Ciona intestinalis (yellow sea squirt): 723806 Help Entry 723806            CDS       T01056                                  Symbol n Name (RefSeq) Notch precursor   KO K02599   Notch 1 Organism cin  Ciona intestinalis (yellow sea squirt) Pathway cin04330   Notch signaling pathway Brite KEGG Orthology (KO) [BR:cin00001]  09130 Environmental Information Processing   09132 Signal transduction    04330 Notch signaling pathway     723806 (n) BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  EGF hEGF EGF_TEN EGF_CA Ank_2 Ank Notch Ank_5 Ank_4 Ank_3 NOD NODP EGF_2 EGF_3 EGF_DL_JAG cEGF Motif Other DBs NCBI-GeneID:  723806 NCBI-ProteinID:  NP_001037825 Ensembl:  ENSCING00000003521 UniProt:  Q2L697 LinkDB All DBs Position 9:4753230..4786088 Genome browser AA seq 2549 aa AA seqDB search MGLKVLMFCTLVALLIFSFAGNCKGVSCSLNPCLNGGECITHYDGNDICRCARGYGGATC NVQDTTCDVSHCNNGGTCHTAVEDGRTVQMCLCTFAYTGDTCQVLISSCEEVDCVQGECE IQDGRAVCVCEENYTGPRCNNYDYCSSEPCRNGATCTNLPQHFSCTCAEYWFGDTCENFR SPCISVPNICKNNGVCETTDDHWYCVCPNGFVGNYCEAKNIQRSSDPCTPDPCVNSGTCV EKSATVYQCVCLPGFGGTNCEIDIDDCQDDPCHNGATCIDQANSPLCQCAPGWTGATCEH GVDECALNPSACLHGGTCLNSEGSYQCTCVNGWTGEDCGTNEDNCLNKPCFHGATCIDLV GRFECICPLNKTGLLCHVDNACVADPPPCAAGAQCDTNPINGQAICTCPAGYTGVNCSLD LNECDLGTNPCEYDGTCVNIPGSYKCVCANGYSGPRCEENINECESNPCVNDATCLDKIG TFLCLCLPGYTGVTCSEEIDECESNPCLYDGECIDQVHGYICNCAAGYTGTNCQTNIDDC ALAHCQNHIECVDDVDDYTCICLPGYGGRNCETDIDECASSPCHYGTCVDGINRYTCNCE LGYGGTLCDTPINECDSNPCQNGGTCHDLVASYSCDCPLGTAGSNCETNIQECASNPCQH GQCVDGINKYTCDCDPGYSGLHCGADINECLSNPCYNGGTCENRLNSFVCHCPAGYNDPR CYSNIDECMSNPCVNGDCQDDINKYICNCYHGYVGVNCEYDINECESSPCVNGGSCLDLV NSYSCRCKTGYEGVNCETDIDECSPSPCLNGGSCANLIGRYVCTCPLGFTGSECETALTP CDPIPCNNGGSCQPNADYLGYTCVCTPGFQGPTCANDINECMSPPCKNGGKCRNREPGYF CECLDGYSGVNCEENVDDCASDPCMNGGTCLDDVNSYKCLCKRGFDGNQCQNDVNECENE PCKNGATCTDYVNSYACTCPPGFRGTTCMENIDECNIGSCLNGGTCVDGINSYSCNCMAG FTGANCERDIDECVSSPCKNGAPCIHGINTFTCQCLTGYTGPTCAQMVDLCQNNPCRNGG QCSQTGTTSKCLCTSSYSGVYCDVPRLSCSAAATWQGVEETSLCQHGGQCINSGSTHYCS CRAGYVGSYCETDEDDCASYPCKNGATCTDYPGSYTCTCMDGFQGTRCETELNECESNPC LNNGQCVDLINAYKCLCQVGTSGDRCQDNENECTSTSCFNSGNCVDGIGGFTCTCVPGYA GPRCEGDVNECVPNPCNTEGSTNCVQGINKFTCTCKQGYTGTRCEKKLTSCSTMPCFNGA TCTDAPYEPTGYRCTCSNGYRGTNCEEVMSRCRDGLVCYNGGTCHENASGGEMCXCPADY NGDNCIYYIPGQAAGPGTNNINIPEFIKKVCLDPTCAALKGNGECDAKCNTHGCEYDGGD