Chryseobacterium lactis: EG342_02590
Help
Entry
EG342_02590 CDS
T06580
Name
(GenBank) T9SS C-terminal target domain-containing protein
Organism
clac
Chryseobacterium lactis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
GEVED
Pur_ac_phosph_N
Ig_DSCAM-DSCAML_C
Por_Secre_tail
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZA80866
UniProt:
A0A3G6RNI6
LinkDB
All DBs
Position
complement(584451..589292)
Genome browser
AA seq
1613 aa
AA seq
DB search
MSGLLLCKMGRPIRGLITLLCMVFGLFLQAQTVSIGTGTSTQRYPLTPYYGFQRSASLYT
AAEINTPGGGSILSVGWEATATMNITFPVKIYLKSVPAATTTITAQNWATVTTGATLVYS
ANVTSLAVGWNTFQLQLPYNYNGTDNLMVLVETNYGGGGGGSGLNGAAFKYSTAASSHMY
YETDTTAPTGNGTVNGNRPNVQLTFGTPPTCLAMPPGGTISTGAITATSAVLNWTAYTPV
PAGGYDIYYSTTNTAPTAATVPSQSGVTGTTANLSPLTPNSTYYVWVRARCSATDQSPWT
GPITFTTPPTCMPMAGGAALTVGTVTLTSAVVNWTAPTPAPAQGYEVYYSATNTAPTAAT
VGTPVTGTSTTLSPLTAGTTYYWWVRAVCSPTDKTPWVAGSSFTPGQIGTGTGTTSNLPV
YSYYGFNYSQQLYTAAEVGAVLGTSLLITAVKFYVAAPQTPQTSYNEWVVYLGNTPKTSF
TTTTDWVPAGNLTQVYSGTLPTMTAGTWITIPLATPFVWDGVSNLVVAVDENSPGYSTSA
ATWGSYNAGSNRGILYYNDTTNPDPTSPPTSSSRYSDIPRLMLTGVDLLPCSTAPPTNIA
VSNITSSSAIVSWMPAVGATYVLQYRVVGSGAAGWQTINITTPLTGSATINNLTDGTQYE
YQIATKCNGTQGAFSPIGTFTTPTLTYCNNTPVNTTSSGYISKVVVAPTNGPLMVSDSGY
DVYKDYSADPTRVVTLLRNSTGNKITITKFWPGSTSSYGVVAWIDFNRNGVFEVSEKVLD
TSSSTTTPVTATFIMPTAAGAVYSGTLPTRMRVVMKQSGVPTACGTFGQFDYGEVEDYAV
KFINQPACSTAPPTNITVTNITDTSATFSWIGATNATYKLQYRKLGSGAAGWVVVNVVPA
PGNVYTTTVPLTEQTDYEVQVATICNGSTGAYSGLVPFRTLPLQYCPMVGSGDNDHISNV
TVTSSNLGVLPMSNTSVQTNYISYTTPATLITLDDNSQNNKISVSKGWTGSTGNDAVSVW
IDFNRNGQFETTERILNSAASTTTPVTANFNVPSGSYTGALGTTMRVVLKRTTAPVMCQN
AIDGEVEDYKVMIRPCSNAVPNPPTFTRTHNSAVITWTGVTSNVSYIVRYRVQGTTTWTE
VYASTLLGNMPLTVNGLIPATTYEVEIAAICGTSIGTATPIRTFTTKCDPTPPTVSISNI
TPTTALVTWAPLAASSTYTMRWRKVGTTGWPNADILLPAAPANTYVLGSVIPLEPFTTYE
VQIANMCNGETTLNPYSNPKVFTTERICEIPPPGLTITQLLPTSAEVKWDPFPGATYVLR
YRKVGIPSWTEVPTIVNNVVLNGLVELTKYEMQVVNICNGTPGNYTPPYYFTTPTVIYCK
MASASSTGEHISKVTVIPTGKLKMENASGASTYTDYTGVPKTFIEMIQGSKDNEIIIEKK
WTGNTYNEGIAVWIDFNRNGEFDINERVFTSSPNTTSPVSGKFDVPVDAFVSMTDYKYVV
MRVAMSRDGIPVSCANFNNGEVEDYTVRISKQGVPNPLNQTDIMIYPNPVTTILFVKNIS
KKAKYKIYNAAGQVIADGILLNNQVNVSRLINGVYVIDIDDNGNTAQKKFIKE
NT seq
4842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtggacttttactctgtaaaatgggccgacctataagggggctcataacattgcta
tgtatggtcttcgggctgttcctacaagcacaaacagtttcaattggtacaggaacaagt
actcaaagatacccgttgactccttactacggatttcaacgttctgcatcgctttatact
gctgcagaaataaatactcctggtggtggaagcatcttatccgtagggtgggaagctaca
