Kaistella jeonii: NCTC13459_00968
Help
Entry
NCTC13459_00968 CDS
T06863
Name
(GenBank) Por secretion system C-terminal sorting domain
Organism
cjg
Kaistella jeonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_5
LRR_8
Por_Secre_tail
FNIP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEI95373
LinkDB
All DBs
Position
1:1050398..1052548
Genome browser
AA seq
716 aa
AA seq
DB search
MIKKLSFLLLFFTLIFAKSQTFQVDGIFYNVISGTNNVEVAPNNYYVGDLIIPGNVSDGT
KNYSVTSIAENAFSNLSIDFLSIPNTVTTIKDYAFDKSTVDQIDFPNSVTFIGKYAFRDA
LITSLILPNSVTFLGEGAFNSCRFLTSVTLSNSLTSLEKNVFIACIKLTSITIPNSVISI
GPSAFYNCSSLIAVNIPNSVTSIDESAFQGCIKIQSVVIPNSVTSIGKKTFLDCTNLTSI
ILPNSLTVIGDQAFENCSSLTSITCDIATPLVINANVFAGITQNSCKLTVPSGSVSAYQS
ALVWKNFNPISSDSTFVVNGIFYSVIEGTTNVKIAPNNCFSGDLIIPASVTNNNIAYAVT
SVGTDAFKNCNTITSITIPNSVTSIGDFAFDNNMNLTSVTLSNSLTSIGEYAFTSCSSLS
SMVIPDSVTTIGKGAFKFCNALNEIELPDTLQAIADETFYGCQAFVLLTIPNTIKSIGNA
AFYNCNGLTSFLIPNSVTTIKESAFENCTRITSIIIPNAVTIIEANVFKNCYDLISVNTP
NSLTTIGKGSFLSCTSLKSIKIPSSVTSIGDQAFENCESLKSIYCNVIFPVDINSNVFAG
VTQNECYLYVPSESITDYREALVWANFVITGDSTLNTTNFKNQKNHTIYPNPVQNEAFLE
LKNSDSNQLQVFDMSGKLMMSKLLNNNSKNSVDTTNLPAGSYLFKVGNSVTKVIKN
NT seq
2151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaaattatcttttttactactattcttcacgcttatttttgcaaaatctcaa
acttttcaagttgatggtatattttataacgtgatttctggaaccaataatgtagaagtt
gcgccaaataattattatgtaggggatttaattattcctggaaacgtttctgatggaaca
aaaaattacagtgttacttcaattgcagaaaatgcttttagcaatttatccatagatttt
ttatctattccaaataccgtaactaccattaaagattatgcttttgataaatcaactgta
gatcaaattgactttccaaattcggtaacatttatcggaaaatatgctttcagagatgca
ttaataacttcgcttatccttccaaattctgttacttttcttggagaaggtgctttcaat
agttgtagatttttaacctctgttaccttatcaaattcccttacttctttggaaaaaaat
gtgttcatagcttgtataaaattaacttcaattacgattccgaattccgtgatttctata
ggaccatctgctttttataattgttctagtttaatagctgttaacattccaaattctgtg
acttctattgatgaatctgcttttcaagggtgtatcaaaatacaatctgtcgttattccg
aattctgtaacttctattggaaaaaaaactttcttagattgtactaacttaacatcaatt
attcttccaaattctttgacagttattggagaccaagcttttgaaaattgctctagttta
acttctattacttgtgatattgcaacacctttagttattaatgcaaatgtttttgcggga
attacacaaaattcttgtaagttaaccgttccttctgggagtgtttctgcatatcaatca
gctttagtttggaaaaattttaatccaattagtagtgattctacttttgtagttaatggt
atattttatagtgttatagaaggtacaaccaatgtgaaaatcgctccaaataattgtttt
tcaggtgatttaataattccggcgagtgttacgaataacaatattgcttacgctgtaact
tcggttggtacagatgcttttaaaaattgcaatacaattacttccatcacaattccaaac
tcggtaacttcaataggtgattttgcttttgataataatatgaatctaacttcggttact
ttatcaaattctttaacttctattggagaatatgcttttacttcttgtagttcattaagt
tcaatggttattcctgattctgtgactactattggaaaaggtgcttttaaattttgtaat
gcattaaatgaaattgaacttcccgatactttacaagcaattgcagacgaaactttttac
ggatgtcaagcgtttgttctcttaactattcctaataccataaaatcaataggaaatgca
gctttttataattgtaatggtttaacttctttcctcattcctaattctgttacaacaatt
aaagaaagtgcatttgaaaattgtacacgtattacctccattataattccaaatgctgta
accataatcgaagcaaatgtttttaaaaattgttatgatttaatttctgtaaacactcca
aattctttaactactatcggaaaagggtcatttctttcctgtacaagtttaaaatcaatc
aagattccatctagtgttacatcaattggagatcaagcttttgaaaactgcgaaagttta
aaatccatttattgcaatgttatttttccagtagatattaattctaatgtttttgcagga
gttacccaaaatgaatgttatttatatgttccgtctgaaagtattaccgattatcgagaa
gctctggtttgggctaattttgttattactggtgattctactttaaacacaacaaatttt
aaaaatcaaaaaaatcatactatttatccaaatccagttcaaaatgaagcttttttagaa
ttaaaaaattctgattctaatcaacttcaagtgtttgatatgagtgggaaattgatgatg
agtaaattattaaataacaattctaaaaattctgttgatacaactaatttacctgcagga
tcttatttatttaaagtgggaaattctgttacgaaagtaattaagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
