KEGG   Clostridium sporogenes: CLSPO_c04110
Entry
CLSPO_c04110      CDS       T03905                                 
Name
(GenBank) putative surface/cell-adhesion protein/N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
Organism
cld  Clostridium sporogenes
SSDB
Motif
Pfam: CW_binding_2 Glyco_hydro127M
Other DBs
NCBI-ProteinID: AKC61141
UniProt: A0A7U5D216
LinkDB
Position
439809..444359
AA seq 1516 aa
MSSFKYIISICRRKYCSSSRKISRSKQGRYTAVKIAEKSFNEAWKGQGNAILSAAADANL
VDSLAVAPLSYQLKAPILLNDAKDSINADTLKALKANNVKTVYIATGEGVISNKAKAQLE
KEGFKVERLGGKNRYETAKNILDTFKKNGGDTKNVALVSGSGLADALSVAPEAARKGMPI
LLTDGKDAVAANLAEVAKAADKVYAIGGNGIISDALVQQLKADRVSGHSRYETNAAVIKK
FAGDKEFSKIYLGNGQDGHLVDSLTGSVLAAQSGSPIVLADGSLVDATKDTLKGKVSDKT
GIVALGGEAVVSNDLVKEVTDIAKPEVNKVAAESVVSLNETSVQVKGLAKDTKEADLKDK
KIELKAGDITLTAKYVQSSLTEDGKANFVLENGKKLVDTTEYTVESDWAEFVVNKFVAKV
VNPYVKTINVTTKAIQAKANNNVYFEAKNQYGEEIAVNGNVKDVKVTATINGVPVKETEI
TKTNINDGYITITNELKEGDDVFVSFINKIGDEDVKVGTATFKVVKAEDAVATEISNMKA
EYTSEANGHKTNEEAKEVLPDDQIKLSAKISDQFGNPMPAGTKARWVVEAGKDLVTKIDA
SAIDEVSDSVDFTFKAIKAGDLKVSAYLANGKKVTYEVKIGAKKLEVVKVEGESGINIAN
VAGINHEEKIVGVVNPNKGAILTPDMIKFDIKATKTSEEVKPSDVEVVAKLRGGEKDNKN
DIVISVKSTKVGKYVITPYVGESVEKGIKGDIITVTTTIDQKVASIDDISFDAAELKTGT
EIKKDIVFRNKHKEVLVLDDNKAIVTVTPEIADAANNAKVTKDADKNKNILTLKADGAKT
YNVVVRVKDEDVIKAFNLTFKAPTFTAVELGNDVNGVVAGDPADKAKYQEVKFLDQDGKT
MTVNKEDIKVSATKPDGQPLTDISKLITLGKTYTVDKDGKVTFDVVANEKDHVVAMKVAP
AEDVVPGTYTVKVEDKDGKISDTLNITVGSKRIAKTVEIKPAATKVVFGGKVKVNIVPKD
QYGEFIVVGKEKVEVLPGTNFEASAITEINKDGGAVDAEHPLAGYQVELTGKTKGTNDVV
VNIKEADKVLSTNKVSMTVDSAAGLIDSVAVDTKDIKSLYSTKAGAAEVDLNAIVKDADG
TVIPVSDSDLDWKVVSQKDAEGKDVSSKTVTVDSKTGKVTATKDTVGTAVIEVTTANMKK
ANITLKFDNKESVAQKGTVEVINTVKTEDGKTLLPLDADDKKEGIQISLDNDAKDGEKDG
AVKVVLNAKDQYGNLLGDQDAEIKADQITLRVGDSSVVKAEVDTKDPKGVITITAKGEGD
SKVYVEYAGQTIALDVTANKAAVDAAKSGELKEEAEKSVGALETAAAKDLTIEANLKEAE
EATKTAKDALDKLPAGTEGLAELTNRFNAADNKVKAAKEGFSVKQELEAAKTAIEGATYT
LDKVNHNEVAKAKTAVGDVVNNLPEVKDKGFTVTVKDGDFVAAQDGASDGSYKFTVKLEK
AGQEITSSEKTVVIPQ
NT seq 4551 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctagttttaagtacatcatcagtatttgccgcagaaaatactgcagtagctccaga
aagattagcaggagcaaacagggtagatatacagctgttaaaatagctgaaaaaagcttc
aatgaagcatggaaaggtcaaggaaacgctatattatcagcagctgctgacgcaaatcta
gttgactcattagcagtagcaccactttcataccaattaaaagcaccaatacttttaaat
