Clostridium sporogenes: CLSPO_c10700
Help
Entry
CLSPO_c10700 CDS
T03905
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
cld
Clostridium sporogenes
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
TRAP_beta
CARDB
SdrD_B
GEVED
SpaA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKC61790
UniProt:
A0A7U4LMA9
LinkDB
All DBs
Position
1162912..1167972
Genome browser
AA seq
1686 aa
AA seq
DB search
MAATIRGVVFDDLNNNGTLNPGEPGIPNAYVVIRDPNGVCTTVQTNASGVYIFSNLNLAG
NYTVYETAINPGATCPPTNFGQPAGFTNSSTFRTQTINVTQTQIDNNSTINGRNYGHDNP
ETFTCRPIGYQVAVPPSAANSEFVEVNLVTGKYNIINPDMGVRINPIAYNVLDNMIYGTI
GTTNNLTRISRDGSRTNFGAITGLPNVFYTTGDIDNQGNLYIYINDTATFYKVDLNQNSA
TFGQVLNSVPITPISVSDWSWNPIDGQLYGVTFDGIAVRVNPVSGNVTNLTTVGVPGVSS
YGATFIDASGTLYAINNATGRVYRIIISGNNATGERFSQAVPTSINDGAMCHNSLIEIDF
GDAPDPTSGTGIDNYNTLLANNGPRHQIINQLTLGTQVTAEIDAYANLTTDATGDDILQG
IQDDGTTLPLMSLLVTDTNYSLTVDVVNNTGLPANVYGWIDFNKNGVFQGNEATPVVVVP
SVPGVQQVVLNFTVPVGVNLEPDHTFVRVRVTTDQLINQNSSQTAEDTRSIGPASDGEVE
DYYLQIDPAADISVVKTANPNPVIPGEVLTYKIDVVNAGPSDAENVVLDDEIPLTIKEPE
FSIDGGATFNPWPTIYDIGTLLAGEIRTILIRGTVASSATGIISNSANVISSTPDPDLNN
NTSIVNTEVNALADISVVKTASPNPVNQGETLTYTIDVINAGPADAQNVVLDDIIPPEII
GAEFSTDGGITFSPWPGSFDIGTLSNGETRTVLIRGTVSPSAIGIISNTAGVISSTPDPD
LDNNMSTIDTEINTADISVIKTSDLNPTFRGQILTYTIRVSNAGPADAQNVVLTDAIPPE
IVGPEFSVDGGVTFNPWPGSFNIGTLLNGETSTILIRGTVAASASGIISNTAEVTSTTPD
PNPDNNTSTVDIEVNALADISVIKTGSPNPVISGETLTYTIDVSNFGPSLAENVTLSDVI
PPEIIGAEFSTDGGVTFNPWAGSLDLGTLLNGETRTILIRGTVAPVAPGFITNTADITST
TPDPNPSNNTSTVDIEVNGSTQVADVGVFKSVEMNPVTPGETVVYPIEVSNFGPADAQNV
VLTDAISPEIIGAEFSTDGGVTFNPWPGSLDIGTLPAGETRNILIRGTVSPSAIGIISNT
AEVSSTTEDPNPSNNASTVDVIVVPSADVSVAKTAAPNPVIPGEMLVYTINVSNAGPSNA
QNVVLTDFISPDIIGEEFSIDGGVTFNPWPGSFDIGTLLSGGTRTILIRGTVSSSATVTI
TNTANITSSTPDPNLDNNESTIITEVNALADISVIKTGTPNPIVTGEILTYTIDVTNAGP
ADAQNVILNDEISPNVIAPEFSIDGGVNFNPWPTIYVIGTLAAGETRTILIRGTVSPSAT
GVISNTASVISSTPDPNLDNNTSTVDTEISALADISVVKTGSANPVKPGEILTYTIDVSN
AGPADARNVVLDDAISPEIIAPEFSIDGGVTFNPWPIIYVIGTLPAGETRTILIRGTVSP
SATGVITNTAVVISSIPDPNPNNNESTVNTEVSAVVSADVSVVKTAITKQVRPGDTVVYT
IVVSNAGPSDAQNVVLTDTIPPEIISPEFSIDGGLTFNTWPGSLDIGTLPAGASRTIIIR
GKVVSSSTKCKCITTITNTARVTSTTPDLELNNNTSTATIKVCRCFIVCFKCRCCNKCKP
DCKNEH
NT seq
5061 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgcaacaattagaggagtagtttttgatgacttaaataataatggtacattgaat
ccaggggaaccaggaatacctaacgcctatgtggttatacgtgatcctaacggggtatgt
acaactgttcaaaccaatgcatctggagtatatatcttttcaaatcttaatttagcaggg
aactatactgtttatgaaactgctataaatccaggcgctacttgtccaccaacaaatttt
