Clostridium sp. MD294: C820_002430
Help
Entry
C820_002430 CDS
T10174
Symbol
rcsC_3
Name
(GenBank) Sensor histidine kinase RcsC
Organism
clod Clostridium sp. MD294
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Response_reg
HATPase_c
HisKA
Hpt
cREC_REC
HATPase_c_2
PDDEXK_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USF30984
UniProt:
N1ZIT9
LinkDB
All DBs
Position
2466542..2469685
Genome browser
AA seq
1047 aa
AA seq
DB search
MKKCRILAWFTFLLLFVSMVISVKQFQKEEINPFINSIQYSFNEDWHMVSLDNTGVWFQT
YDDMQEIVRDAFATGNYQKVNLPYKGKSKPNDIIVFQTIILEEDTDLLRFTSIDTAVCVF
LDGKLLYKYGFEPDGTPKEITGESEHIVNIPNQFENGELWIVQTSLYPNAASILDYVNLN
TQDTVTINVFGNKITDVGCCLLIILSAFLMLLLELIRRYTHQLTKGELYIALVCIAAGIS
CFIATDTLSIFYNIHEAYTLQEYFPLMISLFLAMYFECVLSTIYPHRYTILLLFVVFSVL
LQLLFNVLGVQTIEDMVLFPVFTIVIVCTVSIVGLLQFYYKHRYFQTLLVIGAIFIMFFG
SIINIIFPNVNGNIIYHIYQYSMTAFSIIMAAAHILQLSQEYQKNVEKNARLLEEEIKVI
EQQNIQLTLAKQDADTARREALAANEAKGKFLAHMSHEIRTPINAVLGMDEMILREAKQA
TIKEYAMDIYTAGQTLLSLINDILDFSKIESGKMEIVPVTYDISSMIHDLVNMTTQRAKN
KNIKFEVNIAPEIPCQLYGDDVRIRQVLTNILTNAVKYTHEGTVWLRVKCSQINDVAILT
FEVEDTGIGIKEEDLPKLSAEFERIEEDKNRNIEGTGLGMSITIQLLALLGSKLHIESIY
GKGSKFFFELKQNIVDNTPIGNFEFRVQQMTQDYHYKTKLYAPDAKILVVDDNAVNRRVL
RNLLKETGIQITDAESGTQCLELVQKNYYDLIFIDHMMPDMDGIETLHRIKTFEDFPCQN
TPIVVLTANAITGAREQYLSEGFDDFLSKPIVPEKLENLIKNILPEQLLAEAISQQEYNY
SPSEFLEELPPVDGLDWQYTWIHLPDKKLLEYTINEFYAQIDFAADRLEQLYEQITEVEQ
MEQYRIQVHAMKSLAATVGILTLAGVAKLLEDASRECNIETIASITPIFLSEWRSYRQKL
QGVFDIGKTVRLQVNDISIILALLEMVRLSMQELDIDKADQLMEQLQNYAYSDDVEQNIK
KLSEAVTNLDATKVNTYVELLMKQLKQ
NT seq
3144 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatgtcgaatattagcatggtttacatttctattattatttgtatctatggtc
atatcagtaaaacaatttcaaaaagaagaaataaatccatttataaattcaatacaatat
agttttaacgaggattggcatatggtttcgctggacaacactggagtatggttccaaaca
tatgatgatatgcaagagatagttcgtgacgcatttgcaacaggaaattatcagaaagtc
aatcttccatacaaaggaaaaagtaaacctaatgatattattgtttttcaaaccattata
ctagaagaagatactgacttactgcgatttacctctatagacacagctgtatgtgtattt
ttagacggaaaactactttataaatatggatttgaaccagatggaacaccaaaggaaata
actggagaaagtgagcatattgtaaatattccaaatcaatttgaaaatggtgagttgtgg
attgtacaaacatcactctatccgaatgctgcatcaatacttgactatgtgaatttaaat
acacaagatactgtgacaattaatgtatttggaaacaaaattactgatgtggggtgttgt
ctactaattatactctcagcatttcttatgttattgctggaattaattagacgatataca
catcaacttacaaaaggagagttatacatagcacttgtttgcatagcagcaggaattagc
tgctttattgcaacagatacattatctattttttataatatacacgaagcatatactctg
caggaatattttcctttgatgatttctttgtttttagcaatgtattttgagtgtgttttg
