Cryptomeria japonica (Japanese cedar): 131047911
Help
Entry
131047911 CDS
T10556
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
cjf Cryptomeria japonica (Japanese cedar)
Pathway
cjf03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cjf00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
131047911
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
cjf03019
]
131047911
Messenger RNA biogenesis [BR:
cjf03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
131047911
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Nup35_RRM_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
131047911
NCBI-ProteinID:
XP_057837711
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(390860793..390866554)
Genome browser
AA seq
395 aa
AA seq
DB search
MDSDHGKIFVGGISWDTTEERLKEYFGAYGEVVDVVIMKDRTTRRARGFGFVVFADPSVA
DRVIQEKHTIDGRNVEAKKVVPRDEQQTAQRTSNTAGPRTKKIFVGGLAPTVTEDDFRKY
FEQFGNITDVVVMYDHTTQRHRGFGFITYDSEDAVDKVLQQTFHELKEKTVEVKRAIPKE
MSSGNTRGPAGRGTSYGGPYMQGYGPSPVGAYGVRPPLASSGYSPYGAAPAYGPTGYGST
PGYGANMNGGYGAAPVYGAAAGYAAGTAGSYGAGFSTAPGSAPYGSGTAGYAAAAVPAPY
GNAVVGARTGWGTGGGSPGYAATGAGSWGSAAPAGQPTGAAAGYGYATGETGYVSRSDGG
YVQGGSGYGPPVGASGGMYSGGYGDTHGPSSYGNS
NT seq
1188 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattccgatcatggtaagatatttgtaggggggatatcgtgggatacgacggaagag
aggctgaaagagtatttcggtgcatatggggaagtggtggacgtggtgataatgaaagac
aggactaccagacgagcaaggggctttggttttgttgtttttgctgatccctctgttgca
gatcgcgttattcaggagaaacataccattgatggtagaaatgttgaggccaaaaaggtt
gtgccaagggatgaacaacagactgcacagaggaccagcaatacggcaggccctagaact
aagaagatttttgtgggtggattagctccaactgttactgaggatgacttcagaaagtat
tttgagcagtttggtaatataacagatgtagttgtaatgtatgaccacactactcaaagg
catcgaggttttgggttcattacttatgattcagaggatgcagtggataaggttcttcaa
cagaccttccatgaactcaaggaaaagacagtggaggtgaagcgggccattccgaaggag
atgtcttcaggaaatacaagaggtcctgctggacgtggaaccagttatggtgggccatat
atgcaaggttatggtccaagtccagttggggcttatggagtgcgcccacctctggcaagc
agtgggtattctccttatggtgcagcacctgcttatggcccaactgggtatggaagcacc
cctggatatggggcaaacatgaatggtgggtatggtgcagcacctgtatatggggctgct
gcaggttatgctgctggtacagcaggatcttatggagctggttttagcacagcacctggt
agcgccccatatggttctggaactgctggctatgctgctgcagctgtgcctgctccatat
ggaaatgctgttgtaggtgctagaactggctgggggactggtggtggttctccaggttat
gcagcaacaggagcaggttcttggggttcagctgctcctgcaggacagcctactggagct
gctgctgggtatgggtatgcaactggtgagactggttatgttagcagaagtgatggtggt
tatgttcaaggaggcagtggctatggacctcctgttggagccagtggaggaatgtactct
ggaggctatggggacacacatggtccttccagctatggaaactcataa
DBGET
integrated database retrieval system