gggcaaccagcagggtttacaaattccagtacttttagaacacaaacaataaatgtaact
caaacccagatagataataactctactattaacggtagaaattatggtcatgataatccg
gaaacttttacttgtaggcccattggatatcaagtggctgtaccaccctcagctgcaaat
agcgaatttgtagaagtaaatttagtaacaggtaaatacaatataataaatccagatatg
ggagttaggataaatcctatagcatataatgttttagataacatgatatatggtacaata
ggcactaccaataatttaacaagaatttcaagggatggaagtagaacaaattttggtgct
attacgggattgccaaatgtattttatacaacaggggatatagataatcaaggtaatttg
tatatatatataaatgatacagcaactttttataaggttgatttaaatcaaaactctgct
acttttggtcaagttttaaattctgtaccaataacccctatcagtgtatctgattggtca
tggaatccaattgatgggcaattatatggtgtaacttttgatggaatagcagtaagggtg
aatcctgttagtggtaatgttactaatttaacgacagtaggggtaccaggggtatcttcc
tatggagctacctttatagatgcatcaggaactttatatgctataaacaacgctacaggg
agagtctatcgtataataatttcgggaaacaatgcaactggtgaaagattttctcaggct
gtaccaaccagtataaatgatggggctatgtgtcataattcattaattgaaatagatttt
ggtgatgctccagatccaacttcaggaactggaatagataattataatacactacttgct
aacaatggacctagacatcaaataataaaccaattaactttaggaactcaagtaacagct
gaaattgatgcttatgcaaatttaactacagatgctacaggagatgatatactacagggt
atacaagatgatggtactactttaccacttatgtcattattggtaacagataccaattac
tccttaacagtagatgtagtaaataacacaggattaccagccaatgtatatggatggata
gattttaataaaaatggtgtattccagggaaatgaggctacaccagttgtagtagtacca
tcagttccaggggtgcagcaagtagtattaaactttacagtacctgtaggggttaattta
gaaccagatcataccttcgtaagagttagagttacaactgaccagctaataaatcaaaat
tcctcacaaacggctgaggatacgaggagtataggaccagcatcagatggagaagttgaa
gattattatttgcaaatagatccagcggcagatatatctgtagttaaaacagcaaatcca
aacccagtaataccaggagaagtattaacttataaaattgatgtggtgaatgcaggacca
tcagatgctgaaaatgttgttttagatgatgaaattccacttactataaaagaaccagaa
ttctccatagatggaggagcaacctttaatccatggccaacgatttatgatataggaaca
ttattagcgggtgaaataagaactattttaataagaggaacagtagcatcatctgccaca
gggattataagtaatagtgcaaatgtaatttcatcaacaccagatccagatctaaataac
aatacatcaatagtaaatacagaagttaatgcattagcggatatttcagttgtaaaaacg
gcaagtccaaacccagtaaatcaaggagaaacattaacctatacaattgatgtaataaat
gcaggaccagcagatgcccagaatgttgttttggatgatatcattccacctgaaattatt
ggagcagaattttcaacagatggaggaataacctttagtccatggccaggaagttttgat
ataggaacattatcaaatggcgaaacaagaactgttttaataagaggaacagtgtcacca
tcagcaataggtattataagtaataccgcaggggtaatttcatctacacctgaccccgac
ttggataacaatatgtcaacaatagatactgaaattaatacagcagatattagtgttata
aaaacatcagatttaaatccaacattccgaggacagatactaacttatacaattagagta
tcaaatgcaggaccagcagatgcccaaaatgtggttttaacggatgctattccacctgaa
attgtaggaccagaattttcagtagatggaggggtaacctttaatccatggccaggaagt
tttaatataggaacattattaaatggtgaaacaagcactattttaataagagggacagta
gcggcatcagcttcaggaattatatctaatactgctgaggtaacatcaacaacaccagat