CSYGNTDPWAKCPASLQCYNYFHDGACDEACNNADCLFDGFDCETPHEACPADYQDYCDK NYKNNKCDSGCNTFGCGWDGLDCDKDHPQQPAAGELIMIVLIPPEELISRQAEFLRFIGT VLHSVVEFKLTTSGQPYIEAISSQLSRKKRSVISSLGWEKFVGYDSSIYHNKTHTRLRRA SNTFFSKAHLLVNSQKCKQTSSECIDTTDNAASVISARASTGTLEAEFPINTVASTTNPT PPPQDYTYIVGAAGGVVLVIVIIGVLTHRKRKRETSTLWAPEGFNVTKKQRREPIGQDDL NGLNGSIHPGELTQLDTAGTPFLNRWENTSLPQKSNHYHVQYTPENITFLPNNGTVPRSQ MSSSAQKSSSRDDMEPTDNRKWTPQHLEAADLSRAGSACTPVTDLTPPPHIDVDEDDVNA RGPDGVTPLMVASIRGGGVDHGISDDESQHSGDAGISGEGSDSMIAGLLLQGASLSAQTD RSGETALHLAARYARADAAKRLLDAGADANMKDHSGRTPLHSAVAADAQGVFQILLRNRA TDLDARTNDGTTPMILASRLAVEGMVEELISANADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVDAVS TLLRAGCNRDAQTEREETPLFLAAKEGSYEAIRILLDHYANRDITDHMDRLPRDIAQERL HTDIVQLLDEYNLVRSPPLPANHMTSHMNGHAMMSRDPYLTSQMKQHTTGKKPRRQSNRA DGKPSRRVKKTPTSSQGPPSSVTTADSITPVIDPTPNMAIHPGITHVGESTLSPGNNSLP SPATTYSTDSTLSPPSSMGPPSNGTYHPHLHPHQQGVPHQFSNMEERMMSTLNYRGTPPR LSHPLPHGGAPGLYPARSHGHLAGTHTGLGFSLGQIPNGQVPQEWIQRNERIQQQNQQNQ QMYNAVISQSGVHHPSQFAAYRALGFPEQQHNRVDSASSDQRRYSEVIYGKGLPIYSLPH TQPQLGYTTIQGVPHQHPVSSAGQTPPVQTGTVIAPHSYTNVLEKYPTPPSAHTMSPSSG SENLSPPGPLPPAPKHLVHDLSYETPSPDSPDPWSSSSPSNSDWSEGIRSPPGPMQGHHH HAPQPQHQRMRVYPPQNTGAAIAGKMGVA NT seq 7650 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgggattaaaagttctaatgttttgcacactagttgcacttcttatattttcatttgct ggaaactgcaaaggtgtttcatgttcattgaatccttgtttaaatggtggggaatgtata acacattatgatgggaatgacatatgcaggtgtgcgcgtggttacgggggagctacgtgc aacgtacaggataccacatgtgatgtatcgcattgtaacaacggtggtacatgccatact gcagtagaggacggccgcaccgttcaaatgtgtttatgtaccttcgcatacaccggtgat acttgtcaagtgctgataagttcgtgcgaggaagtggattgtgtgcaaggcgaatgcgaa atacaagacggtcgggcggtgtgtgtttgtgaggaaaattacacaggcccaagatgcaac aactatgattattgctccagtgagccatgtaggaacggggcaacatgcaccaacctgcca cagcacttcagctgtacatgtgcagaatactggttcggcgacacgtgcgaaaatttccga agtccttgtatatcagtgcccaatatatgcaagaataatggtgtttgcgagactacagat gatcattggtattgtgtttgtcccaatggttttgtgggcaattattgtgaagccaagaac attcaacgcagctcagacccatgtacacctgatccttgtgttaatagtggtacatgcgtg gagaagtcagccacagtgtaccagtgtgtgtgtttacctgggtttggaggaaccaactgt gaaatagacattgacgactgccaagatgatccttgtcataatggagctacatgtattgac caagctaactcaccgttgtgtcagtgtgcccctgggtggacaggtgctacatgcgaacat ggcgtggacgaatgcgcactaaatccatcagcatgtttacatgggggaacatgtctcaac tcagaaggttcctaccaatgtacttgtgttaatggttggacaggtgaagattgtggaaca