Caldisphaera lagunensis: Calag_1080
Help
Entry
Calag_1080 CDS
T02380
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
clg
Caldisphaera lagunensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clg02000
]
Calag_1080
Transporters [BR:
clg02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Calag_1080
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Baculo_PEP_C
DUF1664
NPV_P10
YwqH-like
DUF4618
IFT57
BLOC1_2
SF-assemblin
Gp58
Bacillus_HBL
ATG17_like
Apolipoprotein
Mce4_CUP1
CENP-F_leu_zip
Prominin
Golgin_A5
COG5_N
AIP3
Filament
SKA1
FlaC_arch
Rootletin
Tweety
LMP
Exonuc_VII_L
CoV_S2
Alanine_zipper
Phasin
COG4_N
KASH_CCD
Wtap
TPR_MLP1_2
DUF3450
DUF2884
Dynamitin
EzrA
Fib_alpha
Lectin_N
ATG16
CCDC22_CC
Motile_Sperm
V-SNARE
Laminin_II
FlgK_D1
MAP65_ASE1
COG3_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ70802
UniProt:
L0ACD9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1087992..1091810)
Genome browser
AA seq
1272 aa
AA seq
DB search
MNSREKYGAIALLAVAFVLVMAFGVIPISHAATPVTISSGRGAEFPSIVSPGSTVEIAFN
FTIAAPSSGYYQLYLYYPTTSGYVTEPVSPTFFLDSNAQYLAVNVTLTPNEVQQFVSNIE
KYQNISGYDNLTVFIALNTPYTPTITTTAPVIGTNQFTLLLTPALQTAINGTRDISYYTL
YNVTTNRTVYKLNVTLTSPVSSNVLPNYGYNKSTTNVTLILNLLNSNYMNYPIMLYENQT
EYNKSPSGFHSVSSSDLLSKGFSSEIYSSNKIYLNGALYPATALPLVTNVLTANFGLEYS
YFEGNVLQLIVYNASSQVSLTAKKGYVVEYFEAASNSVPIKPSTSGSLTENVTLYSLSNL
GVSVTPSTVLNIFPSTQLSSPSSYELYPGGTFSYDLLAANFPSGSNITSTGIYFINPVNK
TVQNTSAAISGAPLFYALEGDEYAEPTATPTYAPTPTSSFTVTLPLNDPYWGSPVILYIK
TNNSVITYAVSTPETTLPEFASVYPIYYVVSAGSNGTFSELNTTAILLGQYVFVYGYGFY
PNLNVSNISYVTNGSTAPVVKQLLLLSTPMTGSNLVMTNENGIFYFVAQVPYTGSIANLA
VKAGSSGLPVYFNVSTLSVSNVPTYNKLNSSLPSSKIYALKTGDAIIYINPQLEYVKLNT
SLMVWWPEVVQNKYYYLVPYNATQPFSLTIAGKSFSFSGIAPVSDGEFTAQIIGANATAY
ANYLNLTNSSVIKSIDVTSQLVNGYGFVTVEVPNANGGIIISLKVASYEKTSSGMESVSE
SSPSYSKVKVLTAYEVIVGKMPIYAVDEGPTYMGPVTGLDNTTFIVLNNVPITVVGWGFV
PETSQGLEFEVNGVPVANVSAIVNGYAEGTMFVNQTNGFILSGSDYSFTLDPSNVEIATP
TNVVPAASEELYYITQIIIPVNVIFSGSTVSVGEPYIAYVLNPLITMQIYNSQLSQFTKY
FALGPSSTEAFVYNNGMQMGKVMSGQNVVPTPPTMQSFLITPPMVSQGQLIFDYNVSLIF
LPWPSVSAQAYGIGEAGIVSNTSFEGLYQSVSALSTQLSNAQSSIEANITEGLNSLGSSL
SSSISSLSTSLSNVNSTLESQISSLSSSISSLSTSLSNDYSALSSSISSLSTSLSNVNST
LESQISSLSSSISSLSTSLSNVNSTLSSKVASISSSLSSLESTVSGISSTVSSLSTTVSS
LSSTVSSLSTTVSSLSSTVSSLSSLPSTVSSLSSTASSASSRALSAEYYALGALIVAVIV
LILAAYMAFAKM
NT seq
3819 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcgagagaaaaatatggggctattgccttattggcagtagcttttgtgttagta
atggcctttggagtaataccaataagtcatgctgctactccagtaacaatatcatcaggt
agaggagcagaatttccaagcatagtaagccctggttcaactgttgaaattgcatttaac
tttactatagcagcaccatcatctggatattaccagttatacctttattatccaacaaca
tcaggatatgtcactgagcctgtttctccaacattcttcttagattcaaatgcacaatat
ttagctgtaaatgtaacattaactccaaatgaggttcaacaatttgttagtaacatagaa
aagtatcaaaatataagcgggtatgacaatttaactgttttcattgcattaaatacacca
tatactccaacaataacaacaacagctccggttatagggacaaaccagtttactttattg
ttaacacctgcacttcaaactgctataaatggtactagagatataagctattatacatta
tataatgtgacaacaaatagaacggtatacaaattaaatgttacattgacttcaccagta
agtagcaatgtattgcctaattatggttataacaaaagtacaacaaacgttactttaata
ttgaatttattaaatagcaattatatgaattatccaataatgttatatgaaaatcaaacg
gaatacaacaagtcaccttcaggatttcattcggttagtagttcagatttactatcaaaa
