacaaattctatatgatgaaaataatgatgtggttccc
ggaacaacggctaacacctatgtattaaaccctcaaacccctagtgataactatggtaga
ttgattaatattaaaacggttgaaaacattaatgttccaagtttaaatggagtcaattat
cctgcttgtcagaatcttccgacacaacaggaaatcgcacaatgtattgccaatcagata
aaccagcctaacagcccatatcagactggtgcctttaaccttgatccggtgatcccaatg
acgacgaagaaattaaataatgttgaaaaatgggtaggattaggacctgaacagtactca
atggcggattcatttaaaaatgatcaggaaactacagatttatttgatcctaacggcgga
aacccggatatgccggataccgtagtacagggacaggtagatacaaaaatgtacgctatt
gacaaaaagcattacagcagagctaaaacaactacagacagtggatctttcattgttgta
agtgcaggaaattcttcttcacatcttgaaggacaaggaagtattgaccaacaggattat
atggacctgaacggtgacggatatcctgaactggtttatccaacagctacgcaacgtacc
aattctacaggaggactaggaggacttatgcctgcctatgcgaatggaaaccttaccaat
actgacagttaccagaactctgtttctatcagtttttcaccgaacagccacaaaacagtg
ggacgaacaaaaattaatgggaattccatcacaactactcaggcagatacttctacagct
tggtcagggacaggacttagtgccaactatgatgctaaggatgttggtgaatcttattgg
ctggatgtgaatggcgatggtcttccggacagaattacaggcggaggaacttctaatatg
agatatgccctgaatatgggtaatgctcttgcaactcctgaaagctatgctaatctacaa
acgtatgcatcacgtcctgtagggtctgccggactatctttcagtaccggagcattttct
caaatggcagatttcaattcaggagcttcttcaggattcggaatcagtggaagtttaagt
gcttctgcatctctgggaacagcggaaagagtgtttgaagatattaatggagatgggtta
gttgatattttaaatgttagcagtagctcaacaacagtaaactataatttaggaaataaa
tttgctgctcctgtacagctttacaaatcaggcggaggaatagactttaataatgaagct
aaaacatatagtggaggatttacattaagcggatattattattacaatattccgattgtc
ttcttcttctttgtaccggttatttacctgaaactaggtgcagaagcgtccgctaatata
ggattgtctattgctgaagttgacaaatcattcaaagatatgaatggtgatggattcccg
gatctagtcatttctaaaaacgacggattcaaagtaaattactctaacatcggtaaaacc
aacaagcttaagagtgtagcaagcatctacaaccgtatgccgttgaataaatttgtcatt
gactataagtttacgcaacctaattacaacgatcctcacggaaggcttgtcatgagtgaa
tcaaggattatcaatccggatgtcaattcaggaaattacctgatcactaatcctgcaaag
gatatggtaacccaattcgattacggaacatctcgttatgacagaagagaaagagatttc
tttggatttgataccgtaacaagtaaggaaatggaaggttcaagtgtatatagatcttcc
agagaaaccttttataacaatagctatttcttaaacggaatcctgaagaaaacagaagta
tttggaggaacctctaatttactttccgttaatgagaaaatatataagttatataaattt
aaaaataacaacacacagctcaaccctactcctgttgcagatacatttgatacaggaggt
agagaaggcagaaagatggctacggcattgctggacaatactaaaaacatagtgtacgaa
aatggtggaagtattcaaagtacaacccaattaacgtataattcaaaagggcaggttgtg
acctatgtttaccaaagtccatcttctccttatcatacagtgattgattatcatacagga
ttagcgcgtaatatgattgatattcctagcaaaatagatgtttattatggagctacggga
aattcattactaagacatagagaaactactgtagataatgcaacaggtaacatagtaaaa
gtaaatgtaaagcttaattattatcaaaatgcggtaacctctatgaaatatgatcctttc
ggtaatatttctcagattacttatcctcctaacgaagccaatgaagaatatactttagac
tatgtgtatgatcatatacaaagcaaatatttgacatcaacatcagacagcttcggacta
acctctgcaaccatctatgatcaaatgtttgatacgttgattggatccattgacactgca
ggaaatactataagctaccaatacgatcagagaggaagactaatctcaatacttgcccct
aacgaacaggcaaacggagctccttataccgttagttatgaatatttcatgtcacctttc
ctggccgcaagtaataacgaacagagacacttattcggagctgttacccgaaactatgat
cctgagcatccgcagaatcctattgaaaccatcagtattgcagacggtttaggacgagtg
gttcaggtgaaaaaagatcttgagattgatgcagaagagaaaatgtctgtttccggaatg
gccatatatgatatccatggaagagttgtaaaacagtatcatccggtatctgaagcgaag
