Chryseobacterium sp. T16E-39: CEY12_18230
Help
Entry
CEY12_18230 CDS
T04952
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
chry
Chryseobacterium sp. T16E-39
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpvB
RHS_repeat
TcdB_toxin_midN
FG-GAP
FG-GAP_3
DUF6443
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASK31926
UniProt:
A0A220SEW9
LinkDB
All DBs
Position
complement(4018542..4028771)
Genome browser
AA seq
3409 aa
AA seq
DB search
METKFKFRLRKSLLLKLLFFANIFVFASFTKEDRLKVRAFKLKMMDKYIYHHKIEDGTST
DNPKKDSLTNDILSPIPGKEIQTGNNTFTSLLPRTSEYKSIDNVFDSEEKQGMIGEFSDE
EPDSPSDNFFTINIPEIKNQNTRAYLVYDLLGLGSYHSVSRSINRNIAFGGNIIVSGNTW
SPQKEEISLNSLKQGKNSILFTSSANGIKYKVKNVKIILENNGNSQQDVSSLLSGDQLYI
KGVESTATLNPVQINNKTIPSLKGEYETLVKLTEEDKVRGFVTITGAKGVKEYKIPQNTS
SFKVLSEEKFNPLTINISKDSEYKENYENTTISIEKNSVADVARIQVLKLRKKDYPALSG
DIKNLTANSYAYRLETQSGELTKAVKFSFPYDEKKLGARSAKEIKAFYFDYASRKWKVDP
TSVVDTEKKVITVENKGDGDYINGIISVPESSQLEAFAPTSISGLKAADPTSGLQLMEVP
TATQKGDANMNYPIRVPSGLGGLQPSLSIGYNSGGGNGWMGDGWNINGLSSISADTKWGV
PSFGSGETELYSLDGEMLVYPNGYMPHRHNDVSETNTAITTERQLRTDYTTGGVKQFYLR
KNHDFTLIERIGTSPSDYSWKVTSTNGTKSYYGGTPDSVLYGSGGIVHWGLRMIEDVHGN
TMEFTYYNESVSSAPASVSGGKFFQIKKIAYGKNKDYSVNFNKETTITRKDISINGKQGF
KSVEPYLLKNIEVKYKTEIIRTYKMDYIDGEFYKTLLKRLYIVPNNPCSTTLANKAGERD
PMDDGSGGGGGTNGGIEPTCNEISDSYVFEYHNDVKDAQGNVRIFGPDTHINLQNDKEAY
SGFIRGLVSPSKINGNISSEKGLNFRPAAGLNFYYPSSDAYGHLMFGFPFGYSNAEARNA
QQLIDFNGDGIQDMIYRVPGEGLFLRSGILDAQGNLTFSLSKKISNYGGDFSYTETSTTN
SGWDMGAIVYSHSKTSSSSTGKTPIYLTDANADGLIDIVDNGDVWFNKYTPSTGISEMTK
HSEYTENMVVKAKAIQPPIINPGPKDPIEPVYPPTSITDVVKVWVAPMDGYIKFTDNIVM
SSYGVIQTPPQKMYYSVEIQDPTPNGSTNIYKNGRIYLTELHAGDPYQFITIERYNSYYA
QMQTVPQFASNNVWGIDNPNRLFVKSGDKVYVRLHKNMVKNYAVSCDPNITYVDSMGNAI
PNTVELSQNQFQLNNGSYGSNMLLNNLSAPIYLDAQGTATINVDSVMLGNISDDFTFKIV
TENAVTGAITNLITPEVYLHNTSAFTPSHSLTLNVNPAEPVYLRFIVESDSHTNFLNSNW
TNKITVDYNASTTTNQNVNVNFLPIVEYPSFAVTQLTKKLDIRNVSMTGILGNHTFGVQI
KKDNINFSSLGTGSFYYIIKRGNEVLGKRKVVVSHTNSILIEEDMVSGQTISGTSPVEIF
NGDISTVAGNNLLVTVEVYCKTGGDYALFNKYSEYFQGKPFTVYYDTTSFYANTSATAVN
TAMYNTKTPLFNNWGQFLYQPGILSDYAYGGPIEISAFSAAVSTQNPYQSCYSITNDNAA
LAQCILNATSDPNAGNNTVSQNIASMKPSIQRTRGMYFRSYWVGIAPNQYSTDLGFQNDE
TVDYFSNPVPSTPAVVPTTYTSGQLSVSTTMKAISKIQKSSSRNTTDGLSFNMGSGGNSE
TYLTGIGSVETQMFSDLNGDGYPDIIYPKSMQFTNSTGSLEDIQLMSVDDYPTSNSSHLK
MNSVGFSYNAFSVAGRLGAQGDLGTSSKPDSGLPWSGGGSISAGANSYYDSSDSGINFWM
DINGDGLPDRVVGGAGANMGYALNLGKGLGAAAPYENMITYRSHPKGSLSLGIGGGLGSS
ANLGALSSFGFGISASVGASASIGTGDVVYEDVNGDGLIDILEINNSNNSTTVRYNLGSK
