Cellulophaga lytica HI1: IX49_06100
Help
Entry
IX49_06100 CDS
T03279
Name
(GenBank) cell envelope biogenesis protein OmpA
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
clh
Cellulophaga lytica HI1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
clh02000
]
IX49_06100
Transporters [BR:
clh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
IX49_06100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OmpA
TSP_3
PagL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM60113
LinkDB
All DBs
Position
complement(1358021..1359379)
Genome browser
AA seq
452 aa
AA seq
DB search
MKNLSKLMLVALLLVGVNNIQAQDENNPWQISFGVNAVDMYPTNDEDAVYPTGELFDEYF
NATDHWNILPSISYIGVSRSVGNGFSVGVRGSLNRIENLGDWSADDLSYYGLDGAIKYAF
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STAVMVDIITILKEYPNAKFTVEGHTDSVGSATLNQKLSESRALSVKEFLVEKGIGEFRL
SAVGYGEDKPIATNKTRAGRKQNRRVEINLVK
NT seq
1359 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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aagcaaaacagaagagttgaaatcaacttagtaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
