KEGG   Cellulophaga lytica HI1: IX49_09965
Entry
IX49_09965        CDS       T03279                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
clh  Cellulophaga lytica HI1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:clh00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:clh02000]
    IX49_09965
Transporters [BR:clh02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   IX49_09965
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel Plug CarbopepD_reg_2 CarboxypepD_reg Opacity
Other DBs
NCBI-ProteinID: AIM60830
LinkDB
Position
complement(2216362..2218758)
AA seq 798 aa
MRYTLTILCIIVCQSFVFSQDCSNILLGEVIDFHDKQPLADAIIQVRGNKKQVYSDEFGK
FTLKNLCNGIIELEISHPECSTRFVTVEIYGNTHKKITLEHHLEELNEVKVTGSTIKETN
SAQEKTIKTEQLERFGSNNLGDVLKQINGVSSLNTGSNIVKPIIQGLGGSRVLILNNGTR
MQDMEWGAEHAPNIDINSANKVTIVKGAAALKYGGDAIGGIILLDQNRIPKKDTIYGKTL
VNGVSNGRGGNITTELTKAYENGFYVKGQASYKKLGDAEAPNYVLSNTGVSQFGASIDFG
KLGFESGWNAYYSYFDTNIGILSASHIGNVDDLITAINSDEPSETTSFTYDINNPRQHVK
HHLGKLKYYKRFGGLGKLNLQYDIQQNHRFEYDIRVGDDKEKASLDLKLTTQTLAADITI
DAFEKQKFSFGILGRYQDNFANPDTGVRRLIPDYDKVDFGVFATTEYKLSDATTLDAGIR
FDYSKIDAQKFYITSRWEERGYNEDFNDIIIDDLGTQLLTNPELSYHNFSASAGLKHRFN
SENLFRFNYTLAQRAPNPSELFSDGLHHSAARIELGDLRIKSETSHRISLSLGKNTYTWG
YEVSPYYNLISDFILLEPTGVEFSLRGAFPVWEYRQTDARLLGVDASIYNNWTNNWRTDH
KFSIVKGKDRTKNEALINIPSARLQNQITFTKQEWNNFNISLQSEYVFKQNEYLDNIMVY
SPQQDQEVELDINTPPSAYHLLKLDSEMKFNLKNSKALTVGLGITNLLNTEYRDYLNRQR
YFTDDLGRSFTLRLKYNY
NT seq 2397 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgctatacgctaacaatactatgtattatagtgtgtcagtcttttgtatttagccaa
gattgttctaatattcttttaggagaagtaatagactttcatgacaaacaaccattagca
gacgctattatacaagtaagaggaaacaagaagcaagtatattctgatgagtttggaaag
tttactctaaaaaatttatgcaacggcattatagagttagaaatatctcacccagaatgc
agtacaagatttgtaacagtagaaatttatggcaacacccataaaaaaataaccttagaa
catcatttagaagagttaaatgaagttaaggttacgggctctaccattaaagaaaccaat
tctgcacaagaaaaaacgataaaaacagagcagctagaacgctttggcagcaacaatttg
ggtgatgtgcttaaacaaataaacggagtatctagcttaaacacaggttcaaatattgta
aaacctataatacaaggtttaggaggcagtagagtacttatacttaataatggtactcgt
atgcaagatatggaatggggtgcagaacacgcaccaaacatagatattaattctgccaac
aaagtcacaattgtaaaaggtgctgctgcattaaaatatggtggtgatgctattggaggt
attattttactagaccaaaatagaatacccaaaaaagatactatttacggcaaaacactt
gtaaacggagtgtctaatggcagaggcggaaacataaccacagaacttaccaaagcatat
gaaaatggtttttatgtaaaaggacaagcatcttacaagaaattaggagatgcagaagct
ccaaattatgtattatcaaatacaggagtttctcaatttggcgctagtatagattttgga
aaacttggttttgagagtggctggaatgcctactactcgtactttgacacaaatattggt
attttaagtgcgtctcatataggtaatgtagacgatttaattaccgctattaatagtgat
gaaccaagtgaaacaacaagttttacttatgacatcaacaaccctagacaacatgttaaa
catcatttaggaaaacttaaatactacaagcgttttggaggcttagggaaattaaatctt
caatatgacatacaacaaaaccataggtttgagtatgatatacgtgttggtgacgacaaa
gaaaaagcttctttagaccttaagcttacaacacaaacacttgctgcagatattactatt
gatgcttttgaaaagcaaaaattttcttttggaattctaggccgatatcaagataatttt
gccaatccagatacaggtgtaagacgtttaattcctgattatgataaagtagattttgga
gtttttgcaactacagaatataaactttctgatgctaccactttagatgctggtattaga
tttgattatagtaaaattgatgcccaaaagttttacataacatctagatgggaagaacgc
gggtacaacgaagattttaatgatataattattgatgacctaggcacacaacttttaaca
aatcctgagctaagctatcataatttttcagcgtctgcaggactaaaacaccgctttaat
tctgaaaatttatttagatttaattacactttagcgcaacgcgctccaaatccgtctgaa
ttatttagtgatggactgcatcattctgctgcccgtatagaattaggcgatttacgcata
aagagcgaaacgtcacacagaatatcattaagcttaggaaaaaacacttacacttggggc
tacgaggtttcaccttattataaccttatatcagactttattcttttagaaccaactggt
gtagaattctctttacgaggtgcatttcctgtttgggaatacagacaaacagatgctcgt
ttacttggtgtagacgcatctatctataataactggacaaacaactggagaacagatcat
aaattttctatagttaaaggaaaagacagaactaaaaacgaagctttaattaatattcct
tctgctcgtttacaaaaccaaataacgtttactaaacaagaatggaacaactttaatatt
agcctacaaagtgaatatgtatttaaacaaaatgaatacttagataatattatggtatac
tcaccacaacaagaccaggaagtagaactagatataaacacacctccaagtgcttaccat
ttattaaaattagattcagaaatgaaatttaacttaaaaaatagcaaagcattaactgtt
ggtttaggcataactaatttattgaacacagaatatagagactaccttaacagacaacgt
tattttacagacgatttaggaaggtcttttacacttagattaaaatataattactaa

DBGET integrated database retrieval system