aacgaggacaattgtttaaataaaccttgttttcatggagctacatgtattgacttggtg ggaagatttgaatgcatttgtcctcttaataaaacaggattgttatgccatgttgacaac gcttgtgtggcggaccctcccccttgcgcagcgggtgcacaatgcgacaccaacccaata aacgggcaagcgatatgcacgtgccctgcaggttacactggtgttaattgctcgcttgat ctgaacgaatgtgacttgggaacgaacccatgtgaatatgatggcacatgcgttaacata ccgggcagctacaagtgtgtgtgcgctaatggttattctggcccaagatgtgaggaaaat ataaacgaatgcgaatccaacccatgtgttaatgacgcaacttgtctggataagattgga acgtttctatgtctttgcttgccaggttatactggggtaacatgcagtgaagaaattgat gaatgcgaatcaaacccttgtctttatgatggagaatgcattgaccaagtgcatggatat atctgtaactgtgcagcaggatacactggtacaaactgtcaaaccaacatagatgattgc gcgttggcacattgtcagaaccacatagaatgtgtagatgatgtggacgactatacttgc atttgtctacctggatatggtggtaggaattgtgaaacggatattgatgaatgtgcatca tctccctgccattatggtacttgtgtagatggaattaacagatacacatgtaactgtgag cttggatatggtggtacattatgtgacaccccgataaatgaatgcgactccaacccatgt cagaatggtggcacgtgccacgatcttgtggcttcgtattcatgcgactgccctcttggt accgcaggatctaattgcgaaaccaacattcaagaatgtgcgtccaatccttgtcaacat ggtcaatgtgttgatggtatcaacaaatacacatgtgactgtgatcctggctattcaggc cttcattgtggagcagatatcaacgaatgtttatccaacccatgttataatgggggcact tgcgaaaatcgactcaattcatttgtgtgtcattgccctgcaggttataacgacccaaga tgttattccaacattgatgaatgcatgagcaatccctgtgtgaatggagattgccaggat gacatcaacaagtatatatgcaactgctaccatgggtatgtgggtgtcaactgtgagtac gatattaatgaatgcgagtcatcaccttgcgttaatggaggttcatgcttggatcttgtc aactcatattcatgcagatgcaagactggatatgaaggtgtaaattgtgaaactgatatt gatgaatgtagtccatcaccttgtttaaatggtggttcatgtgcaaaccttattggtcga tatgtttgtacttgtccactgggattcacaggtagcgaatgtgaaacagctttaacccca tgtgaccccataccatgtaataatggtggtagttgccaacctaatgctgactaccttggc tacacatgtgtttgtacaccaggatttcaaggccccacatgcgcaaatgacatcaatgaa tgcatgtccccaccctgtaagaatggtggcaaatgtagaaaccgggaacccggttatttc tgtgaatgtttggatggttattccggcgtaaactgtgaggagaacgtggatgattgtgct agtgacccatgcatgaacggtggaacttgccttgatgatgttaattcgtataaatgtctt tgtaaacgtggttttgacggcaaccaatgtcagaacgatgtgaatgaatgtgagaatgaa ccatgtaagaatggagctacgtgtacagattatgtaaacagctacgcttgtacttgcccg cctggttttcgtggaacaacatgtatggaaaacattgatgaatgtaatattggttcatgt ttaaatggtggaacatgtgtggacgggattaattcatattcatgcaactgtatggctggt ttcacaggtgccaactgtgagcgcgatatagatgaatgtgtttcctccccgtgtaagaat ggagcaccatgcattcatggtatcaatacattcacatgccagtgtttgaccggctatact ggacccacatgtgctcaaatggttgatttgtgccagaacaacccatgtaggaatggtgga