Campylobacter jejuni subsp. jejuni 35925B2: UC78_0712
Help
Entry
UC78_0712 CDS
T03745
Name
(GenBank) hemagglutination activity domain protein
Organism
cjq
Campylobacter jejuni subsp. jejuni 35925B2
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
IFT57
DUF2491
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP35212
LinkDB
All DBs
Position
691230..694553
Genome browser
AA seq
1107 aa
AA seq
DB search
MKKMSKHIVLSFAVSSLLFSQAYALPQGGKFTHGSTGSISSSNGTMNITGNKGAGTGGNN
FVIQWGGGFNIGQNESVNFNGKNQNYLNIAYQKDASKIGGALNGGNNNIFLVNPMGVLIG
KTGTITAGKFVASTTPLKDSDVQNFISQGMNFSPVFDVSKQGNIINLGKINADNIVLIGN
KVEIGVGGRINGQNEASNAKEAHFVGNYVYVNVGKENEKNTINVDSLKGTAVKEGFLQRD
MTSFAGDGYVFGNFGTITKVSYNNIQGVDFTKAITIGGHYNDSLQTTLNNYANATEWKLF
ADGWNGNELSEDILKDGLTTIRLISDIDFSGYYTDGIDPVGANKYAFSGKFDGGGHTLKN
LTIKAQNTSTGWNTGIFGKVQGTSDKKAQIYNLTVDNLKFSGKTNSGGGFVAQSKDAEFY
NIHLKNYNDLNFYDFGDGQDTFGGGFVGYADSGSKFENITLENFGTIRLTPDQWINSQII
NSYLGGFAGYDNGGVYNNILLNGFKDIRLEGYGNGISFYAGGFVGYSKNSSFKNITLNNF
SNIYSGYILNETSKRGQIFDSIAGGFAGVIDGNKLDIENISLNNFGDIEARRGIIYYQNA
SYLAAAGGFAGMIKLENQVNGNISNIFLNFDNNKIYAQKTYSGTSVISDYDYAGGFAGLF
QGSDFSSNFVIENIDLKFGGKVKIYTFSKNPNGVFNQGVFTGYVDNINSFKNIFKTIRVF
YINNEGGLSKNPQRDYWDTLNKLFLEYKWNDFTAGDKNLIFYIYDKSNENNEKVNNLIKE
KFANLDNNGYVNFYNSNAINNPDIPNFKDPVLSKNDFDPKLLQRILDDLMNGKYTYDFDT
KTWTYTDSKGVVGKDEASEITQSLNFLNAFKDTGVEQEFLKLWQGSQEQSYKNYANLYEK
WTQKKTAMDKIKTGEGYFASFKEELQKYQEALAQLDKENKNYEKIKESGLVSDETFKVMY
EKLLEQKEALEKQFADLSGNEGFHYKLENEILNSQGFSIEGKDVDDKAYTGNYKFEGKLA
SLPEKPNISIYEPDKQGGEDPDKPSVLPPEIPEKVVEAPIKIQTEVDTKKEEDDDQVEIG
EADARSSGLRCIVSDNFKTMNICVNVK
NT seq
3324 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaagatgagtaaacatatagttttatcatttgcggtgagttctttactcttttct
caagcttatgctttaccacaaggaggtaaatttactcatggttcaacaggaagtataagt
tcaagcaatggcacgatgaatatcacaggaaacaaaggagctggaactggtggaaataac
tttgttatccaatggggtggtggttttaatataggacaaaatgaaagtgtaaattttaac
ggcaaaaatcaaaactacctaaacattgcttatcaaaaagatgcttctaagataggcgga
gctttaaatggagggaataacaatatctttttagttaatcccatgggagttttgattggc
aaaacaggaaccatcactgcgggaaaatttgtagctagcacaacacctttaaaagattca
gatgtccaaaattttatttctcaagggatgaatttttctccagtatttgatgtaagcaag
caaggaaatattataaatcttggaaagatcaacgcagataatattgttttaataggaaat
aaggttgaaataggggtaggtggtagaataaatgggcaaaatgaagctagcaatgctaaa
gaagctcactttgtaggtaattatgtttatgtgaatgtaggaaaagaaaatgaaaaaaat
actataaatgtagattctttaaaaggaacagctgtcaaggaaggttttttgcaaagagat
atgacaagttttgctggagatggttatgtctttggaaattttggaactataactaaagtt
tcttacaataatattcaaggcgtagattttactaaagctattactataggtgggcattat
aatgatagtttacaaactacattgaataattatgccaatgctaccgagtggaaacttttt
