Ciona intestinalis (yellow sea squirt): 100183523 Help Entry 100183523         CDS       T01056                                  Name (RefSeq) fibrillin-1   KO K23342   fibrillin 2/3 Organism cin  Ciona intestinalis (yellow sea squirt) Pathway cin04820   Cytoskeleton in muscle cells Brite KEGG Orthology (KO) [BR:cin00001]  09140 Cellular Processes   09142 Cell motility    04820 Cytoskeleton in muscle cells     100183523  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cin00536]     100183523 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:cin00536]  Heparan sulfate / Heparin   Extracellular matrix molecules    100183523 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  EGF_CA cEGF EGF FXa_inhibition hEGF TB EGF_3 Plasmod_Pvs28 Motif Other DBs NCBI-GeneID:  100183523 NCBI-ProteinID:  XP_009858101 Ensembl:  ENSCING00000008571 LinkDB All DBs Position 3:complement(6392250..6426429) Genome browser AA seq 2901 aa AA seqDB search MHMQLHVVVLAALVCGFTGYVAGQGGGHLTRQSFVGMNNGWRTWNPLVGPNHHRYRGDRP RSARQGNERQRGSRNRRMGTVLTGRHVCHEKGSTFCCPGWTASTSGKTCSIPKCDEGNCG PRGVCVSPNRCMCQDGQTQMRCQREDAEDRRCNMRCMNGGECVDNQCRCPYGYTGPHCGQ PICGPGCLNGGRCIAPGRCACVYGFTGMRCERDYRKGPCFHTRVNGTCKDEVPGVMCTKL FCCATVGEGWGHPCEECPARVGNCTKGRLPPLCTDIDECEIMPGLCEGGTCRNTDGSFAC DCPEGYRADTNIHQCVDVNECASSDVCVYGNCINTDGGFICECPPDYKLSIDKTYCISDK PGRCYTAIESGMCARPLSELVRRTMCCCTPTGEETLGKCFAAVGEFPERCPAVGTPEFNR DCEGVTTGEVIPGGGLCELMGDRACAHGRCVNQPEQHTYFCECEAGYESADGGKQCVDVD ECTQAGSAYPSVCGPHGTCLNTEGSYTCHCSRGFENDAGSMISCVDIDECTQDGLCENGA CVNTRGSYVCNCNDGYRTSATQLECEDINECQEQQGLCDNGRCINSGGDFRCICNPGFFT SPDSRSCLDENECERDNMCANGECVNMDGRYKCVCNTGFHLLPSGQSCADINECHMNPCE NGRCENSEGSFQCHCHRFQILDSTGTRCLLDQTSGECYRGVRNGQCRARNALTGGSSRSD CCCAVPGATSAWGDTCEPCPEVGEADYTVLCHDVQISNICELMVNPCENGDCLKMGNNQF RCICNKGFVVADDQMSCIDVDECSKNLCSNGACRNTPGSYTCTCNEGYLLRGDVCEDIDE CVSNPCTNARCTNEPGAYRCVCEDGFILDTTGHVCYDVKVGRCWSSYANNQCSGNIGNRL LTKEECCNTIGVAWGNANCRPCTDFDLPCDHGYTLNVQTNECVNINECDFGLCQEDTTCV DLEGSFRCECPAGLTLRADGTSCTDVRVGICYMEVEDGVCSTTSADTILMTKHQCCCTVG HGWGSPCEICPQAGTDARTKLCLPANQRVITLNECILFPNLCVDGECLNTDSSFTCNCNQ GYTLDESGKNCTDIDECGISPGLCGNGQCVNVGGDFRCDCDEGYEDSQTLKVCTDIDECS IPGHCTGGTCFNTEGSYECVCPDGRSLGPDGTKCIDVDECALRPNLCEPNGRCENMLGYY MCICDVGYIPTPDARDCVNIDECLDNNGGCHMGCTDTIGSYECSCDDGFVLAFDGHTCAD RDECMEQMNRCDGGTCENTDGAFRCVCFDGFMATADLQFCEDIDECAMNANVCMHGKCHN TRGSYTCNCEPGYCVPQGQMICVDEDECEMSKHNCHVNADCNNTEGGYNCRCIPGFHGDG FMCHDDDECAMGTHMCHEFATCTNKHGSYECNCQDGYHGDGFSCSDNDDCVEDDTLCGPH GQCMNIEGSFECNCPMGFVTTEDRKACKDIDECSFEGICVNGRCHNVPGTFRCVCLEGYE KDDQGANCTDVDECSDLANCINGMCVNTDGAYECQCPEGFQSNPTGIGCVDTRVGNCFNS AEGDDLAPICTGQIGTSVTRGTCCCISNAGAWGNPCELCPIINSTEYHTLCPGGPGFRTN