Citrobacter sp. CRE-46: AN232_14220
Help
Entry
AN232_14220 CDS
T05520
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
cie
Citrobacter sp. CRE-46
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
ResIII
Helicase_C
Spo16_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWS96279
LinkDB
All DBs
Position
2922829..2926353
Genome browser
AA seq
1174 aa
AA seq
DB search
MPATADEIIEAIKEASAVGFRGRLIARGQARSVIWRDGDLPPDAPEFSALLSQDLQGYAY
ALIDLGLRLRELNGDDAYARIAFEQAGTALESAIAKGKRDSRDTDFHFVMAAASYHLAHL
SARAYSLLAMVGQDDNFSPIERALTQLIRRDLRTLRDNALGFRLRGDGSDVKITEILQAR
LNLPQDENGDSESEEDILFDGLDLALTDAYMSAISLYLLAVERGESRLLSRAIEKLRISL
SICAQFNMLPQWWLNFITIHLLSDLWSDTFHERLPLVPVGGDAAEWPALRELFIALLQRR
PRAEIDLWPSQREAAGRSVNDNDDLVVSLPTSAGKTRIAELCILRCLAGGKRVVFITPLR
ALSAQTEATLSRTFGPLGKTISMLYGSIGVSGMDEDAIRQRDIVVATPEKLDFALRNDPS
IINDVGLFIFDEGHMIGADEREVRYEVQIQRLLRRQDADTRRIVCLSAILPDGEQLDDFA
GWLRRDKPGGPIKNNWRPTRLQFGEVIWSAPAGRLNLSVGYEAAWVSRFIVSRQPPKVKL
PNKKQRTKMFPSDNKELCLATAWRLIEDGQTVLIYCPLRRSVEPFAETIVDLHQRGLLPS
LFDAAPDILDTAISLGEEWLGAHSPILACLRLGVALHHGALPTAYRKEIERLLRDGVLKV
TISSPTLAQGLNLSATAIVMHSLHRNRELIKVSEFRNVIGRAGRAYVDVEGLVIYPIFDK
VNKRQTNWHTLTSDTGAREMESGLIQLVCVLLIRMHTRLGGDLKALTEYVTNNAVAWEFP
EIMTESPQERDIAQAIWEKQLSTLDTAILSLLGENDIPDDQIETALDDILQSSLWQRSLQ
RYRDENERILLKSGLLSRSRYIWQRSTAAGRRGYFLSGVGLTTGLRLDAIAAKANQLLID
ANAAIMGGDAEEAIAAITALAEEVFTFYPFIPDPLPGDWRGILRSWLLGEPMTNVANTQA
SETLQFVENGLVYRLPWAMEAIRVRATANGDLIGDTDTTLDDYELGFAVAAVETGTLSRS
SSLLIQAGFSSRLAAIKVVTDTTADFQSGQELRRWLNSEEVISHTDNHDWPTPETRVMWL
EFLGSLSPKGSQVWSRHRYNGMVDWRDTPAVIGTPLQLYTVDGIHHVLADDGTPLGSING
RINTNRRGLLRVEVDDENGRAMFDYLGPDDFIST
NT seq
3525 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccagcaacagctgatgaaattatcgaagctattaaggaagcttcagctgtaggtttt
cgcgggcgcctgattgcacgcgggcaagcccggtcggtgatctggcgagacggtgacttg
ccgccggatgcaccggagtttagcgcactgctcagtcaggaccttcaaggctatgcttat
gccctaatcgatctcggccttcgtcttcgagaacttaatggagacgacgcctatgcgcga
attgcttttgaacaggccggaaccgcactcgagtcggctattgctaaaggaaaacgcgac
agccgggatacagattttcacttcgtaatggctgctgcaagctatcaccttgcgcatctt
tcagcacgagcctattcgttactcgcaatggttggtcaggatgataatttttcaccaata
gagagggctcttacacaactgatccggcgtgatttgcgtactctgcgcgataatgcgttg
ggctttcggctcagaggtgatggcagtgacgtgaaaattactgaaatcctccaggctcgc
ctaaacttgccgcaagacgagaacggtgacagtgagtcagaggaggacatcctttttgat
gggcttgatttggcactgactgacgcctatatgtcggccatttctctctaccttctcgct
gtagaaaggggagaatcacgtttgctttccagggctattgaaaaattaagaattagtcta
agtatatgtgctcagtttaatatgctaccccagtggtggctaaactttattaccattcat
ctgttatctgacctttggtcagatacattccatgaaagattgccactggttccagttggt
ggtgacgctgctgaatggcccgcgcttcgggaactgtttattgcactgcttcaaagacga
cctcgagccgaaattgatctctggccatcgcagagagaggccgccggacgctctgttaat
