Ciona intestinalis (yellow sea squirt): 100176310
Help
Entry
100176310 CDS
T01056
Name
(RefSeq) calcium-activated chloride channel regulator 1-like isoform X1
KO
K05030
calcium-activated chloride channel regulator 3/4
Organism
cin
Ciona intestinalis (yellow sea squirt)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
cin04040
]
100176310
Ion channels [BR:
cin04040
]
Chloride channels
Chloride channel, calcium-activated (CaCC)
100176310
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CLCA
Sushi
VWA
VWA_2
VWA_3
VWA_CoxE
DUF1194
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100176310
NCBI-ProteinID:
XP_009861981
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1690 aa
AA seq
DB search
MSLPSVIGIILVTVVTVGGDFASVTLVNNGYDGIVVAINPAVAEDETLINKIRNMFTRAS
PTLFTATKKRAYFRNINILVPKTWTSGSYQTAVGLTYRKADVIIAPPNPVRGDNPYVLQT
GACGEPGTHMHLTPEWVNDTRESVYGPSDKAIVHEWAHLRWGVFDEYATGDHKRHYLDSN
NVLQGTRCPLSIRGVNREYVPPYQVLNQTCIINQTTLLPASDTCHFIPGIEQPRGLKTSM
MFYSYLSSVIEFCHSDPSDPVNQHNTEADNEQNAKCNLRSTWDVITSTSDFSGGSNPPNP
TLTNLAPTFRVVRVAASRRFVLVLDVSGSMSGNRLLMMRQSAGDFISTSLPDGDKVGIVQ
FHSSANLMMEIRQISSQLDRVAIAAGIPGIAGGSTCIGCGIYAAMNEMERHDANETCGNI
IVLTDGKENQPPYVNDVSQLAIQKNCVVNAILFTTTENSALVDLVTATGGQWFFAQDRDL
KRLMGSFAVIAANDDGDVRNLVSTILYKQYVFAAGESKAGSVIIDSTVGINTTFKFSYQS
QVPTIVLTNPTGCLHYSLSIPLPGTCASHPLANIDTTLKFVEFVIPGRATIGTWNYSITS
MYSDTVSVSVTSKTMGNVQPIVVLTRTRSNSNIVLGPVIIEATVTRGDPGLPVLNLTVVA
VIETPESTEERLQLLDNGGSPDMVRNDGVYSAMFFNYTSRGRYSIQVEVNGSLSNSGDTT
FTSKAPLIFGVRFPNGTVAGNPEAGESQPSTGGTGGGGGFTRVTTGGAIEFAGEVTPPEF
DTLAPIQINDLTATQEDPNDVTSGIRLSFTAPGDDMASGRATSYKVCYTFGDPTHLSTNF
DGNICHTPPVQPQVANTRESFIIKSPDTTGMTGSIRMAIAVKALDEMGNESPVSNLVILR
FFIEPPIPKCPDAPPPSPNSRAPVFSSTPVVITGTNHYNNGTTVTYTCIDGLAFADGFSQ
TYSCIFGVWEITSAPVCYGLCPRAPTEDVNGQPPIYSQSPTLGGKYLSGTTAHYNCMEGH
TTHVDDGNTLVCFDGSWASDNPPQCWQVCSHAPAIMENSGPILYSTEPMTISGSERYRTG
TAASYTCAASFSVAVAVANTRTCHDGAWNATTPLCLPECGEAPTASPNGNPPSYNPSHDD
MYMLTSYPSETNATYRCTDEFAFPLGVADTLTCYAGVWSATHAPLCEAVCSSAPPPSIHG
IQPVYNSQHLVMNDGNKYVAGTTATYTCSTNYALSASVSDVLTCKHGSWLQHTSPQCVQV
CSDPSNETSVSFNPPQTDGTFRNATIATYTCTTGFAFPVGVGETQICLRGVWVGGKPQCQ
PVCEVAPPTSTHGLPPIYNSQPINNKYRSGSVAMYNCMEGYKLAVNVGNTMSCGNGAWSM
NSSPTCLPVCGDPPTPSSNGNQPTLNVAQVQTLGGWYYISGSVATYTCTTNHSFAVGVGS
TLTCNAGDWGTDHAPRCLEMCVDAPEHSSHSFPPTYTPSPTTVTHKSGTIALYHCGAGYA
VAVGVSNTLTCNDGRWFEPLAPLCPAVCGSPPPSGSSGFDPTYQVPPVTQQPQTYRTGTV
ATYTCPPTYRFLDEVSGDLICNNGAWNATFSPRCRPGIRCMKCVGETHQECDNSGTFITC
QNNQGQCAVEIRTSETGVQTISKYCKQRDACFNDQVQNTHDCRGGGRSTVCRCCCANNKC
NIGDSSCTFD
NT seq
5073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcattaccaagtgtgatcggaattatattagttacggttgtaacggtaggcggggat
