Cellulosilyticum lentocellum: Clole_0686
Help
Entry
Clole_0686 CDS
T01448
Name
(GenBank) Pectate disaccharide-lyase
KO
K22994
pectate disaccharide-lyase [EC:
4.2.2.9
]
Organism
cle
Cellulosilyticum lentocellum
Pathway
cle00040
Pentose and glucuronate interconversions
cle01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
cle00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00040 Pentose and glucuronate interconversions
Clole_0686
Enzymes [BR:
cle01000
]
4. Lyases
4.2 Carbon-oxygen lyases
4.2.2 Acting on polysaccharides
4.2.2.9 pectate disaccharide-lyase
Clole_0686
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cu_amine_oxidN1
fn3
Reo_sigmaC
DUF4766
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ82419
UniProt:
F2JNS1
LinkDB
All DBs
Position
869450..873919
Genome browser
AA seq
1489 aa
AA seq
DB search
MSKKVKNQVVAWILSVIMLTLGLPLNATMLLQEEPVDTSIQVFNDSMMRTTTESSIKILN
ASDLENAKLAADKVAGDFTIKAAAGKEVDIDASSYMSEYYHSFSKRIKLNGTGNAAARTI
EFTTTGSATVQVFALSGSSSTDRTLGIYDAADNQVTTLKAVGKSSDSDGKLPMSEATIDA
AGTYNIRSTGSGINIYYVKVIQGAVETVTFTDGTKPSVMSAVQDTVDQRKVNVTVSGTLP
NAEIDKIWVKIYDSSNKLTTSKLLDNLEADGTGIAALTLEKSGDYTIVAEAIREGCKTSY
SSDIFALNDFVVPLGDVKITNVKTTAIEAPTNATLTIDWDDALNAKTYDVEVKDTANNLF
EKKDLKVSTCDILGLTVGETYTIKVTAYGSGQSKSATTTKKVAASVERFLGGLVGSGASG
TITENSDGSITLDARAVGGNTGGKLADSEDGFLYYYTEINPETENFTLTATFRVDESGSK
DNQSGFGVMAIDTMVLGDSSARYFNSAGAMFRKYVKTVDGTLINGYGIPGGYFVTGYTAG
PTVANSARKTIDTEPFDWEFKKDYTTATNSNPPKFEDGEVYTLTLRKSNTGFHAYMSNDK
TNEVICYEPELLLKQDSSKYYVGMCASRKIMVTVLDYSFTTIHPSADEPKEERPLKYVTP
TVSLDSTTTTSNKNYEAAFKANVVGTIDIKDAAGNVVASKVVLDPREASTFRAVAPVKLS
GETNQFTAIFTPADKLGQGELLADNEELSSYEPVEIPFSITYKQYGTSENAIYVGASGSA
SNQGTKASPLDVQTAVNFAQPGQEIVLLDGTYKLTKGINIARGNNGTKEEPIVLMSEPGK
RVVFDLSNCSTNGITVNGNYWHIYNIELMNSPNAKRPVQVSGHYNTIEKLLIHDNADTGL
QISGSAYEPNTMWPSYNLILSCEVYNSCDALGNDADGFAAKLTAGEGNVFRYCIAHHNID
DGWDLYAKSTTGPIGTVTIESSVAYANGTLLGNPSKTGEGNGFKLGGESISVPHVLKNSV
SFANLNNGVFSNSNPSCMVYNTTSYGNEGKNLFFNTNAKTTDWVLENFISYKGNDSDTMD
LKGQDSLADRSNYINGVNTEGTSVSDDWFTNLDTTIVPTIAEDGSIDMKGLLVLTANAPE
GVGAILTENPNPTVITIGKEIGGTSTGGGSTGGGSTGGGSSSGGSTNSSTTKPIATVLDK
IIEALKESKTPVIKVDANNMLQLVAEAVSELIDSQTGIVVEGNGVTITLNEKLIKEVTDG
EKLSLTIKVPSLLASELAAIKTQLSQNENFKTYFDSVATVAFEMSTNKKVEVISEPVTLT
FDLSKVSAENADKLTLVRYEKQEDGTFKVVKVGGSYDAKTKTFIAKVDQAGNYGVLEAKE
LFKLNLAIGKTSSEVNGKTIINDVAPMIVKDTTMVPIRFTVENLGAEVKWDNEAKQVTII
LNGKALTLDSANGMLIKDSRALVPLRFISETVGANVLWIPTEKAIEIVY
