Clostridium sp. MF28: AXY43_10580
Help
Entry
AXY43_10580 CDS
T11014
Name
(GenBank) hybrid sensor histidine kinase/response regulator
Organism
clom Clostridium sp. MF28
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
Response_reg
PAS_9
HisKA
PAS
PAS_8
PAS_4
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_3
PAS_7
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVK48445
LinkDB
All DBs
Position
complement(2462366..2464072)
Genome browser
AA seq
568 aa
AA seq
DB search
MKFVINKDKLRELNKTDSKDKKYTILLIDDELANLEALTRLLEEEYDVIKAENGFEALNI
LKDESCSKKINLIISDQRMPGMTGVELLKQTISIVPNAIRIILTGFMDVKDIIDSINEGH
IYKFLLKPLEADELLISVKRALETYELKMKNIKLIDELKQTNKKLKKSEVYLSTIFNSVS
DAILIHDFNGIIVNVNDTANRLYGYLHDELIGMSIKDIISKNSPYIYDDILKLINDRKKN
KINTPVTLEAISIDKNHKEFWVESNSRAIIFNEQKAIIATVRDITERKNTELKSKEEALE
LEKLRTEFFANISHELRTPLNIILGVIQILRRDLLDKEKPIDKGKIINNIDIERQNCFRL
LRLINNLIDSTKLDAGHFQIDMINCNIVSVVEEITLSVAGYISNNNINLIFDTDVEEKII
ACDPDKIERIMLNLLSNCIKFTDDDGSIFVNIFDGEEYITLSVEDTGIGIPEEKVEIIFD
RFRQVDKSFTRNYEGSGIGLSLVKSLVEMHDGTISVESKYGVGTKFTIKLPVKVLNKSKE
RVNISNNIINTCVEKINIEFSDIYKQHL
NT seq
1707 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttgttataaataaggacaagcttagagaacttaataaaacagatagtaaagat
aaaaaatatacaatactattaattgatgatgaactagcaaatcttgaggctttaacaaga
ctcttagaagaagagtatgatgtaatcaaagcagaaaatgggtttgaagcattaaatata
cttaaagatgaatcatgttctaaaaaaatcaatttgattatctcagatcagcgcatgcca
ggaatgacaggggttgaattattaaagcaaacaatatctattgtcccaaatgcaattcgt
attattttaactggattcatggatgtgaaagatattattgattcaattaatgaagggcat
atttataaatttcttttaaagccattggaggcagatgagttgttaatttccgtaaaaagg
gctttggagacatatgaattgaaaatgaaaaatattaagcttatagatgagttaaagcaa
acaaataagaaattaaagaaaagtgaagtttacttaagcactattttcaattcggtaagt
gatgcaatattgattcatgattttaatgggattatagttaacgttaatgatactgctaat
aggctatatggatatctacatgatgaactaattggtatgagtataaaagatattatttca
aaaaattcaccgtacatatacgatgatatacttaaattgattaatgatagaaagaaaaat
aagattaatactccagtaacccttgaagctatttcaatagataaaaatcataaagagttt
tgggttgagagtaatagtcgtgcaataatatttaatgagcagaaggctattattgcaact
gtaagagacataactgaaagaaaaaatactgaattaaaatcaaaagaagaggctttggaa
ttagaaaaattaagaactgaattttttgctaatatttctcacgaattgagaacaccactt
aatataatactaggtgtgatacaaattctaagaagagatcttttagataaagaaaaaccg
atcgacaaaggaaagataattaataatatagacattgaaagacaaaattgttttagatta
cttcgtttaataaataatttaattgattcaactaaattagatgcaggacattttcagatt
gatatgattaattgtaacattgtcagtgtcgtagaagaaatcactctgtcagtagctggt
tatataagcaataacaatataaaccttatatttgataccgatgttgaagaaaaaattatt
gcttgtgatcctgataaaattgaaaggattatgttaaacctactgtctaattgcataaag
tttacagatgatgatggaagcatatttgtaaatatatttgatggagaagaatatataacc
ttgtctgtagaagatacaggtataggaattccagaagaaaaagttgaaattatttttgat
agatttagacaagtagataaatcttttacaagaaattatgaaggaagcggaattggatta
tctctcgtaaagtccttagtagagatgcatgatgggacgatatcagtggaaagtaaatat
ggggtaggaactaaatttacgattaaacttccagtaaaggtattaaataaaagtaaagaa
agagttaatataagtaataatataattaatacttgtgtagaaaaaataaatattgaattt
tcagatatatataaacaacatttgtag
DBGET
integrated database retrieval system