gcgaccatgaatattacctttcctgttaaaatttatttaaaatccgtaccagctgcaacc
acaactattacagcacagaattgggccacagtgacaactggggctactttagtatatagt
gctaacgtaacaagtttagcagtgggttggaataccttccagttacaacttccttacaac
tataacggaacggataaccttatggttttagtcgaaaccaattatggtggcggtggcggt
ggatccggacttaacggagctgcttttaaatattctacagcggcatcaagccatatgtat
tatgagacagataccacagctcctacaggaaatggtacggtaaacggtaacagaccaaat
gttcagttaacttttggtactcctccaacatgtttagcgatgcctcctggtggaacaata
tctaccggagcaataacagcaacaagtgcagtacttaactggactgcttatactcctgta
ccagcaggaggttatgatatatattacagtacgacaaacactgcgcctacagcagcaaca
gtaccttctcaatcaggtgtgacaggtactacggctaatttatctcctttaactcccaac
tcaacttattatgtttgggtaagagcgagatgtagtgcaacggaccaaagtccatggaca
ggaccaattacatttactacaccacctacctgtatgcctatggcaggcggtgcagcttta
actgtaggtacagtaactttaacgagtgcggtagtcaattggactgctcctacacctgca
cctgcacaaggatatgaggtgtattacagtgctacaaatactgctccgacggctgctacc
gtaggaactccggttacaggtacttctacaactttgtctcctcttactgcaggaactacc
tactactggtgggtaagagcagtgtgtagtcctactgataaaacaccttgggtagctggg
tcttcatttactccgggacagattggtacaggtacagggacaacaagtaaccttcctgta
tattcttattatggttttaactattctcaacagctttatacagctgctgaagtaggtgcc
gtattaggaacttctctattgattacagcagtgaaattttatgttgctgcccctcagacc
cctcagacatcatataatgaatgggttgtttatttaggaaatacacctaaaaccagcttt
acaactacaacagactgggtgcctgcagggaatttaacccaggtttacagtgggacactt
cctacaatgactgccggtacctggattaccatccctctggcaacacctttcgtatgggac
ggtgtaagtaatcttgtcgttgcagtggatgaaaactcgccaggatatagcacaagtgct
gcaacatggggatcttataatgcagggtcaaacagaggaatattgtattataacgataca
actaaccctgatcctacttcccctccaacatcatcaagcagatattctgatatcccaagg
ctgatgcttacaggggttgatttactaccttgttctactgcgcctcctacaaacattgcc
gtgagtaatatcacatcaagttcagctattgtaagctggatgcctgcagtgggagctacg
tatgttttacaatatagagtggtaggttcaggtgctgcgggatggcaaacgatcaatatc
accactccgcttaccggtagtgctacgattaataacttaacagatggaactcagtatgag
tatcagatagcaactaaatgtaatggaacgcaaggtgctttttcacctatcggtaccttt
acaactccaacgttgacttattgtaataatactccggtaaataccacatcaagtggatat
atcagcaaagtagtagtggctcctacaaatggtccgctaatggtaagcgattccggatat
gatgtttataaagattattcggctgatcctaccagagtagttacattgttgagaaactct
acaggaaataaaattacaatcaccaaattctggccaggttctacctcttcttacggagta
gttgcttggattgattttaacagaaacggtgtttttgaagtgtcagaaaaagtattggat
acttcaagtagtacaacaactcctgtgacagcaacatttataatgcctactgcggctgga
gctgtttatagtggaactcttcctacacgtatgcgtgttgtaatgaaacaaagtggtgtt
cctacggcttgtggaacattcggtcagtttgattatggtgaagtggaagactatgctgtg
