Croceimicrobium hydrocarbonivorans: H4K34_14435
Help
Entry
H4K34_14435 CDS
T07152
Name
(GenBank) fibronectin type III domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
chyd
Croceimicrobium hydrocarbonivorans
Pathway
chyd02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
chyd00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
H4K34_14435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MAM
fn3
Por_Secre_tail
PKD_4
PKD
PKD_6
InlK_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNR23566
UniProt:
A0A7H0VCW8
LinkDB
All DBs
Position
3204768..3211220
Genome browser
AA seq
2150 aa
AA seq
DB search
MRKLLLLCSYLAAISLYGQGTIITSPPLTPNNGSTGISLRVEATSPIEITGLTNVFSTGA
TSATVWVRQGGVTPGGTPNVSTANGWTQVVVNAPITGANSTALNNIPFGGVKIPVPSGGS
IGIFIEGTSGSSRYQTGTASDQVIFTDGTMTVNLADSVAYGGPASSPSNNPRRFVGSVTY
ALSVTGNCTPFTGFAIDSISGTAAKVNWTPGTGNTGYKLEYGPVGFTPGTGTVVSGTYPT
SPVSPPVILSGLSASTTYDVYFEEYCNTGTDTVGFPTPQSFTTTKLCGAPTGFAESNLTS
NTVDVNWSQAGSYTEAWVMWGPTGTTPGSAGWDVDTIMSPTMTYTISGLSPSTGYDIYLA
TNCGGGNGVSDTVGPIQIVTPIQGPQGLNCTTGQAGLIFQDDFETQLGWTGNFGSGTTAS
NWNYHSGPTGSTATGPTGAHSGNTYLYTEVSGTASGTHIEAISPRIDLSSSFNHAELAFW
LHAYGANIDTIKVQVGGSATGPWNTVFTRVGQVQTANADPWQQVGVNLDAYVGSAIYLRF
LTVHGTSFNGDVSIDLVEVSSCQTCPFPSAPTVNYVSSDSAYFTWNGTGYDYDVNWGPRG
FTQGSPSSFFDSTSVASIGIGGLSGNTAYDIYIRNDCSDSANGTSGWVGPVPFVTLCNPL
TAPYTNNFDSDSIDAPPICWDNALIGGTSATLPNADVEVPSTTYPPISSPNVVRFYNYNT
DTAWLISPQFSDLSVGDKRISFYAMTTTTATPNQLVVGTVASPGDRSSYVAIDTIDIQRN
YAQYVVDLTVANGYNGSHEFVVLEHAGPDFRTYYIDDFVYEQIPACNPPLSSTLGVNYVT
ATTAEVFWGSGSDGDTTWIEWGLPGFTPGASNLGRIAVSGAQDSALISGLMAETDYEFYI
QDSCYGNGNSPYVGPVAFRTACAIVAPAVLPLSDGFENYSNGPTFSATAFLCNPSYYWTF
EPGNTNGRGRLQANSAFYRNGLQAFTIDNSAFVNPSQTSYLTMTVDLSSYTSAGGINLSF
YLMDHSNQNHPDNKVWVRGAPSDPWIEVVDLNTTVFGSFGSYDSIIDLDIMAPITSAGQA
IGNSTQIRWGQNDFGSATSATCCYGYTIDDVSLTAVTCPNPSALAVSNLLDTTATMGWAN
STSASQYQFWFGPQGFYQGTTTTTGTKFFTSSSSITADTLSATTCYEFLVRSVCSAGDTS
DWVGPVQFCTTCPVGYAMPYFTDFEINTPGVATGSPAGWANCWTQQSASGATVRWEAEDA
SGSNENSSSTGPFLDNTLAPQSGGIYMYLETSTSGSYADLVSPGINLAGSTNPQIEFAYH
MYGATINKLVILAENVTTGTITTLDSIVGQQQTAGSDPFNTHVTNVSSLASGSYRFIFRG
YLGTSFTGDISIDDVWVMEAPTCPRPAGLMQDSANLNDITASWTSNGTGSSWEIEYGPAG
FTPGSGTTIIATSNPYTITGLSSATAYDVYVREICGPGDTSLRVGPSLMNTTLCLASDQC
WHDVDLEDTFGDGWNGGLVDVVQNGVVVATLGQSFTTGTLYQDSVLLCDLLNTVFVLQNA
GGWPSEIGITVYTPWGTQAGQYIANGATGQGDTLVAMTAQCNPPTCPQPTALVVNSVTGT
TANVGWTAGGTGTSWEVEYSTGTFLPGAGTRVSATTNPYTITGLSGSTNYNFYVREVCSP
GDTSVWSGPMNFATACITATAPYFTDFENIPIGTGTGTPATWGNCWYAETLNGATVRWES
