Carya illinoinensis (pecan): 122309423
Help
Entry
122309423 CDS
T08745
Name
(RefSeq) cellulose synthase-like protein D3 isoform X1
KO
K20924
cellulose synthase-like protein [EC:2.4.1.-]
Organism
cill
Carya illinoinensis (pecan)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cill00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
cill01003
]
122309423
Glycosyltransferases [BR:
cill01003
]
Polysaccharide
Structural polysaccharide
122309423
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cellulose_synt
zf-RING_4
zf-UDP
Glyco_tranf_2_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
122309423
NCBI-ProteinID:
XP_042978840
LinkDB
All DBs
Position
5:41996190..42011358
Genome browser
AA seq
1148 aa
AA seq
DB search
MASRSFKASRSNLSSTSDAPPEALNKPPMPPTVTFGRRTSSGRYINYSRDDLDSELGSGE
FMNYTVHIPPTPDNQPMDPSISQKVEEQYVSNSLFTGGFNSVTRAHLMDKVIESETSHPQ
MAGAKGSSCAIPGCDANVMSDERGVDILPCECDFKICRDCYIDAVKTGGGICPGCKEPYK
NTDLDEGAVDNNGRPLPLPPPNGMSKMERRLSLMKSTKSALMRSQTGVGDFDHNRWLFET
RGTYGYGNAIWPKDGGFGNGKDDETVEPTELMNRPWRPLTRKLKIPAAVLSPYRLLIFVR
MVVLALFLAWRINHPNNDAIWLWGMSIVCEIWFAFSWLLDQLPKLCPVNRSTDLNVLKEK
FETPTLNNPTGKSDLPGIDIFVSTADPDKEPPLVTANTILSILAADYPVEKLACYVSDDG
GALLTFEAMAEAASFANIWVPFCRKHDIEPRNPETYFNLKRDPYKNKVKSDFVKDRRRVK
REYDEFKVRINGLPDSIRRRSDAYHAREEIKAMKLQRQNRDDEPVEIVKIPKATWMADGT
HWPGTWLNASTEHSKGDHAGIIQVMLKPPSDEPLHGGADESKLIDLTDVDIRLPLLVYVS
REKRPGYDHNKKAGAMNALVRASAIMSNGPFILNLDCDHYIYNSQAMREGMCFMMDRGGD
RICYVQFPQRFEGIDPSDRYANHNTVFFDINMRALDGVMGPVYVGTGCLFRRVALYGFDP
PRSKEHHTGCCSCCFGSRKKHYSVESSPGENRALRMGDSDEEEMNLSLLPKRFGNSTFLI
DSIPVAEFQGRPLADHPAVKNGRPPGALTIPRELLDASTVAEAISVISCWYEDKTEWGQR
VGWIYGSVTEDVVTGYRMHNRGWKSVYCVTKRDAFRGTAPINLTDRLHQVLRWATGSVEI
FFSRNNALLASPRMKLLQRIAYLNVGIYPFTSIFLIVYCFLPALSLFSGQFIVQTLNVTF
LAYLLIITLTLCMLAILEIRWSGIELEEWWRNEQFWLIGGTSAHLAAVLQGLLKVLAGIE
ISFTLTSKSGGDDVDDEFADLYIVKWSSLMIPPLTIIMVNLIAIAVGFSRTIYSTIPQWS
KLIGGVFFSFWVLAHLYPFAKGLMGRRGRTPTIVFVWSGLIAITISLLWVAISPPSGQDQ
IGGSFQFP
NT seq
3447 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtccaggtccttcaaggcgagccggtcaaatctatcgtcaacctccgatgcgcct
cctgaagcacttaacaaacctccaatgcctccgactgtgacatttggtcggaggacttcc
tcaggtcgctacatcaactactcaagggatgatctagatagtgagcttgggagtggtgaa
ttcatgaattatacagtacacataccgccaactcctgacaaccagcctatggatccatcc
atatcgcagaaggttgaagaacaatatgtgtcaaattcgctcttcacaggtggtttcaat
agcgttacacgagctcatctcatggacaaggtgattgagtctgaaaccagccatccccag
atggctggtgcaaaagggtcctcgtgtgcaattcctggatgtgatgctaatgtgatgagt
gatgagcgtggggtggacattcttccttgtgaatgtgatttcaaaatatgtcgtgattgc
tatatagatgcagtgaagacagggggcgggatttgcccaggatgtaaggaaccttataag
aacacagatttggatgaaggagctgtggataataatgggcggccgctccctcttcctccg
ccaaatgggatgtcaaaaatggagaggaggttgtcgttgatgaagtcaaccaagtcagca
ttgatgaggagccaaactggggttggggactttgatcacaatcggtggctgtttgaaaca
aggggaacatatggatatgggaatgccatatggccaaaggatgggggttttggaaatggg
