Clostridium sp. MF28: AXY43_01180
Help
Entry
AXY43_01180 CDS
T11014
Name
(GenBank) helicase
Organism
clom Clostridium sp. MF28
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2_assoc
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
ERCC3_RAD25_C
SWIM
SWI2_SNF2
GatB_Yqey
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVK46746
LinkDB
All DBs
Position
complement(290621..293878)
Genome browser
AA seq
1085 aa
AA seq
DB search
MIKQILLEGFNKNITNSSLTKGQRVLKNDLLREINVKVDKDYIKINSTVVSESLLSEYSC
KLEIDNMTKEIIGTHCSCLDFEKNEFSRDNYCCKHIIATFYTFLRNIDEDEELRTKLNNN
LSLKDNKARIKENSNDDLLSLLVGDTDKEKLKFEVIINKNNWSSKLQIEFKIGLRKSNKM
YIVKDINQFLTCVYNKVPIKYGKEFIFDIKTQSLSYEDRRLIKFMNNIKNLADHDRNFRR
YQDKFIEGKTLTIPDMMFKEFLYIIKKNRVFLGDGFFYRILESEIIEGDMPIPFALLSKN
NNIILEAPNGIPESLTQDEDVFLFGTSIYIPSIEQCERLSPYLKIFNATNKVSFNKINES
RILKELIPSIQKVTNDLVLSKDIREKVVIAPVIFRFYFDKDKDISLLFKVSYEGHEFNFF
EEYKDKIIYRDTNKEYEVLGVLKSLGFEEVNGRLFFLRDDDEAFKFFKYEIEKLQRYGEV
FYSERFKGIKDIKKSDFVGEVRKGKFNYFEFEFKISDISPEETAKILRSFRDNLKYYKLE
NGEFLDLEDEALKESLTLIDNLLLEEKLNENLINVPINKGAYLEDYLEDKELRYINSCDE
IKDLKERLSNIKDKAFQPPYGLQAKLRKYQKEGYNWLRTLDYLGFGGILGDEMGLGKTLQ
TITLLLSKPDSKTLIIAPTSLTYNWKNEFNKFAPSMKIAICNGVKEEREELINNYKEYDV
ILTTYNLLRRDIELYNMNFDYCILDEAQNIKNQSSLSSKSVKEIKARIRFALTGTPIENS
LMELWSIFDFIMPGYLYNEKKFVTRYHRRLEEGPEILEELNRLVKPFILRRYKKNVIKEL
PDKIEKRLLVPLSDEQKVVYETYANYTKDLIQKKVEDFEFSKSKIEILAYITKLRQICLD
PSVTMDNYLGSSGKIDALIELLEQSIDEGHKILVFSQFTSVLKNISKILKEKNFLFSYLD
GSVSSINRMKMVEEFNNGENTVFLVSLKAGGTGLNLTSADIVIHFDPWWNPAVEDQATDR
AHRIGQKNVVEVIKLIAQGTIEEKIVELQDSKRELINKILGDDLSVGEFIHSLNENEILE
LFNYN
NT seq
3258 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgataaaacaaattttactagagggttttaataagaacataacaaattcatctcttaca
aaaggtcaacgtgttctaaaaaatgatttgttaagagaaataaatgttaaagtagataaa
gattatataaaaataaactcaactgtagtttcagaaagccttctaagtgaatattcgtgt
aagcttgaaattgataatatgactaaagaaattataggaacccattgtagttgtctagac
tttgagaaaaacgaattttctcgtgataattactgttgtaaacatataatagctactttt
tatacattcttaagaaatattgatgaagatgaagagttaagaaccaagttaaataataat
ttatctcttaaagataataaagctagaattaaggagaattctaatgatgatttattatct
ttacttgttggggatacggataaggaaaagctaaaattcgaagttattattaataaaaac
aattggtcctctaaacttcaaatcgagtttaaaataggattaagaaaaagcaataagatg
tatatagttaaagatattaatcaatttttgacatgcgtttataataaagtaccaattaag
tacggaaaagaatttatttttgatataaaaactcaaagtctttcttatgaagatagaaga
ttaataaaattcatgaataatataaaaaatttagcagatcatgatagaaattttagacgt
tatcaggataagtttatagaaggaaagacccttacaattcctgatatgatgtttaaagaa
tttttatacattataaaaaagaatagagtttttttaggcgatggattcttttatagaata