EDATGANENSLDTGPFTDASIHPASGGTYMYIETSTSGTGPAELTSPTIDFSSLSQPELR
FAYHMYGATINKLVIQAEDINGNRIAIDSLVGQQQTAQSDSFFIRTIDLSTLPQTTYAFV
FQGYRGTSFTGDISIDDVSVDEQGSTGSNCPAPLNAMATTNVGCDSVEVDWMSGTGGSII
EYGPAGFTPGTGTFTNVVTAPYTIYGLTPGTAYDILVADTCSGDTSSYAPINVSTASGPL
PVATIGSVTSTIAGNQFIVYLDATGTTDATSYTWDFGNGVTGSGLMDTVVFLGNGTYTVV
LTATNGCGSDTASYQVYVNIGLDENPLANHLNVYPNPANYKVNVSFREVGSADVEIRLRD
AQGREVLFISDRMQSGTYARDIDVSQLARGIYTVEVKSGGLTAHRRLSLN
NT seq
6453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggaagttactactcctttgtagttaccttgctgctatatccctatatggccaaggg
actatcatcacgagtccaccattgactcctaacaatggctccaccggaatatccttacgg
gttgaggcgacctccccaattgagattaccggcttaactaatgttttttccaccggcgcc
actagtgctactgtttgggttcgtcaaggcggggtaactcccggaggaactccaaacgtt
tctactgcaaacggttggactcaggttgtggtaaatgctccaattactggcgcaaacagc
accgctctgaataacattccctttggtggggtaaagattcctgttccttcaggaggttcg
atcggtatctttattgaaggcacctctggttcttctcgttatcaaacgggtacggcttct
gatcaggtgatttttaccgacggaaccatgacggtaaaccttgcagattctgtggcttat
ggtggtcctgcatctagtccatccaacaatccacgtcgttttgttggctctgtaacttat
gcattgtctgtaaccggcaactgtaccccatttaccggatttgcaatcgacagtattagc
ggtactgctgctaaagtgaactggactcctggaaccggaaacaccggttacaaattagag
tacggtcctgtaggatttacgcctggaactggtactgtggttagtggtacttatcctacc
agtccagtaagtcctccagtgattttatctggtttgagtgctagcactacctatgatgtt
tacttcgaagagtattgcaacactggaaccgatacggttggtttcccaactccacaaagc
ttcactaccactaaattatgtggtgcaccaactggctttgctgaatctaaccttacttcc
aatacggtagatgtaaactggtctcaggccggttcttatactgaggcttgggtgatgtgg
ggtccaactggaaccactcctggtagtgccggatgggatgtagacaccattatgtctcca
accatgacttacaccatttcgggtttaagcccatctacaggatatgatatctatttagct
accaattgcggtggtggaaatggagtttctgatacggttgggccgatccaaattgtgact
ccaattcagggaccacaaggtttgaactgtaccactggtcaggctggtttaatcttccag
gatgattttgaaactcaattaggttggaccggaaactttgggtctggaaccaccgcttca
aactggaactaccactcaggtcctaccggatctactgctactggtcctaccggagctcac
agtggaaatacctatttatatacggaggtttccggtacggctagcggaacccatatagaa
gccatctctcctcgcatcgatctaagttcttcttttaatcatgctgaattggctttctgg
ttacatgcctatggagccaatatcgacactataaaggttcaggttggtggctctgccact
ggtccctggaatacggtatttactagagttggacaagttcaaacagccaatgcagatcca
tggcagcaagtaggggtaaacctagatgcttatgtaggttctgcaatttacttgcgcttt
ttaacggtgcatggcactagctttaacggtgatgtttctatcgatttggtagaagtaagt
tcatgtcaaacctgtcctttcccatcagcaccaacggtgaattatgtttctagcgattct
gcctactttacttggaatggaaccggctatgattacgatgtaaactggggaccacgtggc
tttacccaaggatcaccatccagtttctttgatagtacttcggtggccagtattggtatt
