Caldisphaera lagunensis: Calag_0680
Help
Entry
Calag_0680 CDS
T02380
Name
(GenBank) RecA-superfamily ATPase possibly involved in signal transduction
KO
K08482
circadian clock protein KaiC
Organism
clg
Caldisphaera lagunensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clg00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99995 Signaling proteins
Calag_0680
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ATPase
AAA_14
nSTAND3
AAA_22
AAA_25
ABC_tran
AAA_18
DnaB_C
SLFN-g3_helicase
GvpD_P-loop
Zeta_toxin
AAA_16
AAA_24
NPHP3_N
AAA
ATPase_2
AAA_7
AAA_19
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ70427
UniProt:
L0ABB2
LinkDB
All DBs
Position
complement(666764..668143)
Genome browser
AA seq
459 aa
AA seq
DB search
MSLTKIGIKGLDEIFSKIYRGSIILIAGNPGTGKTTLGSKFLYEGLKNDENSIYLNFTET
KKDFYRNMLNLGIDFEYYEKQGKFKYIEAITITDINALSDLLQELLDLIDKMNAKRLVID
SISAIMQLGEQNLGKIRELLHNFFYLGPKLKEVTTFLIAELPYGKKSVGYGVEEFIVDGV
IILKIKIVKRKIIRLMEIRKMRGNEISIGEVPFVIAPDEGIAIIKPESPFGMPSAVNPEG
IIELKFKDSNYKLEFQKGSQTLFVIHPSIDPLILLTALGVDIIISEKRKVFYRSYLHGEN
TIRDRFKICVNNLFSQEKANEIFDLVKTFSINPTRYSIDELYYMISKMESEIKADTVVVE
GLETLYDLSDKRGFINAQYNSLIKMAVNGITGFYSTKGVKEEINQLPLINFYDNIIYAEP
ISTPNGRFVKITPIRLILKVNPYFEILLNADNIEKCTNL
NT seq
1380 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgtctttaacaaagattggtatcaaaggactcgatgaaattttcagcaaaatatacaga
ggctcaataatattaatagcaggaaatccaggaacaggtaaaacaactcttggatctaaa
tttctttatgaaggtttaaaaaatgatgaaaattcaatttatttaaattttacagaaaca
aaaaaggatttttataggaacatgttaaatttaggaatagattttgaatattatgaaaaa
caaggtaaatttaaatatattgaagcaataacaattacagatattaatgcattatctgac
ttattgcaagaattgctagatttaattgataaaatgaatgcaaaaaggttggttatagat
tcaattagcgctataatgcaattgggtgaacaaaatttaggtaaaataagggaattatta
cataacttcttttatttaggccctaaattaaaagaagttacaacatttttgattgctgaa
ttaccatatggtaagaaaagcgttggatatggtgttgaggaattcattgttgatggtgtt
attattttaaaaattaaaattgttaagagaaaaatcattagattaatggaaataaggaag
atgagggggaatgaaataagcattggagaagtaccatttgtaatagctcctgatgaagga
atcgcaattattaagccagaaagtccatttggaatgccttcagcagttaatcctgaaggc
ataatagaattgaaatttaaggatagcaattataaattagaatttcaaaaaggatctcaa
accctatttgttatacatcctagcatagatcctttaatattattaacagctttaggggtt
gatataataatttcagaaaagcgtaaagtattttatagatcatatttgcatggagagaac
acaataagggataggtttaaaatatgtgtaaataatttattttctcaagaaaaagcaaat
gaaatttttgatttagttaaaactttttcaattaacccaactcgttattcaatagatgaa
ctatattatatgatcagcaaaatggaatctgagataaaagcagatactgtagttgttgaa
gggcttgagacattatatgatttatcagataaaaggggattcattaatgcgcaatataat
agtttgataaaaatggcagttaatggaataacaggcttttactctactaaaggtgttaaa
gaggaaataaaccaattaccattaattaacttctatgataacataatatatgcagagcct
atatctacacctaatggaagatttgttaaaataacacctataagattaattttaaaggta
aacccatattttgagattttgttaaatgctgataatatagaaaaatgtacaaatttataa
DBGET
integrated database retrieval system