agcactctagctatcacagattctaacaacccaaatgcaaagcttaaccttggactttca
ggatattatgcttcgacagcatatgatgctttagacaggcctatacagcaaactgatgaa
gattcacattctactgatacaaaattcagtattaccggaggtaacttaaaaacaagtgtt
acgcaaatgcagaatacttctgtacaacttatttccgaatctttgaaagatgctgaagga
aaaattgtccaaacctccaattatataggtggacagccattaaatacaaagtattactat
tatcctctagaccaactttatatggttgaggacgctgaaggtattactacatcctatgag
tatgatttagcaggaagaagaacaagagtcaatcatcctgaccattcaacaacgaaatat
gagtatgacctggctggtaatttagtcaggcttggaacggctaaccttgatggtgatcca
aatatttcagatccttttatcaaatataagtactcctacaacaggctgatggaaatcaaa
tttccacctcttgccaatggatatggaaatccgtctaatgtaagatacgtttatggcgca
gctaattcaggaaaccaaaccggaagactgattcaaaaatatgacaatacgggagatacc
atctttaaatatggaatgcttggtgaggtcattgaagaaaacaggtctgtttatccatat
gtatcacaggccatgaattttgtaacaaaatacacctatgacagctggaaccgtattaaa
gaactgcgttatccggatggagaaaaactgatgtatgaatacgatttaggtggaaactta
aagagaatcagtaatgatggcggatatgaatatgttagaaatattacctatgaccagtat
gaacagcgtaccttcatagattttggtaacgacactaattcttcctttgaatatcttccg
accaacagaagactggctttccattcattaaaaaataatggtggaaatgaaattttagct
aatgtttataagtatgatttcgtaggaaacattacaagtatgtataataaggcacctaaa
tcttcaaatgaaatgggtggtccatatcagtttaaatattcttacgatcaattaaacaga
ttgagagattcaggaggtgattttaattcaggaggttcaccatatgcaatcaataaatct
aactacgaactagcattagcctataatgcttcaagtggaattcaacaaaagactcagaga
catactcaggatggagcttggaatcatgataacacttatgacagttcttataattatatt
aaagggacgcataagatagatacaatatatgattctggtggccttagtgattcttttgaa
tacgattacaatggtaaccctgttgcacataacgattcaaaaacaggtaccgaacatatg
tattgggacgaacaggataggttgaaagcttattacgctccggaaaaaggaactttccaa
tattatgcatatgatgataacagtgagagaatcattaagtacaaccttaaagatcaggca
aatctttatcaaaatggtgctttaattagctcaggtttttcttttgacgcctataaatta
tatccaaatgcctatatttctgtaggatctaataatcaatatactaaacattattatgca
ggaacacagagaatagcgggtagaataatggaaggtactaagaaatttgtcatggatgca
acaccttaccgtatgaagcaggataagaaggaggaagtaaaacaggtaaacccagaaaca
gatttcaaagattatctgacaaaagctggcctggatatcaatgatatcacgacagagcta
tctatgaagactgtttcacaaccggatgtatattacctacatggggaccatttaggaacc
gcaacctttgtgaccaattccaattcagaaaccatccagtttttcttaaatttaccgttc
ggagaaactatggcagagcagatgaccggagtccatgacaatccgtataagttcaatgcc
aaagaattagatgcggaaaccggattgtattactatggagccagatattataatcctaag
ttgagcgcttggtatggagtagatccattagcagaagattatccttcatggtctccatat
gtttatacacttaacaacccaataaaatacattgatccagacggaaaatccgtttggcct
cctgcgaaaggaactgaaggacaaagattgagtgatggagatggagacttcatatataca
ggtggtaaatggtatagagataatggtgcctttataggagctttcacaaatagatatgat
tctgttggtggcggtggtggaagttcttcatatgatggaaaatctatgttaccttcatct
aattatgactatacctatgatattatgcctggaaagcaggccgatgatataaaatattgg
aaaaatggagaaagtggaacaatggcttctaggtttcttgagacaactgctcgtgatgca
atagctaaagagaatagaacgacaaccattgaaatggcggctactatttttacaactcct
agaggaggaggagcaagatctagtacaggaaaatatacagaacctcaattgccaaataaa
acaatagtagatgaaagaggaatcactgtggagcattattataaatccggagatcatgct
ccaactcacttccatgttaaaggaggaggtaccagcactaaaataggagctaatggaaag
cccataaaaggaagcgcagaattaagcaaagcacaacaaacagtaatcgaaaataataaa
tctgctataagaagtgcaggcaaaaagttaaacaattatcaaaaatttcacaattattat
aaaaataagtaa
DBGET
integrated database retrieval system