ggaggtttaagtggcaacaccgcatacgatatctacatccgtaacgattgttcggattcg
gctaatggaaccagcggatgggttggacctgtgccttttgtaacattatgtaatccactt
acagctccttacactaataattttgatagcgattctattgatgcaccccccatttgttgg
gataatgcattaattggtggaactagtgcaaccttgcctaatgccgatgtggaggtgcca
agtacaacctatcctccaatatcatcacccaatgtcgtacgattctataattacaatacc
gatacggcatggctgattagtccacagtttagtgatctttctgttggagataagcggatt
agtttctatgctatgactaccactactgctactcctaatcagctagtagtaggtactgtc
gctagcccaggagatcgttccagctatgtagcaattgacactattgatatacagcgaaac
tatgctcaatatgtagtggatcttaccgtagccaatggttacaatggaagccatgaattt
gtagtgctagagcacgctggtccagatttccgcacctattatattgatgattttgtgtac
gagcaaattccagcttgtaaccctccattaagcagcaccttaggtgttaattatgtaact
gccactaccgcagaagtattctggggttcaggttcggatggcgatactacctggattgaa
tggggcctacccggctttactcctggtgcttccaatttaggacgtattgcggtaagcggt
gctcaagacagtgccttgattagtggcttgatggccgaaaccgactatgaattctacatt
caagatagctgctacggaaatggtaatagtccttatgtaggtccggttgctttccgcact
gcttgtgccattgtagcaccagcggttcttccgctgagtgatggttttgagaattattcc
aatggcccaacttttagtgccactgccttcttatgtaatccatcttattactggactttc
gagccaggtaatactaatggtagaggacgtttacaagcaaatagcgcattttaccgcaat
ggtttgcaggccttcacaattgacaatagtgcctttgtaaacccatctcaaaccagttat
ctaactatgacggtagatttaagtagctatacctccgctggtggtatcaacttaagtttc
tacttgatggatcacagcaaccaaaaccatccggataacaaggtatgggttcgcggtgca
ccaagtgatccttggattgaagtggtggacctaaatactacagtatttggaagctttggt
agctatgattccattatagacctggatattatggcaccaattaccagtgctggacaggct
ataggtaatagcactcaaatccgttgggggcaaaacgactttggatcggctacctcagca
acttgctgctacggttataccattgatgatgtatccttaactgccgttacctgtcctaat
ccaagtgcactagccgtatctaatcttttagataccactgctactatgggctgggcaaat
agtacttcagctagccagtatcaattctggtttggtcctcaaggtttctatcaaggtaca
accaccactacgggtactaaattctttactagctccagcagtattactgctgatacttta
agtgctacaacatgctatgaattcttggttcgcagtgtatgttcggcaggggataccagt
gattgggtaggtccagtgcagttctgtactacctgtccggttggatatgcgatgccttat
ttcactgattttgaaatcaatactcctggggtggccactggttcaccagcgggttgggca
aactgttggacacagcaatctgcctctggcgccaccgtacgttgggaagcagaagatgct
agtggttcgaatgagaattcctcgagtacaggtccattcctggataataccctggctcca
cagtcgggtggtatttatatgtatttggaaacttctacatccggttcttatgctgatcta
gtttctccgggaattaatctggctggatcgaccaatccacaaattgagtttgcttaccat
atgtatggggccactatcaataagctggttatccttgctgagaatgtaacaacaggaact
atcaccactttggatagtattgttggtcaacagcaaaccgctggatctgatccattcaac
acccatgttaccaatgtgagtagcttagctagtggttcctaccgatttatctttagagga
tatcttggtacatcttttaccggtgatatttccatagatgatgtttgggtaatggaagca
