| Entry |
|
|---|
| Name |
(RefSeq) MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 2
|
|---|
| Organism |
cin Ciona intestinalis (yellow sea squirt)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
4:292767..319538
|
|---|
| AA seq |
3122 aa
MLTFYSHVYGSNTGTLSVFYKEENGLPMLLWSISEDMDNHWRPMQVTITATTSYQIIFES
IVGSEVGDGHDIAIDDILLLPNACPPLGSCTFEDGLCTWQNSENSDDFDWLRAAGESMTA
DTGPTVDHTLGTPYGVYLLMEASTPQVEGDMARLFSVRLDNSVPRCLQFFYHMRAKTPTG
MGSIKVIQYWNSDYNYELWEDHSTYGDQWVEAMVDLPNNVTQDDMFVIRIQAYVGSSAYA
DIAIDDINLMLGVCPYVPTAPPDCAYYCDPSNPSTSVCIPAASVCDFNIDCPVDGIDEIN
CEYDCTFDLDLCGWMEASSGSFRWSQGSGSTPDANTGPSGDHTGNGRYMYVDADSGVSGS
QAHLVSKVIPQSGPQCEMTIYYHMYGDHIGTLQVNKKINGQDNIMWSLVGNQANAWYQAI
VKLGRTNTPFQIDVTATRSFDVLGDIAIDDIAFQNCGLPVPQSSCLAQEFQCDRGACVDV
ARICDYTDDCGDMSDEADCTAYPARCNFENGGICDWTQDNDDVFDWTVSSGFRCRADTGP
CVDHTTSTRDGKFLFIDSSTQISGETARILSPTMISRVNAEDCSLRLHYHMYGENVRSLT
VFTRTQIGGPLEQQWKQHGTQGDAWERTEVKLKPIANIPFQVLIEAMSPNSALGDIAIDD
ISFSNSCEVDGSVLPPGTTVATTTESPCPGDLEFHCGDGTCMHIEKYCNGVTDCSTGLDE
LYCGDCTFETDMCGWDDVSSGLYQWDRVSSGSVIYPSSDHTQISGSGWFAYVDPAAGDYM
NYAHLISPLLPQTSTTCAINFWYYMYSPTDSFDAKIALLLNNEDGSQIIWSSAINGGNRW
NNQNMVVGAQNHGHYFVFEVYHGSNGASAALDDISFIDCQQSSSNQCDFGQFACTTGSCI
PIENRCNFVDECGDNSDEQGCPSYQACDFNTDFCLWETDPSSTLTLTRGISYDSNSPTTD
HNNNAGGSYLYVKATSANNNQQSYLNGPVVYPVDGTACQIRFFSNIYGLDSGRIDIGIRT
TSSGYSLVSSIVTINNDQLWHKQSVPLSSKEYFQVVIGVIRGVADQGTISIDDVSLSPSC
KVDPNAILPCPANNLPCDNGYCLAADKFCNFQTECPDSSDELTCPSTCDFESAGGLCQWS
NDPKNSIHWTHQQAISSSPVGTGGPATDHTSGTNQGNFVILKSTNQVSVNSKVSLLSPTF
SQAGLTCSIQFWLYMYGDFATLRIKTVTDTDSKEYWQQNGDQGSQWIKHIVKLPTCLKDF
QISFEVEVISASLGSIALDDVSFLSCEYPDATPGSTCSANQKQCMSGHCIDADYWCDFNY
DCCDATDENAFECASYSRCNFERDYCEWKKPSDGSGNEWLVGKSPSNNPAFDHTSNLENG
KYLYVDSSSMSGSAQLQSFVYSSTSSQCYIRFYSFIEGPGAQSLKVIVVTTTGESVKLTL
APDVSAQWTRRSILLTPANSAFQVVLEGLVQSISPGVIAVDDISFSEGCIKSPNEGPVIP
GGQTTTIMPPYVCDGNSFFCDESGFVCVDPDKECDFNMDCPNNKDEENCPTQCSFEGTPS
IDGSKCGWGESIASQLDSFNWVISDAQSAIIGMAPTTDHTTMSQQGSFAYITKLGYQPLQ
TAELVSPMFKKSFSTCKIVLYYYQTGISPGQTDVVLTTNNEFSLMASITNNGDSNWKALA
LDIGKQVYTFQISITKVDEGYDGITAIDDVNFIGCNTPLPSSCNPANQFQCTTTHVCVDQ
HDNICDGVDDCGDYSDESGCQTTFITTFETGLNGWSQDNIDEFDWTLQSKYSETTTGPLR
DHTLSNKFGNYVVMSSASQTAGDRAWLNSSPMQSRTNCELRFWFYMNGPDVYRLSVYTRI
NTNGGFNHLKDFIGEPTDNMLWQRAVIPLIVDDPFVVVIEGVVGYGNVGFIAIDDVSFST
ECSTYNGVLPTLPNGGTPSEPNPPSSCDESIEFSCRINSGANCVSLDKVCDFRSDCQDGS
DESTCVSKKCDFESGWCGWTSGTQIQTMDDTNVYSWKKGKGSTLLPNENGKRPGTDHTQS
TASGFYIYADSNQASSNSTAQLFSTMIAKSGSQCTLRFFYWMGSKATDQVGSLHIVAVNN
QGTRLELVEVQRVQVNQWSEARALIGSLVNFQIVIEARAQNMNDVDISVDDLEFMDCSPN
IPSTSGCASTQFTCANLVCIDQSVICDYADDCGDASDEVQALCYQKFPRCNFEQDLCQFE
REFVDFQWQLSTPAMVVDGTLQPAYDHTLHGPQGHYLLADPMTSTDPSHNGKARIGTPGL
FRSTSLYCVVRFYYHVMSTSDVLKIYTRTAWTSNPTTGLNLVYTNTDDANYAGPGNFWQR
