Campylobacter lari RM16712: UPTC16712_1334
Help
Entry
UPTC16712_1334 CDS
T03556
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA polymerase I, 5' --> 3' polymerase, 5' --> 3' and 3' --> 5' exonuclease
Organism
clm
Campylobacter lari RM16712
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_pol_A_exo1
RNase_H_2
DUF5069
DNApol_Exo
CAF1
NYN_YacP
HHH_5
PDDEXK_15
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJD06832
LinkDB
All DBs
Position
complement(1321307..1323946)
Genome browser
AA seq
879 aa
AA seq
DB search
MKTLTIIDTFGFFFRLFYALKGLKNSKGEPSNMISGFANFIYSLKNEHPSDMIIFALDSK
GKTFRSEIDPNYKINRTPPPPDLLAQIPICIQMIEKMGFSSFSCEGYEADDIIASLVKEC
ENKDIFIRIITQDKDLYQLIKDNKVSIYSPISKNDYNEAGCLEKYGVKPSQIRDFLALCG
DSSDNIPGVKGIGAKGAKNLLDEFESIEGIYENLTLVRNERSRNLLLEGKENAFLSKKLA
SLYENLDVKDMLLNCEYPKDEPLLKIMDVLEYYELNALLKRLRTNPTNKDKNLGFNARLI
LDEKELFEILEKIDNQSIVAFDTETTGLDTKEAKIVGFSFCFHESEAFYVPLVHDYLGVC
KQISMQVAKRGIEKIYQSTVIGHNLKYDFEIIKNNFNLLPPKNYADTMILAWLKEPSLRV
NMDDLAKRLFDYETLHFEDLVKKGESFAGVDVEKACKYAAEDAYITLRFYLYFLKNLEKP
LFELAQKSEFEFIKVLIMMENNGIKLDTQKLENLMQSFNQDIKILSEKIYDLAGEKFNIN
SPKQVGDILFEKLKLPSGKKSKTGYSTDEKVLNAILDNHLIVKEILAYRELAKLVSTYCE
PLLKLAKKDENSRIYSSFLQTGTATGRLSSKDPNLQNIPAHGQYAKDYKSCFVAKEGFSF
ISLDYSQIELRMLAHFSEDEKLLEAFSNNEDIHAKTAIMIFNRSDYETRSIAKSINFGLI
YGMGYKTLSQNLKIEAKLAKEYIEKYFENFTSIKTYFEKVKNEAKQNGFIKTLLGRKRYF
DFENAKPMQVAMYERESINSTLQGSAADIIKLAMIEIAKDLDENKRLILQIHDELIFEVK
DELCEEFAKNASDIMENIVKLKVKLKTSSSIAKNWGALK
NT seq
2640 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaactttaaccataattgatacttttggctttttctttagacttttttatgcttta
aagggtttgaaaaattcaaaaggcgaacctagtaatatgattagcggttttgctaatttt
atttatagtttgaaaaatgaacatcctagtgatatgattatttttgctcttgatagtaaa
ggaaaaacttttagaagtgaaattgatccaaattataaaatcaaccgtactccacctcca
cctgatttattagctcaaattccaatttgcattcaaatgatagaaaaaatgggtttttca
agtttttcttgcgaaggctatgaggctgatgatatcatagcatctttggttaaagagtgt
gaaaataaggatatttttataagaattatcactcaagataaagatttgtatcaacttata
aaagataataaagttagtatttatagtcctatttcaaaaaatgattacaatgaagcagga
tgtttggaaaaatatggggtaaaacctagccaaataagagattttttagctctatgtgga
gatagctcagataatatcccgggggtaaaaggaattggcgctaagggtgctaagaattta
cttgatgagtttgaaagtattgagggaatttatgaaaacttaacactagtgcgtaatgag
agaagtcgtaatttgttgcttgaaggcaaagaaaatgcctttttaagcaaaaaacttgct
tctttgtatgaaaatttagatgtaaaagatatgcttttaaattgtgagtatccaaaagat
gagcctttgcttaagattatggatgttttggagtattatgaattaaatgctttgttaaaa
agactacgtactaatcctactaataaagataaaaatttaggatttaatgcaagattaatc
ttagatgagaaagaattatttgaaattttagaaaaaattgataatcaaagtattgttgct
tttgacactgaaactacgggcttagataccaaagaagcaaagatagtagggtttagtttt
tgttttcatgaaagcgaagccttttatgtgccacttgtacatgattatttaggggtttgt
aagcaaatttctatgcaagtggctaaaaggggtatagaaaaaatctatcaaagcacggtt
ataggacataatcttaaatatgattttgagattataaaaaataattttaatttacttcct
ccaaaaaactatgctgatactatgatacttgcatggcttaaagaaccaagtttgcgtgta
aatatggatgatttagcaaaaagattatttgattatgagactttgcattttgaagatttg
gtaaaaaaaggagaaagctttgcaggagtggatgtagaaaaagcttgtaaatatgcagct
gaggatgcttatatcactttaagattttatttgtattttttaaaaaatttagaaaagcct
ttatttgagcttgcacaaaaaagtgagtttgaatttatcaaagtgcttattatgatggaa
aataatggcattaagcttgatactcaaaagcttgaaaacttaatgcaaagttttaatcaa
gatatcaaaatacttagtgaaaaaatatatgatttagcgggtgaaaaatttaatatcaac
tctccaaaacaagtaggggatattttatttgaaaaactaaaactaccaagtggtaaaaaa
agtaaaacaggttattctaccgatgaaaaggttttaaatgctattttagataaccatctg
attgtgaaagaaattttagcttatagagagcttgcaaaattagtttctacttattgtgaa
cctttgttaaaattagctaaaaaagatgaaaactcaagaatttattcaagctttttgcaa
acaggaacagctactggacgactttcatcaaaagatccaaatttgcaaaatatccctgcg
catggtcaatatgctaaagattataaatcctgttttgtagcaaaagaaggatttagtttt
atctcacttgattattcacaaattgagcttagaatgctagcgcattttagtgaagatgag
aaattactagaagcgttttcaaacaatgaggatattcatgcaaaaactgctattatgatt
tttaatcgtagtgattatgagacaaggagtattgctaaaagtataaattttggtcttatt
tatggtatgggttataagactttgagtcaaaatttaaaaatagaagcaaaattagccaaa
gaatatattgaaaaatattttgagaattttactagcattaaaacttattttgaaaaggta
aaaaatgaagctaagcaaaatggttttataaagactttactaggccgtaagcgttatttt
gactttgaaaatgcaaagcctatgcaagttgcaatgtatgaaagagagagtattaactct
acacttcaaggttctgctgccgatataataaaacttgcaatgatagaaattgcaaaagat
ttagatgaaaataaacgcttgattttacaaattcatgatgagcttatttttgaagtaaaa
gatgaactttgcgaggaatttgcaaaaaatgctagtgatattatggaaaatattgtaaaa
ttaaaagttaaattaaaaacttcatcaagtattgccaaaaattggggcgcattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
