Cellulophaga lytica HI1: IX49_11455
Help
Entry
IX49_11455 CDS
T03279
Name
(GenBank) preprotein translocase subunit SecD
KO
K12257
SecD/SecF fusion protein
Organism
clh
Cellulophaga lytica HI1
Pathway
clh02024
Quorum sensing
clh03060
Protein export
clh03070
Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
clh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03060 Protein export
IX49_11455
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
03070 Bacterial secretion system
IX49_11455
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
IX49_11455
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
clh02044
]
IX49_11455
Secretion system [BR:
clh02044
]
Sec (secretion) system
Prokaryotic Sec-SRP core components
IX49_11455
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SecD_SecF_C
SecDF_P1_head
SecD_1st
Sec_GG
MMPL
ACR_tran
DUF6673
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM61109
LinkDB
All DBs
Position
2525537..2528536
Genome browser
AA seq
999 aa
AA seq
DB search
MYNKGLIKLFAFLFGIVSIYQLSYTFISSKIENEAATYAASKISESDKDFASKREALEIK
YLDSIGSESVFGFTSYNEAKKKELNKGLDLKGGINVTLQIKIKDILSGLANNTKNPVFLK
SLEDADEASKSSDKTYVDLFFEAFDANKGDTKLASPDIFFTKSLSEEIKTMDASDEQVKS
IIRKKIDESVESAFEVLRERIDGFGVTQPNIQREGTSGRILVELPGAKDKARAQELLSST
AQLEFWETYPKNDPNVMQFINAANEKLRSLVDTKTATAEDTESKPESEIDSLLSDVTQDS
LDVASQINPLGDLIKGIPNSFAVAEFAIKDTAKVNEYLNMPEIKRLIPNAIQHVKFAWER
PSKGSEVVGLFALKGNRDNTPKMSGDVVSAARAQFDQFNRPAVGMDMNVKGAKQWQKFTS
EVNLNQTGIAVVLDNRVYTAPGCSVVGGISGGSTEISGDFTITETKDIANVLRAGKLPAR
ADIIQSEVVGPSLGHESINSGLMSFLIAMALVLVWMIFYYGKAGVAADIALLLNILLIFG
VLVSLDAVLTLPGIAGIVLTIGMSVDANVLIFERIKEELAKGKGQSLAISDGFGNALSSI
LDANITTGLTAIILFIFGSGPIKGFATTLLIGIATSLFTAIFVTRLFIEGYTGAKGKVLE
FCTGLTRNLFKNLSINFLKKRKIAYIFSGALIVIALFSLLTTGLQQGVDFVGGRTYQVRF
DQSVNTSEISSNLTEIFGSGTNVKTFGEDNQIMITTSYKVDAEDIAVDEEIQEKLFTSLQ
NLLPSGLTLEEFNNGGTEDVSIGILKSKKVGPTIADDIKKNAVWAILGSLFVVFLYILFR
FRKWQFSLGAVVAVFHDVLVVLGVFSLLGKVMPFNMEIDQAFIAAILTVIGYSLNDTVVV
FDRIREIVKERGWSSGDNVGLALNSTLSRTLNTSLTTLVVLLAIFIFGGESLRGFMFAMI
IGVIVGTYSSLFIATPVMFDTLKKRIQSGKEDVVVEDKE
NT seq
3000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataataaaggacttataaagctgtttgcttttttatttgggatcgtaagtatctat
caattatcctatacttttataagtagtaagattgaaaatgaagcagcaacttatgcagcg
agcaaaatttctgaatctgataaagattttgcaagcaagagagaggcattggaaattaaa
tacttagactcaattgggagcgaatctgtttttggatttacatcttacaatgaagctaag
aagaaagaattaaacaagggtcttgaccttaaaggtggtattaatgtaacgcttcaaatt
aagataaaagatatcttatctggtttagcaaataacactaaaaaccctgtttttcttaaa
tctttagaagatgcagatgaggcgtctaaaagcagtgataaaacatatgtagacttgttt
tttgaagcttttgatgcaaataaaggtgatactaagttagcttctccagatattttcttc