FDTAVPLVKSTGNVDFTDETRSFNGSFSFGGNYMFNIGPITLIPPFIVLILYIKAGLGAT
ANLGLNVSETRKAFKDMNGDGFTDLVIDDNSGFTVNYSLIGRTNKLKSVTNSFTKGKYLL
DYQFARANYANPHAKLVVSKINVVNPDMYSSGYTTEQGNKMETRYSFSNRRYDRREREDF
GFGTVTKQEMDGSSVVRTSTDTYFTNTYLLNGLIKRSTVSGGSSSSDVSYTYKLRKFTDN
VTKIDLASDLSLDYDAGGREGRKMAIALLDKKTKTISEPGGSIKTTEQFTYTTKGQISKY
QYTSPSAIYNSNIKYQALNNNIIGVPTLIEVFEGTTTGQLLRRRKASNINLNTGDIGTFS
TFDGSQYIATDIKYNAAGNIIKVTYPPNNNNERYTLDYTYDDTVTGKYIIKTKDTFQLTS
TAIYNPLFDVVTRKVDTGGNAMVFYYDGFGRTKSIMGPNEIASGSTVPTVAYRYWFDHAG
IPNNDATVKVYRASTANFDPEYAAAGNKIMTETYSDFLGRIIQVKKDIEQQGAESRSVSG
KQVFDNLGRVIRQYHPTYEAASMQNFNTATGYASTSKLYDSQDRVIADTDEDNNTKKTTY
SIENNLLKVTDEFLSEKSEILSNVEGKMIQKNDYLYTQPLSTKFKYNTIGELMVAEDPQG
LRTEYSYNLAGRKTQQIHPDKGITTYRYDPSGNLTELLTNNLSAAGQPAIQYTYEYNRLT
DIKLPDLPNGHPNPNNVSYQYGYIGAGNNNLGRLIAKYDGTGNTKYTYGRMGEVISEERF
IRGYYFPNMYFKTYFNYDSWNRVTKIKYPDNEIVSYHYDLGGNLKSVNNDRGETYIQNIT
YDHYEQRTSIINGNGTSHDYYYNDSNRRLRNYGLRNSSNNQMLRNTYEYDDFGNITTIKN
EASQLANGMGGMFLFGFKYDTLNRLIGTGSEKVLTDGENQPIPVTMNVPTSYKLEMKYNE
SGGIISKNQFHERDQNVVHENTYENKYEYIPKTHQVAEVADGASGNVEKFEYDLNGNPVR
HIDPTGEKRMFWDEQDRMKAFYNDNSGLYQYHVYDDEGERTIRYGLERPADLYQNGELIN
PDDVRLIDYKIYPNAYVTVSSTGQYTKHYFEGSKRFASRLLDNASIFENLPTTTKIADQS
NKKETVDPEVDFKAYLKKAGLGKDISTELRETNQNPGLYYLHGDHLGTSTFVTNSFSQAT
QFFVNLPFGETMLEQMDGSYNNPYKFNAKELDEDTGLYYYGARYYNPRLSIWYGVDPLAE
KYPEMSPYVYTANNPVKYVDPDGRDFILGILGMFRKDRTVSKMEVRATVYITGANASAAR
AKELNTLAKGTFKSKKVDGAEVGFNIKYVYKKNINSNDLKDGENILNLVNKSGRSEVNGV
ISEDSFDGSLTHFTGNTGTIYSDGDNMTIMHETGHFIGLPDRYTDVTDKKGNVISKAHSG
FVGDLMGDKGKKLNSNYYKDYLERANKNKGKDTPSYIQIGRDKKGNLIK
NT seq
10230 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaccaaatttaaatttaggcttagaaaaagtctgctccttaaactattattcttt
gcgaatatatttgtttttgccagctttactaaagaagaccggctcaaagtaagagccttc
aaattgaaaatgatggataaatatatctatcatcataagatagaagatggtacttcaaca
gataacccaaaaaaggacagtcttacaaatgatattctttcacctataccaggaaaggag
atacaaacaggaaataatacatttacctcattattgcctaggacctcagaatacaaaagc
attgataacgtttttgattctgaagaaaaacagggaatgattggagagttttctgatgag
gagcctgacagcccttctgacaactttttcaccatcaatattcctgagataaaaaaccaa
aataccagagcatacttagtatatgatctattgggtcttggttcataccattctgtttcg
agatctatcaacagaaacattgcttttggaggtaatattattgtttcggggaatacgtgg
agtccacaaaaagaagaaatcagtttaaattctttaaaacaaggtaaaaacagtattctt
tttacttcttccgcaaatggcatcaagtataaagttaaaaatgtaaaaatcatactggaa
aataatggaaattcccaacaagatgtttcttcattattatcaggagaccagctttacata
aaaggtgttgaaagcacagctacattgaatcctgttcaaattaacaataaaacaattcca
tccctaaaaggagaatatgaaactttagttaaattaacagaagaagataaagtcagaggt
