| Entry |
|
|---|
| Symbol |
pme8A
|
|---|
| Name |
(GenBank) pectin methylesterase, putative, pme8A
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
|
|---|
| Pathway |
| cja00040 | Pentose and glucuronate interconversions |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:cja00001]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
CJA_0041 (pme8A)
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
CJA_0041 (pme8A)
Enzymes [BR:cja01000]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.2 pectate lyase
CJA_0041 (pme8A)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
69515..72958
|
|---|
| AA seq |
1147 aa
MKLQIAVTGVIAALILAGCGGSSSGSSKTSSSSSSVNSSVVSSSVSSTSSSVEQSSSSVS
EVSSSSESSSEVSSSEVSESSVSSDSSSEESSSSESSSSSSAAALSGCAATTGLYFCDDF
AANNSDNWDALPSTINSLAPNGEFSVEDDNGNYIWRYTAASTGGVIALIKPDAFSSVTSA
DYYVEAKIRPRANSTTSNKQIYLLARYVDGNNWYAGALNVQNATTSTQVEIARMVSGTLS
RPVQVKKPIEQGTADEFDGVWYTLRFEVLGDKLTVYLDGETIGSTTDANFTQPGLIGFWT
ANKSFDIDDIKVGNATDKPASLLLSPSAITYAAEAGDAARVITVNAKTDAGTADDFTVES
SDPAVVSVVTNGTEVSLTPVGEGSATIVFTSSSGLVRSITATIAPQFVMPTATYSFTNQL
VPAAGETDAYEDLTLKLTFDSVPALGSSGSIRIFKASDDTQVDKIALVDEKDAIGFGTLR
SLNTRPVRISGNTASISLHANKLEPNTTYYVAVSEAVFSGATLAGQSFTGIGKNANWSFT
TRAAKPAAGLTTIIVDDAGSTADFRSVQGALNYAMEHVALADAVTIEVKDGIYEEPLYLR
NKNNVTIRGESREGTIIQYPNNELLNSGSTGRALFLVESADMLSLENLTLKNTTLIGAGG
QAETIYFNSTTGRLIAKNANFISEQDTLLLKGWTWFYNTLVAGNVDFIWGYSKASLFEKS
EIRSLGRSTGNTNGGYVLQARVESATDKGFVFLNSSVTAGAGPTGETPVDGSHYLARSPG
GTTTYDNIVFVNTRMGSHVNAKGWAGGGVNSQPIANPATGTVTTGWREYNTMDLNGNPLD
MSGREFVYQLNAGEVAGYCSRAQVFSAYNSGAGWDPMPEDTSDCIDVDGTGGASSSSSAA
SSEASSESSIASSSSSNSEASSEASSESSSSVSSESGGGTSESSSSSSTGLSINWSPTYE
DFAAVVAAQPAAGSNANFNANASAFAIGNFNFYSSGAGSLRLHLTADSSAYAINYNGSSL
RTEPTKFVEGSSGQVNPTQLTGAGGVSRYVSYPVVSSSDALTFTVTYTNGSADYDVVNNQ
NGCLNGQIAIVDQTGKAWKVASSCGNTTPSTITATISDPNVTELYVLMSRNGDGGGGIRI
WNIQVTR |
|---|
| NT seq |
3444 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgaagttacaaatagcagtaacaggggtgattgccgctttgatattagctggatgtggt
ggctcaagcagtggctcatccaaaacatctagcagcagctccagtgtaaacagctcggta
gtgtctagttcggtatccagtacttcatcaagtgttgagcaatcttcatcttcggttagt
gaagttagttcctccagtgaatcaagtagcgaagtctcctccagtgaggtcagcgaatct
tcagtctctagcgacagtagcagcgaagagtcatcttccagcgaatcaagttcatccagc
tccgctgcggcgttgagcgggtgtgcagcaactaccggcctatatttctgtgatgatttc
gcagcaaataacagcgataactgggatgccttgccaagcacgattaatagtttggcgccc
aacggtgaattcagtgttgaagatgacaacggtaattacatttggcgttatacggctgcg
agtacaggtggtgttattgccttgataaagcctgatgcgtttagcagtgttacttcagca
gattattatgtagaagcaaagatccgtccgcgtgctaatagtacgaccagtaacaagcaa
atttatttattggcacgttatgtggacggtaacaattggtatgcgggtgcacttaatgtg
caaaacgcgactaccagtacccaggtagaaattgcgcgcatggtgagtggtacgctcagt
cgaccagtgcaagttaaaaagcctattgaacaaggtacagcggacgaatttgatggcgtt