ADVTVAAPTDFQVIFEASHTTGEFTPSIAIDDISFSDGCAYDASGEHGVIPTAPPQPSEC
GDGYYPCAAGGCYDNSQRCDFLDECKDSQPPNAPSDEKSCGSSCTFDNDGCGWTNSKSAT
YNFDWSRSSSSGPGSDHTSGSGSYMVVTTGPQTNVGSKAHLITDVYHRSAASCKMNFYYN
MNSNDNQNSDIGMLHVIIKSSLGANLVLNIPGSQGNTWTQSIVPVGQNRDFEIVFEVENG
KASGYVAIDDVTFNDCGDQSSGHVCDANAFTCADGQCIFSDEVCDMRNDCDDGSDELTCP
LHDGDCTFDGQAWGGTSGCKYVQNQDDNGDWQLSDGTGLSNGNPVTSGPSMDHTPSAGGY
FAMVDVTSLPPGSVVRFTTSKAMPASTDICTIRFWYFMSGTELSTILRTYVVESTGTRLL
TSSFYGNTGSSDWQYASVVVSSNNLFRVEFEAETGNYASSGGVIAVDDVTFTDACREGHT
ATAPPIHCTTTQFSCSNNGVLECMPNSYICDGFVDCSDGTDEVGCAPVTNPGTTPQQHTG
KCKDNEFRCSNDACISGLLVCDGVADCNNGDDEKSCPVITCSVGQFYCNDNGGSCLSSSL
QCDGQVDCMAYNADESLCGMCPMNYCQNNGQCKLATHGAPYCQCLTDYVGMRCNVYKPDT
GNPTSTSLSGGSVAGIVIGCILGVTMLVVAAYFYITRERRFRSKLDHTGYDNPILYDTTP
YGSSSFGTEMTSTSGATAMREIPSPSGISNPGFNDSDLQTFGQSNDIYATVQKPSKHDDS
NA |
|---|
| NT seq |
9369 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgttgacattttattcacatgtgtatggatcaaatacaggaacactgagtgtgttttac
aaggaagaaaatggcttgcccatgctgctgtggtccataagtgaagatatggacaaccat
tggagaccaatgcaagttactatcacagcaacaacttcatatcagattatatttgaaagt
attgttggaagtgaagtaggggatggtcacgatattgcgattgatgatattctacttcta
cctaatgcttgtccaccacttggatcatgtacatttgaagatggtttgtgtacttggcaa
aattcagaaaattctgatgactttgattggctaagagctgctggggaaagcatgacagca
gatacaggaccaacagtggaccacacacttggaacaccatatggtgtgtatttacttatg
gaagcatccacaccacaagtagaaggagatatggcaagattattctctgtcaggttggat
aattcagtaccaagatgcttgcagtttttctatcacatgcgggctaagacaccaacagga
atgggatcaataaaagttattcagtattggaattctgattataattatgaattatgggaa
gaccattcaacatatggtgatcagtgggttgaagctatggtggatttaccaaacaacgtc
acacaagatgatatgtttgttataagaatacaagcgtatgttggaagtagtgcttacgct
gacattgcaattgatgatattaacctgatgcttggtgtgtgtccttatgtaccaacagca
ccacctgactgtgcatactattgtgatccatctaacccatccacttcagtatgcatacca
gcagcatctgtttgtgactttaacattgattgtcctgttgatggaattgatgaaataaac
tgcgagtatgattgtacttttgatctagacttgtgtggatggatggaagcgagcagtgga
tcattccgttggtcacaaggtagtggaagcacacctgatgctaatacaggtcccagtggt
gaccacacaggaaatggtcgttacatgtatgttgatgctgatagtggagtaagtggtagc
caagctcacttagttagtaaagtgattcctcaaagtggacctcagtgtgagatgaccata
tattaccacatgtatggtgatcatattggaactttgcaggtgaacaaaaagatcaatggt
caggacaatataatgtggtcgcttgtaggcaatcaagcaaatgcatggtaccaagctatt
gttaagctaggaagaacaaatacacctttccaaattgatgtaactgctacgaggagtttt
gatgttttaggtgatattgcaatagatgatatagcatttcaaaattgtggcctgcctgtt
ccacagtctagctgtcttgcccaagaatttcagtgtgatagaggggcatgtgttgatgtt
gctcgcatctgtgattacactgatgattgtggggatatgtcagatgaagctgactgcact
gcttaccctgcaaggtgcaactttgaaaatggtggaatttgtgattggactcaagataat
gacgacgtgtttgattggacagtttctagtggtttccgatgcagagcagatactggacct
tgtgttgatcatacaacaagcactcgggatggaaagtttctatttatagattcttcaacc