ttcgtaacaattacaggggctaagggagtaaaagaatacaaaatcccacaaaatacaagt
tctttcaaggttttaagcgaagagaagttcaatccgcttactataaatatctccaaagat
tctgaatacaaggaaaattatgagaacacaacgatctccattgaaaaaaattccgtggca
gatgttgctaggatacaggtcctaaaacttagaaaaaaggactaccctgcactttccgga
gacatcaaaaacctcacagcaaattcttatgcgtatcgtttagaaacccaatcaggagag
ttgaccaaggctgttaaattctcttttccgtacgatgaaaagaagttgggagcaagatca
gcaaaagagatcaaggcgttttacttcgattatgcatcaaggaaatggaaagtagatcca
acctcagtagtcgacaccgagaaaaaggttatcaccgttgaaaataagggtgatggagat
tatatcaacgggatcatttccgtccctgaatcatcacaattggaggcctttgctccaacc
agcatcagtggactaaaagcagctgacccgacttccgggctacaactcatggaagtccca
accgcaacacaaaagggagatgccaatatgaactaccctattcgtgttccttcaggctta
ggaggcctgcagccttctttatctataggatataatagtggcggaggcaacggctggatg
ggtgacggttggaatatcaacggcctctcctctatcagcgcagatacaaaatggggggtc
ccttcatttggaagcggggaaacagaactctattctttggatggagaaatgctggtatat
cccaatggatatatgcctcacagacataacgatgtgagtgagaccaatactgccattact
acagaaagacagctgagaaccgactacactaccggtggtgtaaagcaattttatcttaga
aaaaatcatgactttacacttatcgaaagaatcggaaccagcccaagtgattattcctgg
aaagtaacttctactaatggaacgaaaagctattatgggggtacgccagattctgtactt
tatggctccggaggaattgttcattggggtcttcgaatgattgaagatgtccacggaaac
acgatggaattcacctattacaacgaatctgtatcatcggcacctgccagcgtttcgggt
ggaaaattcttccagatcaaaaaaatcgcttatggaaaaaacaaggattacagtgtgaat
ttcaataaagagacgactattacccgcaaagacatcagtatcaatggaaaacaaggcttc
aaaagtgttgagccttatttactgaaaaacatcgaggttaaatataaaacggagattatc
agaacctataaaatggattatatagatggagagttttataaaactcttttaaaaagacta
tatatagttcctaataatccttgttcaactactcttgccaataaggctggtgaacgcgat
cccatggatgatgggagtggcggaggcggaggtaccaacgggggtatcgaacccacctgt
aacgaaattagtgacagctacgttttcgaatatcataatgacgttaaagatgcccaagga
aatgtaagaatatttggacctgacactcatattaatcttcagaatgacaaagaagcgtac
tcaggttttataagaggtcttgtcagtccttccaaaattaacggtaacatttcttcagaa
aaaggacttaatttcagacctgctgccggattaaatttctattatccttcaagtgatgcc
tacggacacctgatgtttgggtttccattcggatactcgaatgctgaggcaagaaatgcg
caacagcttatcgacttcaatggtgacggaatacaggatatgatctacagagttcccggc
gaaggacttttcttaagatccggaatcttagacgctcagggcaaccttacgttttctctt
tcgaaaaagatttccaattatggcggcgatttttcttatacagaaaccagcaccaccaat
tcaggttgggacatgggagcaatcgtttacagccattctaaaacaagctcttcaagtaca
ggtaaaacacctatctatcttacagatgctaatgctgatggattaatagacattgtagat
aatggagacgtttggtttaacaaatacactcccagcactggtatttcagaaatgacaaaa
cactctgaatacaccgaaaatatggtagtcaaagcaaaagctatacaacctccaattatc
aatccgggacctaaagatcctatcgagcctgtataccctccaacttctatcaccgatgtt
