Carettochelys insculpta (pitted-shelled turtle): 142013535
Help
Entry
142013535 CDS
T11194
Symbol
FBN2
Name
(RefSeq) fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
ciz Carettochelys insculpta (pitted-shelled turtle)
Pathway
ciz04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ciz00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
142013535 (FBN2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ciz00536
]
142013535 (FBN2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
ciz00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
142013535 (FBN2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
FXa_inhibition
EGF
hEGF
TB
EGF_3
Fibrillin_U_N
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
142013535
NCBI-ProteinID:
XP_074851141
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(46499269..46813935)
Genome browser
AA seq
2896 aa
AA seq
DB search
MGARRGLCPRLYCLWLGCVALWSQGAAGQQVRPAGGADAVYPASEYPEDGAGAASSRVRR
RGQQDVLRGPNVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNSCGDGFCSRPNMCTCSSGQ
ISPTCGSKSIQQCSIRCMNGGTCADDHCQCQKGYIGTYCGQPVCENGCQNGGRCIGPNRC
ACVYGFTGPQCERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLTGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPP
QPQPCRRGFIPNIRNGACQDVDECQAIPGVCSGGNCINTVGSYECKCPAGHRQNEATQKC
EDIDECSITSGICEGGECSNTVGSYFCICPRGYVASTDGSRCIDQRAGTCFSSLVNGRCA
QELPNRFTKMQCCCESGRCWAIGSVPEMCPMRGSDEYRRLCIDGVPAGGGSRPGGTGGNG
FLPGGNGNSYGPGGTGFIPILGGNGFSPGVGGAGIGTGGQSPTGNGAIITGLTILNQTID
ICKHHPNLCLNGRCIPTISSYRCECNMGYKQDASGDCIDVDECTSNPCTNGDCVNTPGSY
YCKCNAGFQRTPTKQACIDIDECIQNGVLCKNGRCVNTDGSFQCICNAGFELTTDGRNCV
DHDECTTTNMCLNGMCINEDGSFKCICKPGFILAPNGRYCTDIDECQTPGICMNGHCINT
EGSFRCDCPPGLAVGVDGRVCVDTHMRSTCYGGIKKGVCIRPFPGAVTKSECCCANPDYG
FGEPCHPCPAKNSAEFHGLCSSGVGITVDGRDINECALDPDICANGICENLRGSYRCNCN
SGYESDPSGRNCVDIDECSVNRLLCDNGLCRNIPGSYSCTCPKGYVFSTETDTCEDVNEC
EISPCVNGACRNNLGSFNCECSSGSKLDSTGLICIDSLKGTCWLNIQDSRCEVNINGATL
KSECCATLGAAWGSPCERCELDAACPRGFARVKGITCEDVNECDVFPGVCPNGHCVNSRG
SFHCECPEGLTLDGTGRVCLDIRMEQCYLKWDEDECVQSVPGKFRMDACCCAVGAAWGSD
CEECPKFGTKQYEALCPRGPGFSNRGDVLTGRPFYKDINECKAFPGMCMNGKCRNTVGSF
KCRCNSGFALDMEERNCSDIDECRISPDICGSGTCVNTPGSFECECFEGYESGFMMMKNC
MDIDECERNPLLCRGGTCVNTEGSFQCDCPLGHELSPSRENCVDINECSLSDNLCRNGKC
VNMIGTYQCSCNPGYQATPDRQGCTDIDECMIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSDGYALMP
DVRTCADIDECENNPEICDGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMKTCIDVNECDLNSNIC
IFGECENTKGSFICHCQLGYSVKKGTTGCTDVDECEIGAHNCDMHASCVNVPGSFKCSCR
EGWMGNGIKCIDLDECSNGTHKCSVNAQCVNTPGSYRCSCAEGFTGDGFTCSDIDECAEN
INLCENGQCLNVPGEYRCECEMGFTPASDSKSCQDIDECTFQNICVFGTCNNLPGMFHCI
CDDGYELDRTGGNCTDIDECADPINCVNGLCVNTPGRYECNCPPDFQLNPTGVGCVDNRV