ggatttagtagcgagatttattcaagtaataaaatatacttaaatggtgcattatatcca
gcaactgctttacctttggttactaacgtgttaacagctaactttggtttagaatactca
tactttgaaggtaatgttttgcaactaatagtctataatgcatcatctcaagttagttta
actgcaaagaaaggttatgttgtagaatactttgaagctgcatcaaatagtgttcctata
aaaccatctacttcaggtagtttaacagaaaatgttacattatattcgcttagtaattta
ggcgttagtgtaactccatcaacggtcttaaacatattcccaagtacgcagttatcatcg
ccatcaagttatgagttatatcctggcggaacattttcttatgatttattagcagcaaac
ttcccatcaggtagcaatataacatcaactggaatttactttataaatcctgttaataaa
acagttcaaaacacaagtgccgcgataagtggagctccattattttatgcattagaaggc
gatgaatatgcagaaccaactgcaacgccgacttatgccccaactcctacatcatcattt
actgtaactctgcctttaaatgatccatattggggatctcctgtaatactatatataaag
actaataatagtgtaataacttatgcggtatcaacaccagagacaacattaccagaattt
gcttcagtatatccaatttattacgtagtatcagctggtagtaacggaactttcagtgaa
ttaaataccacagcaatattattaggtcagtacgtatttgtttatggatatggattttat
cccaatttaaatgtttcaaacatatcatatgtaacaaacggaagtacagctccagtagta
aaacagctattgttattatcaacaccaatgactggcagtaatttagtaatgacaaacgaa
aacggtatattctatttcgttgcccaagtaccatatacaggatctattgccaacttagca
gttaaagcaggttcttctggtttaccggtttactttaatgtatcaacattaagcgtatca
aatgtacctacatataataagttgaattcatcattaccatcatcaaaaatatatgcgtta
aaaacaggagatgctataatatatataaacccacaacttgaatatgttaagctaaacaca
tcattgatggtatggtggcctgaagtagtacaaaacaaatattactacttagttccatat
aatgcaactcaaccatttagcttaacaattgctggaaagagcttctcatttagcggaata
gctcctgtaagtgatggtgaattcacagctcaaataataggagcaaatgcaactgcgtat
gcaaactatcttaacttaaccaattcatcagttataaaatcaattgatgttacaagtcaa
ttggttaatggttatggatttgttacagtagaagttccaaacgcaaacggaggaataatt
atatcattaaaagttgcatcatatgaaaagacgagtagtggtatggaaagtgtttctgaa
tcatctccatcatattctaaggttaaagtgttaacagcttatgaagtaattgttggtaaa
atgcccatatatgcagttgatgagggtcccacttatatgggtccagtaacaggtttagat
aacacaactttcatagtattaaataatgtacctataactgttgtaggatggggtttcgtt
cctgaaacatctcaaggattagaatttgaggttaatggagtaccagtagcaaatgtttca
gcaatagtaaatggatacgcagaaggtacaatgtttgttaaccaaactaatggatttata
ttatcaggaagcgattatagttttacattagatccaagcaatgttgagatagcaactcca
acaaatgtggtgcctgcagcatcagaagagttatattacataacacaaataataatacca
gttaatgttatattctcaggatcaactgtttcagttggtgaaccctatatagcatatgta
ttgaatccattaataacaatgcaaatatacaactctcaactatcccagtttacgaaatac
tttgcattgggcccaagctctacagaggcctttgtttacaataatggaatgcaaatgggt
aaagtaatgtctggacaaaacgttgttccaacacctccaactatgcaatcattcttgata
acaccacctatggtatcacaaggtcaattaatatttgactataatgtatcattaatattc
ttaccatggccttcagtatcagcgcaagcctatggtataggagaagctggtatagtttca
aatacatcatttgaaggtctatatcaatcagttagtgcgttatcgactcaattaagtaat
gcgcaatcaagcatagaagcaaatataacagaaggcttgaactccctaggttcatcccta
tcatcttccatatcatccctaagcacttcactatcaaacgttaactccacattagaatca
cagatatcatccctatcatcttccatatcatccctatcaacttcactatcaaacgattac
tctgcattgtcatcttccatatcatccctaagcacttcactatcaaacgttaactccaca
ttagaatcacagatatcatccctatcatcttccatatcatccctaagcacttcactatca
aacgttaactccacattatcatctaaagttgcatcaatatcatcttcactatcatcatta
gaatcaactgtttcaggtataagttccacagtctcatccctaagtacaacagtctcatca
ttaagttccacagtctcatccctaagtacaacagtctcatcattaagttccacagtctca
tcacttagctcattaccaagtacagtctcatcactaagctcaactgcatcatctgcatca
agcagagccttaagtgctgaatactatgcattaggagcattaatagtagctgtaatagta
ttaatattagctgcatacatggcctttgctaaaatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system