PITVLLEDINECVEVPGVCRGGKCINGFGTFVCECSMGYQLNPATKTCEDIDECEGDSDD NDYDVCGAGQCLNTVGGYNCQCPEGYKSIMGGRKCEDIRERSCHRNYNATTEECSGSLQF DLTKKKCCCFGNIGQGWNNPCEACPTPGTDAFTSVCGSENIIRTNDMCSQIANLCENGLC ISVDSGFTCECSRGYHFNDELIQCEDINECVDEDLCFADSVCTNMPGSYVCSCMEGFVFD EISETCVDIDECNLSGTCTNGDCSNTRGGFVCDCNQGFHPINDDKACEDVNECDRDPCGR GVCQNVFGSFTCTCDNGYRISDNGDCVDKNECDEEGQCNNGFCDNTPGGFACDCNEGYSV TPDGRVCIDTDECTEDPLVCGIGTCQNMDGSFKCYCPDGYNSDNGAACNDVNECDVGDKC VNGACINTPGGFECDCPDEHVVSSNKKTCIDQRRAHCYETISQGTCANPGNTAVTISSCC CRCGGGGWGTATSDCEACPANGTQEFANICPQGCGFTPNGIDLNECDENNPCVNGRCVNQ PGSFRCECTNGFTLDASGVVCVDVNECVSGASPCGNGTCTNTEGAFECACDDGFYNGPAM TCLDVNECKPGLNNNCAFRCVNDIGSFHCACPDGYELREDGNTCKDTDECASPDLNDCTE NGMTCKNMIGFFVCHCQPGYRTSSTGTCVDDNECDVANVCNNGVCINLDGTYRCDCNEGY MYDEEHKMCLDTRQGLCYAQVHQRMCEVTSTTGLPFTKAECCCNRGKGWGEDCEACPVYG TTAFVQLCPHGAGYKPTGEDIDDCRVTPGLCAHGTCINTLGAFRCACSHGYEVTRSNKVC MDINECLAPTNPCSFDCRNTEGSYECICPKGYQIDADNSACVDLNECATKRHNCQYLCIN TVGSFKCECPHGFTQEGAQCVDKNECIDMPGICGPRGVCRNDPGGYHCECPRGYRRDDMG QACMDVDECGGQQSSCAGSCQNIPGSFRCLCSRGFRPTMYGRGCQDVNECAHSPCSQGQS CSNRVGSFQCGCPSGLAKMRGGCGDVDECQMGGGSCNFGCRNSYGGFSCSCRGGFFRMGS GHCMSGHFEQRVPRFPQFPQFGGYGGPQMGMPPNGGFQGAMRPKDSVCYACMPGGDTRRR HKRSADGGRFIEVSNRHGRGTVNTSYPLEVHLNRATLTRRTPILELQPSLKQLRNNVRYR IVSGNDDRKFRLNPRGSSSVLHFTEEGLQQDLAGVASELTIRGSTTLSKDEVKQVALDSD LLEKAIEDILEFHVQIHVNQP NT seq 8706 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcatatgcaactgcatgtcgtcgttcttgcggcgttagtctgtggctttacgggttat gtagcgggccagggtggtggtcatcttacacgccaaagttttgtcgggatgaacaatgga tggaggacatggaacccccttgttgggccaaaccaccaccgatacagaggcgatagaccg agatctgcgagacaaggcaacgaaagacaacgaggatcaaggaaccgacgaatggggacc gttttgacaggccgtcatgtttgccatgaaaaaggttccaccttctgttgccctggttgg acagcttctacaagcggaaagacttgctcaatacccaaatgtgacgaaggaaactgtggg cctcgtggagtttgtgtctcaccgaacagatgtatgtgtcaggacggtcaaacacaaatg aggtgccagagagaagacgccgaagaccgaagatgtaacatgcgttgtatgaacggaggg gagtgtgtggacaaccaatgcagatgtccatacggttacactggaccacactgtggacaa cccatttgtggacctggttgtctcaacggaggaagatgtattgctccaggaagatgtgct tgtgtatatggattcaccgggatgcggtgcgagagagattaccgaaagggcccatgtttc cacacacgagttaacgggacctgcaaagacgaagttccaggggttatgtgtaccaagctc ttctgttgtgctactgtgggagaaggatggggccatccgtgcgaggaatgtcccgcccga gtcggaaattgtaccaagggtagactaccccctctgtgcacagacattgatgagtgcgaa ataatgccgggtctttgcgagggaggaacttgcagaaatactgacggatcttttgcctgt gattgccctgaagggtacagagctgacactaatattcaccagtgcgtagatgtgaacgaa tgcgcaagctccgatgtctgcgtctacggcaactgtatcaacacggatggaggctttata tgcgaatgcccgccagattacaaactctcaattgacaagacatactgcatatctgataaa cccggacgatgttacaccgccattgaaagtggtatgtgcgcaagacccttgtctgagttg