Clostridium sp. LQ25: ONV75_11050
Help
Entry
ONV75_11050 CDS
T10526
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
clol Clostridium sp. LQ25
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
DEAD
ATC_hydrolase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UZT05124
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2391111..2394293)
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MKISDLENIIIRNTSKINMTRGKKLLDDKAFTIDVHKVDNFYNIYGNFKSENNFKKCNPH
LRIDMKNKKISFTKCNCNIFEGGELENKIYMCEHLVAAAMKFVEGIKKKLALKRIEEERI
DKKIIKELENIYLIHSDEKEKVFDKKEKLVLNVSIKQVKEESSNDFDVSIYIGNTHMYPI
LNIKNCVCSIIKDEEYCIGKGLVYDKNKYYFSESDEQFIKYIYEIILISRNNESTSFIRI
SSELLKKFLEKLNNKKIKFNYNYQSYTSVILNSDLPLTFTMKKINGDYVLSTKKILPIPL
SKNRDIFLYDRNIYIPSLKQVDLYRILYKYIKEDKKIIFKSDINNSEFGVLNKVLTSISQ
NIFYDEAIISKMNEDVRINFNFSRKKGKSVCDVIIKNNIIDMNYSEAIKINNDKFNFSKK
LMNIESILNKYRFYYRNENFEFLGDDEEYYLFLKNGIDEIKSIGTIFTERSYIDYFKLNN
GRFKDLSIKENSKGMYEFYMQFENISPYELNDVVKAYKEKKNFIKLDNNIYVDLKSKEIE
KIMKIIDTLNLDIMSGKDKFYLSIDKLYYLKDKIEDDQIVFKNREKILDLIDALHKKQDN
VYEIPKNLKCNLRDHQIEGYNWFKNLSDLGLGGILGDEMGLGKTIQTIAFLASEKNGTSM
VVVPTSLLYNWSDEFKKFIPGLKVCIINGEKKEREKNIENYCDYDVLITTYGLIKNDINL
YENIEFKNIILDEGQNIKNYKAQITTTVKKLKANNRFILTGTPIENNLNELWSLFDFIMP
GYLYTYKVFNEKFVKNESNLEELKILIKPYILRRTKKEAAGEMPEKYEKKILVNMPKEQK
DVYDACVKEIQDKINSEKMNNITIFSFLTTLRQLCLDPSLVTNEYNGESGKFNEVLNIIN
KDQKENKILLFSQFTKALKKLALKLDKEKIQYCYLDGSISSAARIKLVEEFNNDKNKRVF
LISLKAGGTGLNLTSANMVIHFDPWWNPSIEDQATDRAHRIGQKRDVEVIKLISKGTIEE
KIVLLQEDKRNLINDVLTNELNDSEVFNLVTNSELINLLK
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaatatctgatttggaaaatataattatacgaaatacatctaaaataaacatgaca
agagggaaaaagttattagatgataaagcattcactattgacgttcataaggtagataat
ttttataatatttatggtaattttaaaagtgagaataattttaaaaagtgtaatcctcac
ttaagaatagatatgaaaaataaaaaaatatcttttacaaaatgcaactgtaatatcttt
gagggtggcgagttagaaaataagatttatatgtgtgaacatctagtggcagcagcaatg
aagtttgttgaaggaataaagaaaaaattagctctaaaaagaattgaagaagagagaatt
gacaaaaaaataataaaggaattagaaaatatatatttgattcacagtgatgagaaagaa
aaggtatttgataaaaaagaaaagcttgttcttaatgtatcaataaaacaggtaaaagaa
gaaagtagtaatgattttgatgtgagtatatatattgggaatactcatatgtatccaatt
ttaaatataaaaaactgtgtatgttcaattataaaagatgaagagtattgtataggaaaa
ggtcttgtttatgacaagaacaagtattattttagtgaaagtgatgaacaatttattaaa
tatatatatgaaattatattaattagtagaaataatgaaagcacaagttttataagaata
tcttcagaattattgaaaaaatttcttgaaaaattaaataataagaagattaaatttaac
tataattatcaaagttatacaagtgtcatattaaattctgatctaccattaacatttact