cctaatccggataacaacacatcaacagtagatatagaagttaatgctttagcagatatt
tcagttataaaaacaggaagtccaaatccagtaatatcaggagagactttgacctataca
attgatgtatcaaactttgggccatcccttgcagaaaatgttactttaagtgatgttatt
ccacctgaaataataggagcagaattctcaacagatggaggagtaacctttaatccatgg
gcaggaagtcttgatcttggaacattattaaatggtgaaacaagaactatcttaataaga
ggaacagtagctccagtagctccaggtttcataactaatactgcagatataacatcaaca
acaccagatcctaatccaagtaataacacatcaacagtagatatagaagttaatggatct
actcaagtagcagatgttggagtttttaaatcagtagagatgaatccggtaactccagga
gagacggtagtttatcctattgaagtatcaaattttggaccagcagatgctcaaaatgtt
gttttaacggatgctatttcacctgaaataataggagcagaattctcaacagatggagga
gtaacctttaatccatggccaggaagtcttgatataggaacattgccagctggtgagaca
agaaatattttaataagaggaacagtgtcaccatcagctatagggattataagtaatact
gcagaggtaagttcaacaacagaagatcctaatccaagcaataacgcatctacagtagat
gtaatagttgtgccatcagcagatgtttcagttgcaaaaacagcagctccaaatccagta
ataccaggagagatgctagtttatacaattaatgtatcaaatgcaggaccatcaaatgcc
cagaatgttgttttaacggatttcatttcacctgatattataggagaagaattctcaata
gatggaggagtaacctttaatccatggccaggaagttttgatataggaacattactgagt
ggtggaacaagaactatattgataagaggaacagtgtcatcatcagctacagtaactata
actaatactgcaaatataacttcatcaacaccagatcctaatttggacaataatgaatct
acaataattacagaagttaatgcattagcagatatttcagttataaaaacaggaactcca
aacccaatagtaacaggagaaatattaacttatacaattgatgtgacaaatgcaggacca
gcagatgcccaaaatgttattttgaatgatgaaatctcacctaatgttatagcaccagaa
ttttcaatagatggaggggtaaactttaatccatggccaacaatttatgttataggaaca
ttagcagctggtgaaacaagaactatattaataagaggaacagtatcaccatcagcaaca
ggagttataagtaatactgcaagtgtaatttcatcaacaccagatcctaatttagataat
aacacatcaacagtagatacagaaattagtgctttagcagatatttcagttgtaaagaca
ggaagcgcaaatccggtaaagccgggagaaatattaacttacacaattgatgtatcaaat
gcaggaccagcagatgcccgaaatgttgttttggatgatgccatttcgcctgaaattata
gcgccagaattttcgatagatgggggagtaacctttaatccatggccaataatttatgtt
ataggaacattaccagctggcgaaacaagaactatattaataagaggaacagtgtcacca
tcagctacaggagttataaccaatactgcagttgtaatttcatcaataccagatcctaat
ccaaacaataatgaatctacagtaaatacagaagttagtgctgttgtatcagcagatgtt
tcggttgtaaaaacagcaatcacaaagcaagtaaggccaggagatactgtagtttataca
attgtagtatccaatgcaggaccatcagatgcccaaaatgttgttttaacggatactatt
ccacctgaaattataagtccagaattttcaatagatggaggattaacctttaatacatgg
ccaggaagtcttgatataggaacattaccagctggagcttcaaggactataataataaga
ggtaaagtagtatcatcaagtacaaaatgtaaatgtataactactataactaataccgca
agagtaacttcaacaacaccagatctagagctaaataataacacatcaactgccactata
aaggtttgcagatgttttatagtttgttttaaatgtcgttgctgtaataagtgcaaacct
gattgtaagaatgaacattaa
DBGET
integrated database retrieval system