gatgcaaaagattctataaatgcagatactttaaaagcattaaaagctaacaatgttaaa
acagtttatatagcaactggtgaaggtgtaatatctaacaaagcaaaagctcaattagaa
aaagaaggattcaaagttgaaagacttggaggaaaaaatagatacgaaacagctaaaaac
atattagatacttttaagaaaaatggtggagacactaaaaatgtagcattagtatctgga
agtggactagcagacgctctatcagtagcaccagaagctgcaagaaaaggaatgccaata
ctattaacagatggtaaagatgcagtagcagctaatttagcagaagttgcaaaagcagct
gacaaagtttacgctatcggtggaaatggaataatatctgatgctttagtacaacaatta
aaagcagatagagtaagtggacatagcagatatgaaacaaatgcagcagttataaagaaa
tttgctggagataaagaatttagtaaaatatacctaggtaatggacaagatggtcattta
gtagactcattaacaggatcagttttagcagctcaatcaggttctccaatagttttagct
gatggaagtttagtagatgctactaaagatactttaaaaggaaaagtatctgataaaact
ggcattgtagcattaggtggagaagcggttgtatctaatgacttagttaaagaagttaca
gatatagctaaaccagaagtaaataaggtagctgctgaatcagtagtttctttaaatgaa
acttcagttcaagtaaaaggtcttgcaaaagatactaaagaagctgacctaaaagataag
aaaatagaattaaaagctggagatattactttaacagcgaaatatgttcaatcaagctta
actgaagatggaaaagctaactttgtattagaaaacggtaaaaagctagtagatactaca
gaatacacagtagaatctgactgggctgaatttgttgtaaataaatttgtggctaaagta
gttaatccatatgtaaaaacaataaatgtaactacaaaagctatacaagcaaaggcaaat
aataatgtgtactttgaagctaaaaatcaatatggtgaagagatagctgtaaatggaaat
gtaaaagatgtaaaagttacagctacaataaacggagtgccagtaaaagaaactgaaatt
actaaaactaatataaatgatggatatataacaataactaatgaattaaaagaaggagat
gacgtatttgtcagcttcataaataaaataggcgatgaagatgtaaaagttggaactgct
acatttaaagtagttaaagctgaagatgctgtagctactgaaatttcaaacatgaaagct
gaatatacttcagaagctaatggacataaaactaatgaagaagctaaagaagtattgcca
gatgatcaaattaaattaagtgctaaaatatctgaccaatttggtaatccaatgccagca
ggaactaaagcaagatgggttgttgaagcgggaaaagacttagtaacaaaaatagatgct
tcagctatagatgaagtttcagactcagtagattttacttttaaagctataaaagctgga
gatttaaaagtatcagcttatttagcaaatggtaaaaaagttacttatgaagttaaaata
ggagctaagaaattagaagtagtaaaagttgagggagaatcaggaataaatatagctaac
gttgcaggaataaatcatgaggaaaaaattgtaggtgttgtaaatcctaacaaaggagct
atattaactccagatatgattaaattcgacataaaagctactaaaacttcagaagaagtt
aagccatcagatgtagaggttgtagctaaattaagaggtggagaaaaagataataaaaat
gatatagttatatctgttaaatcaacaaaggttggaaaatatgtaataactccatatgtt
ggtgaatcagtagaaaaaggaatcaaaggagatataataactgttacaactacaatagat
caaaaagtagctagtatagatgatataagctttgatgctgctgaattaaaaacaggaaca
gaaattaagaaagatatagtattcagaaataaacataaagaagttcttgtattagatgac
