Chryseobacterium sp. StRB126: CHSO_2273
Help
Entry
CHSO_2273 CDS
T03602
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
chz
Chryseobacterium sp. StRB126
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
chz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
chz02000
]
CHSO_2273
Transporters [BR:
chz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
CHSO_2273
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
TonB_dep_Rec_b-barrel
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP31310
UniProt:
A0A077KGS8
LinkDB
All DBs
Position
2610070..2612985
Genome browser
AA seq
971 aa
AA seq
DB search
MNVRISRNLGVIAVLYFTANFSGQTKKDTLSKENKIDEIVVIGYGTQKKSNVTGAIASIK
ASDIENIPTGKPEQVLQGRAAGVSVVTNSGQPGAAATVRVRGITSFGAGSNSPLWVVDGI
VVDNIGWLNQSDIESIEVLKDGASSAIYGVSAAKGVILVTTKKGKKGKLVLSYNGFYGFS
NTAKKLDLLDATQYAKIINEGFVNDGQAPRFANPESFGKGTNWQDTIFGTGEKSSHEVSI
TGGNDKSSYYTSFGYFDQTGIVMTDISYYKRINARFNSTHKVTDYLTLGQTFAYTHTKSQ
GVSANEEYGGPLASAVNLDPITPEVVTDWSQVDPGGYTDPYIIRDPNGNPYGISRYVNNE
MTNPRAFRAIQQGNYNWSDDFVGNIFAELKFLNHFTFKSSLNGKKSYWGSRTFTPKYYLS
PSYRSTSFNSLNKVDENKFEWSMENTLTYQNKFGDHSLSILIGQGVYRYNVSGGASLTYS
NLPIDSWQDASFNFDVPQDDITAKGWDGIQTRKASYFGRIIYDYADKYLFTGTIRRDGSS
KFATNHHWGTFPSMSVGWNVHKEDFWPENKVINNMKLRGGYGVLGNDEMENFRFASFMVS
GSNYTTPGNNIIIGYAPSTLENPNLKWEQTSQLNIAADFKLFNNFTFTADWYKKKTTDIL
RQINIPGYVGVPNLPWSNVGDMENSGLELELGYKKNWQDFSISVNGNFATIKNKVLRLED
DINYFNLASFQTMGAVSRVAVGQPYGSFYGQTYSGVFQNQAQIDAYVNANGGKLLPDAKP
GDFIWQDNNGDGKIDEDDKVNLGSSIPKYTFGLTVNLNYKNFDFMVFAQGQAGNKIFQGL
RRLDVVDANYQTKILNRWTGEGSTNENPRVTRNDPNHNYTWMSNYYLQKGDYVRVKIVQL
GYTLPQDITSRFGMSKVRLYITGENLFTFTKYTGYDPEIAGRNNSEQDIIGVDRAYYPQA
RTFLLGANIQF
NT seq
2916 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgtaagaatatcgagaaatttaggagtgattgccgtcctctattttacggctaac
ttcagtggccagactaaaaaggacacgctttctaaggaaaacaaaatagatgagattgta
gtgattggttatgggacccagaagaagtctaatgtaaccggggcaatcgcaagtattaaa
gccagtgatatagaaaacatccctaccggtaagccggaacaggtgttgcagggaagggct
gcaggggtttctgtagtaactaattccggacaaccgggtgctgctgcaacagttcgagtt
cgtggaatcaccagttttggagccggaagtaatagtccgttatgggtggtagatggtatt
gtggtggataatatcggctggcttaatcagtctgatatagaaagtattgaagtgctgaaa
gatggagcatcatctgcaatttatggagtttctgcggcaaaaggagtaatcctggttacc
acaaaaaaagggaagaaaggaaaactggttctttcctataatggattttacggattttcg
aataccgctaaaaagctggaccttttggatgccactcaatatgccaaaattattaatgaa
ggttttgtaaatgacggacaggctcctcgttttgcaaatcctgaatcctttggaaaagga
acaaactggcaggataccatttttggaacaggagaaaaatcttcccatgaagtaagtatt
acggggggtaatgataaatccagttactatacatcgttcgggtatttcgatcagacaggt
attgtaatgacggatatctcttattataaaagaatcaatgcaagattcaattcaacccat
aaggttacagattatttaacattagggcagacttttgcctatacccatacaaaatctcag
ggcgtaagcgctaacgaagaatacggtgggccgttagcttcagcagttaacttagatcca
attacaccagaagtggttacagattggtctcaggtagatccgggtggttatacagatcct
tatattatccgtgatcccaatggcaatccttatggaatttcgcgttatgtaaataatgaa
atgaccaatccaagagcttttcgtgctattcagcagggaaattacaattggtctgatgat
tttgtagggaatatttttgctgaacttaaatttcttaaccacttcacattcaagtcgagc
ttaaatggaaagaaatcatattggggcagtcgaacctttacacccaagtattatttaagt
ccaagctacagaagtacaagttttaacagcctgaataaggtggatgagaataaatttgaa
tggagtatggaaaataccctgacttatcaaaataaatttggagatcacagtctaagtatt
ttaattgggcagggagtatatcgatataatgtatcaggtggggccagcttaacctacagt
aatctgccaattgatagctggcaggatgcttcttttaactttgatgttcctcaggatgat
attacagcaaaaggatgggacggaattcaaacccgtaaggcatcttattttggtaggatc
atttatgactatgctgataaatatttatttacagggactattcgtagagatggatcttca
aaatttgcgaccaaccatcattggggaacttttccgtcaatgtctgtaggatggaatgtt
cataaagaagatttctggccggaaaataaggtgattaataacatgaaactgagagggggt
tatggggttttaggaaatgatgagatggaaaacttcagatttgcaagttttatggtttca
ggaagtaattataccactccaggaaacaatattattataggatatgctccaagtacatta
gaaaaccctaatcttaaatgggaacaaacaagccagttgaatattgcagcagattttaaa
ctattcaataattttacttttacagcagattggtataagaagaaaactactgatatttta
agacaaattaatattccaggttatgtaggagttcctaatttaccttggtcaaatgtagga
gatatggaaaactcaggacttgagcttgagttggggtacaaaaaaaattggcaggatttc
agtatatcggttaacggaaactttgctaccataaaaaataaagtgttgcgattagaggat
gatatcaattacttcaatctcgcttctttccagactatgggagcggtatcaagagtagct
gtggggcagccctatggatcgttctatgggcagacgtatagcggtgttttccagaatcag
gcacaaattgatgcttatgtaaatgccaatggaggcaaacttttaccggatgcaaaacct
ggggattttatctggcaggataataacggagatggtaaaattgacgaggatgataaagtg
aatttaggaagttctattccaaaatatactttcggacttacggttaatttgaattacaaa
aactttgattttatggtatttgcccaaggacaggcaggtaataaaattttccagggacta
agaaggttggatgttgtggatgccaattatcagacaaagattttaaaccgctggacagga
gagggttctactaatgaaaatccaagggttacccgaaatgatcctaaccataattataca
tggatgtcaaattattatcttcagaaaggagattatgtgagagtgaaaattgttcagtta
ggatatacacttcctcaggatattaccagccgtttcggaatgagtaaagtgagactctac
atcacaggagaaaaccttttcactttcactaaatacaccggatatgatccggaaattgca
ggaagaaataattctgaacaggatattataggggtggacagagcttattatccacaggcc
agaacattcttgctgggagcaaatattcaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system