ccaacctgtcctcgtcctgccggattgatgcaggatagtgctaacctaaatgatattacc
gcaagctggacttccaatggaaccggttcatcttgggaaattgaatatggtccggcaggc
tttacgcccggtagcggaactacgataattgcaaccagtaatccatacaccattaccggt
cttagctcggccactgcctatgatgtttacgtgcgtgagatttgtggacctggcgatacc
tctttgagagtagggcctagtttaatgaacaccaccttatgtttggcaagcgatcagtgt
tggcatgatgttgatcttgaagataccttcggtgacggatggaacggcggattggtagac
gtggttcaaaatggtgttgttgtagccactttgggtcagagctttactacaggaaccctt
tatcaggattcagtattactttgtgatttactgaatactgtttttgtattgcagaatgcc
ggtggttggccatcagagattggtattactgtttatactccttggggaactcaagcaggt
cagtacatagcaaatggagcaaccggtcaaggagatactttggtagccatgactgctcag
tgtaatccacctacctgtcctcaacccaccgctttagtggtgaactcggttactggaacc
actgcaaatgtgggctggactgccgggggtacaggaacttcctgggaagtagaatacagt
accggaaccttcttgcctggggcaggaacccgcgtatctgctaccaccaatccatatacc
attaccggattaagtggttctacaaactataatttctatgttcgtgaggtttgttcaccc
ggtgatacttcagtgtggtcaggtcctatgaactttgctactgcttgtattacagcaacg
gctccttattttaccgatttcgaaaacattccaatcggaaccggaaccggaactccagca
acctggggtaactgctggtatgcagaaaccttaaatggtgctaccgttcgttgggaatct
gaagatgccactggtgctaatgagaactctttggataccggtccctttaccgatgctagc
atacacccggcttccggaggtacttatatgtatatcgagacctcaacatcaggaaccggt
ccggcagaattgacctcacccacaattgatttcagtagcttaagtcaacctgagttgcgc
tttgcctatcatatgtacggtgcaaccatcaataaattggtgattcaagcagaggatatt
aatggtaaccgaattgctattgatagtttggtggggcaacaacaaacggctcaatcggat
agcttctttatccgaaccatagatttaagtacgctacctcaaactacttatgcctttgta
ttccagggatatcgtggaacctcatttacaggagatatttctatcgacgatgtaagtgtg
gatgagcaaggtagtaccggatcaaattgtccagcccctcttaatgcgatggcaactact
aatgtgggttgcgatagtgtagaagtggattggatgtctggaaccggtggttctatcatt
gagtacggtccagccggatttacgcctggtaccggaacctttaccaatgtggtaaccgct
ccttatactatttacggattgactccgggcactgcctacgatattttagtagcagataca
tgttctggagataccagtagttatgcgccaattaatgtgagcactgctagtggtccatta
ccggtagcgactattggttcagtaaccagcacaatcgcaggaaaccaattcattgtgtat
ctagatgccaccggtaccaccgatgctactagctacacctgggatttcggaaacggagtt
accggcagtggattaatggatacggtagtgttcctgggtaatggtacctatactgtagta
ttaactgcgaccaatggttgtggtagtgatacggccagttatcaagtttacgtgaatatt
ggcttggatgagaatccattggctaatcatttgaacgtatatccaaacccagccaactac
aaggtgaatgttagtttccgcgaagttggaagtgctgatgttgagattcgtttgcgcgat
gcacaaggtcgagaagtactctttatttccgaccgtatgcaaagtggaacctatgcccga
gatattgatgttagtcaattagctcgaggaatttatacggtagaggtaaagtcaggcgga
ttaacggctcatcgccgattaagtctgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system