Croceimicrobium hydrocarbonivorans: H4K34_16195
Help
Entry
H4K34_16195 CDS
T07152
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
chyd
Croceimicrobium hydrocarbonivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS
PAS_9
PAS_4
PAS_8
HATPase_c
HisKA
PAS_3
GAF
Diguanyl_cycl_sensor
GAF_2
DUF4364
Major_capside
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNR23897
UniProt:
A0A7H0VDU9
LinkDB
All DBs
Position
3603192..3605963
Genome browser
AA seq
923 aa
AA seq
DB search
MHPQEIPQGIDLIYRFDPQGRFTYVNEKARALFDMDIDAILGQPYYSFVREDFQEKVAAF
YALQIEKRQASSYFEFPFIADGKEIWIGQTIELVCENNKVVELLGVARPITELRKVKADL
KESDEHLLALLKHLDAAILIEDAQGKIRYVNDNFCRYFRLDSSPAELAGQVCAEVGAGIS
HLFKNPEAFGAGIGRCLEEQVIRRSERIAMADERVLERDYIPMLIDEQNRGNLWVYRDVT
MRYLTEQALIESEKKYREVIQNIDLGLMEVDKDETILWANDSFLKTTGHELKNLQGKNAK
DTFLTEEDIAFTAKRLKETQHLRERGESSVYELPIRHKDGSQLWMQISGAPIKDISGKVI
GSLGIHHNITPLKSLQSQLEYRLTLQAILLDLANDLIFLNPDKENEVIQKALGRLGSFVN
ADRVYIFDYHLDENYTTNTYEWCAEGISPEIENLQEVPLEAIPEWFETHEQGKPMIYDRV
ADLPEGHPVREILEPQGIQSIITMPVLGNGRLRGFIGFDAVRTQKSWNADEKELLEFMAQ
MLAAHNIKNEFENRLGASEYRMRTVLENALDAVITINESGLVEDWNHQAEQMFKYKEAEV
IAKSLSGLIIPEKYAAAHERGMEHFLASGEGPVLNRRIELIGHDKEGRHFPLELSIIPFK
IEGHYYFSAFLRDITARKQAEEDMNIALEQQKELARMKSRLISMASHEFRTPLTTIKANA
EMLELWATKIPEEHREKANRYLERLNRETNRLSNIMTDILMLGRLESGRLNSQLKSLDLV
SFIHDMNDRHFSSQEDGRQLKIVLEGAPKLVRIDPEMLEHIIQNLVGNAFKYSKGRGNPS
LELNFGTDKVRLSVKDQGIGVPEEDQNKIFNSFYRAENTRGIQGSGMGLSVVKQMSDMQN
LNLRFFSKEGEGSEFVIDIPIYA
NT seq
2772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacccacaagaaatccctcaaggtattgatctaatttatcgcttcgacccgcaaggc
cgcttcacctatgtaaatgagaaggcacgggcgcttttcgatatggatatcgatgccatt
ttagggcagccctattacagctttgttcgggaagattttcaggaaaaggtggccgccttc
tatgcgctgcaaattgagaaacgtcaggcctcctcttattttgagtttccctttattgcg
gatggcaaagaaatatggattggtcaaaccattgaattggtttgcgagaataataaggtg
gttgaacttttgggagtggcgcgacccatcaccgaattacgaaaggttaaggccgatctt
aaggaaagcgatgagcatctattggccttactcaagcatttggatgcggccattttaatt
gaagatgcccaaggcaagattcgctatgtaaacgataatttctgtcgttatttccgatta
gattccagtccagctgaattagctggtcaagtatgcgccgaagtgggtgctggtattagc
cacctttttaagaatccggaggcatttggggctggcattggtcgttgtttggaagaacaa
gtgattcgccgcagtgagcgcatagccatggccgatgagcgggttttggaaagggactat
atccccatgcttatcgacgagcaaaacagagggaatttgtgggtataccgcgatgttacc
atgcgttacctaacggaacaggccctaattgaaagtgagaaaaaataccgagaggttatt
cagaatatcgacctgggtttgatggaagtagacaaggatgaaaccattctttgggctaat
gattccttcctaaaaactacggggcacgaattaaaaaatttacaaggcaaaaatgccaaa
gacacttttttaactgaggaggatatagcttttacagcaaaacgcttgaaagaaactcag
catttgcgagagcgcggtgaaagcagcgtttatgagcttcccattcgccataaggatggg
agtcaattgtggatgcaaatctctggagctcctattaaggatatcagtggtaaggtgatt
ggctctttgggaattcatcacaatattacccctttaaagtcattgcaaagtcaattggaa
taccgcctcaccttgcaggcaatcctattggatttggcgaatgatctgattttcctgaac
cccgataaagagaacgaagtaatccaaaaggccctgggcagattggggagctttgtaaat
gccgatcgggtttatattttcgattatcatttggatgaaaactataccaccaatacctat
gaatggtgtgcggagggtatcagtccagaaatagagaatcttcaggaagtacctttggaa
gccatccccgaatggtttgaaacccatgagcagggtaagcccatgatttatgatcgggtg
gccgatttgccagaaggacatccagttagggagatcctcgaacctcagggtattcaatcg
attataaccatgccggttttgggcaatggcaggcttagaggctttattggctttgatgcg
gtgcgcactcaaaaaagctggaatgcggatgaaaaggagctattggagtttatggcccaa
atgctggccgctcacaatattaaaaatgagtttgagaatcgtttaggtgccagtgagtat
cgcatgcgcacggttttggagaatgctttggatgccgtaatcaccatcaacgaaagtggt
ctggtagaagattggaatcatcaggcggagcagatgttcaaatacaaagaagcggaggtt
attgctaagtccttaagtggattaattattcctgaaaaatatgcagcagcgcatgaacgc
ggcatggaacattttttagctagtggagaaggtccggttttaaatcgcaggattgagtta
attggtcatgataaggaggggcgtcattttccgctggagctgagtattatcccctttaag
attgaagggcactattatttctcggcattcttacgggatattaccgcacgcaagcaagcg
gaagaagacatgaacattgccctggagcagcagaaggaactagcacgcatgaaatcgaga
ttgatttccatggcctcacatgaattccgcactccccttactaccattaaagctaatgcg
gagatgctggaactttgggccactaaaattccggaagaacatcgggaaaaggccaaccgc
tacttagagcgtctaaaccgcgaaaccaatcgacttagcaatatcatgaccgacatttta
atgttaggtaggctagagtcggggcgcttaaactcacaattaaaatctctggatttagtg
agtttcattcacgatatgaatgatcggcatttctccagtcaggaagatggccgtcaactt
aaaattgttttggagggtgctcctaaattagtgcggatagatccagaaatgctggagcat
attattcagaacctggtaggcaatgcctttaagtattccaagggaagaggaaatccaagc
ttagagctcaattttggcacagacaaggttcgcttaagtgttaaggatcaggggatcgga
gtgccagaggaagatcaaaacaaaatattcaactcattttaccgagccgaaaatacccgc
ggtatccagggaagtggtatgggattatcggtggtaaagcagatgagtgacatgcaaaat
cttaatttgcgtttctttagtaaggaaggggaaggttccgaatttgtaattgatatacct
atttacgcctag
DBGET
integrated database retrieval system