Carya illinoinensis (pecan): 122276552
Help
Entry
122276552 CDS
T08745
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cill
Carya illinoinensis (pecan)
Pathway
cill03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cill00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122276552
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cill03019
]
122276552
Messenger RNA biogenesis [BR:
cill03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
122276552
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122276552
NCBI-ProteinID:
XP_042942309
LinkDB
All DBs
Position
1:44021551..44029871
Genome browser
AA seq
471 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEHFENYGDVLQTVVMRDKTTGRPRGFGFVVFTDPSIL
DRVLLDSHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSAKSVNPSLARSSGGGGTFRTKKIFVGGLPST
LGEEEFREHFEAYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDDEEAVDRVLHKSFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGNRTMGGGGSGSLGSGYQNYGASGGNPNTYDGRMDSSRYMQTQSSG
GGFAPYGSSGYSAPGYGYGPANNGISYGAYGSYGGANTGYGGPAGAAYGSPNLPNAGFGS
GPPGASRSSWSAQAPTGYGAMGYGNTAAWGAPGGSTGAPSGGPGSAPTGQSPSGATGYGN
QSYGYGGYGGSDGSYGNPVGYGAVGGRSGSVPSNNAGGPAGGDMQGSGGGGYMGSGYGDA
NGNTGYGNAAWRSEQSQTSGNYGASQVNGPHGGQVGYGGGYANAQARTQQQ
NT seq
1416 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaggggaagctgttcatcggcggtatttcttgggagaccacggaggaa
aagctgaaggagcactttgagaactacggggacgtgttgcagactgtggtgatgagggac
aagaccactgggaggcccagagggttcggcttcgtggtcttcacagatccttccattctc
gatagggttctcctggacagccacaccattgatggcagaacggttgaggctaagagggcc
ttatcgagagaggaacagcagacttctgccaaatctgtgaatcctagtcttgctagaagc
tctgggggtggtggaactttcagaaccaagaagatatttgttggagggctgccttctact
ttaggtgaagaagaatttcgtgagcattttgaggcttatggccatgtaactgatgtagta
gtcatgtatgaccagaatactgggcgacctcgtgggtttgggtttattacctttgatgat
gaagaagctgttgatagggttttacacaaaagctttcatgatttaaatggtaaacaagtg
gaagtaaagcgagctcttcctaaagatgcaaatcctggtgggggaaaccgtaccatggga
ggcggtggtagtggttcacttggcagtggttatcaaaactatggggcatctggtggcaac
ccaaatacatatgatggtcgaatggattccagtaggtacatgcagacacaaagttccgga
ggtggttttgctccttatggttcctctggatatagtgcacctggctatgggtatggtcct
gccaataatggtattagttatggtgcttatggcagttatggtggtgccaatactgggtat
ggtggacctgctggtgcggcatatggaagcccaaatcttcctaatgctggttttggaagt
ggcccaccgggtgcttctagaagttcatggagtgctcaagctcccactggatatggtgcc
atgggttatgggaacactgctgcttggggtgctccaggtggcagcactggtgctcctagt
ggtggccccggctcagcacctacaggtcagtcgcccagtggggccacagggtatgggaat
caaagttatggctacggtggttatggtggaagtgatgggtcttatggaaatcctgttggg
tatggtgctgttggaggacgttctgggagtgtcccaagtaacaatgctggtggtcctgct
gggggagatatgcaaggaagtggtggtggtggctacatgggaagtggctatggtgatgcg
aatggaaatacagggtatggaaatgcagcatggagatctgagcaatcgcagacttctgga
aattatggtgcttctcaggtgaatggccctcatggtgggcaggttggctatggtggtgga
tatgccaatgcccaggcccgaacccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