gctgatggttggaatggcaatgagcttagtgaagatatccttaaagatggtttaactact
ataagattaatcagtgatatagattttagtggttattatacagacggaattgatcctgta
ggtgccaataaatatgcttttagtggtaaatttgatggaggtggacacacactaaaaaat
ttaactattaaagctcaaaacacctctaccggatggaatacgggtatatttggcaaggtt
caaggaacgagtgataaaaaagctcaaatttataatcttactgtagacaatcttaaattt
agcggaaagacaaactcaggtggaggatttgtagcgcaaagcaaagatgctgaattttat
aatattcatttaaaaaattataatgatttaaatttttatgattttggcgatggacaagat
acttttggaggaggatttgttggatacgctgatagtggctctaaatttgaaaatattact
ttggaaaattttggaacgattagattgactccagatcaatggataaattctcaaataata
aatagctatttaggtggattcgctggttatgataatggtggtgtatataataatatttta
cttaatggttttaaagatattaggctagagggttatggaaatggtatatctttttatgct
ggtggttttgtaggatatagtaaaaattcttcctttaagaatattacattaaataatttt
agcaatatttattctggttatattttaaatgagacaagcaaacgaggtcaaatttttgac
tctattgcaggcggatttgcaggggttattgatggaaataaattagatattgaaaatatt
tccttaaataattttggagatattgaagctagaagaggtattatttattatcagaatgct
agttatttagcagctgcaggcggatttgcaggtatgattaaattagaaaatcaagtaaac
ggaaatatttcgaacatctttcttaattttgataataataaaatatatgcacaaaaaaca
tatagcggtactagtgtaatttctgattatgattatgcaggtggatttgcgggtttattt
caaggaagcgattttagctctaactttgtaatagaaaatattgatttaaaatttggtgga
aaggtaaagatttatacttttagtaaaaatcctaatggagtgtttaatcaaggtgttttt
actggatatgttgacaatattaactcatttaaaaatatttttaaaacaataagagtgttt
tacattaataatgaaggcggattgtcaaaaaatcctcaaagggattattgggatacgctt
aacaaattatttttagaatataaatggaatgattttacagcaggagataaaaatcttata
ttttacatatatgataaatcaaatgagaataatgaaaaggtaaacaatcttattaaagag
aaatttgccaatttggataacaatggttatgtaaatttttacaattctaacgctataaat
aacccagatattccaaattttaaagatcctgtattatccaaaaatgactttgatcctaaa
ttgcttcaaagaattttagatgatttgatgaatggaaaatacacttatgattttgatacc
aaaacttggacttacacagatagtaagggtgtggtaggaaaagatgaagccagtgagatc
actcaaagtttaaatttcttaaatgcgtttaaagatactggagtagaacaagaattttta
aagttatggcaaggttcgcaagaacaaagttataagaattacgccaatctttatgaaaaa
tggacgcaaaagaaaactgctatggataaaatcaaaaccggcgaaggttatttcgctagt
tttaaagaagaattacaaaaataccaagaagccttagctcaacttgacaaagaaaataaa
aactatgaaaaaatcaaagaatcaggcttagttagcgatgaaacatttaaagttatgtat
gaaaaacttttagaacaaaaagaagctcttgaaaagcagtttgcggatcttagcggaaat
gaaggatttcactataagcttgaaaatgaaattctaaattctcaaggtttttctatagaa
ggtaaagatgtagatgataaagcatacactggaaattataaattcgaaggaaaattagct
tcattgccagaaaaaccaaatatatctatttatgagccagataaacaagggggtgaagat
ccagacaaaccttctgtattgccgcctgaaattcctgaaaaggttgtagaagctcctata
aaaattcaaaccgaagtagacacaaaaaaagaagaagatgatgatcaagtggaaatagga
gaagcagatgctagaagtagtggtttgcgttgtattgtaagtgataattttaagacaatg
aacatttgtgtaaatgtaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system