gttaaagtttgggtagctcctatggatggctatattaagtttacagataatatagtaatg
tcttcttatggtgtgattcaaactccaccacaaaaaatgtactattcagtggagattcag
gatcctactcctaatggaagcaccaatatttacaaaaacggaagaatttatcttaccgaa
ctccatgcgggtgatccttatcaattcatcactatagaaagatacaacagctattatgcc
caaatgcaaaccgttcctcagttcgcatccaataatgtatggggtattgacaatcctaac
agattgtttgttaaaagtggggataaagtatatgtaagactgcataaaaatatggtaaag
aattatgctgtatcatgtgatccgaatattacttatgttgattcaatgggaaatgccatt
ccaaacactgttgaactttcccaaaatcagtttcagttaaataatggtagctatggcagc
aatatgcttttgaataatctgtcagcacctatctatctggatgcacagggaacagctacc
attaatgtggatagtgttatgcttgggaatatcagtgatgattttacatttaagatcgta
actgaaaatgcagttactggtgcaattacaaacttaattacaccagaagtataccttcat
aacacctcagcatttacaccttcccattcattaacacttaacgttaatccagctgaaccc
gtttatttgagatttatcgtagaatccgattctcacactaatttccttaattcaaactgg
acgaataagataactgttgattataatgcatcaacgactaccaatcaaaatgttaatgtt
aactttttacctatcgtagagtatccttcgtttgcagttactcaattaaccaaaaaactg
gatatcagaaatgtatccatgacaggtattcttggcaaccatacttttggcgtacagatc
aaaaaagataacatcaatttctccagcttaggaacaggatccttttattatatcatcaaa
agagggaatgaagttctcggtaaaaggaaagttgttgtatctcataccaacagcatcctc
atagaagaagatatggtttcagggcaaactatttccggtacttcaccagtcgaaatcttt
aatggagatatttccactgttgcaggaaataatcttttagtaaccgttgaggtatattgt
aaaactggaggtgattatgctttatttaataaatattcagagtatttccagggtaagcca
tttactgtttattatgatactacaagcttttatgctaatacttctgcaacagcagtaaat
acggccatgtacaatacaaaaacaccactttttaacaactggggacaatttttgtatcaa
cctggaatcttaagtgattacgcctatggaggaccaattgaaatatcagctttttcagcg
gcagtttcaacgcaaaacccatatcagtcatgttatagtataaccaatgataatgctgct
ttagctcagtgtattctaaatgcaaccagcgatccaaatgccggaaataatactgtttct
cagaatattgcttccatgaagccaagtatacaaagaaccagaggaatgtatttcagaagt
tactgggtaggtatagctccaaatcaatattcaacagatttaggatttcaaaatgatgaa
actgtagattatttcagcaaccctgtaccttctacacctgccgtagtacctacaacgtac
acatctgggcaattatcggtaagtactacgatgaaagcaattagtaaaatacagaaaagc
agctcacgtaatacgactgatggattaagcttcaatatgggaagcggaggaaattctgaa
acctatcttacaggaatcgggagtgtggaaacacagatgttctctgaccttaacggggat
ggatatcctgatatcatatatcctaaatcaatgcagtttacaaactctacaggaagttta
gaggatatccaacttatgtctgttgatgattatccaacaagcaattcaagtcacctgaaa
atgaactctgtaggattctcttataatgctttttctgttgcaggaagattaggcgctcag
ggtgacctgggaacgtcttccaaaccagattcaggattaccatggtcaggaggaggatcc
ataagtgcaggagcaaattcttattatgactctagtgactctgggattaatttctggatg
gacattaatggggatggtctccctgatagagtggttggtggcgctggtgccaatatggga
tatgcattaaatcttggaaaaggattaggggccgcagctccatatgaaaatatgattacc
