Cellulophaga lytica HI1: IX49_06520
Help
Entry
IX49_06520 CDS
T03279
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
clh
Cellulophaga lytica HI1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4175
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM60190
LinkDB
All DBs
Position
1470623..1474102
Genome browser
AA seq
1159 aa
AA seq
DB search
MNSLDHILHKLRAFTRRFYTQKLLKGLLLFISFGLLTLLVILGLEYLLWFNSTGRLLLLL
TLLAITFYLLYAYILTPLFYLFQLKKGISNKDAAILIGKHFPEVGDKLYNLLDLADNQQT
SELLLASIEQRSKKLDAVPFVKAINFSENFKYAKYLLVPLVVIILVWLSGNLSSFFGSYD
RVVNYKMAFEKPAPFSFKLINNNLRVLKGEDITLKVTTEGDIKPENISIIANGNEFFLQE
NNGFYEHTFVSPDKSTSFYFLANGITSKQYSLTVLEIPFLENFNMKLMYPSYTNRQPETL
QSTGNATFPEGTKVQWTIKGNHIDSISLKVKDSKIGFNKKENIFTTTKNIYQSTHYSIST
SNKNVSNFEKLEYKFTVVKDASPALQVNQVKDSLNPNVLYYSGTASDDYKLISIKLVCYP
SNSIENKQIINISSPNSNVAQFYYTFPSGLNLEPNVDYNFYFIATDNDAIHNGKTTKSQV
FSTVLLDDNALKNNSLQQQQQLLNNLDNSLDKFKEQKDVLKELNNKQKEKTSLNYTEQSE
VKDYLQKQQQQEQMMEKFSKQLKENLQKSNTDDKQNKLLQERLERHEQQAKKNQKLLEEL
NKVADKINKDQLTKRLEELGKSQKNSERNLEQLLELTKKYYVTEKLAQLAQDLEKLAEKQ
EVLSELKQDQNFEKEEQEKLNKAFEDLTKELDELEKDNQKLQKPLDIKANKAKEDAVKQD
QNDALEELNKEQGSDNSSKSESKASNKAAKKQKSAADKMRQMSSQMQQSSSGSSGSSITE
DAEMLRQILENLVIFSFKQEQLYNDISSKDYDVAKFSTTIKRQKELRTLFEHVDDSLFAL
SLRQAEISEKVNKDITEVFYNIDKSLEQLAENRTYLATANQKYVLNSSNSLADFLANLLD
NMNQSMKSGAGKGQGKGQGFQLPDIIKAQNSLKDKLLGKQGNSKSSEGKKPGEGQKPGGS
NPGSDGKKGKTGEKGGEGEGGKKGENGKNGASGNGENKNSKGKNGNQNGENGAAGQGLSE
EELKEIYEIYKEQQQIRQALEQQLNDMIAKEDKNLSKKLLQQMEDFENDLLENGITNRTQ
TKANNIQHQLLKLENATLKQGEKSAREANKAKNKFSNPITTKPEALQNYRNEIEILNRQA
LPLQQIFQNKVQHYFKTND
NT seq
3480 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaatagtttagaccatattttacataaattaagggcctttactagaaggttttatacc
caaaagttacttaaaggattactcctttttattagttttggattgctgactttattagta
atattagggcttgagtacctattatggtttaattctacaggtagattgttgttgctttta
acacttttagcaattactttttaccttttatatgcttatattttaacacctcttttttac
ttatttcagcttaaaaaaggaatttctaataaggatgcagcaattttaattggtaaacat
tttcctgaggtaggtgataagttgtataatttgttagatttagcagataaccaacaaaca
tctgagcttttattggccagtatagaacaacgctctaaaaagttagatgctgttcctttc
gttaaagcaataaatttttctgaaaattttaaatacgctaaatatttgctagtaccacta
gtagtaataatattggtttggttatctggaaatttaagttctttttttggatcctatgat
agggttgttaactataaaatggcttttgaaaaacctgctcctttttcttttaaactgatt
aacaataatttacgtgttttaaaaggtgaagatattacacttaaggttacaactgaaggt
gatattaagccagaaaatatatctattattgctaacggtaatgagttttttttacaagaa
aacaatggtttttatgagcatacttttgtatctccagataagagcacttctttttatttt
ttagctaatggtattacatctaaacaatatagccttactgttttagagatcccttttcta
gagaattttaatatgaaattaatgtatccctcatatactaacaggcaaccagaaactctt
caaagtactggtaatgctacttttcctgaaggaaccaaagttcagtggactataaaaggc
