Campylobacter jejuni 32488: M635_06565
Help
Entry
M635_06565 CDS
T02759
Name
(GenBank) ligand-gated channel
KO
K16089
outer membrane receptor for ferrienterochelin and colicins
Organism
cjz
Campylobacter jejuni 32488
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cjz00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
cjz02000
]
M635_06565
Transporters [BR:
cjz02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
M635_06565
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGQ95788
LinkDB
All DBs
Position
1258298..1260370
Genome browser
AA seq
690 aa
AA seq
DB search
MTQIKNMKFKKSLLCFLILSRALLKAEEKYQLNDVVVSASGFEQDLVDAPASISIITKEE
LEKKPIKDIGEAIGDIPGVDVTMNKTGTYDFSIRGFGSSYTLVLIDGKRQSVANGFYDNG
FSGSESGYLPPLNMIERIEVIRGPASTLYGSDAVGGVINIITKKNPDKIEANIEFNTLLQ
QHSNHYGNAGGFNAYVATPLIEDTLSISARLKYYDKAASDLKWPTPVWDSSQQRPDNYQI
ASHSPGAFTSLGFGSRLNWTVDDKNNIYFDIERYINEISVNSTSSRAIKSERQLFKDNIV
LNHDGNYDFGSTNSYLQYGSTKDKELHSQIWVGEGKVVLPWNLGQYGNLVNTFGARIDYE
MVKNDQASAGSQIRGKNLDQTTVALYGENEYFITDDLIFTTGLRYIYSDLFDSEFTPRVY
LVYHLNDNIAFKGGVSKGYKTPAAKQLTNGYYNYANNNAYFGNPDLKPEESINYELGVDF
RVFDFAHYSITGFITDFTNQISSEDLTGMQNDINCSNGIVCKRPINLGKTQTKGIEFAFN
TKTYNGFSLNSSYTFMDNRYKDGQKNWFGGDRIENLPRHIAMLKLNYERGKFSSYIKTRA
RLDTIAKAKGGGNRSLPWQKYKPFYIVDLGINYKINKQSSLSFAVQNLFDKNFFDPQVTR
WDGANPAGYANRYQDYTEGRSFWLSYKYDF
NT seq
2073 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactcaaattaaaaatatgaaatttaaaaaaagtttactgtgttttttaattttatct
agagctttgttaaaagcagaagaaaaatatcaacttaatgatgttgtggttagtgctagt
ggttttgaacaagatttggttgatgcgcctgctagtatttctatcattacaaaagaagag
cttgaaaaaaagccaattaaggatataggggaggctataggagatattccaggtgtagat
gtgactatgaataaaacaggcacttatgattttagcatacgaggttttggtagttcttat
actctagttttaattgatggaaaacgtcaaagtgttgcaaatgggttttatgataatggt
tttagtggcagtgagtcaggatatctaccacctttaaacatgatagaacgtatcgaggtt
atacgtggtccagcttctacactttatggcagtgatgctgtaggcggtgtgataaatatt
atcactaagaaaaatcctgataaaatcgaagcaaatatagaatttaatactcttttacaa
cagcactctaatcactatggaaatgctggaggatttaatgcttatgtagcaactcctttg
attgaagatacattatcaatttctgcaaggttgaagtattatgataaggcagcttctgat
ttaaaatggcctacaccggtttgggatagtagtcaacaaagacctgataattaccaaatt
gctagtcatagtccaggtgcttttactagcttgggttttggttctaggcttaattggaca
gtagatgataaaaataatatatattttgatatagagcgatatattaatgaaatttcagtg
aattctacaagtagtagggctattaaaagtgaaagacaactttttaaggataatattgtt
ttaaatcatgatggtaactatgattttggctcaactaactcatatttacaatatggtagt
actaaggataaggagctgcatagtcaaatttgggtaggagaaggtaaggttgttttacct
tggaatttaggtcaatacggtaatttggtaaatacctttggtgcaaggattgattatgag
atggtaaaaaatgatcaagcaagcgcaggtagtcaaataagaggtaaaaatcttgatcaa
accacggttgcactttatggggaaaatgagtattttataaccgatgatttgatttttact
acaggtttgcgttatatttatagcgatttgtttgattctgaatttacccctagggtttat
ttggtttatcacttaaatgataatatagcctttaaagggggtgtttcaaaaggctataaa
actcctgctgccaagcagttgacaaatggatattataattatgccaataataatgcttat
tttggaaaccctgatttaaaaccagaagaaagtataaattatgaattgggtgttgatttt
agggtatttgattttgcacattattctattacaggatttattactgattttacaaatcaa
atcagtagtgaagatttaacaggtatgcaaaatgatattaattgtagcaacggcattgtt
tgtaagcgtcctattaatcttggaaaaacacagactaaaggtatagaatttgcatttaat
accaaaacttacaatggctttagcctaaattcaagttatacttttatggataatcgctac
aaagatggtcaaaaaaattggtttggtggtgatagaatagaaaatttaccaagacatata
gcaatgttaaaattaaactatgagcgaggtaaatttagttcttatataaaaacacgagca
agacttgatactatagctaaagcaaaaggtggcggtaatcgtagtctgccatggcaaaaa
tataagcctttttatatagtagatttagggataaattataaaatcaataagcaatctagt
ttaagttttgcagtacaaaatctttttgataaaaatttctttgatccgcaagttacaaga
tgggatggggctaatcctgctggatatgcaaatcgctatcaagattatacagaaggaaga
agtttttggttaagttataaatatgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
