Clostridium sp. BNL1100: Clo1100_3875
Help
Entry
Clo1100_3875 CDS
T01708
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
clb
Clostridium sp. BNL1100
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEY67988
LinkDB
All DBs
Position
4345381..4347600
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MATNIIINGGFETGTFPPWNSFNAIVTSAFSHSGTFSAELLDGGVTSTIYQIIEADFTEP
YEFSAFLAKVGALPNPLTTITIAYFDANFNYLGLGLVISIPPGTLPDATLNNWQEFTGTT
TPAPAGTVYAIVSISKQAEPNTANVVVDDVSLTSSSGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGAT
GATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGTTGATGAT
GATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGVT
GATGATGATGATGVTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGPTGAT
GVTGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGATGAT
GATGATGATGATGATGATGTTGATGATGATGATGATGATGATGATGVTGATGATGATGTT
GATGATGATGATGATGATGPTGPTGPTGPTGATGATGATGATGATGATGATGVTGATGAT
GATGPTGPAPTLFFNESPGPVSVLPAGTEITLVSVTVPVTIGEEIKVDYTTTINATAAAL
GVFDFEIRLYRNSTLIDTRTFSNSVVQVGTQSMQLASTQVDTESATGNNTYSVRVFVTTA
TLITAATADNSDINAIVFP
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctactaatattattataaatggcggttttgaaacaggaacttttcctccctggaat
tcgttcaatgcaatagtaacttccgccttcagccattcaggtactttttctgctgaatta
cttgatggaggtgtaacctcaactatttatcagataattgaagcagattttactgagcct
tacgaattctccgctttcctcgcaaaagtaggagcattgccaaatccacttactactatt
acaatagcttattttgatgctaactttaattatctgggacttggtctcgttatcagtatt
ccacccggtacccttcctgatgctacgctgaataactggcaggaattcacgggtacaact
acgcctgcaccggctggaaccgtgtatgcgattgtatctataagtaagcaggccgaacca
aatacagctaatgtagttgttgatgatgtatctttgacatcatcatccggacctactgga
cctaccggacctactggaccgactggaccgaccgggcctactggggcaactggagctact
ggtgctactggcgctactggagctactggcgctactggagccactggcgctactggtgct
actggagccactggagcaactggcgctactggcgtaacgggtgccaccggagctactggc
gctactggtgctactggcgcaactggcgctactggggcaactggagctactggtgctact
ggagcaactggtgctactggtgcaactggcgcaactggagccaccggagcaactggagca
actggcgctactggagccaccggagcaactggagccactggggcaactggagctactggt
gctactggagcaactggtgctactggtgcaactggcacaactggagccaccggagcaact
ggagcaactggcgctactggagccaccggagcaactggagccactggcgctactggggct
actggcgctactggtgctaccggagcaaccggagccaccggagccactggcgcaactggc
gcaactggcgcaactggcgctactggcgctactggcgctactggcgctactggcgtaacg
ggtgccaccggagctactggtgctaccggagctactggcgtaaccggagccactggtgct
accggagccactggtgctaccggagccactggagctactggcgctactggggcaactgga
gccaccggagcaaccggagcaaccggagctactggcgctactggcccaactggagctact
ggcgtaacgggtgccaccggagctactggcgctactggtgctaccggagctactggcgct
actggcgcaactggcgcaactggcgcaactggcgcaactggtgcaactggagcaaccgga
gcaaccggagccactggcgctactggtgctactggagcaactggagctactggcgcaact
ggcgcaactggagcaactggcgctactggagccactggagccaccggagctactggtact
actggtgctactggcgcaaccggagccactggtgccactggtgcaaccggggctaccggc
gctaccggcgctactggcgtaacgggtgcaaccggagcaactggtgctactggtacaacc
ggagctactggcgctactggcgctactggtgccactggagccactggcgcaactggaccg
actggaccgactggaccgaccgggcctactggggcaactggagctactggtgctactggc
gctactggtgctactggcgcaactggcgctactggcgtaacgggtgccaccggagctact
ggcgctactggcccaaccggaccggcaccaactttattctttaatgaatcgcctggtccg
gtatcagttttaccggcaggtacagaaataacgttggtatcggtaacagttccggttaca
attggagaagaaattaaagttgactataccacaactataaatgcaactgcagcagcttta
ggagttttcgactttgaaatcagattgtacagaaattctacactgattgataccaggaca
ttcagcaattctgttgtccaggttggaactcaatctatgcaattggcaagtacacaagtg
gatactgagtcagctacaggtaacaacacttattctgtaagagtttttgtaacaacagct
acgttaattactgcagctacagcagacaatagtgatattaatgcgattgtattcccatag
DBGET
integrated database retrieval system