gacaatgacgatttggttgtttcgttgccaaccagcgctggaaaaactcgtattgctgaa
ttgtgtattcttcgctgtctggcgggtggcaagcgtgttgttttcatcaccccgcttcgt
gcgctttctgcacaaacagaagccactctctccagaacatttgggccgcttgggaaaaca
atatcaatgctgtatggcagcattggcgtaagtggtatggatgaggatgcaattcgccag
cgtgacatcgtcgtcgccacgcctgaaaaacttgactttgctctccggaatgacccgtca
attattaatgatgtaggactttttatttttgatgaggggcacatgattggggccgatgaa
cgagaggttcggtatgaagttcaaattcaacggctgttgcgcagacaggatgccgatacg
cgcagaattgtctgcctctcggcaattctacctgatggtgagcaactcgatgattttgcc
ggttggctccgtcgtgacaagcccggaggaccaatcaaaaataattggcgaccgacccgc
ttgcagtttggcgaggtcatatggtccgctccagcaggtcggcttaatctcagcgtcggt
tatgaggcggcttgggtatcgcgttttatcgtcagcagacaaccgccaaaggttaaatta
cctaataaaaagcagcgaacaaaaatgtttccctctgataacaaggagctctgcttagcg
acagcctggcgtctaattgaagatggacagaccgtacttatctactgcccacttcgccgg
agcgtcgaaccgtttgccgagacaattgtcgatctgcatcagcgcggactactgccatct
ttatttgatgctgccccggacattctggatacggctatctcgctgggagaagaatggttg
ggggcacacagcccgatacttgcctgcctacggttgggcgtggctcttcatcatggcgca
ttgcctacggcttaccgcaaagaaatcgaacgtttgctgcgagatggggtacttaaagtg
acgatctcatcaccgacgctagcacaaggtcttaatctttcggcaacagctatcgtcatg
cattctcttcatcggaatcgcgagcttatcaaagtgtccgagttcagaaacgtcataggc
agagcagggcgcgcatatgtagatgttgaagggctggtgatttatccaatattcgataaa
gtaaataaacgccagactaactggcataccctcacatctgacacgggggcccgtgagatg
gagagcggactaatacagcttgtctgtgtgttattgattcgcatgcatacacggcttggt
ggggatttaaaagcactcactgaatatgtgaccaacaacgccgtagcgtgggaatttcca
gaaattatgaccgaatctccgcaagaaagagatattgcgcaggccatctgggaaaaacaa
ctttcaacgcttgatactgctattctgagccttcttggtgagaatgatatcccggatgac
cagattgaaactgctcttgatgacattcttcagtcttcactttggcaacgcagtttgcag
cgttatagggatgagaatgaacggattttgctgaaatcgggactcctgtcccgcagccgc
tacatctggcagcgctcaacggcagcagggcgccgggggtatttcctgtcgggggtagga
cttacaaccgggctacgacttgatgctattgccgctaaggccaaccaactattgattgat
gcgaatgcggctataatgggcggtgatgccgaagaggcaattgctgctatcacggcgctc
gctgaagaggtctttaccttctatccgtttatacccgatccattgcctggcgactggaga
ggtattttacgttcctggctattgggtgaacccatgactaacgtcgcgaatacgcaggcg
tctgaaacgcttcaattcgtcgagaatgggctggtgtatcgacttccgtgggcaatggag
gctattagggtacgtgcaacagctaatggagacctcataggtgatacagataccacgcta
gacgattatgagttaggttttgcggttgctgctgttgaaacaggtaccttgagccgttcg
tcttcactgcttattcaggcgggttttagctctaggcttgcagccataaaagtggttaca
gacactactgccgattttcaatccggccaggagcttagaaggtggctgaactctgaagaa
gtgataagccacacggataatcatgactggcctacacctgaaaccagagtgatgtggctg
gaattcttgggtagtctcagccccaaaggcagccaggtttggagtcgtcatcgttataac
ggaatggtggactggagagatactccggcagtgatcggcacaccattgcagctttacact
gttgatggtattcatcacgtactggctgatgatggcactcctctgggaagtataaatggc
agaattaacacaaacagaagaggtcttcttagagttgaggtggatgatgagaatggtcgt
gccatgttcgattatttaggaccggacgactttatttctacctga
DBGET
integrated database retrieval system
