Cellulophaga lytica HI1: IX49_02505
Help
Entry
IX49_02505 CDS
T03279
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
clh
Cellulophaga lytica HI1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clh02000
]
IX49_02505
Transporters [BR:
clh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IX49_02505
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Plug
SpaA
SdrD_B
PEGA
CooC_C
Big_3_5
DUF3869
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM59450
LinkDB
All DBs
Position
complement(563388..565889)
Genome browser
AA seq
833 aa
AA seq
DB search
MKNNYYLILLLLTAFTVTAQNKGGITGQVLDETGTPVIGANVVIQSISIGAVTDENGTYK
LDDLSYNTYTITVSYLGYKSIKKSVEIATPQTTLNFNLKEPSFQLDGLVVTAQKREQLNK
DVPIAITSYGSDFINNQGTFEYDTFSDYVPGLQIQIQSVNNPGIVVRGITSDSGDSRVEP
RVSVFQDGVSISKSRGSVVELFDIERVEVLKGPQGTLFGRGAQIGAMHIIQNKAKNETSA
SLKTGIGNYNQFLVNGYVNTPLVKDKLFARVAAIYNRRDGYIENLSGGDLNGKETLALRG
SLKYMISDNTTFDFIANWQQDTPPGTSFKSGTFAPLGGDLSPNSFADLERGKELGLDRTV
YGFTGILKSALNDNWDITSTTAYRKFNSDEAFDADGTAAPVLFFREVAEGEQFSQEVRFN
FDNDDKLSGFFGANFFYENGSQAVPFEVNEQSYLALLVATDALVINGVPTLFPNIPNDPG
SFGPLAGAPLLPFNKEESINYGENYSGDIFADASYDVTEKLTLTLGLRATLENSNAGLEV
INADNPGLLGNFLGAFPNNLFTPTNGRISASETFTSAVGRFAVNYDLSDAVTVFGNVARG
RRPNVINVSATEVNVLSDETVWSYELGLKSLMLDNKLQFDINGYYYDYSNFQTTIARLDE
TDGLVILPNDSGSATALGFEAAMQYQFAKSSSFFANYGYIDASFDDEDSDGNPQQLAGNT
FRLTPEHSFSAGFNINPTLSEKVAVFLRPTYTYKSKVFFEETNLPNISQDGYGLLNIRTG
ITIQDRYEISLYATNVLDEEFIIDAGNTGGAFGIPTFIAGPPAFYGLQLSVKF
NT seq
2502 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataattactatttaattttactattacttaccgcatttacggtaacagcacaa
aacaaaggaggtataactggtcaggttttagatgaaacaggaactcctgtaattggagct
aacgtagtcatacaaagtatatcaataggagcagttacagatgaaaacgggacatacaag
ttggatgatttatcttataatacttatactattacagtatcttacttagggtataaaagc
ataaaaaaatcagtagaaattgcaactccgcaaacaactttaaactttaatttaaaagaa
ccatcttttcagttagatggtttagtggttacagctcaaaaaagagagcaactaaataaa
gatgtaccaattgcaataacttcttacggaagtgactttataaataaccaaggtacgttt
gagtatgatactttttcagattatgtaccaggtttacaaatacaaatacaaagtgtaaac
aatcctggtatagttgttaggggaattactagtgatagcggagattctagagtagagcca
agagtatctgttttccaagacggggtttctattagtaagtctcgtggttctgtagtagag
ttgtttgacatagaacgagtagaagttttaaaaggcccacaagggactctttttggtaga
ggagcgcagattggagcaatgcatattattcaaaataaagctaaaaatgagacttctgct
tccttaaaaacaggtattggtaattacaatcagtttttagtaaacggttatgtaaacaca
cctttagtaaaagataagttgtttgctcgtgtagctgcaatttacaatagaagagatggg
tatatagaaaacctttctggaggagacctaaatggtaaagaaactttggcacttagaggt
tctttaaaatatatgattagtgataatactacgtttgattttattgcaaattggcaacaa
gatacacctccaggaacttcttttaaaagtggaacttttgctcctttaggaggtgactta
agtcctaactcttttgcagatttagagcgtggtaaagaattagggttagaccgtacagta
tatggctttacaggaattttaaagtcggcacttaatgacaattgggatataacttctact
acagcttatagaaaatttaattcagatgaggcttttgatgcagatggtacagcagcacca
gttttattttttagagaggttgcagaaggagaacaatttagtcaagaagtacgttttaat
tttgataatgatgataaactatctggtttctttggagctaatttcttttatgaaaacggg
tcacaagcagtaccttttgaggttaatgagcaaagttacctagcacttttagtagcaaca
gatgctttggttataaacggtgtgccaactttatttcctaatattcctaacgacccaggt
agttttggaccattagcaggagctcctttattgccatttaataaagaggaatctattaat
tacggagaaaattactctggtgatatttttgcagatgcttcttatgatgttacagagaaa
ttaactcttacactaggactaagagcaactttagaaaatagtaatgctggtttagaggtt
ataaatgcagataatccaggattgttaggtaactttttaggagctttccctaacaactta
tttacgccaacaaacggtagaatttcggcaagtgaaacttttacatctgctgtaggtagg
tttgctgttaattatgatttaagtgatgcggtaactgtttttggtaacgttgcacgcgga
agaagaccaaatgtaattaatgtatcggctacagaagtaaatgtgttgtcagacgaaact
gtatggtcttatgagctaggactaaaatcattaatgttagataataaactacagtttgat
attaatggatattattatgactacagtaattttcaaactacaattgcacgtttagatgaa
acagatggtttggtaattcttcctaatgatagtggtagtgcaacagcattaggttttgag
gctgctatgcagtaccaatttgcaaaaagtagttctttctttgctaattatgggtatata
gatgcttcttttgatgatgaagattcagacggtaacccacagcaattggcaggaaatacg
tttaggttaacaccagaacactctttctcagcaggatttaatatcaaccctactttaagt
gaaaaagtagctgtatttttaagaccaacatatacttacaagtctaaagtattttttgaa
gaaactaatctgccaaatatatctcaagatggttatggtttattaaacattagaacaggt
ataactatacaagataggtatgaaattagtttatatgcaactaatgttttagatgaagaa
tttattatagatgcgggtaatactggtggtgcttttggtataccaacatttattgcaggt
cctccagcattttacggacttcaattgtctgtgaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system