aacaaggctatagtaaccgtaactcctgagatagctgatgcagcaaataatgcgaaagtt
acaaaggatgctgacaagaataaaaatatattaactttaaaagctgatggtgctaaaact
tataatgtagtggttagagttaaggatgaagatgtaattaaagcatttaatctaacattc
aaagcaccaacatttacagctgttgaattaggtaatgatgtaaatggagtagttgcagga
gatccagctgataaagctaaatatcaagaagttaaattcttagaccaagatggaaaaaca
atgactgttaataaagaagatataaaagtttctgcaactaaaccagatggtcaaccatta
actgatatatctaaattaataactttaggaaaaacttatacagttgacaaagatggaaaa
gttacttttgacgttgttgccaatgagaaagatcatgtagttgctatgaaagtagcacca
gcagaagatgttgtaccaggaacttacactgttaaagttgaagacaaagatggtaaaatt
tcagatacattaaatataacagtaggatctaagagaatagctaaaactgtagaaattaaa
ccagcagcaactaaagttgtatttggtggaaaagttaaagttaatatagttccaaaggat
caatatggtgagttcatagttgtaggtaaagaaaaagttgaagtattgccaggtactaat
tttgaagcaagtgccataacagaaataaataaagatggtggagctgtagatgcagaacat
ccattagctggatatcaagttgagttaacaggaaagactaaaggcacaaacgatgttgta
gttaacattaaagaagctgataaagttctttcaactaataaagtaagtatgacagttgat
tcagccgcaggcttaatagattcagtagctgtagatactaaggatataaaatctttatat
tcaacaaaagctggagctgcagaagttgatttaaatgctattgttaaggatgcagatgga
actgttataccagtatcagatagtgatttagattggaaagttgtatctcaaaaagatgca
gaaggaaaagacgtttcatctaaaactgtaactgtagattctaaaacaggaaaagtaaca
gcaactaaagacacagtaggaacagcagtaatagaagttactacagctaatatgaaaaaa
gctaatataactttaaaatttgataacaaagaatcagttgcacaaaaaggaactgttgaa
gttattaatacagtaaaaactgaagatggaaaaacattattaccattagacgctgatgat
aaaaaagaaggaattcaaatatcattagataatgatgcaaaagatggagaaaaagatgga
gcagttaaagttgtattaaatgctaaagatcaatatggtaatttgcttggagatcaagat
gctgaaataaaagcagatcaaataactttacgtgttggtgattcttcagttgtaaaagct
gaagtagatactaaagatcctaagggtgtaataactataactgctaaaggcgaaggagat
tctaaagtatatgtagagtatgcaggacaaactattgctttagatgtaacagctaataaa
gcagcagtagatgcagcaaaaagcggagaattaaaggaagaagctgaaaaaagcgtaggt
gctttagaaacagcagctgctaaagatttaactatagaagctaatttaaaagaagcagaa
gaagctacaaaaacagctaaagatgctttagataaattaccagcaggaacagaaggttta
gctgagttgacaaatagattcaatgctgctgacaataaggtaaaagctgcaaaagaaggg
ttttctgtaaaacaagaattagaagcagctaaaacagctatagaaggagcaacttataca
ttagataaagtaaatcataatgaagtagccaaagctaaaacagcagtaggagatgtagta
aataatttaccggaagtaaaagataaaggatttactgtaactgtaaaagatggtgatttt
gtagcagctcaagatggagcgtcagatggttcatataaatttacagtaaaattagaaaaa
gcaggacaagaaataacttcaagtgaaaagacagttgtaataccacaataa

DBGET integrated database retrieval system