caatgtagtcaaacaggaactacatctaaatgcttgtgtacatcatcgtattctggtgtt tattgcgatgtacctcggttgtcgtgctctgctgctgctacatggcaaggtgttgaagag acatcattatgccaacatggtgggcaatgcatcaacagtggctcgacacattattgctca tgtagggcaggttatgtgggaagttattgtgaaacagatgaagatgattgtgcgagctac ccttgtaagaatggagcgacgtgtactgactatcctggaagctacacatgtacatgcatg gatggattccaaggaactagatgtgaaactgaactgaatgaatgcgaatctaacccatgt ttaaacaacggacaatgtgttgatttgatcaacgcttataaatgtttatgtcaagtaggg accagtggtgatcgttgccaagacaatgagaatgaatgtaccagcacttcttgcttcaat agtgggaactgtgtggatgggattggtggattcacatgtacctgtgttcctggttatgct ggcccaagatgcgagggtgacgtgaatgaatgtgtgccaaacccatgtaatactgaaggt tcaactaactgtgtacaagggataaataagtttacgtgtacatgtaaacagggatatact ggcacgaggtgtgagaaaaaacttacaagttgcagcactatgccttgttttaatggagcc acatgtacagatgctccgtatgaacccactgggtatagatgtacttgctctaatggttat cgcggcaccaactgtgaggaagtgatgtcacgatgtagagatgggcttgtgtgttacaac gggggtacatgccatgaaaacgcaagtggtggcgaaatgtgtwtgtgtcctgctgactat aatggtgacaactgtatatactacatacctggtcaagctgcaggtcctgggaccaataat atcaatatacctgagtttataaagaaagtatgtctggatcccacatgcgctgcattgaaa ggaaatggggaatgtgatgcgaaatgtaacacccacggttgtgagtacgatgggggagat tgttcttacggaaataccgatccttgggcaaaatgtccggcatctttacaatgttacaat tactttcacgatggtgcatgcgatgaagcgtgtaataatgctgattgtttgtttgacggc ttcgattgtgaaacgccacatgaagcttgcccagccgattaccaagattattgcgataag aattacaagaataataaatgcgacagcggttgtaatacatttgggtgtggttgggacggg ttggattgcgataaagatcatccgcaacaacctgcagctggagaactgataatgatcgtc cttataccacctgaggaattgatctcgcgccaagcagagtttcttcggtttattggaact gtgcttcactctgttgttgagtttaaactaacaacatcaggacaaccttacattgaagca atatcttcacagttatcacgaaagaaaagatcggtaatatcttcgcttggttgggagaag tttgtcggatatgattcatccatttatcataacaaaacacacactcgattacgaagagct tcaaacactttcttctctaaggctcacttattggtaaacagccagaaatgcaagcaaaca tcatctgaatgcattgatacgactgacaacgcagcttctgtgatatcagcgcgtgcaagc acaggaacgttggaagccgagtttcccatcaatactgtagccagcactaccaacccaacc cccccaccacaggattatacatacatagttggggcagcaggaggagtggttctcgtgatc gtgatcattggtgttctgacgcaccgcaagcgaaagcgtgagacaagtacattatgggca cccgaaggtttcaatgttaccaagaaacaaaggagagaacccatcggacaagatgacttg aatggtttaaacggcagcatccaccccggcgagcttacccagcttgatacagcaggaacc ccgtttttaaatcgatgggaaaacacctcgttgccccagaaatcmaaccactaccatgta caatacacaccagagaatattacatttcttcctaacaacggcactgtgccacgctcacaa atgtcgagctcggcgcaaaaatcgtcgagtcgcgacgacatggaacccaccgacaatcgc