aaagatgatgaaactgttgagccaacagagttaatgaacagaccgtggaggccacttacc
cggaaattgaagatacctgctgctgttctcagcccgtatcggcttctaatttttgttcga
atggttgttcttgcactgtttttggcatggaggatcaaccacccaaataatgatgcaatc
tggctatggggaatgtccattgtctgtgagatttggtttgctttttcttggctccttgac
caacttcctaagctctgcccggtcaatcgttctacagatcttaatgtcttgaaagaaaaa
tttgaaacacctaccctaaacaaccccactggaaaatctgatctcccaggcatagatatc
tttgtctctactgcagatccggataaagagccgcctcttgtcactgcaaacactatcttg
tctattcttgcagctgattacccagttgaaaagcttgcttgctatgtttctgatgacggt
ggtgcacttctaacctttgaagccatggctgaagctgcaagctttgccaatatatgggtt
ccattctgtcgtaaacatgatattgagcccaggaacccagaaacgtacttcaatttgaag
agggatccttacaagaacaaggttaagtcagattttgtcaaggatcgtagacgagtaaag
cgtgagtatgatgagttcaaggtccgcatcaatggcctgcctgactcaatacgtcgccga
tcagatgcgtatcatgctcgagaggaaatcaaggcaatgaagcttcagcgacagaataga
gatgatgaaccagtagagattgtgaagatcccaaaagcaacatggatggctgatggtaca
cactggccagggacttggttgaatgcttctaccgagcactctaaaggtgaccatgctggt
ataatacaggtgatgttgaaacctcccagtgatgaaccactacatggaggtgctgatgaa
agtaagctcattgacctcactgatgttgatattcgtctccccttgcttgtttatgtgtct
cgtgagaagcgtccgggctatgatcacaacaagaaggctggggccatgaatgctctggtt
cgagcctcagctattatgtccaatggccccttcattctcaaccttgattgtgaccactat
atttacaactcccaagcaatgagggaaggcatgtgcttcatgatggatcggggaggtgat
cgcatttgctatgttcagtttcctcaaaggtttgagggtattgatccgtccgatcgatat
gccaatcacaacactgttttctttgacatcaacatgcgagctcttgatggggttatgggc
cctgtctatgtcggaactggttgcctctttcgaagggttgccctttatggctttgaccca
ccgagatctaaagaacaccacactggttgctgcagttgctgctttggtagtcgtaaaaag
cattactcagttgaaagctccccaggagagaatcgagccctaagaatgggtgattctgat
gaggaagagatgaacctctctttgctccctaaaaggtttgggaactctacttttcttatt
gattcaatcccagtggcagagttccaaggtcgtcctcttgcagatcacccagctgtgaag
aatggacgcccacctggtgctcttactattccccgtgagcttcttgatgcatcaactgtt
gcagaggcaatcagtgtgatctcctgctggtatgaagataaaactgagtggggacagcgt
gttgggtggatttatgggtccgtgactgaagatgtggtcactgggtatagaatgcacaat
agggggtggaaatcagtttattgtgtgaccaaacgtgatgccttccggggaactgctcca
attaatctcactgataggctccatcaagtccttcggtgggctactggatcagttgagatt
ttcttctcccgtaataatgccctcctggccagcccgagaatgaagcttctgcagaggata
gcgtaccttaatgttggcatctacccttttacttcaatcttcctgattgtctactgcttc
ctccctgcactgtcactcttctctggccagttcattgtccagaccctcaatgtcactttc
ctcgcctacctccttatcatcactttgactctatgcatgcttgctattcttgagatcaga
tggtctggcattgagctggaagaatggtggagaaatgagcagttttggttgattggaggg
actagcgctcacctggctgctgtgcttcagggacttctgaaagtccttgctggaatagaa
atttctttcactctgacatcaaaatcaggaggtgatgatgtggatgatgagttcgctgat
ctctatattgtcaaatggtcatccctgatgataccaccactcacaatcataatggtcaac
ttaatcgcaattgctgttgggtttagccgaacaatatacagcactataccacagtggagc
aaattaataggcggtgttttcttcagtttctgggtcttggctcatctatacccttttgcc
aaagggctgatgggacggagagggagaacacccaccattgtttttgtatggtcaggcctc
attgcaatcacgatatccctcctttgggtggcaatcagtcccccttctggtcaggaccaa
attggaggttcattccagttcccctga
DBGET
integrated database retrieval system
