Carya illinoinensis (pecan): 122300650
Help
Entry
122300650 CDS
T08745
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cill
Carya illinoinensis (pecan)
Pathway
cill03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cill00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
122300650
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cill03019
]
122300650
Messenger RNA biogenesis [BR:
cill03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
122300650
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_11
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122300650
NCBI-ProteinID:
XP_042967395
LinkDB
All DBs
Position
2:28004548..28008486
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKDYFENYGDVIQTVVMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSVL
DRVLLDIHTIDGRTVEAKRALSREEQQTSAKAGNPSLARSSGGGGTFRTKKIFVGGLPAT
LSEEGFRQHFETYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDRVLHKNFHDLDGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRSMGGGAGGGGSLGSGYQNYGASGGNPNAYDGRMESNRYMQPQS
TGGGFGPYGSSGYSTPGYGYGPANNGISYGGYAGANTGYGGPAGAAYGNPNIPSAGFGSG
PPGAPRSSWSTQSPTGYGALGYGNTAAWGAPTGSTGAPSGGPGSAPTGQSPSGATGYGNQ
SYGYGGYGGSDGSYGNPGGYGAVGGRSGSVSNNNAGGPGGGDMQGSGGGYMGSGYGDANG
NPGYGNAAWRSEQSQTSGNYGAPQGNGPHGGQVAYGGGYGSAQARTQQQ
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaggggaagctattcataggtgggatctcgtgggagactacggaggag
aagctgaaggattactttgagaactacggagacgtgattcagactgtagttatgagggac
aagactactggcaggcccagggggttcggcttcgtggtctttgcagatccttccgttctc
gatagggttctcctggacatccacaccattgatggcagaacggttgaggctaagagggca
ttatcaagagaggagcagcaaacttctgccaaagctgggaatcctagtctagctagaagt
tctgggggtggtggaactttcagaaccaagaagatctttgttggaggattgcctgccact
ctaagtgaagaaggatttcgtcagcattttgagacttatggccatgtaaccgatgtagta
gtcatgtatgaccagaatactggacgacctcgtgggtttgggtttattacctttgacact
gaagaagctgttgatagggttttacacaaaaacttccatgatttagatggtaagcaagtg
gaagtaaagcgggctcttcctaaagatgcgaatcctggtgggggtagccgttcaatgggt
ggtggtgctggtggtgggggttcacttggtagtggttatcagaactatggggcatctggt
ggtaacccgaatgcatatgatggtcgaatggaatccaataggtacatgcagccacagagt
actggaggtggttttggtccatatggctcctctggatatagcacacctggctatggatat
ggtcctgccaataatggcattagttatggtggttatgctggtgccaatactgggtatggt
ggacctgccggtgcagcatatggaaacccaaatattcctagtgctggttttggaagtggt
ccaccaggcgctcccagaagttcatggagcactcaatctcctactggatatggtgctctg
ggttatggtaatactgctgcttggggtgctccaactggaagcactggtgctcctagtggt
ggcccaggctcagcacctacaggccagtcgcctagtggggccactggttacgggaatcaa
agttatggctatggtggttatggtgggagtgatgggtcttatgggaatcctggtggatat
ggtgctgttggagggcgttctgggagtgtgtcaaataacaatgctggtggtccaggtgga
ggggatatgcaagggagtggtggtggatacatgggaagtggctatggtgatgctaatggt
aatccagggtatggaaatgcagcatggagatctgaacaatcacaaacttctggaaattat
ggtgctcctcaggggaatggtcctcatggtgggcaggttgcctatggtggtggatatggc
agtgctcaagcccgaacccaacaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