ttcgcttctgtgacgttggtaaacaacggttatgacggaatagtggtggccatcaaccca
gctgtagcggaggatgaaacgttaatcaacaaaatacggaacatgttcacacgagcttct
ccgaccctattcacagcaaccaagaagagagcttactttcgtaatattaatatacttgtg
cctaaaacatggacgagtggaagttaccagacagcggttgggctaacctacaggaaggct
gacgttataatcgcgccacccaatcccgttagaggagacaacccctatgtgttacagaca
ggcgcatgtggcgaaccgggcactcacatgcatcttactccagagtgggtgaacgacact
cgtgaatctgtatacgggccttcagataaggcaattgtacacgagtgggctcatctacgg
tggggggtgtttgacgaatatgctactggcgatcataaaaggcactacctagattccaac
aatgtcttacagggaacaagatgcccgctcagcatacgaggtgttaacagagaatacgtt
cctccttatcaagtgctgaaccaaacatgcatcatcaaccagacaacgttgttgccagca
tcggatacttgtcactttatcccgggcattgagcaaccacgtggtctaaaaacctctatg
atgttttatagctacttgtcatcggtgattgaattctgccacagcgatccaagcgacccg
gtcaaccaacacaacactgaagctgacaacgaacaaaacgcaaaatgtaatttacgaagc
acctgggatgttataacttcaacgagtgacttcagtggcggctccaaccccccgaaccca
accctaaccaacctagccccaacatttcgagtggttagagttgcggcaagccggaggttc
gtgttagtgttggatgtatcggggtctatgagcgggaaccgattattaatgatgcgacaa
agcgctggggattttataagcacgtcacttccggatggggataaagttggaatcgtccaa
ttccattcaagtgcaaatcttatgatggagatcagacagataagttcccaacttgacaga
gtggcgattgcggccggtatcccaggtattgctggagggtcgacgtgcattgggtgtggg
atatatgcagccatgaatgagatggaaagacacgatgccaacgaaacatgcggcaacatt
attgtgctgacagacggcaaggagaatcaacctccctatgttaacgatgtttcccagtta
gctatacagaagaactgtgtggtgaacgccatcttattcaccaccacggaaaactcggcc
ttggttgacctagtaacagctacaggcggccagtggttctttgcacaagacagggacctc
aagcgactgatgggttctttcgccgtcatcgctgcaaatgacgatggtgacgtcagaaac
cttgtctccacgatcctttacaaacaatacgtgtttgctgctggggaaagtaaggctggt
agtgttataatcgacagtacagtgggcatcaacacaacatttaaattctcgtaccaatcc
caagtcccaactattgtgctgaccaatccaaccggttgcttacattactcactatcgatt
ccgcttcctgggacatgtgccagccacccacttgccaatattgacacaacgttaaagttc
gttgagtttgtgattccaggcagagctacgattgggacttggaattattccatcacatcg
atgtatagtgacactgtaagtgtttctgtgacgtcaaaaacgatgggaaatgttcagcca
attgttgtgttgacccgaactcgatcgaattcaaatattgtgctcggtcccgtcattatt
gaagcaactgtgacaagaggtgacccaggactacctgtgctaaaccttactgtggtggca
gtcatagaaacgccagagtccaccgaagaaagattacaactccttgataatggaggaagc
cctgacatggtacgcaacgatggggtatattcagccatgtttttcaactatacatctcgt
ggtcgctacagtatacaggttgaagttaatggatccttgtcaaatagtggggatacaacc
ttcacatcaaaagcaccgcttatatttggggttcggtttcctaatggtacggtggcaggc
aaccccgaggctggggaatcccaacccagcacgggggggacgggtggtggtggtggtttc
acccgcgttacaactggtggagcaatcgaatttgcaggagaagtcaccccaccggagttt
gacacgttggccccgattcaaataaatgatttgacggcaacacaggaagaccccaatgat
gtcacaagcggtattcgattgtcgtttactgcaccaggtgatgatatggcttctgggaga
gcgacttcatataaagtttgctacacatttggtgatccaactcacctctcaacaaacttt
gatgggaacatttgtcacacaccccccgtccaaccacaagtcgcaaacacacgagaatct