gtacgacggactatgtgttgttgcacccctactggggaggaaacacttggaaaatgtttt gccgcggttggggagttccccgaacgatgccctgctgttgggacaccggagttcaacaga gattgcgaaggtgtaacaaccggcgaagttatacctggcggtggactttgtgagcttatg ggtgatcgcgcatgcgcacacggtcgatgcgtcaaccaaccagaacaacatacttacttc tgtgagtgcgaggccggctacgaatcagcggacggtggaaagcaatgtgttgacgtggac gaatgcacacaagccggctctgcttatccaagtgtatgcggaccacacggtacttgcttg aacactgaaggatcgtacacttgccactgctccagaggtttcgagaacgacgctggtagc atgatctcgtgcgtagatattgatgaatgtacccaagacggcttatgcgagaacggtgca tgtgtgaacacaaggggaagctacgtatgcaactgcaatgacggctacaggacctctgct acacaactggagtgcgaagacatcaacgaatgccaagaacaacaaggactatgcgataac ggacgttgtataaatagcggcggagacttcaggtgcatctgcaaccccgggttctttacc tctcctgactcaagatcgtgtcttgatgaaaatgaatgtgaaagagacaacatgtgcgca aacggggagtgcgtcaacatggatggaagatacaagtgtgtctgtaacactggcttccat ttgttgccaagtggacaaagttgtgcagatatcaatgaatgccacatgaatccttgtgaa aatggtcgatgtgaaaactctgaaggttccttccaatgtcattgccaccgattccagatt ctcgattcaactggaacacgatgtttacttgaccaaacatctggtgaatgttaccgcggt gttcgtaatgggcaatgccgagcaaggaacgctctcactggagggagctcaagatcggat tgttgttgcgctgttcctggagcgacaagcgcgtggggtgacacgtgtgagccatgccca gaagttggagaagctgattacaccgttctatgccatgatgtgcagatcagtaacatctgt gagctgatggtaaacccttgtgagaacggtgattgccttaagatgggaaacaaccagttt agatgtatttgcaacaaaggatttgttgttgctgatgatcagatgtcttgcattgatgtt gacgaatgctcaaagaacctttgtagcaacggagcttgtaggaacaccccaggatcttac acatgtacctgcaatgagggatacctccttcgtggggatgtgtgtgaagatattgatgaa tgcgtgtctaacccttgcaccaacgcccgttgtaccaacgaacctggtgcgtatagatgt gtttgcgaggatggttttatattggacaccactgggcatgtctgctacgacgttaaggtt ggccgatgctggagttcatatgcaaacaaccagtgttcgggaaatatcggaaaccgactt cttactaaggaggaatgttgtaacaccatcggtgtagcatggggtaatgctaactgcaga ccatgcactgatttcgaccttccatgcgaccatggatacaccctcaatgttcaaactaac gaatgtgtcaacattaatgaatgcgacttcggactttgccaagaggataccacgtgtgtg gatctggaaggttctttcagatgtgaatgcccagctgggctcacactgcgcgcagatggc acatcatgcacagatgtgagagttggaatttgttacatggaagttgaggatggtgtttgc tccaccacatccgccgacaccatactgatgaccaaacaccagtgttgttgcactgtgggc catggatggggttcaccatgcgagatttgcccacaggcaggaacagacgcacgaaccaag ctatgtctcccggccaaccaacgtgttattaccctcaacgagtgcattctgttccccaac ctttgtgtggatggcgaatgtttaaacacagattccagctttacctgcaactgtaatcaa ggatacaccttggatgaatctggcaaaaactgcactgacattgatgaatgtggtatcagc cccggtctttgtggtaacggtcaatgcgtgaacgttggaggtgacttcagatgcgattgc gacgaaggatatgaagattcgcaaaccctcaaagtttgcacagatattgatgaatgctcc atccccggccactgcactggaggtacttgcttcaacactgagggaagttatgaatgtgtt tgtccagatggaagatcattgggaccagatggaaccaaatgtattgatgttgatgaatgt gcattgagacccaatctatgtgaacctaacggtagatgtgagaacatgttaggatactac atgtgtatatgtgatgttggctacattcctacacccgatgccagggattgtgtcaacatt