aatcatatagatagtatttctttaaaggtgaaagattcaaaaattggctttaataaaaaa
gaaaacatttttacaaccactaaaaatatataccaaagtacccactatagtattagcaca
tctaacaaaaatgtttcaaattttgaaaaattagaatataagtttactgttgtaaaagat
gctagccctgcattgcaagtcaaccaagttaaagatagcttaaaccctaatgtgttatat
tattctggtactgcatctgatgattataaactgattagtataaaactagtttgttatcca
agtaattctatagaaaataagcaaataatcaatatttcatcacctaatagtaatgtagca
caattttattatacatttccatctggtttaaatttagaacctaatgttgactataatttt
tactttattgccacagataatgatgctatacataatggtaaaaccactaaaagtcaagtg
tttagtacagtcttattagatgataacgcacttaaaaataatagtctacagcaacagcaa
caacttttaaataatttagataattctttagataagtttaaagaacaaaaggatgtttta
aaggaattaaataacaaacaaaaggaaaaaacttctttaaattataccgaacagtctgag
gttaaagattatttgcaaaagcaacaacagcaagagcaaatgatggagaagtttagcaag
caattaaaagagaatttacaaaagagtaatacagacgataaacagaataaattacttcaa
gaacgtttagaacgtcacgaacaacaagcaaaaaagaaccaaaaattacttgaagaacta
aataaagtagcagataaaataaataaagatcagttaactaagcgtttagaagaacttggt
aagagccaaaaaaatagtgagcgtaacctagaacagcttttagagctaacaaaaaaatat
tatgttacagaaaaattggcccaattggcacaagatttagagaaacttgcagagaaacaa
gaggtactatcagagcttaaacaggaccaaaattttgaaaaagaggagcaggaaaaatta
aacaaagcctttgaagatttaactaaagaacttgatgagcttgaaaaggacaatcaaaaa
ttacaaaaaccattagatattaaggctaataaagcaaaagaagacgccgttaaacaggat
caaaatgatgctttagaagagctaaataaggaacaggggagtgataattcttctaaatct
gaaagtaaagccagtaataaagctgcaaaaaaacaaaaatctgcagctgataaaatgaga
caaatgagttctcaaatgcagcaatcttcatctggttctagtggatcatctattactgaa
gatgctgaaatgcttcgtcaaattctagaaaatcttgttattttctcttttaaacaggag
caattgtataatgatattagctcaaaagattatgatgttgctaagttttctacaacaatt
aagcgccaaaaagaattacgtacattgtttgagcatgtagatgatagtctgtttgcactc
tctttgcgtcaggctgaaatttcagaaaaggtaaataaagacattactgaagtgttttat
aatattgataaatcattagaacaattagcagaaaataggacttatttagccaccgctaat
caaaaatatgttcttaactcatctaatagtttggcagattttcttgctaatttgctagat
aatatgaaccagagtatgaaatctggtgctggtaaagggcaaggaaaggggcaaggtttt
caattaccagatattattaaagctcaaaatagcttaaaggataagttgttaggtaaacag
ggaaattcaaaatcttctgaaggtaaaaagcctggtgaaggtcaaaaacctggtgggagc
aatccgggatctgatggtaaaaaaggtaaaactggagaaaaaggtggcgaaggcgagggc
ggaaagaaaggtgaaaatggcaaaaatggagctagtggcaatggagaaaataagaattct
aaaggcaaaaacggaaaccaaaatggtgaaaatggtgccgcaggacaagggttatctgag
gaagaactaaaagaaatttatgaaatttacaaagaacaacagcaaattagacaggcttta
gaacagcaattaaatgatatgattgcaaaagaggataaaaatttatccaagaaactgttg
caacaaatggaagattttgagaacgatttacttgaaaatggtataacaaatagaactcaa
accaaagcaaataatattcaacatcaacttttgaagttagaaaatgcaactttaaaacaa
ggtgaaaagagtgcaagagaagctaataaagcaaaaaataagttttccaatcctattacg
actaagccagaggctttacagaattatcgtaacgaaatagaaattttaaatagacaagca
ctacctttgcagcaaatttttcaaaataaagtgcaacattattttaaaacaaatgattga
DBGET
integrated database retrieval system