tggtataccttgcgctttgaagtgctgggagacaagttgacagtttatctggatggcgaa
actatcggcagcacgacagatgccaactttacgcaacctgggcttattggtttttggacg
gctaataaatcattcgatattgatgatattaaagttggcaacgctactgacaagcctgcc
tcccttttgctctcgcccagtgctattacctatgcagctgaagcaggtgatgcagcgcga
gtgattaccgttaacgccaaaacggatgcggggactgctgacgatttcacggttgaatct
tctgatcctgcggttgtgagtgtagtaactaatggaactgaggtgagcctgaccccggta
ggagagggtagtgctaccatcgtatttaccagtagttcgggtttagtgcgcagcattacg
gccactattgcgccacagtttgttatgccaacggcaacctacagttttaccaatcaattg
gtgccagctgcgggggaaaccgatgcttacgaagatcttacacttaaattgacctttgat
tctgtgcctgcgctcggtagcagtggcagcattcgcattttcaaagccagtgatgatacc
caggttgacaagattgctctggttgatgaaaaagatgcgattggttttggaaccctgcgt
agcctgaatactcgccctgttcgtattagtggcaatacggccagtatttcactgcatgcg
aacaaactggagcctaatacaacctattatgttgctgtcagtgaagcggtgtttagtggt
gctaccctggcgggacagtcctttaccggtattggtaaaaatgctaactggagtttcaca
acccgtgcagcaaaaccggctgcaggcttaacgacgattatcgttgatgatgcaggttca
acagccgatttccgctcagtacaaggtgcactgaactacgctatggaacatgttgctctg
gccgatgcagtcactattgaggtgaaggatggtatttatgaagagccactgtacctgcgc
aataaaaacaatgtgaccattcgcggtgaaagtcgtgagggaacaattatccagtacccc
aataatgagctgctgaattccggctctaccgggcgcgcactgttcctggtggaatctgcg
gatatgctcagcctggaaaaccttaccctgaaaaatacaaccttgattggtgctggtggc
caggcagaaactatctatttcaacagcactaccggtcgtctgattgccaaaaatgccaac
tttatcagcgaacaagataccttgttattgaaaggttggacctggttctacaacaccctg
gtagcgggtaacgttgatttcatctggggttacagtaaggcgtcattgtttgagaaaagt
gaaatccgttcactgggccgctccacgggaaatacaaatggcggttatgtgctgcaagca
cgtgttgagtcagcaaccgacaaaggttttgtgttcctcaactccagtgtgactgccggc
gcaggtccaaccggtgaaacaccggtagatggcagccactatctggcgcgcagtcccggc
ggcacaacaacctacgataatattgtatttgtcaataccagaatgggatcacacgttaat
gccaagggttgggctggtggcggtgtaaattcccaacccatcgccaatcctgcaacaggt
acggtgacaacaggctggcgtgaatacaacaccatggatttgaatggcaatccgttggat
atgagtggccgtgagtttgtatatcaattgaatgcaggtgaagtggctggctattgcagc
cgtgcacaggtgttctctgcctataacagcggcgccggttgggacccaatgccggaagac
acgagtgactgtatagatgtggatggtacgggtggcgcttccagcagttcatcagccgcc
agctctgaggcctcaagtgagtccagcattgcatcatccagtagctccaactcagaggct
tcatccgaagcctccagcgaaagcagctcatctgtcagcagtgaatccggtggtggaacc
tcggagtcgtccagttcaagcagtaccggtcttagtattaattggtcaccgacttacgaa
gattttgctgctgtagttgcggcccagcctgcagcgggcagtaatgccaatttcaatgct
aatgcatccgcttttgctattggtaatttcaatttttattcctctggtgcgggtagcttg
cgtttgcacctgacagcggatagcagtgcttatgctattaactataatggttcttcattg
cgtacagaacccaccaaatttgtggagggtagtagtggccaagtaaacccaacccaattg
acaggtgcaggtggagtatcacgttatgtgtcttatcctgtggtatctagtagcgatgcg
ttgacctttactgtgacctataccaatgggagcgcagattacgatgtagttaataatcag
aatggttgtttgaatggccaaatagccatagttgatcaaacaggtaaagcatggaaggta
gcatcttcttgcggtaatactactccttcaactattactgccacgattagtgatcctaat
gtcaccgagttgtatgttttgatgagccgcaacggtgatggtggtggtggtattcgtatt
tggaatatccaggtaactcgataa |
|---|