caaatttcaggggagacagctcgtattttgagtcctaccatgatatcacgtgtcaatgct
gaagattgctcactacgtttacattaccatatgtatggagaaaatgtccgaagtttgacg
gtttttaccagaactcaaataggaggaccattagaacaacagtggaaacagcatggtaca
caaggagatgcgtgggaacgaactgaagtgaaacttaaaccaattgcgaatataccattc
caggttttgattgaagcaatgtccccaaacagtgcactaggtgacattgcaattgatgat
atcagtttctcaaattcatgtgaagtggatggtagcgtattaccacctggtacaactgtt
gcaactacaactgaatcaccttgtcctggtgaccttgagtttcactgtggtgatggaaca
tgtatgcatattgaaaagtactgtaatggagtaacggattgcagcactggcttggacgag
ttatattgtggtgattgtacatttgaaactgacatgtgtggttgggatgatgtgagctct
ggattatatcaatgggatcgtgtgtcatcgggctcagttatttatccttcttcagaccac
acacaaatttctggttcaggttggtttgcatatgttgacccagcagctggtgactacatg
aactatgcacacttgatcagccctctacttccacaaacatcaaccacctgtgccatcaac
ttctggtattacatgtattcaccaacggattcatttgatgcaaagatcgctttattgtta
aacaatgaggatggaagtcagattatttggagttctgcaataaatggtggaaatcgatgg
aacaaccaaaacatggtggttggcgcacaaaaccatggtcactactttgtatttgaagtt
taccatggctcaaacggagcaagtgctgccctggatgatatttcattcattgattgccaa
caatcctcatccaaccagtgtgactttggtcagtttgcctgcaccactggctcttgtatt
ccaatagaaaatcgatgtaattttgttgatgaatgtggtgataatagtgatgaacaagga
tgtccaagctaccaagcttgtgacttcaacactgacttttgcttgtgggaaactgatcca
tcgagtacattgacattaacaagagggatatcatacgattcaaattcaccaacaacagac
cataacaataatgctggtggttcatacttgtatgttaaagcaacatctgcaaataataat
caacaatcatatctcaatggaccagtagtataccctgttgatggtacagcttgtcaaatt
cgattcttctccaacatatatggtcttgattcaggaagaatagacattgggattcgaact
acgtcaagtggttattccttggttagcagtatcgttaccataaacaatgatcaactatgg
cataaacaatctgtacccctgagttcaaaagaatatttccaggttgttattggggttatt
cgtggtgttgctgatcaaggaactatttcaatcgatgatgtaagtctttcaccaagctgc
aaagttgatccaaatgccatccttccctgccctgctaacaacctaccatgtgacaatgga
tattgtcttgcagctgataaattttgcaacttccagactgaatgtccagatagctcagat
gaactgacttgcccttctacttgtgattttgaatctgctggtggtttatgccaatggtca
aatgatccaaagaactccatacattggacacatcagcaggctatcagtagtagtcctgta
ggtactgggggaccggctactgaccatacgtctggtacaaatcaaggcaactttgttatt
ttgaaatctacaaatcaagtgtcagtcaacagtaaagtgagcttgctaagtccaacattt
tcacaagctggtctcacttgttcaattcagttttggttatacatgtatggagactttgct
acacttcgaattaagacagtaacggatacagattcaaaagaatattggcaacagaatggt
gaccagggcagtcagtggatcaaacacattgttaaattaccaacttgtttaaaagacttc
caaatttcatttgaagttgaagtaatatcggcaagtcttggatctatcgcattagatgat
gtatcgttcctctcatgtgaatacccagatgcaacacctggctcaacatgttccgctaac
caaaaacaatgtatgagtggccattgcatagatgctgattactggtgtgactttaactat
gattgttgtgatgcaactgatgaaaatgcttttgaatgtgcaagctattcacgctgtaat
tttgaacgtgattattgtgagtggaaaaaaccaagtgatggttcaggaaacgaatggttg
gttgggaaatctccaagtaacaatccagcattcgatcacacaagcaatttagaaaatggg
aaatatctttatgttgattcatctagtatgagtggaagtgcccaacttcaaagttttgta
tattcatctacttcatctcagtgttacataagattctattcatttattgagggaccagga