agtacaatatatccacaccgttatacgatattactattatttgtagtgtttagtgtatta
ttacaacttttattcaatgtgttaggtgtgcaaacaattgaagatatggttttgtttcca
gtatttacaatagtaatagtctgtacagtgtctattgtaggattattgcaattttattat
aaacacagatactttcaaacattgcttgttattggggcaatttttataatgttttttggt
agtattataaatattatttttccaaatgtaaatggtaacatcatttatcacatttatcag
tacagtatgactgcgtttagcattataatggcagctgctcatattctgcaactttcacag
gagtatcaaaaaaatgtagaaaaaaacgcacgtcttttagaggaagaaataaaagtgata
gagcagcagaacatacagcttactcttgcaaaacaagacgcagatactgcacgacgtgag
gcattagctgcaaatgaagcaaaaggaaagtttctagcacatatgtcccatgaaatccgt
acgccaatcaatgctgtacttggtatggacgaaatgattttacgtgaagcaaaacaagcc
actattaaagagtacgctatggatatttatacggctggacaaacattattgtccctaatc
aatgatattttggatttttcaaaaattgagtcaggaaaaatggaaattgtaccagtaaca
tatgacattagcagtatgatacatgatttagtaaatatgaccacacaacgagcaaaaaat
aaaaatattaaatttgaagtaaatattgctcctgaaattccttgtcagctatatggagat
gatgtacgtattcgtcaggtattaaccaatatactaacaaatgcagttaaatatactcat
gagggaactgtatggttacgagtaaaatgttctcagataaacgatgtagcaatacttaca
tttgaagtagaagatacaggcattggaataaaagaggaggatttaccaaaactttctgca
gagtttgaacgaattgaggaagacaaaaatcgaaatatagaaggtactggtcttggtatg
agtatcacaattcagcttctcgcactgttaggtagcaaactccatattgagagtatatat
ggaaaaggttcaaaattcttttttgaactaaaacaaaatattgttgataatacaccaata
ggaaattttgaatttagagtacagcaaatgacacaggactatcattataaaacaaaactc
tatgcaccagatgcgaaaatattggtggtagatgacaatgcagttaatcgtcgagtactg
cgaaatcttctaaaagaaacaggtattcaaataactgatgctgaaagtggtacacagtgc
ctagaactagtacaaaaaaactattatgatttgatttttattgaccatatgatgccagat
atggacggaatagaaacattacatcgtataaaaacattcgaggattttccatgtcaaaat
acaccaattgttgtactaacagcaaatgcaattacaggagcaagagaacaatatctatca
gaaggctttgacgattttctttcaaaacctattgtgccagaaaaacttgaaaatttgata
aaaaatatattaccagagcaattattagcagaggctatatcacaacaagaatataactat
tcaccatcagaatttttagaggaacttcctccagtagatggattggactggcaatataca
tggatacatctaccagataaaaagttattagaatatacaataaacgaattttatgctcaa
attgattttgccgcagaccgtttagaacagttgtatgagcaaattacagaagtggaacaa
atggagcagtatcgtattcaagttcatgcaatgaaaagccttgcagctacagtaggaatt
ttaacgcttgctggtgttgctaaattattggaagacgcatcacgagagtgtaatatcgaa
acaattgcgtccattacacctatttttttatcagaatggcgtagttatcgtcaaaaattg
caaggagtgtttgatatagggaaaacagtacgattgcaagtaaatgatatttctattata
ttagcactgttagaaatggttcggttgagtatgcaagagttagatattgataaagcagac
caactaatggagcaattgcaaaattatgcgtattcagatgatgtagaacaaaatatcaaa
aaactgtctgaggcagtaactaatctggacgcaactaaagtaaatacctatgtagaatta
ttaatgaaacagttaaaacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
