Ciona intestinalis (yellow sea squirt): 104265965
Help
Entry
104265965 CDS
T01056
Name
(RefSeq) glycine-rich cell wall structural protein-like isoform X1
Organism
cin
Ciona intestinalis (yellow sea squirt)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
104265965
NCBI-ProteinID:
XP_026691226
LinkDB
All DBs
Position
8:3625963..3628498
Genome browser
AA seq
616 aa
AA seq
DB search
MRVACFLALLIVNVDGWLFGGDNRGASGGLGASVDLPILGPVGASIGGSLGGNGGGHGHG
CTCAGPGVGGNGGLGGGLGGGGGGGGGGGGGHGGNGGGSIGENGGLGASLGGLLGGNGGG
NGGLGASLGGLLGGNGGLGASLGGLLGGNGGLGASLGGLLGGNGGLGASLGGLLGGNGGL
GASLGGLLGGNGGLGASLGGLLGGNGGLGASLGGLLGGNGGGNTGGNGGLGGIVASLGGL
LGGNGGGNGRLSIGGNGGGHGGANTGGNGAINVDLTHGGNGGSSVGGNGGAHGNGGIIDL
THGGSGAAGSGVGGNGGASGGGSGTINVDLTHGGNGGASSVGGNGGGSGGGSGTINVDLT
HGGNGGASGGGNGGGSGGGSGTINVDLTHGGNGGASGGGNGGASGGGSGTINVDLTHGGN
GGASGGGNGGGSGGGSGSINVDLTHGGNGGASANGNGGGSGGGWFSGGLGASVDLPIIGP
IGANIGGNVGGNGGASGGASGGASAGGNGGLGGGLGASVDLPLLGPIGANIGGNIGGNGG
ASGGASGGGNGGIGGGLGASVDLPLIGPIGANIGANVGGNGGGSSGGSGGGFRWNNKRLQ
AALADELDSSIEDLFH
NT seq
1851 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagttgcttgcttcttagctctgttgatcgtaaatgtagatggttggctattcggt
ggagataaccgtggtgccagtggtggtcttggtgcgtcagtggacttacctattttagga
cctgttggcgcttccattggcggttctctcggcggtaatggtggtggtcacggtcatgga
tgcacatgcgccggtccaggtgttggtggaaacggtggtcttggtggtggactcggcgga
ggcggaggtggaggtggaggcggaggcggaggacacggtggaaatggtggtggtagtatc
ggtgaaaatggtggattaggtgcctctttgggtggtcttcttggtggaaacggcggcggt
aacggtggtctcggcgcctctttgggcggtcttcttggtggaaatggtggtctcggtgcc
tctttaggtggtcttcttggtggaaacggtggtctcggtgcctctttaggtggtcttctt
ggtggaaacggcggtctcggggcctctttaggtggtcttcttggtggaaacggtggtctc
ggcgcctctttgggcggtcttcttggtggaaatggtggtcttggcgcctctttaggcggt
cttcttggtggaaatggtggtctcggtgcctctttaggcggtcttcttggtggcaatggt
ggcggtaacaccggtggaaacggtggcctcggtggaattgttgcctctttgggcggtctt
cttggtggaaatggtggcggtaacggtagactttctatcggcggtaatgggggtggtcat
ggtggagccaatactggtggaaacggcgcgattaacgttgacctgactcatggcggaaac
ggcggttcttcagttggtggtaacggcggtgctcatggaaacggcggcatcattgacctg
actcatggcggaagcggtgctgctggttcaggtgttggtggaaacggcggtgcttctggt
ggaggaagcggcactattaacgttgaccttacgcatggcggtaacggtggtgcttctagt
gttggtggaaatggcggtggttctggtggaggaagcggcactattaacgtcgaccttacg
catggcggtaacggtggtgcttcaggtggtggaaatggcggtggttctggtggaggaagc
ggcaccatcaacgtcgaccttactcatggcggtaacggtggcgcttcaggtggtggaaat
ggcggtgcttctggtggaggaagcggcactatcaatgtcgaccttactcatggcggtaac
ggtggtgcttcaggtggtggaaatggcggtggttctggtggaggaagcggctctatcaac
gtcgaccttacgcatggcggaaacggtggtgcttcagcaaatggaaacggtggaggttct
ggaggtggctggttcagtggtggtcttggtgcttccgtggatctcccaattattggacca
attggtgctaacatcggtggcaacgttggtggtaacggcggtgcatctggtggagcttcc
gggggtgcttctgctggtggaaacggtggactcggtggaggactcggtgcttccgtagat
ctcccactccttggaccaattggtgccaacattggtggcaacatcggtggtaacggcggt
gcttccggtggtgcttctgggggtggaaatggtggaatcggtggtggtctcggtgcttcc
gttgatctcccacttattgggccaattggtgccaacattggtgccaacgtcggtggtaac
ggcggtggttctagcggtggttccggaggtggattcagatggaacaacaaaagactccaa
gctgcccttgctgacgaattggacagttctattgaagatctatttcattaa
DBGET
integrated database retrieval system