gcacaatcattaaaggtgattgttgtcacaacaactggagagtcagtaaaactaacattg
gcaccagatgtcagtgcacagtggacacggagaagcattttacttactccagctaattca
gctttccaggttgtactagaaggtttggtccaatctatcagtcctggtgtgattgcagtt
gatgatatctcatttagtgaaggttgcattaaatcaccaaatgaaggccctgtaatacct
ggtggtcaaaccacaaccattatgccaccatatgtgtgtgatggtaacagctttttctgt
gatgaatcaggatttgtatgtgtggacccagataaagaatgtgacttcaatatggattgc
ccaaacaacaaagatgaagaaaattgcccaacgcaatgctcatttgagggaacaccttct
atagatggaagtaaatgtggatggggtgaaagtatagcaagccaactggatagtttcaac
tgggtgatatctgatgctcaaagtgcaattataggcatggcaccaacaactgaccatacc
acaatgtcccagcaaggaagttttgcttacattaccaaacttggttatcaacctttacaa
actgctgaacttgtttcacctatgtttaaaaagtctttcagcacctgcaagattgtcctg
tattattaccaaactggaatctcacccggtcaaacggatgtagttttaacaacaaacaat
gaattttcattgatggcttcaataacaaataatggggattcaaactggaaagcattagca
ctggatattggtaaacaagtatacacattccagatatctataacaaaagtagatgaagga
tatgatgggattactgccattgatgatgtgaatttcattggatgcaacacaccactacca
tcatcatgtaaccctgctaatcagtttcaatgtaccaccacacatgtgtgtgtagaccaa
catgataatatatgcgacggtgtggatgattgtggagattactctgatgaatcaggctgt
caaaccacattcattactacttttgaaactggattaaatggttggagccaagataatatt
gatgagtttgactggacattacaatctaaatattcagaaactacaacaggacctttaaga
gatcacacactttcgaacaagtttggaaattacgttgtcatgtcatcagcatcacaaacg
gctggtgatagagcatggttgaatagttctccaatgcaaagtagaacaaactgtgagctt
cgattctggttttacatgaatggtccagacgtctacagactttctgtatatactcgaata
aatactaacggtgggtttaatcatttgaaagactttattggggaaccaactgacaacatg
ttgtggcagcgtgctgttataccactgattgtggatgatccgtttgtggttgtaattgaa
ggtgttgttggatacggaaatgttggttttattgcaattgatgatgtttcattctcaact
gagtgttcaacttataatggagttctccccacattacccaatggtggcacaccatctgaa
cccaaccccccatcatcgtgtgatgaaagtattgagttttcatgcagaataaactcagga
gcgaactgtgtgtctttggataaagtttgtgactttagatcagattgtcaggatggctca
gatgagtcaacgtgtgtcagcaagaaatgtgactttgaatctggatggtgcggttggact
tcaggaacccaaatccaaacaatggatgatacaaacgtatacagctggaagaagggcaaa
ggaagtactttacttccaaatgaaaatgggaaaagacctggaactgatcatacacaatct
actgcatctggattttatatttatgctgattcaaaccaggcatcatctaactctactgct
cagttattttcaactatgatcgcaaaatctggttctcaatgtacactgagatttttctac
tggatgggatcaaaagcaaccgaccaagttggttcacttcatatagttgctgtgaataac
caaggaacacgacttgaacttgttgaagtccaacgtgtacaagttaatcaatggtcagaa
gcacgagctttgataggatcgcttgttaatttccagattgtgattgaagcaagggcacaa
aatatgaacgatgttgatatctctgttgatgacttggagtttatggattgttcaccaaat
ataccatctacaagtggatgtgcatcaacacagtttacatgcgctaaccttgtgtgtatt
gaccagtcagtaatttgtgattatgctgatgattgtggagatgcaagtgatgaagtacaa
gcactctgttaccaaaaattcccaagatgcaactttgaacaagatttgtgtcaatttgaa
cgagaatttgttgactttcaatggcagctatcaacaccagctatggttgttgatggtacg
ttacaaccagcatatgaccatactctacatggaccacaaggtcattacttgctagctgac
cccatgacatcaactgatccatcacataatgggaaagcaagaattggaactccagggttg
