Campylobacter lari subsp. concheus LMG 11760: CONCH_1474
Help
Entry
CONCH_1474 CDS
T03557
Name
(GenBank) hemagglutinin domain-containing protein
Organism
cll
Campylobacter lari subsp. concheus LMG 11760
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Glug
COG4_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJC89860
LinkDB
All DBs
Position
1443275..1446334
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MKTYKLSNHIILSGITVSMLFSPLMALPSGGKFTHGTSGSISTSGNNMNIMGNGTNSVIQ
WGGGFNIGKNEQVNFNGSNKNYLNIAHGTSKSTIEGILNASGNNVFLINPNGVIITKTGT
INANRFVASTSSMSDDNMKAFANLKSFDEGLSFSPVFKPHKAGNVVNMGNINTNDVLLIG
NKVDIQGGRLGNEKSKTHLVGNEVFVDADSVKLSSTINVTALKGGYIQRQMINFANNNYS
FGNNIKINNVDYTETNGQTHKGSSSFKKALTIGNMGDEKANTIEWWHFSKGWNEGLGDTK
NIDEFRLVDDIDFSGNQGNGVEGKDWQNYANYCIDGLGCTSMIVGSTDTNAFTKTFNGQG
YALKNINMDITTLEDKSEYTYIGIFGNSDGANFKNINIDYMNGKIQKQKNVNDGWRYIGG
FIGKSNNSFFEYISLSNIESISNSNRDDNSVVGGFIGSASGTFSNISLNNIRNIENSADD
TWTGGFAGSTLGTFSNISLNNIENISSYSDYGMYGGWSRAGGFAGTTNGTFSNISLNNIK
NISSRGGNYGNKYGNSYAGGFVGESYNSDFDNISLNSIEKITAYGAWGGYAGGFAGGVGY
PYRASFSNIFIYFNPNITLNARKDSSGKLFGKLFLSHNAFLDNIHIYHSDKDLHSATADQ
NYWGSTSNEIQIHTYDDSTQNNAYKDFLSKADTIQKPILPSKPIDPDNPDSDVILSSDDL
YQDTITNEIIADIISKKYNIPIYLLLDMLEDRLNYFNMNENQKVEFVAKYFLGGDKTQAL
EVIQSLNFILAYENNGLSTASKDKFKENGFIAKEEILKQTSNTAKNINDKINQLDNELKS
LVISSDKYLKDLIVKQNKLNEIIKAYNNYVALINKGLANESDPEFITLKNQIDVLMKDSQ
ILADLINENQKELSIWQNNNNTENFKVVGAFANVILNTNPKLDQITEEGGGGEDPNKPEL
PDNDLEFEQTASFNLIGDETVEEEKEEKEVEETAMMQKNRTCIVSDNFKTMNPCAVGGL
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacatacaaactctcaaatcatataatactttcaggtataacagtatcaatgctt
ttttctccactaatggctttacctagtggaggtaaatttactcatggaactagtggaagt
ataagtactagtggtaataatatgaatattatgggcaatggaacaaactcagtcatacaa
tggggtggaggatttaatataggcaagaatgagcaagtaaacttcaatggctcgaataaa
aactacttaaatattgctcatggtactagtaaatctactatagaaggtatattaaatgca
agtggcaacaatgtgtttttaattaatcctaatggagtaatcattactaaaacaggaacc
attaacgctaatcgctttgtagcttcaacttcttctatgagtgatgataatatgaaagca
tttgctaacttaaaaagctttgatgagggtttaagcttttcccctgtatttaaaccacac
aaagcaggtaatgtagtaaatatgggtaatattaatacaaatgatgtgttgcttatagga
aataaggtagatatacaaggtggtaggttaggtaatgaaaaatctaaaacacatttagtg
gggaatgaagtttttgtggatgcagatagtgtaaaattaagctctaccattaatgtaaca
gccttaaaaggtggttatatacaaagacaaatgataaattttgctaataataactatagt
tttggaaataatataaaaataaataatgtagattatacagaaactaatggacaaacacat
aaaggaagttctagtttcaaaaaagccttaactataggaaatatgggagatgaaaaagct
aatactatagaatggtggcatttttcaaaagggtggaatgaaggtctaggtgatactaaa
aatattgatgaatttagattagtagatgatattgattttagtggtaatcaaggtaatggt
gtggaaggtaaagattggcaaaactatgctaattattgtatagatggtcttggttgtact
tctatgatagtaggtagtactgatactaatgcctttactaaaactttcaatgggcaaggt
tatgctttgaaaaatatcaatatggatataaccacactagaagacaaatctgaatataca
tatataggaatttttggaaattctgatggtgctaattttaaaaatataaatattgattat
atgaatggtaaaattcagaaacaaaaaaatgtaaatgatggttggcgttatattggagga
tttattggcaaatcaaataactcattttttgaatatatttctttaagcaatatagaaagt
attagcaattccaatcgtgatgataattctgttgtaggtggttttatcgggagcgcttca
ggaacattttccaatatatctttaaataatatacgaaatatagaaaattcagcggatgat
acctggacgggtggtttcgctggaagtacactaggaacattttccaatatatctttaaat
aatatagaaaatattagtagttatagtgattatggtatgtatggaggatggtctagagca
ggtggtttcgctggaaccactaatggaacattttctaatatatctttaaataatataaaa
aatatcagtagtcgaggtggcaattatggtaataaatatggtaattcttatgcaggtgga
tttgtaggtgaatcttacaattctgattttgataatatatctttaaatagtattgaaaaa
attactgcttatggcgcttggggaggttatgctggaggatttgctgggggtgtaggttat
ccatatagagcaagtttttcgaatatatttatatattttaatccaaatattacattaaat
gcacgaaaagattctagtggtaaattatttggaaaactttttcttagccataatgcattt
ttagataatatccatatttatcattctgataaagatttacatagtgcaactgctgatcaa
aattattggggtagtactagtaatgaaattcaaattcatacttatgatgattctactcaa
aataatgcttacaaagattttttatctaaagcagatactatacaaaaacctatattacca
tccaaaccgatagatcctgataatcctgattctgacgttattttaagtagtgatgattta
taccaagatacaattactaatgaaatcattgctgatatcattagtaaaaaatataacatt
cctatttatcttttattagatatgctagaagatagattaaattactttaatatgaatgaa
aatcaaaaggttgaatttgtagctaaatatttcttaggtggtgataagactcaagcttta
gaagtgattcaaagtttaaattttattttagcttatgaaaataatggtttaagcactgct
tcaaaagataaatttaaagaaaatggttttattgcaaaagaagaaatattaaaacaaaca
agtaatacagctaaaaatatcaatgataagatcaatcagctagataatgaattaaaatca
ctagtaattagctcggataaatacctcaaagatctcattgttaaacaaaacaagcttaat
gaaattattaaagcttacaataactatgtagcattgattaataagggattagcaaatgaa
agcgatccagaatttattacattaaaaaatcaaatagatgttttaatgaaagatagtcaa
attttagcagatttaatcaatgaaaaccaaaaagaattatctatttggcaaaataacaac
aacacagaaaatttcaaagtagttggtgcttttgcaaatgttattttaaacactaaccca
aaactagatcaaatcacagaagaaggtggaggtggagaagatccaaataaaccagaactt
cctgataatgatttagaatttgagcaaactgcttctttcaacttaataggtgatgaaact
gtagaagaagaaaaagaagaaaaagaagtagaagaaacagcaatgatgcaaaaaaataga
acttgtatagtaagtgataattttaaaactatgaatccttgtgctgttggaggattataa
DBGET
integrated database retrieval system