tatcgttctcaccctaaaggaagcttaagccttggaattggcggcggacttggttcatct
gctaatctgggagctttaagtagttttggtttcggaatcagtgcaagcgtaggagcctct
gcctctattggaactggagatgttgtatatgaagatgtaaatggggatggcttaatagat
attcttgagatcaacaattctaataactcaactaccgttcgatataatcttggaagtaaa
tttgatacagctgttcctctagtaaaaagcacaggaaatgtggactttacagatgaaacc
agatcatttaatggttcattctcttttggagggaactatatgttcaatattggtccaatt
acccttattccccctttcattgtccttatcctttatattaaggcaggacttggcgcaaca
gctaatttagggctcaatgtatctgaaacgagaaaagcgtttaaagatatgaacggtgat
ggatttacagatcttgtaatcgatgacaactcaggttttacggtgaattattcattaatt
ggcagaaccaataaacttaaatccgttaccaacagttttacaaaagggaaatatttactg
gattaccaattcgcaagggctaattatgctaaccctcatgctaaattagttgtgagcaaa
ataaacgttgtcaatccagatatgtattcttccggttacactactgagcaaggaaataaa
atggaaaccagatattcgtttagcaatagaaggtacgacagaagagagagagaagacttt
gggtttggaactgtgacaaaacaagagatggatggaagttcagttgtaagaacatctaca
gatacttatttcaccaacacttatttactgaacggtcttataaaacgaagcacagttagc
ggtggaagctcatcttcagatgtaagctacacctataaacttcgaaagttcacagataat
gtgacaaaaatagaccttgcttcagatctatcattagattatgatgcaggaggtagagaa
ggaaggaaaatggctattgctttattagataaaaagacaaaaacaatttctgagccagga
ggcagtataaaaactactgaacaatttacctatacaaccaaagggcaaatttcaaaatat
caatataccagtccttctgctatttataattctaatattaaataccaggcacttaataat
aatattatcggagtccctacccttattgaagtgtttgaaggaactactacaggtcagctg
ttaagaagaagaaaagcctctaatatcaatttgaatacaggagatattggaactttttct
acctttgatggttcacagtatatcgctactgatataaagtataatgctgcaggaaatatt
attaaagtcacctatcctccgaataataacaacgagcgatatacattagattatacatat
gatgatacagtaacgggaaaatatatcatcaaaacaaaggacaccttccaattaacttct
actgctatttataatcctctttttgatgtggtaaccagaaaagtagatacaggaggaaat
gcaatggtcttttattatgatggatttggaagaacaaaatcaattatgggacctaatgag
atcgcaagtggttctactgtcccaacagtagcctaccgttattggttcgatcatgcagga
attccaaacaatgacgcgacagttaaagtataccgtgcatcaacggccaattttgatccg
gaatatgctgctgccggaaataaaattatgacagaaacctattctgatttccttggaaga
atcatacaggtcaaaaaggatattgaacaacaaggtgctgaaagcagatccgtatcaggg
aaacaagtatttgataatttgggaagagttattcgccagtatcatcctacttatgaagct
gcaagtatgcaaaacttcaatactgctacgggatatgcatctacctcaaagctatatgac
agccaggatcgggtaattgcagataccgatgaagacaacaacactaaaaagacaacgtat
agtattgaaaataatttgttaaaagtgactgacgagtttttgtcagaaaaatcagaaatc
ttatctaatgttgaagggaaaatgattcagaaaaacgattacctttacactcaaccactt
tccaccaaatttaaatataatactattggtgaactcatggttgctgaagaccctcaagga
ttgagaactgaatactcctacaaccttgcgggaaggaagacacaacaaatacatcctgac
aaaggaattacaacgtatcgttatgatccttcaggaaatcttactgagttgttaaccaat
aatctgagcgctgcaggacaacccgctattcaatatacatatgaatacaacaggcttact