ttcagatcaacttctctatattgtgttgttcgattctactaccatgtgatgtcaactagt
gatgtgttgaagatttacacacgcactgcgtggacatccaacccaacaactggtctcaac
cttgtctacacaaacacagatgatgctaattatgctggacctggtaacttctggcaaaga
gctgatgtaactgttgcagcacccactgatttccaagttatttttgaagcaagtcacaca
actggtgaattcacaccatccatagctattgatgatatcagctttagtgatggttgtgca
tatgatgcgtcgggtgagcatggggtcatccccacagccccaccccaaccctctgaatgc
ggggatggttattacccatgcgctgcgggtggttgctatgataactcacaaagatgtgac
tttcttgatgaatgtaaagactcacaacctcctaatgcaccgtcagatgaaaaatcttgt
ggatcatcatgtacatttgataacgatggttgtggatggacaaactctaagtcagcaact
tataattttgattggtcaagatccagttcttcaggtccaggttctgatcatacatccggg
tctggttcatacatggttgtaacaactgggccacaaaccaatgttggatcaaaagctcac
cttatcactgatgtataccatagatctgctgcaagttgtaagatgaatttttactacaac
atgaactccaacgataatcagaattctgatattggaatgcttcatgtaataatcaagtct
tcattgggtgcaaatcttgttttgaatatacctggaagccaaggcaatacatggacacag
agtatagttcctgttggacaaaacagagattttgagattgtgtttgaagttgaaaatggg
aaagccagtggatatgttgcaatagatgatgttactttcaatgactgtggtgaccaatca
tcaggtcatgtatgcgatgctaatgcatttacatgcgcagatggtcaatgcatattctct
gatgaggtatgcgatatgagaaatgattgtgatgatggaagtgatgaacttacatgccca
ttacatgatggagattgtacatttgatggacaagcatggggtggaaccagtggttgcaag
tatgttcaaaaccaagatgataatggtgattggcaattatctgatgggacaggtctaagt
aatggaaaccctgtcacaagtggaccatctatggaccatacaccatctgctggtggttat
ttcgcaatggttgatgtaacctcccttccacctggttcagtggttaggttcaccacatca
aaagcaatgcctgcaagtacagacatctgtacaattcgattttggtattttatgtcagga
actgagttatccacaatattacgaacatatgttgttgaaagcactggcacacgtctactt
acttcatctttctatggaaatactggatccagtgattggcaatatgcatcagtagttgtg
agcagtaataatttattccgagttgaatttgaggctgaaactggcaattatgcctcaagt
ggcggagtgattgcagttgatgatgtcacattcactgatgcatgtcgtgaaggacacaca
gccactgccccacccatacactgcacaacaacccagttctcatgttcaaacaatggtgtg
ttggagtgtatgccaaactcatatatatgtgatggttttgttgactgcagtgatggtaca
gatgaagttgggtgtgcacctgtcactaaccctggaacaacaccacaacaacatactggg
aaatgtaaagataatgagttccgatgttcaaacgacgcttgtataagtggtttgttagtt
tgcgatggcgtggctgattgtaacaatggagatgatgaaaagagttgcccagtcatcact
tgctctgttggtcagttttactgcaatgataatggtgggagttgcctttcttcatcttta
caatgcgatggtcaagtggattgtatggcgtataatgcagatgaaagcttatgtggcatg
tgtccaatgaactactgtcaaaacaacggtcaatgtaagttagcaacacatggagcccca
tattgtcaatgtttaactgactatgttggaatgaggtgcaacgtgtataaaccggatact
ggtaaccctacatctaccagtctaagtggaggttctgttgctggtattgtgattggatgt
atcctaggtgtcaccatgcttgtagttgctgcatacttttatattacaagagaaagaaga
ttccggagtaaactggatcataccggttatgacaacccaatactatatgacacaacacca
tatggttcatctagttttggaactgaaatgacaagcacaagcggtgctactgctatgaga
gaaataccttcaccaagtgggatatccaaccctggtttcaatgattcagacttacaaaca
tttggacaatctaatgatatatatgcaactgttcaaaaaccttccaaacatgatgatagt
aatgcataa |
|---|