NT seq
4470 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaagaaggtaaagaatcaggtagtagcatggattctaagtgtgatcatgttaacc
ttagggttaccattaaatgcaacgatgttattgcaagaagaaccagtagatacgagcatc
caggtatttaatgatagtatgatgcgaacgactacagagagcagcataaaaatactgaat
gctagtgatttagaaaatgctaagttagcagcagataaggtggctggggactttacgatt
aaagcagcagctggcaaagaggtagatattgatgccagtagttatatgagtgagtattat
catagctttagcaaacgtattaagctaaatggtaccggaaatgctgcagcgcgtactatt
gagtttacaacaacgggatcagctaccgttcaagtatttgctttaagtggcagttcttct
acagataggacattaggtatttatgatgcagcagataatcaggtaactacactaaaagca
gtaggtaaaagtagtgattcagatggaaaattgcctatgagtgaagcaactattgatgcg
gcaggtacctataatatccgctcaactggtagtggaatcaatatttattatgtaaaagta
atacaaggagctgtagaaacagttacttttacagatggtactaagccttctgttatgagt
gcagtgcaagatactgttgatcaaagaaaagtgaatgttacagtatctggtacacttcca
aatgctgagatagataaaatatgggtaaagatttatgatagttctaataagctaacaacg
agtaaattacttgacaatctagaagcagatggaacaggcattgctgctttaactctcgaa
aaatcaggagattacacaatagtggcagaagctattcgtgagggatgtaaaacaagctat
agcagtgatatatttgcactgaatgattttgttgtaccattaggtgatgttaagattacg
aatgttaaaacgacagctattgaagcaccaaccaatgctactttaacaatagattgggat
gatgcactcaatgcgaaaacctatgatgtggaagttaaagatacagccaataatcttttt
gaaaaaaaggatttaaaagtatcgacttgtgacatcttaggtcttacagtgggtgaaacc
tatacaattaaggtaactgcttatggtagtggtcaatctaagtcggctacaacaactaaa
aaggtggcagctagcgtagaaagatttttaggtggtttagtaggttcaggtgcttctgga
accatcactgaaaatagtgacggttctattaccttagatgctagagctgtcgggggtaat
actggtggtaagttagcagatagtgaagatgggttcttatactattatacagaaatcaat
ccagaaacagaaaactttactttaacagctactttcagagtagatgaatctggtagtaaa
gataatcaatcaggcttcggcgtaatggctattgatacaatggtgcttggagatagtagt
gcacgttactttaactcagcgggtgctatgtttagaaagtatgtgaaaacagtagatggc
acactcattaatggttatggtattccaggaggttattttgtaacaggttatacagcggga
ccaactgttgcaaactcagctagaaagacgattgatacagagccatttgattgggaattt
aagaaagactatacaacagcaactaattcaaatccacctaagtttgaagatggggaagtt
tatactttaacacttagaaaaagtaatactggtttccatgcatatatgagtaatgataaa
acgaatgaagtgatttgttatgaaccagaacttttattgaaacaagatagtagtaaatac
tatgtaggtatgtgtgcaagccgtaaaattatggtgactgtacttgattatagttttaca
actattcatccaagtgcagatgagccaaaggaagaaagaccattaaaatatgtaacacca
acagttagtctagattcgacaacaacaacgtctaataaaaactatgaagctgcttttaaa
gccaatgtagtaggaacaattgatattaaagatgcagcaggaaatgtagtggcttctaag
gttgtacttgatcctagagaggcaagcacctttagagcggtagcaccagtgaaattatca
ggagaaacaaatcaatttacagctatatttactccagcagataaattaggtcaaggagaa