tttatcatcaaatctcctgatacaacgggaatgacgggctctataaggatggcaattgca
gtgaaagctttagatgaaatgggaaacgagtcacccgtatcgaacctcgtaattcttcga
ttctttattgaacctccaataccaaaatgccctgatgccccacccccttccccaaacagc
agggcaccagtgtttagttcaacacccgtggtgataactgggaccaaccactacaacaat
gggaccacagttacttacacttgcattgatgggcttgcttttgcagacggcttttcccaa
acctatagttgtatctttggtgtttgggaaatcacatccgctccagtctgctatggattg
tgcccacgtgccccaacagaagatgtgaatggccaaccaccaatctattcacaatcacca
acattgggtggaaagtatttatcgggtacaacagctcattataattgtatggaaggtcat
acaacccatgttgatgatggcaacacattggtttgctttgatggatcctgggcttctgac
aatccaccacaatgctggcaagtgtgtagccatgcgccagccattatggagaactcgggt
cccatattgtattcaactgaaccaatgacaatatcgggaagtgaaagatatcgcactgga
acagcagcaagttatacctgtgcagcttccttcagtgttgctgtggctgttgcaaacact
cgcacgtgtcacgatggggcttggaacgccacaacaccattatgtctaccagagtgtgga
gaagccccaactgcctccccaaatggcaacccaccaagttacaatccttcccatgatgac
atgtatatgcttacatcttacccaagtgaaactaacgcaacatatcggtgcaccgatgaa
tttgctttcccccttggtgtggccgatacattaacatgctatgctggggtttggagtgcc
acgcacgccccactatgtgaagcagtttgttccagcgcccccccaccttccatacacggc
atccaacctgtatacaacagtcaacatcttgttatgaatgatggcaacaaatacgtggct
ggtacaactgctacatacacatgcagcaccaactatgcattatctgccagtgtatccgat
gtattgacctgcaaacatggctcatggctccaacatacatcccctcaatgcgtacaagtt
tgtagtgatcccagtaatgaaacaagtgtaagtttcaacccaccacaaactgatggtaca
ttcagaaacgctacaatcgccacatacacttgtacaactggctttgccttccctgttggg
gttggtgagacacaaatatgtttaaggggtgtttgggtgggaggcaagccacaatgtcaa
ccagtttgcgaagttgctccccccacctccacccatggtttgccacctatctacaactca
caaccaatcaacaacaagtacagaagtggcagtgttgccatgtataattgtatggaaggt
tacaaacttgcagtaaatgtggggaacactatgagctgtggtaatggtgcatggtcaatg
aattcatcaccaacgtgtctcccagtatgtggagacccacctactccttcatctaatggt
aaccaaccaacattgaatgttgcccaagtacaaacacttggtggatggtattacataagc
ggttcagtggcaacatacacatgcacaactaaccattcgtttgcggttggtgttggttca
acattgacatgtaatgcaggggattggggtacagaccacgcaccaagatgtttggaaatg
tgtgtggatgcacctgaacattcatcccatagtttcccaccaacatacaccccaagcccc
accactgtaacacacaagagtggaaccatagctttgtatcattgtggggcaggatatgca
gtggctgttggtgtttctaatacattaacatgcaatgatggaaggtggtttgagccactg
gcaccattatgtcctgcagtgtgtgggtcaccgcccccatcaggctctagtgggtttgac
ccaacatatcaggtaccccctgtcactcagcaaccacagacatacagaacagggacagtg
gccacttatacgtgcccgcctacatatagatttctcgatgaagtttcaggagatttgatt
tgtaataacggggcatggaacgcaacattttcacccagatgtaggccaggtatacgttgc
atgaagtgcgtcggtgaaactcatcaagagtgcgacaattctggtacatttatcacttgt
caaaacaaccagggacaatgtgcggtggagattcgaacgtcagaaactggtgttcaaacg
atttctaaatattgtaaacaacgtgacgcctgctttaacgatcaagtgcagaacacccac
gattgtagaggtggtggaaggagtaccgtgtgtcggtgttgttgtgcaaacaataaatgt
aacatcggcgattcttcgtgtacgttcgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
