Caldicellulosiruptor acetigenus 6A: Calla_1250
Help
Entry
Calla_1250 CDS
T01600
Name
(GenBank) type 3a cellulose-binding domain protein
Organism
clc
Caldicellulosiruptor acetigenus 6A
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pel9A-like_beta_helix
CBM_3
Beta_helix
3keto-disac_hyd
Laminin_G_3
Laminin_G_1
Laminin_G_2
Glyco_hydro_59_C
IMPa_N_2
Dispersin
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEM73875
UniProt:
G2PX96
LinkDB
All DBs
Position
complement(1308141..1311092)
Genome browser
AA seq
983 aa
AA seq
DB search
MSNKKILAIVVSLIMVLSLFAGIGLRNEVARAATLLTDDFEDGNSDGWSTSNGSWSVVVD
GSKVLKQASTGSEARAYTGSSDWSDYSVEAKVKVLGVKDSSSGAGVIVRYKNSGTFYALV
LRGSKVEIMKKMNSSSTTLVSKSFTLNKNSWYNVKLEVSGSKLVGYVNGSQVLGVSDSSI
ATGKAGLIADKCIAEFDDVVVSSSSGNITPTPTPTPTVTATPTPTPTPTSTPAGDIQLSD
SYGALKVLYANGVTASSTSQLVIKVKVQNTGDRAIDLGRVKVRYWYTGDGADVEGLTVAS
SLGSKVAAKVVKVGATAGGADRYVEISFASGVVLNAGSTTSEIRVTVSRASGSYNQANDY
SVMSATSYVENKKVTGYIDDVLVWGQESSRTEKIKVLYANGATASSTSQLVIKVKVQNTG
DRAIDLGRVKVRYWYTGDGADVEGLTVASSLGSKVAAKVVKVGATAGGADRYVEISFASG
VVLNAGSTTNEIRVTVSRASGSYNQSNDYSVMSATSYVENKKVTGYIDDVLVWGQEPSRG
IKAADSTPTVAPSPTPTPTSTVTPTPTPTPTPTSTATATPTPTPTPTTVPTPAPTPVPGV
NAIYVAPSGSPDNPGTIDRPTTLEKAITIVQPGQIIYMRGGTYKYSVQITIERNNSGTSN
ARKCIYAFPNERPILDFSSQPYGSVDSNPRGLQINGNYWHIKGLEVMGAADNGIFVGGSY
NIIEQCEIHHNRDSGLQISRYISSATKDEWPSYNLILNCTSHDNMDPDNGEDADGFACKL
TAGPGNVFRGCVAYYNVDDGWDLYTKSETGAIGEVLIEDCVAYGNGQTSNGSATSSSDGN
GFKLGGSNIKVNHTVRRCIAFNNNKHGFTYNSNPGSITVENCTGYNNGLKVSGRNFYFEE
GTHVLKNCLSYKESASSDLVSGTIINCVLWSNRQAIKPNGQLVTDNDFYSLTPTITRNSD
GSLNLGDFLKPKPGSGLEGIGAR
NT seq
2952 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaacaagaagattttagccattgtagtcagtttgataatggttttatcattgttt
gcagggattgggttgcgtaatgaggttgcaagagcggcgacacttttgactgatgacttt
gaagatggcaacagcgatggatggtcgacatcgaacggtagttggagtgtagtagtggat
gggagcaaggttttaaagcaggctagtacaggatctgaggcgagagcatatactggttcg
tctgattggagcgattattcagttgaagcaaaagttaaggtattgggggtgaaggattcg
agttcaggagcgggagtgatagtaagatataagaactctggcactttttatgcattggta
ttgagaggttcgaaggtagagataatgaagaagatgaatagtagtagcactacattggta
tccaagtcgtttactttgaataagaatagctggtataatgtgaaattagaagtaagtggg
agcaagttagttgggtatgttaatgggagtcaagtattgggtgtgagtgattcgtcgatt
gcgacagggaaagcaggtttaatagctgacaaatgtattgctgagtttgatgatgttgtt
gtaagttcaagttctggtaacataacacctactccaacaccaacaccgacggtaacagcg
acaccaacgccgacaccgacgccgacaagcacacctgctggcgatattcagctgagcgac
