Caldicellulosiruptor acetigenus I77R1B: Calkr_2289
Help
Entry
Calkr_2289 CDS
T01356
Name
(GenBank) S-layer domain-containing protein
Organism
cki
Caldicellulosiruptor acetigenus I77R1B
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ41743
UniProt:
E4S6W0
LinkDB
All DBs
Position
complement(2350565..2355052)
Genome browser
AA seq
1495 aa
AA seq
DB search
MSLFTAVIVVLSLIQPVFASFNDVQNHWAKDAIERLIIKGYPEGTFKPQNPITRVEFATI
INSLLKLRNASDIAYKDVKQSDWYYQQVRLASNYMNGYPDLTFRPNKPLTRQETVTILDR
VFDITPASNKVPNFMDNNQIADWAKDAVNALYSAGYIKGYSDNTFRPNSYITRAEAVYLI
SEIAKQIYSKEGEYTSGKILGNVIINTANVTLKDTEISGNLYITEGVGDGDVTIENVKVD
GKVIVSGGGEQSVKIKNATINQLKIDKKGTPVRVVAEGNTNVKLAQVISSAKIEDNSQKA
GFAVVTIENSNKPIEVELKGYIASVKISGEAVVKTTPDTQIENLRVEASDATLSLEGSVN
KLEVANANNVVVSEKANVKELVVNSEEAKVTIQGTVEFAQIAAAKEAVIASNAKVEKLSV
KDQNANIKVDGTVNTVLIEVPSAKINNQEVKKGDEVKIEKGGIVSVEKQSQQTQNTQNNT
QTNNNSASTSQQSQTSTVAQNTTSNQVGNQSSQTQSSITTGSGQTSSSGTGSTNTNTSNQ
QTGTSSDQTNNTTSGQAGSQSGQTDSQSSQTGTQSGQTGSQTGQGNNQQDQTSNQTGPTG
SQSDQTTTPSEQGNNQQGQSGSQEGNQGGQQNTQQPVNGKYALNINIKYSGQPVEVNGSF
AIVAEDVYGRPRYGIFYPKVLLINTINFYSDFDFSTTNESVFLFSGCMENVKENVASSQV
KFVIKKESVVLSTYSTANVEVNLEDYPKVTLNLSKDKIALGNAQVLIKPQKDIFSNLWYI
GNTDENGNIDVFMSPDTYTIVVRYTESDGNEKTVAIGDVTIPAEKVQTLKLEVKPQSNIT
LSANIPDNLNNINLRYYYSLSWSENGNSYHYNFYTVTNSVYYNMPLKNKYIYTGIYFTRY
LNDKYISYGLMKDGIADSDYCNMVFDLNRFTTPYIDYYCYINDVYKSVDRGTVYRGSTLK
YVRFGFANENGEKLSIYLGAPVEVKIEDLQTNEVLYQNSNFDLNKDTIYIDPQKFVTGNK
YLLKISFDPNWWPLFNGDNITAEFTVIDNSQSSADTGSESSGSSSGAEGMQQSSNIAGGS
LSINVKYQSQPVDAKGTIVIGYTSSGGQTYNGIWYVGVPLNTVINYSNYTMLDNSTEIVW
LVTGYDKSKLNTDLQNDIDRLPLRFFIQNDTVDLTTYSSSSIDINIEDYPEVTININKDG
FDLENAQVLLEPTGSSPFSNFMYVGKTDSNGDIKIYISPGKYTLAVNYYENNMPKTVVLG
NIIVTDEKVQRISLNAKPLSGLNINIIKPESLSDINRYGLNYGMFWIENGNYYVQSYYAE
NTDEISLYFNDCMKNIGVWYRYGFRRKNIISADYTLVEENYSLNENEFLNLNIDLNKFIT
PIIFIFNQSDYRYNWVSSINIYQDSTIKIAGIGFAADGGHILNIYPYVPLELNIIDPSNN
EVLYQKSDFRLYSDIYIDSKKFIAGKKYLIRIGFDPNWWPVFKGNFEIELNVISP
NT seq
4488 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtttatttacagctgttattgtcgtcctttcattaattcaaccagtttttgcttcc
tttaatgatgtacaaaatcattgggcaaaagatgcaattgaacgtctaattataaaaggg
tatccggagggtacttttaagccacaaaatccaattacacgcgtcgagtttgctacaatt
ataaattctcttctaaaactcagaaatgctagtgatatagcgtacaaagatgtaaagcaa
agcgattggtactatcagcaggttcgtttagcatcaaactacatgaatgggtatcctgat
ctgacatttagacctaacaagccattgacacgtcaggagacagtgaccattctagataga
gtatttgatattactccagcctctaataaagttcctaattttatggataataatcaaata
gcagattgggcgaaagacgctgtaaatgctctttattcagcaggatatataaagggatat
tctgacaatacatttagacctaactcttatattacacgagcagaggctgtatatttaata
agtgaaatagcaaaacagatttattcaaaagaaggggaatatacaagtggaaaaatattg
ggcaatgttataataaacactgcaaatgttaccctaaaagacacagaaatcagtgggaat
ttatatataactgagggtgttggcgatggtgatgtaacaattgaaaatgttaaagtagat
ggtaaggtaattgtttcaggtggtggcgagcaaagtgtaaagataaagaatgccactata
aatcagttaaaaatagacaaaaaaggtacacctgttagagttgttgctgagggtaataca
aatgttaaactggctcaggttatttctagtgctaaaatagaagataattctcagaaagct
ggttttgcggttgtaactattgaaaattcaaacaaacctatagaggttgaattaaaagga
tacattgcaagcgttaagatttcaggggaagcagtggttaaaaccacacctgatacccag
atagagaatttaagagttgaagcttctgatgctacactttcattagaaggttctgtaaat
aaattagaagtagcaaatgccaacaatgttgtggtaagtgaaaaagcaaatgttaaggaa
cttgtagtaaattcagaagaagcaaaagttacaatccaaggaacagttgaatttgcccaa
atagctgcagcaaaagaagcagttattgcttcaaatgcaaaagtagaaaagctttctgta
aaagaccagaatgctaatattaaagttgatggaacagtcaatactgtcttaattgaagta
