Campylobacter jejuni subsp. jejuni YH001: QZ67_00175
Help
Entry
QZ67_00175 CDS
T03744
Name
(GenBank) mechanosensitive ion channel family protein
KO
K16052
MscS family membrane protein
Organism
cjy
Campylobacter jejuni subsp. jejuni YH001
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cjy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cjy02000
]
QZ67_00175
Transporters [BR:
cjy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
QZ67_00175
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MS_channel_2nd
MS_channel_1st
MS_channel_3rd
DUF5759
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJA54289
LinkDB
All DBs
Position
complement(163958..165841)
Genome browser
AA seq
627 aa
AA seq
DB search
MKKIIFSLCFFILHLGAQEFKFIDANISKEDEGIYALVEKYVDLNNQIKEFKKNNDENSS
TFNGILSEFEKDKKTILAKIPDMIVGQKINEEAVARFLKAKEKLLDVQKKNINKPYIYTD
ATLNLVYFNIVESFYSSLFEVEKLFKNTASSEDLIATVDKAMENLQNSSNVNLDSFKSKI
TNPEELEKITLKERYISNAVDSYSEILKYLRSNADLLESNYIFSLLELQVWIDRINEAIG
VSFVNIGKIVISALVLVFFISLRRFFANIVYFFLVQLFYRNKNDVDDIKVIFIENIKKPV
GFLLIVYAISLCLTIATYPAPLSVNLSNFFHIVYAVLIAWLILRMLDGYGVVLVSKLAQK
SGKKEVVNLIIKILYFVIIIIALLYILAQLGFNISAIIASLGIGGLAVALAAKDIIANFF
ASILLLFDNSFNQGDWVEVSGIEGTVVETGLRKTTIRTFDNCLVFLPNSTIMGANIKNWS
KRRMGRHVRMYLGVGYDATPEKLEQCVKDLREFLHTSDLVAHDEDSALKYGDHTTKYRQN
LVSINDLEGYKNACYVALSEFADSSINIELYFYIKEIGGKDFREARQSLMLEFMRIIEKN
GLTFAFPSRSIYIENLPPLDLQAKAIK
NT seq
1884 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaattatttttagtttatgtttttttattttacaccttggagcacaagaattt
aaatttattgatgcgaatattagtaaagaagatgaaggaatttatgctttagttgaaaaa
tatgttgatcttaacaatcaaattaaagaatttaagaaaaacaatgatgaaaattcaagc
acttttaatggtattttaagtgaatttgaaaaagacaaaaagactattttagcaaaaata
cccgatatgatagtaggacaaaagattaatgaagaggcagtggctagatttttaaaagca
aaagaaaaattactagatgttcaaaaaaagaatattaataagccttacatttatacagat
gccactcttaatctagtttattttaacattgtggaaagtttttattcttctttgtttgaa
gtggaaaaactttttaaaaatacagcaagcagtgaagatttgattgctactgttgataag
gcaatggaaaatttacaaaattcttctaatgttaatttagatagttttaaaagcaaaatt
acaaatccagaagaattagaaaaaattaccctaaaagaaagatatatcagtaatgccgta
gattcttattctgaaattcttaagtatttacgttcaaatgcagatttgcttgaaagtaat
tatattttttcattactcgagcttcaagtttggatagatcgtataaatgaggcaattggg
gtaagttttgttaatatcggaaaaatagtaatttctgctttggttttagtattttttata
tctttaagacgtttttttgcaaatatagtatattttttccttgttcagcttttttataga
aataaaaatgatgtagatgatattaaagtcatttttattgagaatattaaaaaacccgta
ggtttcttgttgattgtctatgctatttctctttgtcttactatagcaacttatcctgca
cctttgagtgtaaatttaagtaatttttttcatatagtttatgcagttttaattgcatgg
cttattttaagaatgcttgatggttatggcgtggtattggtttctaaacttgctcaaaaa
agtggaaaaaaagaagttgtaaatttaattattaaaattttatattttgtcattattatc
atagctttattatatattcttgctcaacttggttttaatatttcggctattattgcatct
ttgggaattggtggtttagctgttgctttagcggcgaaagatatcattgcaaatttcttt
gcttctatactcttactttttgataatagctttaatcaaggagattgggtagaggtttca
ggcatagaaggaactgtggttgaaacaggacttagaaaaactactattagaacttttgat
aattgtcttgtatttttaccaaattcaactattatgggagctaatatcaaaaattggagc
aaaagacgcatgggtcgccatgttagaatgtatttgggtgttggttatgatgctactcct
gaaaaactagaacaatgtgtaaaagatctaagagaatttttgcatacaagtgatttagta
gctcacgatgaggatagcgcattaaaatatggcgatcatacaacaaaatatcgtcaaaat
cttgtatctattaatgatttagaaggctataaaaatgcttgttatgtggctttaagtgaa
tttgcagatagtagtattaatatagagctttatttttatatcaaagaaataggtggaaaa
gattttagagaagctagacaaagtttaatgcttgagtttatgcgtataattgaaaaaaat
ggtttaacctttgctttcccaagtcgtagtatttatatagaaaatttaccaccccttgat
ttgcaagcaaaagctataaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
