Conchiformibius kuhniae: LVJ77_11965
Help
Entry
LVJ77_11965 CDS
T08263
Name
(GenBank) RecQ family ATP-dependent DNA helicase
Organism
ckh
Conchiformibius kuhniae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
ResIII
AAA_30
SNF2-rel_dom
DEAD_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XHH49986
LinkDB
All DBs
Position
78406..80496
Genome browser
AA seq
696 aa
AA seq
DB search
MMAIAFNQIRAVELLRQASGKPDAHFRDGQEEAISHIVTSPQRLLVVQKTGWGKSFVYFI
ATKLLREAGSGPALLVSPLLALMRNQIAAAEKMGIKAVSINSDNTDEWSSIEYQIVSGQA
DIVLISPERLANQQFINNVLSRISDTISLLVIDEAHCISDWGHDFRPHYRLIERIIRNLP
PNLRVLATTATANNRVMEDLATVLGSNIKILKGDLNRPSLTLQTIRMPSQVERLAWLSEQ
LHHLQGSGIIYTLTVRDAYQVAEWLKSQGLNVAAYTGQTGDERVYLENALLNNQIKALVA
TTALGMGYDKPDLAFVIHYQRPNSVVAYYQQVGRAGRALEHAYGVLLSGVEDDEISKFFI
ESAFPAPEEVDIVLSVLARMPNGASVPEMRNYLNLSDGKINQTLKLLSLESPAPVVKQGS
KWFLTTAPLSDLFWQRVERLTNLRYAEHRQMQDYTHLPFGEHMAFLIRALDGDVNQISTP
GLPPLPVSTNPLYIRQAVEFLRRSSIPIEPRKQWPFGGLSKYGVKGAIPSDYRSEEGKAL
SVWGDSGWGQQVKQNKYQDKHFSDELVAACLNMLENWQPHPKPTWLTCVPSLRNPHLVAD
FARRLAEKMGLPFYPIIQKIRETEPQKLMKNSHAQACNLDGAFKLIDSPPREPVLLIDDM
VDSRWTFTICAYLLKRGGSGAVFPLALSQTTNQGGE
NT seq
2091 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggctatagcatttaatcaaattcgtgctgttgaattattacgccaagcctcagga
aagcctgacgcacattttcgtgatggtcaagaagaagccatatcccatattgtaacgtcg
ccccaacgtttgttggttgtgcagaaaacaggatggggaaaaagttttgtctattttatc
gccacaaaattattgcgtgaagctggttctgggcctgcgcttttggtttcacctttactg
gcattgatgagaaaccaaattgcagcagcagaaaaaatggggataaaagccgtaagtatt
aattcagataatactgatgaatggtcaagcattgagtatcaaattgtttctgggcaggcc
gatattgttttaatttcaccagagcgtttagccaaccaacaatttatcaataatgtatta
agtcgaatttcagacaccatttctctgttggtcattgatgaagcacattgtatttcagat
tgggggcatgattttcgtccccactaccgtttaattgaaagaatcattagaaacttgccg
cctaatttacgtgttttagcgaccaccgcaacagccaataatcgtgtgatggaggatttg
gctactgttttaggttctaatattaaaatattaaaaggagatttaaaccgtccatcactt
actttgcaaaccattcggatgcccagtcaagtagaacgtttagcatggctttcggagcaa
ttgcatcatctgcaaggcagtggcattatttataccctaaccgtacgagatgcataccaa
gtcgcagaatggttgaagtcgcaaggattaaatgttgctgcttacacagggcaaacagga
gatgagcgcgtatatttggaaaatgccttgttaaataaccagattaaagcactggtggca
acgactgctttgggtatgggatatgacaaacccgatttggcctttgtgattcactaccaa
agacctaattctgtagtagcgtattaccaacaagtggggcgggcgggacgtgctttagaa
catgcttacggtgtattgttgagtggtgttgaagatgatgaaatcagtaaattttttatt
gaaagtgcctttcctgcccctgaagaagtggatatcgttttatctgtgctggctagaatg
ccaaacggcgcatcagtgcctgaaatgagaaattatctgaatttaagtgatggcaaaatc
aatcaaaccttaaaattactgtctttggagtctcctgcacctgtcgtcaaacaaggctca
aaatggtttttaaccaccgcacctttatcggatttattttggcagcgagtcgaacgtttg
acgaatttaagatatgccgaacatcggcaaatgcaggattacacccatttgccttttggt
gaacatatggcgtttttgattcgggcgcttgatggtgatgttaatcagatttcgacacct
ggcttaccccctttgcccgtttcaactaatccgctatatatccggcaggcagttgaattt
ttaagacgcagctcaatccctatcgagcccagaaagcaatggccttttggggggttgagc
aaatatggtgtgaagggggcaataccttctgattatcggtcggaagaaggtaaagcatta
tcggtttggggtgattcgggttgggggcagcaggtcaagcaaaataaatatcaggataag
cacttttcggatgaattggtggcggcttgtttgaatatgctggaaaactggcaacctcat
ccaaagcctacttggctgacgtgtgtgccttccttaagaaatccccatttggttgcagat
tttgcacgacgtttggcggaaaagatgggcttgccattttatccgattattcaaaaaatc
agagaaaccgagccacaaaaattgatgaaaaacagtcatgcacaagcctgtaatttagat
ggtgcttttaaattgattgattctccgcccagagaacctgttttattgattgatgatatg
gtggattcgcgttggacattcactatatgtgcctatttgctaaaaagaggcggtagtggt
gcggtttttccgcttgcactttctcaaaccaccaatcaaggaggggagtga
DBGET
integrated database retrieval system