gatgaatgtttggataacaatggtggttgtcacatgggatgcaccgataccattggttct tacgaatgtagttgtgatgatgggtttgtgcttgctttcgacggacacacttgtgcagat cgtgatgaatgtatggaacaaatgaacagatgtgacggcggtacttgtgaaaataccgat ggtgcttttagatgcgtctgctttgatggatttatggcaactgctgatttacagttctgt gaagatatcgatgaatgtgcaatgaatgcaaacgtgtgtatgcacggcaaatgtcacaac accagaggatcatacacatgtaactgcgaacctggatattgcgttccacaaggacaaatg atctgtgttgatgaggatgaatgcgagatgtcgaaacacaattgccacgtgaatgctgat tgtaacaacacagagggaggatacaactgccgttgtattcctggtttccatggagatgga ttcatgtgccacgatgatgatgaatgcgcgatgggcacacacatgtgccacgagttcgcc acgtgcacgaacaaacacggaagttacgagtgcaactgccaggatggttaccatggagat gggttctcttgctccgacaatgacgattgtgttgaggatgatacgttatgtggacctcat gggcagtgcatgaacatcgagggaagttttgaatgtaattgtcccatgggattcgttaca acagaagataggaaggcttgcaaggatattgatgaatgctcattcgagggaatttgcgtg aatggccgatgtcataatgtgccgggaactttccgatgtgtatgtcttgaagggtatgag aaagacgaccaaggcgcaaactgtacagatgttgatgaatgctcagatcttgccaactgt atcaatggtatgtgcgtcaacaccgacggcgcatatgagtgtcaatgtccagaaggtttc cagagtaaccctacaggcattggttgtgttgacacccgtgttggaaactgtttcaacagc gccgagggagacgatttggctccaatctgcaccggacaaattggaacctccgtcactaga gggacatgttgttgcataagcaacgcaggagcgtggggcaacccgtgtgaactttgcccc attatcaactcaactgagtaccacacattgtgtcctggaggacctggtttccgtaccaac cccatcactgtcctcttggaagacatcaacgagtgcgtggaggtgcccggtgtttgcagg ggtggcaaatgcatcaatgggttcggaacctttgtgtgcgaatgttccatgggatatcaa ctcaaccctgcaacaaagacttgcgaagacattgatgaatgtgagggagacagtgacgac aatgattatgatgtttgtggtgccggccaatgcttaaacactgtgggcggttacaactgc cagtgccctgaaggttacaagtccattatgggaggcaggaaatgtgaagacatccgagag agatcatgccatcgtaactacaacgcaaccacagaagaatgctccggctcccttcagttt gatcttaccaagaagaagtgttgttgcttcggtaacattggacaaggatggaacaatcca tgcgaagcttgcccaactcctggcaccgatgcctttacttcagtgtgtggttcagaaaac ataattagaactaatgacatgtgctcacaaatcgccaacctctgcgagaatggcttgtgc atttccgtggatagtgggtttacttgtgaatgctcaaggggttaccacttcaatgatgaa ctcatccagtgtgaagacatcaatgaatgtgttgacgaagatctttgctttgctgattct gtttgtaccaacatgccaggatcatatgtatgttcttgtatggaaggattcgtgtttgat gaaataagtgaaacttgcgttgatattgatgaatgcaacttgagtggaacttgcacaaat ggagattgttcaaacacaagaggaggatttgtgtgcgattgtaaccagggattccaccct attaatgatgataaggcttgtgaagatgtgaatgaatgcgacagagacccgtgcggacgc ggtgtttgccagaatgtattcggaagtttcacttgtacttgtgacaatggatatcgtatc tctgataatggggattgtgttgacaagaatgaatgtgatgaagaaggccaatgtaacaat ggtttctgtgacaacacacctggtggatttgcatgcgattgtaatgaaggatattcagta acacctgacggcagagtttgtattgatactgatgaatgtacagaagatccattagtgtgt ggtattggtacttgccagaacatggatggttctttcaaatgttattgccctgatggttac aacagtgataatggtgcagcttgtaatgatgtcaatgaatgcgatgttggcgacaaatgt gtgaatggtgcttgtatcaacacacctggtgggtttgaatgtgactgcccagatgaacac gtcgtcagttctaacaagaagacttgtattgaccaacgtagagctcattgttacgagaca