GNCYLKYGPRGDGSLSCNTEIGVGVSRSSCCCSLGKAWGNPCETCPPVNSTEYNTLCPGG
EGFRPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCECPQGYYLSEETRICEDIDEC
VAHPGVCGPGTCYNTLGNYTCICPPEYMQVNGGHNCMDMRKSFCYRSYNGTSCENELPFN
VTKRMCCCTYNVGKAWNKPCEPCPTPGTAEFKTICGNIPGFTFDIHTGKAVDIDECKEIP
GICANGVCINQIGSFRCECPTGFSYNDLLLVCEDIDECSNGDNLCQRNADCINSPGSYRC
ECAAGFKLSPNGACIDRNECLEIPNVCSHGLCVDMQGGYQCVCHSGFKASQDQTMCMDVD
ECEHHPCGNGTCKNTVGSYNCLCYPGFELTHNNDCMDIDECSSFFGQVCRNGRCFNEIGS
FKCLCNEGYELTPDGKNCIDTDECMALPGACSPGTCQNLEGSFRCICPPGYEVKSESCID
IDECNEDPNICLFGSCTNTAGGFQCICPIGFVLSDNGRRCFDTRQSFCFTNFENGKCSVP
KAFNTTKAKCCCSKMPGEGWGDPCELCPKEEEVAFQALCPYGHGTIPGIDDTREDVNECI
ESPGICSNGHCINTDGSFRCECPMGYNLDYTGVHCIDTDECSIGNPCGNGTCTNVIGSFE
CNCHEGFEPGPMMNCEDINECAQNPLLCAFRCINTYGFYECTCPAGYELREDQKMCKDMD
ECAEGLHDCESRGMMCKNLIGTFMCICPPGMIRRPDGEGCMDENECRTKPGICENGRCVN
IIGSYRCECNEGFQSSPSGTECLDNRQGFCFAEVLQTMCQMASSSRNLVTKSECCCDGGR
GWGNQCELCPLPGTTQYKKLCPHGPGYATDGRDIDECKVMPNLCRNGQCINTMGSFRCFC
KVGYTTDITGTSCVDLDECSQSPKPCNFICKNSEGSYQCSCPRGYILQEDGKTCKDLDEC
QTKQHNCQFLCVNTLGGFTCKCPPGFTQHHTACIDNNECGSQPALCGLKGICQNTPGSFS
CECQRGFSLDSTGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNILGGYRCGCPQGYIQHYQWNQCIDEN
ECTNPNACGTASCYNTLGSYKCTCPSGFSYDQFSSACHDVNECSSTKNPCNYGCSNTEGG
YLCGCPPGYYRVGQGHCVSGLGFNRGQYLPLGGDVDEENALSPEACYECKINGYAKKNRR
RKRSVNETEQAEIEQISLESLDIDSPLRIRLNISGLGNKEHILELMPAIQPLTNHIRYVI
SHGNDYGIFQIHQRDGLSYLHTAKKKSVPGTYTLEITSIPLYKKKELKKLEDSNEDNYLL
GEIGEVLRMRLLIELY
NT seq
8691 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggggcacggcgggggctttgcccgcggctgtactgcttgtggctgggctgcgtcgcg
ctgtggtcgcagggagcagccgggcagcaagtccggccggcggggggagcagacgccgtc
tatccagcctcggagtatccggaggacggggcaggggccgcctccagccgggtccgcagg
agaggccagcaggacgtgctccgggggccaaatgtgtgtggctctagattccactcctac
tgttgccctggatggaaaacgctccctggaggaaaccagtgtattgttccaatttgtaga
aatagttgtggtgatggattttgttcccgtcctaatatgtgcacttgctccagtggacaa
atatcacctacctgtggatcaaaatctatacaacagtgcagtatcagatgcatgaatggt
ggtacttgtgcagatgaccattgccagtgccagaaggggtatattggaacttattgtgga
cagcctgtctgtgaaaatggttgccagaatggaggacgttgtattggacccaaccgctgt
gcgtgcgtatatggatttactggtcctcagtgcgaaagagattatagaacaggcccctgt
ttcactcaggtcaacaaccagatgtgtcagggccagctgactggcattgtttgcacaaag
accctttgttgcgcaacaattggccgtgcatggggccatccttgtgagatgtgtcctccc
cagcctcagccatgtcgtcgtggcttcattcccaacatccgcaatggagcatgtcaagat
gttgatgagtgccaggctataccaggggtctgctctggaggaaactgcattaatacagtt
gggtcttacgaatgcaagtgtcctgctggtcatagacagaatgaggcaactcagaaatgt
gaagatatagatgaatgcagcatcacttcaggaatctgcgaaggtggtgaatgttctaac
accgtgggaagctatttttgcatttgtccacgtggctatgtcgcatctacagatgggtcc
cgctgcattgatcaaagggcaggcacatgtttctccagcttagtgaatggacgctgtgca