gacattaagttaccggaccttcctaatggacaccctaatcccaataatgtttcttatcag
tatggatacattggagccggtaataacaacctaggaagacttattgcaaaatatgacggt
acaggtaatacaaaatacacgtatggaagaatgggagaagttatttcagaagagcgattt
atacgcggttattatttccctaatatgtactttaaaacctactttaattatgacagttgg
aaccgtgtgaccaaaattaaatatcctgacaatgaaatagtttcctatcactatgatctg
ggtggtaatcttaaatcagtaaataacgacagaggtgaaacttatatccagaatataacc
tatgatcattatgaacagcgaacatcaattatcaatggaaatggaacttctcatgattat
tattacaatgatagcaaccgtagattacgaaattatgggctgagaaactcttccaataat
cagatgcttagaaatacctacgagtatgatgattttggaaacattacaacaattaagaat
gaggcttctcagctagctaatggaatgggaggaatgtttttatttggtttcaaatatgat
acccttaacagactgataggtactggttccgaaaaagtattgacggatggagaaaaccaa
cctatcccagttacgatgaacgttcctacatcctataaattggaaatgaaatataatgaa
tcaggaggaatcatatcaaaaaaccaattccatgaaagagaccaaaacgttgtccatgag
aatacttatgagaataaatatgaatacattccaaaaactcatcaagtagcagaggttgcg
gatggagcttccggaaatgttgaaaaatttgaatatgacttaaacggaaaccctgtccga
catattgatcctactggagaaaaacgaatgttttgggatgaacaagaccgtatgaaagca
ttttataatgataactcgggactatatcaataccatgtatatgatgatgaaggggaaaga
accattagatatggattagaacgtcctgcggatctttatcagaatggcgaattgattaat
ccggatgatgtaagacttattgattacaaaatttatccaaatgcatatgttaccgtaagc
tctaccgggcagtatacaaaacattattttgaaggatcaaaaagatttgcaagccgactc
cttgataatgcctctatttttgaaaaccttccaacaactacaaaaatagcagatcaaagc
aataaaaaggaaacagtagatcctgaagtagatttcaaagcttatcttaaaaaagcagga
ctaggcaaggatatttctacagaattgagagaaacgaatcaaaatcctggattatattac
ctgcatggagaccatctcggaacatctacatttgtaaccaattcattttcacaagctacc
cagttttttgtaaatttacctttcggggaaacaatgttggaacaaatggatggttcatac
aacaatccatataaattcaatgcaaaagaattagatgaagacactggattatattattat
ggagcgagatattataatccgagattgagtatctggtatggagttgatccattagctgag
aagtatcctgaaatgtctccatacgtttatacagctaataaccccgtaaaatatgttgat
cctgatgggcgagattttatacttggaattttaggaatgttccgtaaagatagaactgta
tctaaaatggaagtaagagcaacagtttatattactggagcaaatgcatcagcagcacga
gcaaaagagttgaacactttagcaaaaggtacatttaaaagtaaaaaagttgatggagcg
gaagtaggatttaatataaagtatgtttataaaaagaatattaattctaatgatttaaaa
gatggagaaaatattttaaatttagttaataagagtgggagatcagaagtcaatggagtt
atatctgaagactcatttgatggcagtttaacacactttacaggtaatacaggaactatt
tattcagacggtgataatatgactatcatgcatgaaacaggtcactttatcggtttaccc
gataggtatacggatgttactgataaaaaaggtaatgttatttcaaaggcgcattccggc
ttcgttggtgatttgatgggtgataaaggaaaaaaactaaatagcaattattataaggat
tatcttgaaagggcaaataaaaataagggtaaagatacaccatcctatattcaaattgga
agagataagaaaggaaacttaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system