atgaagaaaataaatggagattatgttctaagtactaagaaaatacttccgataccttta
agtaaaaatagagatatatttttatatgatagaaatatatatattccctcattaaaacaa
gtggatttatataggattttatataaatatataaaagaagacaaaaaaattatttttaag
agtgatataaataatagtgagtttggtgtattaaataaagtattaacatctatatctcaa
aatatattttatgatgaagcaataataagtaaaatgaatgaggatgttagaattaacttt
aatttttcaagaaaaaaaggaaaatcagtatgtgatgtaataatcaaaaataatattata
gatatgaactattctgaggctattaaaataaataatgataaattcaatttttcaaagaaa
ttaatgaatattgaaagtattttaaataaatatagattttattatagaaatgagaatttt
gaatttttaggagatgatgaagaatattatttgtttttaaagaatggaatagatgaaata
aagagtataggaactatatttacagaaagatcatatatagattactttaaattaaataat
ggaagatttaaggatttatcaattaaagaaaattcaaaaggaatgtatgaattttacatg
cagtttgaaaatatatcaccatatgaacttaatgatgtagtaaaagcatataaagaaaag
aaaaattttataaaacttgataataatatatatgttgacttaaaaagcaaagagattgaa
aaaattatgaaaattatagatactttaaatctagatattatgagtggaaaggataaattt
tacctttcaattgataaattatattatttaaaagataaaatagaagatgatcaaatagta
tttaagaatagagaaaaaatactggatttaatagatgcacttcataaaaaacaagataat
gtctatgaaatacctaaaaacttgaaatgtaatttaagagatcatcagattgaaggatat
aattggtttaaaaatcttagtgatcttggtcttggaggaatacttggagacgaaatgggt
cttggaaaaactattcaaacaatagcatttcttgcttcagagaaaaatgggacttccatg
gttgtagtaccaacttctcttttatataattggagcgatgaatttaaaaaatttattcca
ggtttgaaagtttgtattatcaatggtgagaaaaaagaaagagaaaaaaatattgaaaat
tattgtgattatgatgttttaattactacttatggattgattaaaaatgatattaatctt
tatgaaaatatagaattcaaaaatataatattagatgaaggtcagaatattaaaaattat
aaagcacagataaccactacagtaaaaaaacttaaagctaataatcgattcattcttaca
ggtacaccaatagaaaataatcttaatgaattatggtcattatttgatttcattatgcca
ggatacttatatacatataaagtgtttaatgaaaagtttgtaaaaaatgaatccaacctt
gaagaacttaaaatactaataaagccatatatactaagaagaaccaaaaaagaagcagcg
ggagaaatgcctgaaaaatatgagaaaaaaatattggttaatatgccaaaagaacaaaaa
gatgtttatgatgcttgtgttaaagaaatacaagataagattaatagcgaaaaaatgaat
aatataacgatcttttcattcttaacaactcttagacaattatgccttgatccttcatta
gttactaatgaatacaatggagaaagtggtaaatttaatgaagtgttaaatatcataaat
aaagatcaaaaagaaaataagattctgttattttctcaatttacaaaggctctcaagaaa
ctagctttaaaactagataaagaaaaaatacagtattgctatcttgatggtagcatatca
tcagcagctagaattaagcttgtagaagaatttaataatgataagaataaacgagtattc
ctgatttctttaaaagcaggtgggacaggattaaatcttacaagtgcaaatatggttatt
cactttgatccgtggtggaatccatcaatagaagatcaggcaacagatcgtgcacataga
ataggtcagaaaagggatgttgaagtaattaagttaatatcaaaaggaaccatagaagaa
aaaatagttcttcttcaagaagataaaagaaatctaatcaatgatgtattgacaaatgaa
ttaaatgatagtgaagtattcaatttagtaacaaatagtgaattgattaaccttctcaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