aaatttattaatcaacctgcatgttcaactgctcctccaacgaatatcactgtaacaaat
attacagatacaagtgctacattctcatggataggtgctacgaatgcaacgtacaaactt
caatatagaaaattaggttctggtgcagctggctgggttgtggtaaatgttgttcctgct
ccagggaacgtttatacaactacagttcctttaacagaacaaacagattatgaagttcag
gttgcaacaatatgtaatggtagtacaggggcatactctggtctggttccatttagaaca
ttacctctgcagtattgtcctatggtaggaagtggagataatgaccatatttcaaatgtg
acggttacctcttctaacctgggagtacttccaatgagtaatacttctgttcagacgaac
tatatcagttacacaacgccggcaacgcttattactttagatgataattctcaaaataat
aaaatttcggtatcaaaaggatggactggttctacaggaaatgatgcggtaagtgtgtgg
attgacttcaacagaaatggtcagtttgaaacaactgaaagaattcttaactcagcagca
agcacaacgacaccggtcacagccaactttaatgttccatcaggatcttataccggagct
ctgggaacaacaatgagagtagtactgaaacgtacaactgctccggtaatgtgtcagaat
gcaatcgatggagaggttgaagattataaagtaatgatcagaccatgtagcaacgctgtt
ccgaatccacctacctttactcgtactcataactcagcggttattacctggacaggtgta
acaagtaatgtgagttatatagtaagatacagagtacagggaactacaacatggacggaa
gtatatgcttcgacattattaggaaatatgccattgacagttaacggattgattccggca
acaacttatgaagttgaaattgctgcaatctgtggaacttctataggaacagcgacacct
attagaacgtttacaacaaaatgtgatcctactcctccaactgtttctatcagtaatatt
actccaacaacagcattggtaacatgggctcctcttgctgcgagctctacctatacaatg
agatggagaaaagtaggaactacaggatggccaaatgctgatatccttcttcctgctgca
ccggcaaatacttatgtattgggtagtgtgattcctttggagcctttcacaacttatgaa
gttcagattgccaatatgtgtaatggagaaactactctgaatccatattcaaatcctaaa
gtatttactacagaaagaatatgcgaaattccacctccaggattgacaattacacagtta
ttgccaacttcagcagaggttaaatgggatcctttcccaggagcaacatatgttcttaga
tatagaaaagtaggtattccaagctggactgaagttccgacaatagttaataatgtggtg
ctaaacgggcttgttgaacttactaaatatgaaatgcaggtagtcaacatctgtaacggt
acccctggaaattataccccaccttactactttacaacaccaactgtaatctattgtaag
atggcttcagcaagctcaacgggtgagcatatttctaaagtaacagtgatcccaacagga
aaacttaaaatggaaaatgcatcaggtgcttccacttatacagattatactggagtacct
aaaacattcattgagatgattcagggatctaaagacaatgagatcattattgagaaaaaa
tggacaggtaatacttataatgaaggaattgcagtttggatcgatttcaacagaaacgga
gaattcgatatcaatgaaagagtatttacttcatcaccaaatactacatctcctgtatca
gggaaatttgatgtaccggttgatgctttcgtaagcatgacggattacaaatatgtagta
atgagagttgcaatgtcaagggatggtattcctgtaagctgtgccaactttaataacggt
gaagttgaagattatacggtaagaatttctaaacaaggagttcctaatccattaaatcaa
actgatatcatgatttatcctaaccctgtaactacaatattatttgtaaagaatattagc
aaaaaagcaaaatataaaatttacaatgcagcaggacaggtgatcgcagatggtatctta
ctaaacaaccaggtcaatgtaagcagattgattaacggcgtttacgtaattgatattgat
gataacggaaatactgcacagaagaaatttatcaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