atttcccaaggcacatgcgccaaccctggtaacacagctgtcaccatatcctcatgttgt tgtcggtgtggtggaggtggttggggaacagccacaagtgattgtgaagcttgccccgca aacggaacgcaagagtttgccaacatctgccctcagggatgcgggtttactccaaatgga attgacctcaacgaatgtgatgaaaacaacccatgcgtcaacggccgatgtgtcaaccaa ccgggtagcttccgttgcgaatgcaccaacgggttcacactcgatgcatccggtgtggtg tgcgttgatgtgaacgagtgtgtctctggagcatcaccatgtggtaacggaacatgcaca aacacggagggagctttcgaatgcgcgtgtgatgatggattctataacggaccagccatg acttgtttggatgtcaacgaatgcaaacctggattgaacaacaactgtgctttccgctgc gtaaacgacatcggcagcttccattgtgcttgccctgatggttacgaacttcgtgaagat ggaaacacttgcaaagacactgatgaatgcgcatctcctgacttaaatgattgcactgaa aatggaatgacttgtaagaatatgattggattctttgtctgtcactgccaaccagggtac aggacttcttcaacaggaacttgtgttgatgacaacgaatgtgatgtggcaaacgtatgc aacaacggcgtgtgcatcaacctcgatggaacgtatagatgcgattgtaatgaaggatac atgtatgatgaggaacacaagatgtgtctggacacccgacaaggattatgttacgctcaa gtccatcaacgtatgtgtgaagtcacctcaaccactggccttccattcaccaaagctgaa tgttgttgtaaccgtggcaagggatggggtgaagactgtgaggcatgcccagtgtatgga acaactgcgttcgttcaactatgtccccatggtgccgggtacaaacccactggcgaagac attgacgactgccgagtgacacctgggctctgcgcgcacggtacgtgcatcaacaccctt ggtgcgttccgttgtgcatgttcccatggttacgaggtcaccaggtcaaacaaggtttgc atggatatcaacgaatgtcttgcaccaaccaacccatgcagctttgattgccgaaacaca gagggaagttacgaatgtatttgccccaagggttaccagatcgatgctgataatagtgct tgtgttgatcttaatgaatgcgcaaccaaacgtcacaactgccaatacctttgcatcaac acagttggttcattcaaatgtgaatgtccacatggtttcacacaagagggagcacaatgt gttgataagaacgagtgcattgatatgccaggtatttgtggtccacgtggtgtttgtagg aatgatccaggtggttaccattgtgagtgccctcgtgggtacaggagagatgacatggga caagcttgcatggatgttgatgaatgtggcgggcaacaaagctcgtgcgctggaagttgc cagaacatcccaggttccttcagatgtctttgttcccgaggtttccgacccactatgtac ggtagaggttgccaagatgtgaacgaatgcgctcacagcccgtgctcgcaaggacaaagc tgttccaacagggttggatcgttccaatgtggatgtccatcaggattggcgaagatgcgc ggaggatgcggtgacgttgatgagtgccagatgggaggaggaagctgcaactttggatgc cgaaatagttacggaggattctcttgcagctgcagaggtggtttcttccgcatgggcagt ggacattgcatgagcggccactttgaacaaagagttccaagattcccacaattccctcag tttggtggctacggtggtccacagatgggcatgcctccaaatggtggattccagggtgct atgaggcccaaggatagcgtgtgctatgcgtgcatgccaggtggtgacacacgacgtaga cataagaggtctgctgatggtggaagatttatcgaagtttcgaaccgtcatggcagagga actgtcaacaccagctacccccttgaggttcacctgaatcgcgccacactcacacgccgc acacccatcttggagctgcaaccttccctgaaacaacttcgcaacaacgtccgttaccgc atcgtgtccggaaacgacgatcgcaaattccgtctcaacccacgaggaagctccagcgtc ctccacttcaccgaggaaggtcttcaacaagatctcgccggagtcgcaagtgagctcacc atccgaggatcaacaaccttaagcaaggatgaagtgaagcaagttgctctcgacagcgat cttcttgagaaagctattgaagatatcctggagttccacgtccagatccatgtcaaccag ccttag

DBGET integrated database retrieval system