aagtggacgccacaacatctggaagctgcggatttatcacgagcggggtccgcttgtacc cccgttaccgacctcaccccacccccgcatatagatgtggatgaagatgatgttaacgca cgcggtccagatggagtaactccattgatggttgcctccatacgtggtgggggggttgac catggtattagtgacgatgaatcccaacatagtggtgatgctggtataagtggtgaagga agcgattccatgattgctggtcttctactgcaaggagcatcattgagcgcccaaacagat agatctggtgaaactgcattgcacttggctgcgcgttacgcacgagcggatgcagcgaaa cgactccttgatgcaggagcggatgcaaatatgaaggaccacagtgggaggactcctctt cattctgctgtggctgccgacgcacaaggagtcttccaaatattactcagaaacagagca acagaccttgatgcaagaacaaacgatggaacgacacccatgatattggcatctagatta gcagttgaaggaatggtggaagaattgataagtgctaatgctgatgttaatgctgtggat gatcatggcaaatctgctctccactgggctgcagcggtgaacaacgtggatgcggtttcc acgctcttgagagctggatgtaacagggatgctcaaactgagcgcgaggagactcctctc tttcttgcagcaaaggagggaagttacgaagccattcgtattttactcgatcattacgct aacagggatataacggaccatatggataggttaccccgtgacattgcacaagaacgcctc catacagatatcgttcaactacttgatgaatataacctcgtgcgaagcccaccactgccg gccaatcacatgacgtcacacatgaacggacatgcgatgatgtcacgtgacccatacctc acttcacagatgaaacaacatacaacgggcaagaaacctcgtcgtcaatcaaatcgtgcg gatggtaaaccttctcggagggtaaaaaaaacccctacaagctctcaaggccccccatca tctgttaccactgccgatagcatcacccctgtaattgaccccaccccaaatatggcaatt caccccgggatcacccacgtgggtgaaagcaccctctcacccggcaacaactccctgcct tcacccgctaccacgtatagcaccgactccaccctgtcacccccgtcttccatgggcccc ccatcgaacgggacgtaccacccccacctacacccccaccaacaaggggttccgcaccag ttcagcaacatggaagagcgaatgatgtcaacgctcaactaccggggaacccccccacgc ctctcacaccccctaccgcacggtggggcaccagggttataccccgcacgatcacacgga caccttgcaggcacccacactggcctcgggttctcacttggccaaatacccaacggacag gtcccacaagagtggatacaacgcaatgaaagaattcaacaacagaatcaacaaaatcaa cagatgtacaacgcagtgatcagccaatcaggcgtccaccacccgtcacagttcgccgca tatcgtgcccttggtttccccgagcaacaacataacagggtggatagcgcctctagtgac caaagaagatattctgaagtgatatacggcaaagggttgcctatatacagtctaccacac acccaaccccagctaggctacaccactatacagggcgtaccacaccaacacccagtaagc tctgcaggacagacacctccagtgcaaactggcacagttatagcaccacatagttacacc aatgtattggagaaatatccgacccccccatctgcgcatacgatgtctccttcatctgga tcggagaacctttcaccccctggaccattaccccctgcccccaagcatttggtgcacgat ctctcatacgaaacccccagccccgattctcccgacccatggtccagctcttcacccagc aactcagactggtctgagggtatccgtagccccccaggccccatgcagggtcaccaccat catgccccgcaaccacagcaccagagaatgcgagtttacccaccacagaacaccggggct gcgatcgccggcaaaatgggggtagcttaa

DBGET integrated database retrieval system