caagaacttccgaataggtttaccaaaatgcagtgctgttgtgaatctggtcgatgctgg
gctattggatccgttcctgagatgtgtcctatgagaggctctgatgaataccgcagactt
tgtatagatggagttccagcaggaggtggttccagacctggtggaacaggagggaatgga
ttccttcctggtggcaatgggaatagctatggccctggtggaacaggatttattcccatt
ctgggtggcaatggcttctctcctggtgtaggaggagcaggcattgggactggtggccag
agtcccacgggaaatggtgcaatcattactgggctgacaatactcaatcagacaattgat
atatgtaaacaccatcccaatctctgcctaaatggacgctgcataccaacgatttccagt
taccgttgtgagtgtaacatgggctataagcaagatgcaagtggggattgtatagatgtt
gatgagtgcacatcgaacccatgcactaatggagattgtgttaatacacctggatcctat
tattgcaaatgcaatgcaggtttccaaagaacacctaccaagcaagcttgcattgatatc
gacgaatgcatacagaatggcgttctttgtaaaaatggccggtgtgtgaatactgatgga
agtttccagtgtatatgtaatgctgggtttgaactaactacagatggaaggaattgtgtt
gatcatgatgagtgcaccacaaccaacatgtgtttaaatgggatgtgcataaatgaagat
ggtagcttcaaatgtatatgcaaaccggggtttatcttggctcctaatgggcgttattgt
actgatattgatgaatgccagactccgggaatttgcatgaatggtcattgcatcaatact
gaaggttcctttcggtgtgactgtccaccaggcctggctgttggtgttgatggccgtgtt
tgtgtagatactcacatgcgcagcacatgttatggaggaatcaaaaaaggggtgtgcatc
cgcccttttcctggggcagtaacaaaatctgaatgttgctgtgccaatccagactatggc
tttggagagccatgtcacccatgtcctgccaagaactcagctgaattccatggtctgtgt
agcagtggtgtaggcattactgtggatggacgagatattaatgagtgtgcattggatcct
gatatttgcgccaatggaatttgtgaaaacctacgtggtagctatcgttgtaattgtaac
agtggatatgaatctgatccctctggaaggaattgtgttgatattgatgaatgttcagtg
aacagactgctgtgtgacaatggcctgtgtcgaaatatacctggaagctacagctgtaca
tgtcctaagggttacgtattcagcactgagactgacacatgtgaagatgtaaatgaatgt
gaaatcagcccatgtgtcaatggcgcctgcaggaacaatcttggttctttcaactgcgaa
tgttcatctggcagtaaactggattctactggactgatttgcattgatagtctgaaagga
acatgctggttgaacatccaagacagtcgctgtgaggtgaacatcaatggtgctacattg
aaatcagaatgttgtgctactttaggggctgcttgggggagcccttgtgagcgatgtgaa
ttagatgcagcttgcccaagaggatttgccagagttaaggggattacttgcgaagatgta
aatgagtgtgatgtcttcccgggtgtttgtcccaatgggcattgtgttaacagcagagga
tcgtttcactgtgagtgtccagaaggtctgacactggatggaacaggtcgagtatgctta
gatatccgcatggaacaatgctacctgaagtgggatgaagatgagtgcgttcagtctgtg
cctgggaagtttcgtatggacgcctgctgttgcgctgttggtgctgcttggggctcagac
tgcgaggagtgtcctaagtttggcaccaaacaatatgaggctttgtgccctagaggacct
ggcttttccaacaggggagatgttctaactggcaggccattttataaagatatcaatgaa
tgcaaagctttccctggtatgtgcatgaatgggaaatgcaggaacactgttggaagcttc
aaatgtagatgtaacagtgggtttgcgttagatatggaggaaagaaactgttcagacatt
gatgagtgtcgtatctccccggacatctgtggaagtggtacatgtgtcaacactccaggc
agctttgaatgtgaatgctttgaaggctatgaaagtggatttatgatgatgaagaattgc
atggacatagatgaatgtgaacgtaaccctctcctgtgcagaggtggcacttgtgtgaac
acagaaggcagctttcaatgtgactgtcccttgggacatgagctgtcaccatcacgtgag
aattgtgtggatataaatgaatgctcattgagtgataatctctgcagaaatggcaagtgt