ccttctgcaaaaataaacaatcaggaagtaaaaaaaggtgatgaagtaaagatagaaaaa
ggtggtatagtctcagtagagaaacaaagtcagcagacacaaaatacacagaataatact
cagactaataataactcagcttcaacaagccagcagagtcaaacatcaacagttgctcaa
aatacaaccagtaaccaggttggtaaccaaagcagtcaaactcagtcaagcataactaca
ggaagcggtcaaacaagttcaagtggaactggttcgacaaatacaaatacatcaaatcaa
caaactgggacatcgtctgaccaaacaaataatacaacatcaggacaagcaggaagtcaa
tcagggcagacagacagtcaatctagtcaaacaggaactcagtctggacaaacaggcagt
caaacaggtcaaggaaataatcaacaagatcaaacaagtaaccagactggaccaacagga
agtcaatcagaccagacaacaacgccgtcagagcagggtaataatcagcaagggcaatca
ggtagtcaagaagggaatcaaggtggtcaacagaacactcaacaaccagttaatggtaag
tatgcattaaatattaatattaaatacagtggtcaaccagtagaagttaatggttcattc
gcaattgtagctgaagatgtgtatgggagacctcgatatggaatattttatccaaaggta
ctacttataaatacaattaatttttattctgattttgacttcagtaccacaaatgaaagt
gtgttcttatttagtggttgtatggaaaatgtaaaagaaaacgttgcttcatcacaagtt
aaatttgttattaagaaagagtctgttgtactttctacttattcaacagcaaacgtggaa
gttaatctggaagattatcctaaagtaacccttaacctaagcaaagacaaaattgcattg
ggtaatgcacaggtattgataaaaccccaaaaagatatatttagtaatttatggtatatt
ggtaacacagacgaaaatggcaacattgatgtctttatgtctcctgacacttacacaatt
gttgtaaggtacacagagagcgatggcaatgagaaaactgtggcaattggtgatgtgact
attcctgctgaaaaggtacaaacactcaaattagaagtaaagcctcagtcaaatattact
ttgagtgctaatatacctgataatttaaataacattaatctccgttattattactcttta
agctggagtgaaaatggtaattcttaccactataatttctatacagtaacaaatagtgtt
tactataatatgcctttgaaaaacaaatatatttacactggaatttactttacaagatat
cttaatgacaaatatatcagctatggtcttatgaaagatggcatagctgacagtgactat
tgcaatatggtctttgatttaaatagatttacaacaccatatattgattattactgttat
ataaacgatgtttacaagagtgttgatagaggaactgtataccgtgggtcaacactcaaa
tatgttagatttggctttgcgaatgaaaatggtgagaaactaagtatatatttgggggca
ccagtagaagttaaaatagaggatttacagacaaacgaggttttatatcaaaattcgaac
ttcgacctaaataaagacacaatttatatagacccacaaaagtttgtaacaggtaataag
tacttactgaaaataagctttgatcctaattggtggccattgttcaacggtgataatatt
actgctgagttcacagttatagataatagtcaatctagtgcagacacaggaagtgaatct
tctggtagcagttcaggggcagaaggtatgcagcaatcatctaatattgcaggcggtagc
ttaagcattaatgttaagtatcaatctcaaccggtagatgctaaaggtacaattgttata
ggttatacttcatcaggaggacaaacatacaatggtatttggtatgtaggagttccgttg
aataccgttataaattattctaattataccatgttagataatagcactgaaatagtctgg
cttgtaactggttatgataaatcaaagctaaatactgatttgcaaaatgatatagataga
ttgccactaaggtttttcatacaaaatgatacagtagatttaacaacatattcatcgtca
agtattgatatcaacattgaagattatcccgaagtaacaattaatattaataaagatggt
tttgatttagaaaatgcacaggttttgctggagccaacaggaagctcaccatttagcaat
tttatgtatgtaggaaaaactgatagtaatggtgatattaagatttatattagtccagga
aaatacacacttgctgtgaattattatgaaaataatatgccaaaaactgttgtgttgggt
aatattattgttactgatgaaaaagtacaaagaataagccttaatgcaaaaccattatct
gggctaaatataaatattataaaacctgaatctcttagcgatataaatcggtacgggcta
aattatgggatgttttggattgaaaatggcaattattatgtacaatcctattatgcagaa
aatactgatgaaataagtttatattttaatgattgtatgaaaaatatcggagtatggtat
cgttatggcttcagaagaaaaaatattatttcagcagattatacgttagtggaagaaaat
tatagtttaaatgaaaatgaatttttgaatttaaatatagatttaaataagtttataaca
ccaataatttttattttcaatcaaagcgattataggtataattgggtatcatcgatcaat
atatatcaagattcgaccataaagattgcaggtataggttttgcagccgatggaggacat
attttgaatatatatccatatgtaccgttggaattaaatattatagatccatctaataat
gaggttttgtatcaaaaatctgactttagactttatagcgatatttatattgactctaaa
aaatttatcgcaggtaaaaagtacttaataagaataggatttgatcctaactggtggcca
gtattcaaagggaattttgaaattgagttaaatgttataagtccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