acaaaatcattaagtgaagaaataaaaactatggatgcttctgatgaacaggtaaaatct
ataatccgtaaaaagattgatgagtctgtagaatctgcttttgaggtattaagagaacgt
attgatggttttggtgtaacacaaccaaacatacaaagagaaggtacttctgggcgtatt
ttggtagagttaccaggagctaaagataaggcaagagcgcaagagttactttctagtaca
gctcaattagagttttgggaaacgtatcctaaaaacgatcctaacgttatgcagtttata
aacgctgctaatgaaaaattaagatctttagtagatacaaaaactgctactgcagaagat
actgagtctaaaccagaatctgaaattgattctttattatctgatgttactcaggattct
ttagatgtagctagtcaaataaaccctttaggagatttaataaaaggtattcctaatagt
tttgctgttgcggaatttgcaattaaagatacggctaaggttaatgagtaccttaatatg
ccagaaattaaaagattaattccaaatgcaatacaacatgttaaatttgcttgggagcgt
ccttctaagggttctgaagttgttggtctttttgcattaaaaggtaatagagataatact
cctaaaatgagtggggatgtagttagtgctgcacgtgctcagttcgatcagtttaacaga
ccagctgttggtatggatatgaacgttaaaggagctaagcaatggcaaaagtttacaagt
gaggttaacttaaaccaaactggtattgccgtagttttagataatagagtatacactgct
ccaggttgttctgtagttggtggtatatctggtggtagtacagaaatctctggagatttt
actattacagaaactaaggatattgcaaatgttcttagagctggtaagttacctgcaaga
gcagacatcattcagtcagaagtagttggaccatcattaggtcatgaatctataaacagt
ggtttaatgtctttcttaattgcaatggcattagtacttgtttggatgattttttattat
ggtaaagctggtgtagctgcagatattgcattgttattaaacatattgttaatatttgga
gttctagtaagtttagatgctgtgttaacattgccaggtattgctggtattgttttaaca
attggtatgtctgtagatgcaaacgttcttatttttgaacgtataaaagaagaactagca
aaaggaaaaggacagtcattagcaatttctgatggttttggtaatgcactatcttctatt
ttagatgcaaacattacaactggtttaactgcaattatcttgtttatatttggttctgga
ccaattaaaggttttgctactactttattaattggtattgctacgtctttatttactgca
atatttgttactagattatttattgagggttatactggagctaaaggaaaagtattagag
ttttgtacaggtttaactagaaaccttttcaaaaatttaagtattaactttttaaagaaa
agaaaaattgcatacattttttctggagctttaatagttattgcattattttctttactt
actactggtttacaacaaggtgtagattttgttggaggtagaacatatcaagttcgtttt
gatcaaagtgtaaatacttcagaaatttcatcaaacttaactgagatttttggtagcggt
actaacgtaaaaacttttggtgaggataatcaaataatgattactacatcatacaaagta
gatgcagaagatattgctgttgatgaagaaattcaagaaaaattatttacgtcattacaa
aacttattgcctagtggtttaacattagaggaatttaataatggaggtacagaagatgta
tctataggtatattaaaatctaaaaaagtaggaccaactattgctgatgatatcaaaaag
aatgctgtttgggcaattttaggttcgttatttgtagtgttcttatatatcttattccgt
ttccgtaaatggcaattctctttaggagctgttgtagcggtattccatgatgtattagtt
gtactaggtgttttctctttattaggtaaggttatgccttttaatatggaaatagatcaa
gcatttattgcggcaatattaacagttattggttactcattaaatgataccgttgttgtt
tttgaccgtattagagaaatagtaaaagaaagaggatggagttctggtgataatgtaggt
ttagcattaaacagtacattaagtagaacattaaatacttctttaactacgttagtagta
ttactagctatctttatttttggtggtgaatctttaagaggatttatgtttgctatgata
attggtgttattgtaggtacatattcatctttatttattgcaacacctgttatgtttgat
acattaaagaaaagaatacaatcaggtaaagaagatgttgttgtagaagacaaagagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