gtgaacatgattgggacatatcagtgttcctgtaaccctggttaccaggctactccagac
agacaaggctgcactgatattgatgaatgtatgatcatgaatgggggctgtgacacgcat
tgcaccaactcagagggcagctatgaatgtagctgcagtgatggctatgctctcatgcca
gacgtgagaacatgtgcagatattgatgagtgtgaaaacaacccagagatctgtgatggt
ggacagtgtactaatattccaggagaatatcgctgtctttgttatgatggcttcatggct
tctatggacatgaaaacctgtattgatgtgaatgaatgtgacttgaattccaacatctgt
atctttggggagtgtgagaacactaagggatccttcatttgccactgtcaattaggatat
tcggtcaagaaggggaccactggatgcacagatgtcgatgagtgtgagattggtgcccac
aactgtgacatgcatgcctcatgtgttaatgtcccaggaagcttcaaatgcagctgcaga
gagggatggatgggaaatggcattaaatgtattgatcttgatgagtgttctaatggaacc
cacaagtgtagtgtgaatgctcagtgtgtgaacactcctgggtcataccgttgttcctgt
gctgagggattcactggagatggattcacttgttctgatattgatgaatgtgcagaaaat
attaatctctgtgagaatggacagtgcctaaacgtccctggtgaatatcgatgtgagtgt
gagatgggttttactccagcttcagacagcaaatcttgccaagatattgatgaatgcacc
tttcagaacatttgtgtttttggtacttgcaataacttaccaggcatgtttcactgtatc
tgcgatgatggctatgaactggatagaacaggaggaaactgtacagatatcgatgagtgt
gctgatcctattaactgcgttaatggtctctgtgtgaatactcctgggaggtatgagtgt
aactgcccaccagatttccagctgaacccaactggagtaggttgtgtagataatcgtgtt
ggcaattgttacctgaaatatggaccccgaggagatgggagcctctcttgcaacactgaa
attggcgttggagtcagtcgctcctcatgctgctgctctttggggaaggcctgggggaac
ccatgtgagacttgtccccctgtaaacagcacggaatataatactctgtgtccagggggt
gaaggattcagaccaaatcccatcactattattttagaagatattgatgaatgccaggag
ttgccaggtctgtgtcaaggtggaaattgcataaatacttttggtagcttccagtgtgaa
tgtccacaaggctactacctcagtgaagaaacacgcatctgtgaagatattgatgagtgt
gttgcacatcctggtgtctgtggccctggtacctgctacaacactctggggaactacacc
tgcatctgtcctcctgaatatatgcaggtgaatggaggacacaattgtatggatatgaga
aagagcttttgctacagaagctacaatggaacctcctgtgagaatgaactgcccttcaac
gtgaccaagaggatgtgctgctgcacatacaatgttggcaaagcttggaacaaaccctgt
gagccatgtccgaccccaggaacagctgaatttaagactatatgtggaaatattcctggc
ttcacctttgacatccatactggcaaggctgttgatatcgacgaatgcaaggagatccca
gggatttgtgcaaacggagtttgcattaatcagattggcagtttccgctgcgagtgtccc
acaggcttcagctacaatgacctgctcttggtctgtgaagatattgatgagtgcagcaat
ggagacaatctctgtcaacgaaacgcagattgtatcaacagtccagggagttaccgctgt
gaatgtgctgcaggtttcaaactttcacctaatggtgcctgtatcgatcgcaacgaatgt
ctggaaattcctaatgtttgtagtcatggcttgtgtgtggatatgcaaggaggttaccaa
tgcgtctgtcacagtggttttaaggcatcccaagaccagaccatgtgcatggatgttgat
gaatgtgaacaccatccgtgtggaaatggaacttgcaaaaacacagttggatcatataac
tgtttgtgctaccctggatttgagctcactcataataatgactgtatggatattgatgag
tgcagttccttctttggtcaggtgtgcagaaatggccgctgttttaatgaaattggttct
ttcaaatgtttatgtaatgaaggatatgaacttactccagatggcaagaattgtattgat
actgatgagtgtatggcacttcctggtgcatgctctcctggtacttgtcagaacttggaa
gggtcattcagatgtatctgcccaccaggatatgaagtgaaaagtgaaagttgtattgat
attgatgagtgcaatgaagaccccaacatctgtctcttcggttcctgcactaatactgca