agttacggtgcattgaaggtgttatatgcgaatggagtgacagcgtcaagcacgagccag
ttagtgattaaggttaaggtacagaatacaggggacagagcgatagaccttggcagggtg
aaggtaaggtactggtacacaggagatggagcagatgttgagggattgacggtagcgagc
agtttaggcagcaaggtagcagcgaaggtagtgaaggttggagcgacagctgggggagcg
gacaggtatgtagagataagctttgcaagcggagtagtattgaacgcgggcagcacgacc
agcgagataagggtaactgtaagccgtgcgagcggtagttataatcaggcgaatgactat
tcagtgatgtcggcaacaagctatgtagagaacaagaaggtaacagggtatatagatgat
gtacttgtatggggtcaggagtcatcgaggacagagaagataaaggtgctgtatgcgaat
ggagcgacagcatcaagcacgagccagttagtgattaaggttaaggtacagaatacaggg
gacagagcgatagaccttggcagggtgaaggtaaggtactggtacacaggagatggagca
gatgttgagggattgacggtagcgagcagtttaggcagcaaggtagcagcgaaggtagtg
aaggttggagcgacagctgggggagcggacaggtatgtagagataagctttgcaagcgga
gtagtattgaacgcgggcagcacgaccaacgagataagggtaactgtaagccgtgcgagc
ggtagttataatcagtcgaatgactattcagtgatgtcggcaacaagctatgtagagaac
aagaaggtaacagggtatatagatgatgtacttgtatggggtcaggagccatcgaggggg
ataaaggcagcagatagtacaccgacggtggcaccgagtccgacgccgacaccgacctca
acagtgacacctactccgaccccgacaccaacgccgacatcgacagctacagcaacaccg
acgccgaccccaacgccgacgacagttccaacacctgccccgacacctgtacctggggtg
aatgctatttatgtggccccaagtggaagcccagataatcctggtaccattgatcgacct
actacattagaaaaagcaatcacgatagtacaacctgggcagataatctacatgaggggt
gggacgtataagtattctgtgcagatcacaattgaaagaaataatagtggtacaagcaat
gcaagaaaatgtatttatgcatttccaaatgaaaggccaatattggacttttcatctcaa
ccatatgggagtgtggactcaaatccaagaggattacagattaatgggaactattggcac
ataaaaggattagaagtcatgggagctgcggacaacggaatcttcgtaggaggcagctac
aatataattgaacaatgtgaaattcatcataacagagattcaggtttgcagataagcagg
tatataagttctgcaaccaaagatgagtggccaagttataacttgatattgaattgtaca
tcacatgacaatatggatccagataacggtgaagatgcagatggttttgcatgcaaacta
acagcaggaccaggaaatgtgttccgaggttgtgtagcgtactacaatgttgatgatggt
tgggatttatacacaaaaagtgagacaggagctattggtgaagtattaattgaggattgt
gtggcatatggtaacgggcaaacatcaaacggaagtgccacatctagcagtgatggaaat
ggctttaagctaggaggcagtaatataaaggtcaatcatacagtgagaagatgtatagca
tttaataacaacaaacatggatttacttataatagtaatccgggtagcataacagtggaa
aattgtacgggctataataacggtttaaaggtaagtggaaggaacttctattttgaagaa
ggtacacacgtgttgaagaattgtttatcatacaaagagagtgcatcgagtgatttggta
agtggaacgataattaattgtgttttgtggagtaataggcaagcgataaagccaaatggt
caactggtaaccgataatgacttttacagcttaacaccaactataacaaggaatagtgat
gggagtttaaacttaggagactttttaaagccaaagcctggtagtggtttagaaggaata
ggagcaaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