ttattagcagataatgaggaacttagttcctatgagcctgttgaaataccttttagtata
acttacaaacaatatggaacaagtgaaaatgccatttatgtaggagcaagcggctcagca
tctaaccaagggacaaaagccagtcctttagatgtacaaacagctgttaattttgcacag
ccaggtcaagagattgttcttttggatggtacatataaattaacaaagggtattaatatt
gctagaggtaacaatggtacgaaggaagagcctattgtattaatgtcagagccgggcaaa
cgagttgtttttgatttatcaaactgtagcacaaatggtattacagtaaatggtaactac
tggcatatttataatattgagcttatgaattcaccaaatgctaaacgtccggtacaagtg
agtggacattataatacgattgaaaaacttttaattcatgataatgcagatacaggcctt
caaattagtggtagtgcatatgagccaaacactatgtggccatcttataacttgatatta
agctgtgaggtttataacagctgtgatgcgttaggaaatgatgcagatggctttgcagct
aaattaaccgctggagaaggtaatgtattccgctattgtatcgcacatcataatatcgat
gatggctgggatttatatgcaaaatcaacgacaggaccaattggtacggtgacgattgaa
agctctgtagcttatgcaaatgggacattacttggtaatccaagtaaaacaggtgaaggt
aatggtttcaaactaggtggtgaaagtatatctgtaccacatgtattaaaaaatagtgtt
tcttttgcaaacttaaataatggtgtatttagtaatagtaatccaagctgcatggtttat
aatacaacttcttatggtaatgaaggtaagaatctattctttaatacgaatgccaaaaca
acagattgggtattagaaaactttatatcctataaaggaaatgatagcgatacaatggat
cttaagggccaagattcattagcagatagaagtaactatattaatggagtgaatactgaa
ggtacctctgttagtgatgactggtttaccaatttggatacaactatcgttcctactatt
gcagaagatggaagtattgatatgaaaggtctcttggtattaacagcaaatgcaccagaa
ggtgtaggagctatattaactgagaatccaaatccaacagtaataaccattggtaaagaa
attggcggaactagtacaggtggaggttcaacaggtggaggttcaacaggtggaggttca
tcaagtggaggctccacaaattctagtacaacaaaaccgatagcaacagtgctagataaa
attatagaagcacttaaggagagtaaaacacctgttattaaagtagatgcaaataatatg
cttcaattagttgcagaggcagtaagcgagttaatagatagtcaaacaggcattgttgtt
gaaggaaatggtgtaaccattaccttgaatgagaaacttattaaggaagtaacagatggg
gaaaaactaagtctaacgattaaagtgccaagtctattagctagtgaattagcagctatt
aaaacgcaactcagtcaaaatgaaaatttcaaaacatattttgatagtgtggcaacagta
gcttttgaaatgagtacgaataaaaaagtagaagttattagcgagccagttacactcacc
tttgatttatcgaaagttagtgctgagaatgctgataagctaactcttgtaagatacgaa
aaacaagaagatggaacttttaaagttgtaaaagtaggtggcagctatgatgctaaaacc
aaaactttcatagctaaggtagatcaggcaggtaactatggcgttttagaggcaaaagaa
ctctttaaattaaatctggctattggtaaaacaagttccgaagtaaatggtaaaacaatt
attaatgatgttgcacctatgattgtaaaggatacaaccatggtacctattcgctttact
gtagaaaatttaggtgcagaagtaaaatgggataatgaggctaaacaagtaactatcatt
ttaaatggtaaagcgctaacattagatagtgcaaatggtatgctgattaaagattcaaga
gccttagtacctcttagatttatttcagaaacagtaggggcaaatgtactttggatacct
acagaaaaagctattgagattgtatattag
DBGET
integrated database retrieval system