ggaggctttcaatgcatctgtcccataggttttgtgctgtcggataatggacgaaggtgc
tttgatacccggcagagcttctgcttcactaactttgagaatgggaaatgctctgtccca
aaggctttcaacaccaccaaggcaaaatgttgctgcagtaagatgccaggagaaggatgg
ggtgacccttgtgagctttgccccaaggaagaagaagtcgctttccaggctctgtgtcca
tacggccatggaactatccccgggattgatgatacgcgggaagatgtcaatgaatgtatt
gagagccccggcatctgttctaatggtcattgcatcaacactgatggatcattccgctgt
gagtgccccatgggttacaacttagactacactggcgtgcactgtatagatactgatgaa
tgttcaattggtaatccgtgtggaaatggcacatgcactaatgtgattggcagttttgaa
tgtaactgtcacgaagggtttgagccaggcccaatgatgaattgtgaagacataaatgag
tgtgctcagaatcctttgctgtgtgcttttcggtgcatcaacacttacggtttctatgaa
tgcacctgtccggctggctatgaactaagagaagaccaaaagatgtgcaaagacatggat
gaatgtgcagaaggtctccatgactgtgaatcaagaggcatgatgtgcaaaaacttgatt
gggaccttcatgtgtatatgtcctcctggaatgattcgtagacctgatggagaaggctgc
atggatgaaaatgaatgtcgcaccaagccaggtatatgtgaaaatggtcgctgtgtgaac
attattggaagctacaggtgtgaatgtaatgaaggattccagtcaagcccctcaggcact
gagtgtcttgacaaccgccaaggattctgttttgctgaagttttacagacaatgtgccag
atggcttccagtagccgtaatcttgtcaccaagtcagagtgctgctgtgatggagggcga
ggctggggcaaccaatgtgagctttgtccactgccaggaaccactcagtataagaaactc
tgtccacatggaccaggatatgcaacagatggaagagatattgatgaatgtaaggtcatg
ccaaacctgtgtagaaatggccagtgtatcaacacaatgggttctttcagatgcttttgt
aaagttggctacaccactgatataactgggacatcctgtgtggatcttgatgaatgttcc
cagtctccaaagccctgcaactttatctgcaagaactcagaaggaagctatcagtgctca
tgtcctcgtggctacatcctgcaagaggatggaaagacatgcaaagatcttgacgaatgt
caaaccaaacaacacaactgtcagttcctctgtgtcaacactcttggaggctttacgtgt
aaatgtccaccgggtttcactcaacatcacactgcttgtattgataacaatgagtgtggt
tcacagccagcactttgtggattaaaaggaatctgtcaaaacacccctggaagtttcagc
tgcgagtgtcagagaggcttctctttggattctactggattaaactgtgaagatgtggat
gaatgtgatggaaaccacaggtgccagcatggctgccagaatatcctgggtggctacaga
tgtgggtgtccccaaggatatattcaacattatcagtggaatcagtgtattgatgaaaat
gaatgtaccaaccctaatgcgtgtggtactgcttcctgttacaacacactcggaagttac
aagtgcacttgtccatctggattttcttatgaccagttctctagtgcatgccatgatgtg
aatgaatgttcctccactaaaaacccctgcaattatggctgttccaacacagaaggtggt
tatctctgcggctgccctcccggatactacagagttggacaaggccattgtgtctcaggg
ttgggcttcaacagaggccaataccttcctctgggtggagatgtagatgaagaaaatgct
ttgtctcctgaagcatgttatgaatgcaaaatcaatggctatgccaagaagaaccgcagg
aggaaaagaagtgtgaatgaaacggagcaagccgagattgagcagattagcttggaaagc
ttagacattgactctcctttgaggataaggttgaacatctctgggcttggtaacaaagaa
cacattctagaactcatgccagccatccagccccttacaaaccacatccgctatgtcatc
tcccatggcaatgactatggcatctttcaaatccatcagagggacggacttagttacctg
cacacagctaagaaaaaatcagtgcctggcacttacacactggaaatcactagcattcct
ctgtacaagaagaaggagctaaagaaactggaagatagcaatgaggacaactacctcctg
ggagagattggagaagtgctcagaatgagactgttgattgaactgtattag
DBGET
integrated database retrieval system
