Cellulophaga lytica HI1: IX49_00310
Help
Entry
IX49_00310 CDS
T03279
Name
(GenBank) ABC transporter
KO
K18889
ATP-binding cassette, subfamily B, multidrug efflux pump
Organism
clh
Cellulophaga lytica HI1
Pathway
clh02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clh00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
IX49_00310
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clh02000
]
IX49_00310
Transporters [BR:
clh02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
IX49_00310
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_29
nSTAND3
AAA_21
AAA_18
AAA_23
DUF87
RsgA_GTPase
ATP-synt_ab
DUF5906
MMR_HSR1
AAA_15
AAA_22
NACHT
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM59045
LinkDB
All DBs
Position
80377..82134
Genome browser
AA seq
585 aa
AA seq
DB search
MKELKHINKYFKKYWLKLTIGIIITVVARVFSLVMPPYVNKSINVVKEFISQGNVPIDVV
KGHLLDYILIILGAALLSGFFTFLMRQTIINVSRHIEYDLKNEVYDHYQKLSLNFYKKNR
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SMSLVRINAWFFPLMVLLIGISNIIVIYVGGKQYLNGQIESIGLIAEFIIYVNMLTWPVA
IVGWLTSIIQRAEASQERINEFLQEEPEIKNTVTTPMEINGKIEFKNVSFTYDDTNITAL
KNVSFTINPGETVAIIGKTGSGKSTILDLIARLYDVSSGNIAIDNTPIKEVNLDCLRQNI
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LSGGQKQRVSIARALLKDPKIYLFDDCLSAVDTETEEKILNNLKSASKNKTTLIVSHRVS
SAKNADKIIILDNGKVVQEGTHNSLFEIDGYYKALYNSQLSEKES
NT seq
1758 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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tcagagaaagaaagttag
DBGET
integrated database retrieval system