ttagaatctgaaataatagaaggggatatgcctattccatttgctttattgagtaagaat
aacaatataattttagaagctcctaatggaataccagaatcattaactcaagatgaagat
gtattcttatttggtacttccatatacattccatcaatagaacaatgtgagagattatcg
ccatatttaaaaatatttaatgctactaacaaagttagtttcaataagatcaatgaaagt
agaattttaaaagaattaataccttcgattcaaaaagtaacaaatgatttagttttatct
aaggatattagagaaaaagttgtaatcgcgcctgtaatcttcaggttttattttgataaa
gataaggacatttcgttgttatttaaggtatcatatgaaggacatgaatttaattttttt
gaagaatacaaagataaaattatttacagagatactaataaagaatatgaagttttagga
gtattaaaaagtcttggatttgaagaagtcaatggaagattattctttttaagagatgat
gatgaggcttttaaattctttaaatatgaaatagaaaagctccaaagatatggtgaggta
ttttattctgagagatttaagggaataaaagatattaagaaatcagattttgttggagaa
gttagaaaaggtaaattcaactattttgagtttgaatttaaaatttctgatatatctcca
gaagaaactgcaaaaatacttagaagctttagagataacttgaaatattataagcttgag
aatggagaattcttagacctagaagatgaagcattgaaagaatcattgacccttatagat
aatttacttttagaagagaaattaaatgagaatctcattaatgttccaattaacaaggga
gcttatcttgaagattatttagaagacaaagagttaaggtatataaatagttgtgatgaa
attaaggatcttaaagaaagattaagtaacattaaagataaagcctttcaacctccatat
ggacttcaagctaaacttagaaagtatcaaaaagaaggctataattggcttagaacttta
gattacttagggtttggtggaatacttggtgatgaaatgggacttggaaagacactgcaa
acaataacattattgctttcaaagccagattcaaaaactcttattattgcacctacttct
ttaacctataattggaaaaatgaatttaataaatttgctccatcaatgaaaattgctatt
tgcaatggggtaaaagaagaaagagaagaattgattaataactataaagaatatgatgta
atcttgactacctataatttattgagacgtgacatagaattatataatatgaattttgat
tactgtatcttagatgaggctcaaaacataaagaatcaatcttctttaagttctaagtca
gtcaaggaaataaaagcaagaataagatttgcgttgactggaacaccaatagaaaattca
ttaatggaattatggtcaatatttgattttataatgccagggtatttatataatgagaag
aaatttgtaactagatatcataggaggcttgaagaaggaccagaaattcttgaagagtta
aatagacttgtaaaaccatttattcttagaaggtataagaagaatgtaattaaagaatta
cctgataaaattgaaaaaagacttcttgttcctttaagtgatgagcaaaaagtcgtatat
gaaacctatgctaactatactaaagatttaattcaaaagaaagtcgaagattttgagttt
agtaagagcaaaatagaaattttggcttatataactaagcttcgtcagatatgtttagat
ccgtctgtaactatggataattacttgggaagtagtggaaaaattgatgcattaattgaa
ttattggaacaaagtatagatgagggacataaaatattagtattctcgcaatttacttct
gtattaaagaatataagcaaaatacttaaagaaaaaaatttcttattttcatatttagat
ggatcagtttcatcaatcaatagaatgaagatggttgaggaatttaataatggtgaaaac
actgtattcttagtatccttgaaagctggtggtacggggctgaatttaacaagcgcggat
atagtgatacattttgatccatggtggaatcctgcagttgaagatcaagcaactgataga
gcacatagaattggtcaaaaaaatgtagtagaagtgattaagttaattgcccaaggaact
atagaagaaaaaatagtggaattacaggattccaaaagagagctaataaataagatttta
ggtgatgatttatccgtaggagaattcatacattcgttaaatgaaaatgaaattttagaa
ttatttaattataattaa
DBGET
integrated database retrieval system
