KEGG   Cellulophaga lytica HI1: IX49_08500
Entry
IX49_08500        CDS       T03279                                 
Name
(GenBank) RNA-binding protein
  KO
K06959  protein Tex
Organism
clh  Cellulophaga lytica HI1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:clh00001]
 09190 Not Included in Pathway or Brite
  09192 Unclassified: genetic information processing
   99973 Transcription
    IX49_08500
SSDB
Motif
Pfam: Tex_YqgF Tex_central_region HHH_3 HHH_9 Tex_N S1 HHH_7 YqgF T2SSK HHH OB_PDCD11 HHH_6 HHH_2 HHH_5 DHQ_synthase
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIM60561
LinkDB
Position
complement(1885712..1887835)
AA seq 707 aa
MIKYILKHTQLPELSVKNTIELLNQDCTIPFISRYRKEKTGNLDEVQIGAIVTYKAQFEA
LEKRKAAILKALQEQDVLTPELQTKIATTDNLTTLEDIYLPFKKKRKTKAETAIKNGLEP
LAKIIMAQRNDEIEYTASRYLNDVIVNEDLALEGARHIISEWINERTDIRNGIRHQLENY
ALITTKVIGTKKDDEKAQKFRDYFDWSEALKRCPSHRLLAILRAEKEGFIRVKIEIDNDR
ALDKIENRIIKSNNACAQQIELAIQDAYKRLLLPSLSNELLKNAKEKADADAIAVFSKNL
KQLLLGSPLGEKRILALDPGFRTGCKLVCLDAQGDLLHNETIYPHAPQNKSTEAIKKISS
LADAYKIEAIAIGNGTASRETEQLVKRIQFKNPLEVFVVSEAGASIYSASKIARDEFPNY
DVTVRGAVSIGRRLADPLAELVKIDAKSIGVGQYQHDVDQNKLKQSLDTVVESCVNAVGV
NINTASTSLLSYVSGIGPKLAENIVNYRNENGAFTSRTAIKKVPRLGGKAFEQGAAFLRI
KNAKNPLDDSAVHPESYSIVQQITKDTKVPIEELIGNKEVLQKIDLQKYCTDTVGLPTLQ
DIVKELEKPGLDIREKAKVFSFNQNIRSITDLVAGQLLPGIVNNITNFGCFVDVGIKESG
LIHISNLADTFVKDVNEHVSLHQQIVVKVLEVDVARKRIQLALHKNM
NT seq 2124 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgataaaatatatacttaaacacacgcagttaccagaactaagtgtaaaaaatactata
gagcttttaaatcaagattgtaccataccgtttatatctagataccgtaaagaaaaaaca
ggaaacttagacgaggtacaaattggtgctattgttacctacaaagctcagtttgaagcc
ttagaaaaaagaaaagcagcaatactaaaagcgttgcaagaacaagatgttttaacgcca
gaactacaaacaaaaattgctaccacagacaaccttactaccttagaagatatttacctt
ccgtttaagaaaaagcgtaagacaaaggcagaaaccgctattaaaaacggtttagagcct
ttggctaaaataataatggcacagcgtaatgatgaaattgaatatacagcctctagatac
ctaaatgatgttattgttaatgaagatttggcgttagaaggagccagacatattatatct
gaatggattaatgagcgtacagatattagaaacggtatacgccaccagcttgaaaactat
gcccttattaccaccaaagttattggcactaaaaaagatgacgaaaaagcccagaagttt
agagattattttgattggagcgaggctttaaaacgatgcccatcacacaggttacttgcc
attttaagagcagaaaaagaaggttttattagggttaaaatagaaatagacaatgataga
gctttagataaaattgaaaaccgaattataaaaagtaacaatgcctgtgcacagcaaata
gagcttgctatacaagatgcttacaaaagactacttctcccctctttgtctaacgagctt
ttaaaaaatgctaaagaaaaagcagatgcagatgcaatagctgttttctctaaaaattta
aaacaattacttttaggttctcctttaggcgaaaaaagaatattagccttagatcctggt
tttagaaccggttgcaaattggtgtgtttagatgcccaaggagatttgttgcataatgaa
accatttatccgcatgcaccacaaaacaaaagtacagaagcaattaaaaaaattagttct
ttagcagatgcatataaaattgaagccatagcaataggtaacggtacagcctctagagaa
acagagcaattggttaaacgcatacaatttaaaaacccattagaagtttttgtggttagc
gaagcaggcgcatctatatactcggcttctaaaattgctagagatgagtttcctaattat
gatgttaccgtgcgtggcgcagtttctattgggcgtagacttgcagatccgttagcagaa
ttggtaaaaatagatgcaaaatctataggtgttgggcaataccaacatgatgtagaccaa
aacaaactaaaacaatctttagacactgttgtagagagttgtgtaaatgcggttggtgta
aatataaacaccgcaagtacatctttactaagttatgtatctggtattggaccaaaatta
gccgaaaacatagtaaattaccgaaacgaaaatggtgcttttacaagcagaacagccata
aaaaaagtaccacgtttgggcggaaaagcatttgagcaaggtgcagcttttttacgcata
aaaaatgccaaaaatccgttagacgattctgccgtacacccagagagttacagcatagtg
caacaaataactaaagataccaaagtacctattgaagagttaattggcaataaagaggtt
ttacaaaaaatagacctacaaaaatactgcacagatactgttggtttaccaactttgcaa
gacattgttaaggagttagagaaaccaggtttagatattagagaaaaagccaaagtattt
tcttttaaccaaaacatacggtctataacagaccttgttgctggacagttattaccaggt
atagttaacaatattaccaattttggttgttttgtagatgttggcattaaggaaagtggc
ttaatacacatatctaacctggcagacacttttgtaaaagacgtaaatgagcacgtaagc
ctacaccaacaaatagtggtaaaagtattagaggtagacgttgctcgtaagcgcatacaa
ctagctttacataaaaatatgtaa

DBGET integrated database retrieval system